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ExCYT: 高次元フローサイトメトリー データの分析を合理化するためのグラフィカル ユーザー インターフェイス
11,137 Views
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05:12 min
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January 16, 2019
DOI:
1The Bloomberg~Kimmel Institute for Cancer Immunotherapy,Johns Hopkins University School of Medicine, 2The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center,Johns Hopkins University School of Medicine, 3Department of Biomedical Engineering,Johns Hopkins University School of Medicine, 4Department of Immunology,Johns Hopkins University School of Medicine, 5Department of Pathology,Johns Hopkins University School of Medicine
Summary
Automatically generated
ExCYT は、MATLAB ベース グラフィカル ユーザー インターフェイス (GUI) を介して流れ cytometry データをよく分析できる採用法 t SNE、さまざまな自動および手動による次元圧縮を含む高次元データの解析技術クラスタ リングの方法、ヒートマップなど、および新規高次元フローがプロットされます。
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Sidhom, J., Theodros, D., Murter, B., Zarif, J. C., Ganguly, S., Pardoll, D. M., Baras, A. ExCYT: A Graphical User Interface for Streamlining Analysis of High-Dimensional Cytometry Data. J. Vis. Exp. (143), e57473, doi:10.3791/57473 (2019).
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