Journal
/
Inmunología y contagio
/
Высокопроизводительный анализ транскриптома для исследования взаимодействий хозяина и патогена
JoVE Revista
Inmunología y contagio
Author Produced
Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido.  Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
JoVE Revista Inmunología y contagio
High-Throughput Transcriptome Analysis for Investigating Host-Pathogen Interactions
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Высокопроизводительный анализ транскриптома для исследования взаимодействий хозяина и патогена

3,860 Views

•

14:58 min

•

March 05, 2022

DOI:

10.3791/62324-v

DOI:
10.3791/62324-v

•

14:58 min
March 05, 2022

•

3 Views
, , , , ,
1Laboratory of Pathology of Infectious Diseases, Department of Pathology, Medical School,University of São Paulo, 2Scientific Platform Pasteur USP, 3Department of Clinical and Toxicological Analyses, School of Pharmaceutical Sciences,University of São Paulo, 4Hospital Israelita Albert Einstein

Summary

Automatically generated

Протокол, представленный здесь, описывает полный конвейер для анализа данных транскриптома РНК-секвенирования от необработанных считываний до функционального анализа, включая контроль качества и этапы предварительной обработки для передовых статистических аналитических подходов.

Explore More Videos

– High-throughput Transcriptome Analysis- Host-pathogen Interactions- Quality Control- Sequencing And Annotations- Statistical And Co-expression Analysis- Molecular Degree Of Perturbation Analysis- Functional Analysis- Docker Container- Chikungunya Virus- RNA Sequencing- Reference Genome- Gene Annotation

Read Article

Cite this Article

Aquime Gonçalves, A. N., Escolano Maso, V., Maia Santos de Castro, Í., Pereira Vasconcelos, A., Tomio Ogava, R. L., I Nakaya, H. High-Throughput Transcriptome Analysis for Investigating Host-Pathogen Interactions. J. Vis. Exp. (181), e62324, doi:10.3791/62324 (2022).

Download .ris file

Copy

Share Video

.

Copy