A subunidade ribossómica grande tem várias estruturas importantes essenciais para a tradução. Estas incluem o centro da peptidil transferase (PTC) – que é o local onde se forma a ligação peptídica – e um tubo interno grande, cheio de água, através do qual o polipeptídeo nascente se move. Esta última estrutura é chamada de Túnel de Saída de Peptídeos, e começa no PTC e abrange o corpo da subunidade ribossómica grande. Durante a tradução, à medida que a cadeia polipeptídica nascente é sintetizada, ela passa pelo túnel de saída de peptídeos. Em seguida, ela surge no lado do solvente, onde a cadeia peptídica é posteriormente dobrada em uma proteína.
Este túnel formado pelo RNA ribossomal 23S cria uma grande superfície hidrofílica, contendo pequenas porções hidrofóbicas. As dimensões do túnel (aproximadamente 10 nm × 1,5 nm) podem acomodar cadeias de polipeptídeos não estruturadas e em crescimento, bem como moléculas de solvente. O interior do túnel de saída de peptídeos não é complementar a nenhum peptídeo. Por isso, a cadeia polipeptídica não se “cola” às paredes e pode deslizar facilmente. Assim que chega a um local no túnel de saída onde há espaço suficiente, a cadeia peptídica nascente começa a dobrar e pode formar com sucesso algumas regiões α-helicoidais. No entanto, a maioria do enovelamento proteico ocorre quando o polipeptídeo sai do ribossoma.
