منذ اكتشاف مسارَي BER، دار نقاش حول كيفية اختيار الخلية لمسار واحد على الآخر والعوامل التي تحدد هذا الاختيار. أشارت العديد من التجارب في المختبر إلى محددات متعددة لاختيار المسار الفرعي . هؤلاء هم:
نوع الآفة: اعتماداً على نوع الضرر الأساسي، يتم تجنيد جليكوزيلاز الحمض النووي المحدد – أحادي أو ثنائي الوظيفة، في الموقع التالف. في حين أن الإجراء المتسلسل للجليكوزيلاز أحادي الوظيفة يفضل أحداث إصلاح التصحيح الطويلة، فإن الجليكوزيلاز ثنائي الوظيفة يؤدي إلى تصحيح الخطأ BER.
حالة دورة الخلية: المشاركون الرئيسيون في البروتين الذين يميزون BER طويل التصحيح عن المسار البديل لـ BER قصير التصحيح هم مستضد نواة الخلية المتكاثر (PCNA)، وعامل تكرار البروتين C ( RF-C)، والنوكلياز الداخلي 1 الخاص بهيكل الرفرف (FEN1). يتم التعرف على PCNA بشكل خاص باعتباره العمود الفقري لهذا المسار. إنه بمثابة سقالة لتثبيت البوليميراز في الموقع التالف ويرتبط بـ FEN-1 لتسهيل نشاط نوكليازه. علاوة على ذلك، فإن RF-C مطلوب لتحميل PCNA على الحمض النووي. كل هذه البروتينات مطلوبة أيضاً أثناء تكرار الحمض النووي، مما يشير إلى أن BER طويل التصحيح يصلح الأضرار لتكرار الحمض النووي بينما يتم استخدام التصحيح القصير لإصلاح الحمض النووي الراحي.
نقص ATP: لقد لوحظ أيضاً أنه بينما يسود النوكليوتيدات المفردة أو التصحيح القصير BER في ظل الظروف الفسيولوجية العادية، في ظل ظروف نقص ATP، يتم تحويل التفضيل نحو BER طويل التصحيح. وذلك لأن بولي (ADP-ريبوز) يمكن أن يكون بمثابة مصدر فريد لـ ATP أثناء خطوة الربط في BER.