Journal
/
Bioquímica
/
Detektion av protein ubiquitination platser av peptidanrikning och masspektrometri
JoVE Revista
Bioquímica
Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido.  Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
JoVE Revista Bioquímica
Detection of Protein Ubiquitination Sites by Peptide Enrichment and Mass Spectrometry
Please note that all translations are automatically generated. Click here for the English version.

Detektion av protein ubiquitination platser av peptidanrikning och masspektrometri

DOI:
10.3791/59079-v

•

11:54 min

•

March 23, 2020

•

, ,
1Proteomics Center,Erasmus University Medical Center

Capítulos

  • 00:05Introduction
  • 01:16Sample Preparation
  • 03:36Offline Peptide Fractionation
  • 06:16Nanoflow LC-MS/MS
  • 07:51Data Analysis
  • 09:00Results: Detection of diGly Peptides Using Nanoflow LC-MS/MS
  • 10:51Conclusion

Summary

Traducción Automática

Traducción Automática

Vi presenterar en metod för rening, detektion och identifiering av diGly peptider som härrör från ubiquitinated proteiner från komplexa biologiska prover. Den presenterade metoden är reproducerbar, robust och överträffar publicerade metoder med avseende på nivån på djupet av ubiquitinome analysen.

Tags

Protein UbiquitinationDiGly PeptidesMass SpectrometrySILACProtein EnrichmentLys-CTrypsin DigestionTFA Precipitation

Article

Embed

Añadir a la lista de reproducción

Usage Statistics

Videos relacionados

Tidsupplöst elektrosprayjonisering Väte-deuterium Exchange-masspektrometri för att studera Protein Structure and Dynamics

Lösa affinitetsrenat proteinkomplex av Blue Native PAGE och protein Korrelation profilering

Lipid Droplet Isolation för Kvantitativ masspektrometri Analys

Enkelt att använda arkitekturer i Protein-baserade hydrogeler för Cell kultur applikationer

Djupa proteomet profilering av isobariska märkning, omfattande vätskekromatografi, masspektrometri och programvara-assisted kvantifiering

Optimal förberedelse av formalinbeständiga prover för peptid baserat Matrix assisterad Laser Desorption/jonisering masspektrometri Imaging arbetsflöden

Nitropeptid profilering och identifiering illustrerad av angiotensin II

Provberedning för probe electrospray jonisering Masspektrometri

Absolut kvantifiering av cellfri protein syntes metabolism genom omvänd fas vätskekromatografi-masspektrometri

Kvantitativ analys av cellulär lipidom e av Saccharomyces Cerevisiae med hjälp av flytande kromatografi tillsammans med Tandem Mass Spectrometri

Read Article