Kilitli Nükleik Asit modifiye Oligonükleotidler Transfeksiyon ve Sivrisinek Hücreler Hedef Genler Mutagenez
Summary
Hem de özel transfekte hedef genlerin tek bir nükleotid yerine Oligonükleotidler sitesi için kullanılabilir<em> Anofel gambiae</em> Ve<em> Anofel stephensi</em> Hücreler.
Abstract
Sıtma parazitinin, sıtma etkeni, her yıl 250 milyon yeni enfeksiyon sonucu enfekte Anofel sivrisinek sokması ile bulaşır. Onlarca yıllık araştırma rağmen, sıtmaya karşı bir aşı roman kontrol stratejileri için gereğinin altını, hala orada. Bir yenilikçi bir yaklaşım etkili sıtma paraziti iletimini kontrol etmek için genetiği değiştirilmiş sivrisineklerin kullanılmasıdır. Parazit geliştirme 1 düzenlemek için kasıtlı olarak değişiklikler, hedef mutagenez üzerinden sivrisinek hücre sinyal yolları bulundu. Bu çalışmalarda, biz, dönüşüm için potansiyel gen hedefler belirlemeye başlayabilirsiniz. Hedeflenen mutagenez, geleneksel bir hedef gen ve büyük bir DNA molekülü arasındaki homolog rekombinasyon güvenerek vardır. Ancak, stabil bir şekilde dönüştürülmüş hücre hatları üretimi için bu tür karmaşık DNA molekülleri inşası ve kullanımı, pahalı, zaman alıcı ve genellikle verimsiz. Bu nedenle, kilitli nükleik asit modifiye oligonükleotidler (LNA-ons) kullanarak bir strateji episomal ve kromozomal DNA gen hedefleri (2) içine yapay tek nükleotid değiştirmelerin tanıtmak için yararlı bir alternatif sağlar. LNA-ON-aracılı hedef mutagenez, maya ve fareler 3,4 hem de kültür hücreleri ilgi genler nokta mutasyonları tanıtmak için kullanılır olmuştur . LNA-ons Anofel gambiae ve Anofel stephensi hücreleri hem de yeşil floresan protein (GFP) ifade mavi floresan protein (BFP) ifadesi bir anahtarı sonuçları transfekte episomal hedef tek bir nükleotid değişimi tanıtmak için kullanılabileceğini gösteriyor . Bu dönüşüm, sivrisinek hücreleri hedef genlerin etkili mutagenez LNA-ons aracılık ve bu tekniği, in vitro ve in vivo kromozomal hedefleri mutagenez için geçerli olabileceğini düşündürmektedir ki ilk kez gösteriyor.
Protocol
Discussion
Burada A. LNA-ons transfeksiyon aşağıdaki episomal bir gen hedef tek bir nükleotid hedeflenen dönüşüm için de vitro metod ve kanıtların bir mevcut stephensi ve A. gambiae hücreleri. LNA-ON-aracılı gen dönüşümü bir site-spesifik DNA onarım yanıt indüksiyon gerektirir; bizim veri sivrisinek hücreleri için bu siteye özgü mutagenez mekanizması destek olduğunu göstermektedir. Burada sunulan yöntem episomal bir hedef dönüşüm dayalı iken, bizim veri, diğer…
Divulgations
The authors have nothing to disclose.
Acknowledgements
Biz sitometrisi ile ona yardım için California Ulusal primat Araştırma Merkezi Abbie Spinner teşekkür etmek istiyorum. Bu çalışma, Ulusal Alerji ve Bulaşıcı Hastalıklar Enstitüsü (NIAID) Ulusal Sağlık Enstitüleri (NIH) AI073745, AI080799 ve AI078183 fon tarafından desteklenmiştir.
Materials
| Material Name | Type | Company | Catalogue Number | Comment |
|---|---|---|---|---|
| Effectene transfection reagent | Qiagen | 301425 | ||
| GFP control plasmid (pcDNA6.2-GW/EmGFP-miR-neg) | Invitrogen | K4935-00 | ||
| BFP plasmid (pcDNA5/FRT/TO) | Gift from Dr. Concordet3 | |||
| LNA-ONs | Gift from Dr. Concordet3 | |||
| MEM, Earle’s w/ glutamine | Invitrogen | 11095 | ||
| Fetal calf serum (FCS) | Invitrogen | 16000 | ||
| Schneider’s Drosophila medium | Invitrogen | 11730 | ||
| Non-essential amino acids | Invitrogen | 11140 | ||
| 10% D-glucose | Sigma | G5767 | ||
| Penicillin-streptomycin antibiotic | Invitrogen | 15140 | ||
| 6-well culture plates | Corning | 3516 |
References
- Corby-Harris, V. D. A., Watkins de Jong, L., Pakpour, N., Antonova, Y., Ziegler, R., Ramberg, F., Lewis, E. E., Brown, J. M., Luckhart, S. L., Riehle, M. A. A novel strategy for controlling malaria transmission in the mosquito Anopheles stephensi. PLOS Pathogens. , (2010).
- Braasch, D. A., Corey, D. R. Locked nucleic acid (LNA): fine-tuning the recognition of DNA and RNA. Chem Biol. 8, 1-7 (2001).
- Andrieu-Soler, C. Stable transmission of targeted gene modification using single-stranded oligonucleotides with flanking LNAs. Nucleic Acids Res. 33, 3733-3742 (2005).
- Parekh-Olmedo, H., Drury, M., Kmiec, E. B. Targeted nucleotide exchange in Saccharomyces cerevisiae directed by short oligonucleotides containing locked nucleic acids. Chem Biol. 9, 1073-1084 (2002).
- Rhee, W. J., Santangelo, P. J., Jo, H., Bao, G. Target accessibility and signal specificity in live-cell detection of BMP-4 mRNA using molecular beacons. Nucleic Acids Res. 36, e30-e30 (2008).
- Marras, S. A., Kramer, F. R., Tyagi, S. Genotyping SNPs with molecular beacons. Methods Mol Biol. 212, 111-128 (2003).
- Tyagi, S., Bratu, D. P., Kramer, F. R. Multicolor molecular beacons for allele discrimination. Nat Biotechnol. 16, 49-53 (1998).
- Blandin, S. A. Dissecting the genetic basis of resistance to malaria parasites in Anopheles gambiae. Science. 326, 147-150 (2009).
- Niare, O. Genetic loci affecting resistance to human malaria parasites in a West African mosquito vector population. Science. 298, 213-216 (2002).
- Riehle, M. M. Natural malaria infection in Anopheles gambiae is regulated by a single genomic control region. Science. 312, 577-579 (2006).
