Denne protokollen gir en metode for å studere Mycobacterium tuberkuloseinfeksjon i humane M1- eller M2-polariserte makrofager basert på differensiering av perifere blod-monocytter til makrofaglignende celler som er infisert med den GFP-merkede virulente stammen H37Rv, og analysert med strømningscytometri ved hjelp av et 10-fargers panel inkludert uttrykk for utvalgte M1 / M2-markører.