Journal
/
Neurociencias
/
TACI: плагин ImageJ для 3D-анализа кальциевых изображений
JoVE Revista
Neurociencias
Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido.  Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
JoVE Revista Neurociencias
TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

TACI: плагин ImageJ для 3D-анализа кальциевых изображений

3,141 Views

•

09:39 min

•

December 16, 2022

DOI:

10.3791/64953-v

DOI:
10.3791/64953-v

•

09:39 min
December 16, 2022

•

11 Views
, , , , ,
1School of Neuroscience,Virginia Polytechnic Institute and State University, 2CMU-Pitt Joint Computational Biology, School of Medicine,University of Pittsburgh, 3Eastern Virginia Medical School, 4Department of Physics,University of Miami

Summary

Automatically generated

TrackMate Analysis of Calcium Imaging (TACI) — это плагин ImageJ с открытым исходным кодом для 3D-анализа кальциевых изображений, который исследует движение по оси Z и определяет максимальное значение каждого z-стека для представления интенсивности ячейки в соответствующий момент времени. Он может разделять нейроны, перекрывающиеся в латеральном (x/y) направлении, но в разных z-плоскостях.

Explore More Videos

3D Calcium ImagingImageJ PluginTACIMotion CorrectionZ-driftTemperature RecordingPeltierTIFF File RenamingTIFF File Organizing

Read Article

Cite this Article

Omelchenko, A. A., Bai, H., Hussain, S., Tyrrell, J. J., Klein, M., Ni, L. TACI: An ImageJ Plugin for 3D Calcium Imaging Analysis. J. Vis. Exp. (190), e64953, doi:10.3791/64953 (2022).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy