Denne protokol giver en metode til at studere Mycobacterium tuberkulose infektion i humane M1- eller M2-polariserede makrofager baseret på differentiering af perifere blod-monocytter til makrofaglignende celler, der er inficeret med GFP-mærket virulent stamme H37Rv, og analyseret med flow cytometry ved hjælp af en 10-farve panel, herunder udtryk for udvalgte M1/M2 markører.