यह प्रोटोकॉल बताता है कि जेब्राफिश भ्रूण वर्गों के सीटू संकरण और इम्यूनोहिस्टोकेमिस्ट्री में संयोजन करके छवियों को कैसे प्राप्त किया जाए। सीटू संकरण में क्रायोसेक्शनिंग से पहले किया गया था, इसके बाद एंटीबॉडी धुंधला हो गया था। एंटीबॉडी की कमी होने पर ज़ेबराफिश में दो जीनों के अभिव्यक्ति पैटर्न का पता लगाना उपयोगी है।