यह प्रोटोकॉल एक प्रोटोटॉक्सिक एंटीमाइक्रोबियल के साथ उपचार के बाद एस्चेरिचिया कोलाई से एकत्रित और घुलनशील प्रोटीन के निष्कर्षण और दृश्य का वर्णन करता है। इस प्रक्रिया के बाद विभिन्न जीवाणु उपभेदों और/या उपचार के बीच में वीवो में प्रोटीन समग्र गठन की गुणात्मक तुलना की अनुमति देता है ।