VisioTracker представляет собой автоматизированную систему для количественного анализа визуального представления личинок и взрослых рыб небольших основан на регистрации движений глаз. К услугам гостей полный контроль над визуальными свойствами стимулов и анализ в реальном времени, обеспечивая высокую пропускную исследований в таких областях, как визуальная система развития и функции, фармакологии, исследований нейронные цепи и сенсомоторной интеграции.
Расследование визуальной разработки системы и функции необходимость количественной модели поведения визуального представления, которые легко выявить, надежные и простые манипулировать. Подходящая модель была найдена в оптокинетических ответ (ОКР), рефлексивное поведение присутствует во всех позвоночных из-за его высокой стоимости выбор. ОКР включает в себя медленный стимул следующих движений глаз чередуются с быстрым сбросом саккад. Измерение такого поведения легко осуществляется у рыбок данио личинки, в связи с его ранней и стабильной начала (полностью разработаны через 96 часов после оплодотворения (HPF)), и извлечение преимуществ из глубоких знаний о генетике рыбок данио, на протяжении десятилетий одной из благоприятствования модели организмов в этой области. Между тем анализ аналогичных механизмов у взрослых рыб приобрел значение, особенно для фармакологических и токсикологических приложений.
Здесь мы опишем VisioTracker, полностью автоматизированные, высокой throughpuТ-системы для количественного анализа визуального представления. Система основана на исследованиях, проведенных в группе профессора Стефана Neuhauß и был вновь разработанные системы TSE. Он состоит из иммобилизации устройство для мелкой рыбы контролируется высококачественного видео камеры с высоким разрешением зум-объектив. Рыба контейнер находится в окружении барабан экран, на котором компьютерные модели стимула может проецироваться. Движения глаз, фиксируются и автоматически анализирует пакет VisioTracker программного обеспечения в режиме реального времени.
Анализ данных позволяет немедленное признание таких параметров, как медленные и быстрые фазы продолжительность, частота движения цикла, медленные фазы усиления остроты зрения и контрастной чувствительности.
Типичные результаты позволяют, например, быстрой идентификации визуального мутантов системы, которые показывают без видимых изменений в морфологии дикий тип, или определение количественного эффекта фармакологических или токсических и мутагенныхАгенты по визуальной производительности системы.
Важность ОКР для исследования зрительных функций было признано в научном сообществе в течение длительного времени (Пасха и 1996 Nicola, 1997), и попытки по-настоящему количественной парадигме начались более десяти лет назад. Пасха и Николя (1996) разработана система с моторизованные вращающиеся барабаны полосатые, где видеозапись движения глаз были проанализированы вручную. Эта система страдает от отсутствия иммобилизации эмбрионов рыб, которые требуют частой эксплуатации репозиционирование, и может обнаружить отслеживания движений глаз лишь с большим трудом. Шагом вперед стало использование видео-полосатый барабан прогнозируемых в целях обеспечения более переменных компьютерной презентацией стимула (Roeser и Байер, 2003;. Rinner и др., 2005a).
Главным образом вручную кадр за кадром анализ видеозаписей записи оказалось чрезвычайно трудоемким, и в определенной степени препятствует наблюдателя смещения (Beck и соавт.,2004). Автоматизированный анализ в режиме реального времени было предложено разрешить использование поведенческой обратной связи обучения механизмов (Major и соавт., 2004). Использование инфракрасной подсветкой и регулируемой частотой вращающегося раздражители была пионером Beck и соавт. (2004). Тем не менее, система, описанная там использовался только для личинок, а также анализ был проведен в автономном режиме. Кроме того, VisioTracker позволяет осуществлять полный контроль над стимулами, включая изменение стимула в ходе эксперимента, что позволяет большую гибкость и спонтанное влияние на ход эксперимента. Кроме того, создание цифрового стимул используется VisioTracker преодолел проблемы, упомянутые ранее, с ускорением инертная масса полосатый барабан стимулом (Beck и соавт., 2004).
Личинки сдержанность метилцеллюлоза существенно не мешать движению глаз и не имеет никаких долгосрочных последствий для рыбок данио благополучия. Личинок рыб были успешноподдерживаются встроенные в метилцеллюлозы в течение нескольких дней, пока кислород через кожу становится недостаточным для спроса с увеличением возраста (Qian и соавт., 2005).
Сдерживающих взрослых рыб методом одинаково легко на животных. Короткая продолжительность эксперимента, в сочетании с возможностью быстрого обмена испытаний на животных для другой, далее добавляет к положительным животных аспектов системы. Так как жабры постоянно вспыхнул водой, удобно всплеск воды с любыми химическими выбором для изучения его влияния на движения глаз и визуальное исполнение. Точно так же вымывания эксперимента могут быть добавлены без необходимости обращаться с животными между экспериментами.
Пиксель шума в кадре была сведена к минимуму путем сглаживания алгоритмы проприетарное программное обеспечение VisioTracker, что позволяет очень точно измерить положение глаз и угловой скорости. Кроме того, для облегчения статистическихАнализ, программного обеспечения отфильтровываются скачкообразных движений, которые происходят при фиксированной скорости и не вносят вклад в экспериментальную заявлении. Усреднение скорости кривых над 7 кадров видео способствовала последующего анализа.
VisioTracker открывает новое измерение для многих различных областях исследований. Система и ее предшественников уже были успешно использованы для количественной визуальное представление у рыбок данио личинки, используя такие параметры, как острота зрения, контрастная чувствительность и легкой адаптации (Rinner и соавт., 2005a, Schonthaler и соавт., 2010), по функциональному анализу конуса фоторецепторов следующие манипуляции членов визуального каскада трансдукции (например, Rinner и др., 2005b, Реннингер и др., 2011.)., или анализ визуальных дефектов в мутанта личинки данио (например, Schonthaler и др., 2005, 2008;. Bahadori и соавт., 2006). Взаимозависимости морфологического и функционального созревания зрительной системыбыла изучена ОКР измерения показывают, что острота зрения в основном, но не полностью ограничено фоторецепторов расстояние в личиночной стадии (Хауг и соавт., 2010).
VisioTracker одинаково подходит для анализа зрительной функции у взрослых данио рерио и других аналогичных размеров видов рыб (Мюллер и Neuhauß (2010), настоящего доклада).
Возможно также использовать систему в исследованиях таких областях, как токсикология и фармакология которого вещества, которые будут исследованы могут быть добавлены в поток воды окружающих взрослых жабры рыб. Кроме того, универсальность VisioTracker позволяет более тщательный анализ для примера ontogenetics зрительной функции, нейронные функции цепи и развития, или сенсомоторного контроля (см. обзор в Huang и Neuhauß, 2008).
The authors have nothing to disclose.
KPM была поддержана ЕС FP7 (RETICIRC).
Name of the reagent | Company | Catalogue number |
---|---|---|
Methylcellulose | Sigma-Aldrich | M0387 |
Ethyl 3-aminobenzoate methanesulfonate (MS-222) | Sigma-Aldrich | E10521 |
35 mm cell culture dish | Corning | 430165 |
Serum pipette | Greiner bio-one | 612 361 |
VisioTracker | TSE Systems | 302060 |