تحتوي الوحدة الفرعية الريبوسومية الكبيرة على العديد من التراكيب المهمة الأساسية للترجمة. وتشمل هذه الببتيدل ترانسفيراز سنتر (PTC)- وهو الموقع الذي تتشكل فيه رابطة الببتيد – وأنبوب كبير داخلي مملوء بالماء يتم من خلاله يتحرك عديد ببتيد ناشئ. يسمى هذا الهيكل الأخير نفق خروج الببتيد، ويبدأ عند PTC ويمتد على جسم الوحدة الفرعية الريبوزومية الكبيرة. وأثناء الترجمة، حيث يتم تصنيع سلسلة البولي ببتيد الوليدة، فإنها تمر عبر نفق خروج الببتيد. ثم يظهر في جانب المذيب، حيث يتم بعد ذلك طي سلسلة الببتيد إلى بروتين.
يشكل هذا النفق المكون من الحمض النووي الريبوزي 23S سطحاً كبيراً محباً للماء، يحتوي على رقع صغيرة كارهة للماء. أبعاد النفق (حوالي 10 نانومتر × ؛ 1.5 نانومتر) يمكن أن تستوعب سلاسل البولي ببتيد المتزايدة وغير المنظمة، وكذلك جزيئات المذيبات. الجزء الداخلي من نفق خروج الببتيد ليس مكملاً لأي ببتيد. ومن ثم، فإن سلسلة البولي ببتيد لا تلتصق ”؛ على الجدران ويمكن أن تنزلق بسهولة. بمجرد وصولها إلى موقع في نفق الخروج حيث توجد مساحة كافية، تبدأ سلسلة الببتيد الوليدة في الانطواء وقد تشكل بنجاح بعض المناطق الحلزونية. ومع ذلك، فإن غالبية طي البروتين يحدث بمجرد خروج عديد الببتيد من الريبوسوم.
