/
/
ExCYT: ממשק משתמש גרפי עבור התייעלות ניתוח של נתוני Cytometry גבוהה-ממדי
Se requiere una suscripción a JoVE para ver este contenido. Inicie sesión o comience su prueba gratuita.
ExCYT: ממשק משתמש גרפי עבור התייעלות ניתוח של נתוני Cytometry גבוהה-ממדי
11,137 Views
•
05:12 min
•
January 16, 2019
DOI:
1The Bloomberg~Kimmel Institute for Cancer Immunotherapy,Johns Hopkins University School of Medicine, 2The Sidney Kimmel Comprehensive Cancer Center,Johns Hopkins University School of Medicine, 3Department of Biomedical Engineering,Johns Hopkins University School of Medicine, 4Department of Immunology,Johns Hopkins University School of Medicine, 5Department of Pathology,Johns Hopkins University School of Medicine
Summary
Automatically generated
ExCYT הוא MATLAB מבוסס גרפי וממשקי משתמש (GUI) המאפשר למשתמשים לנתח את הנתונים cytometry זרימה שלהם דרך כלל המועסקים בשיטות אנליטיות עבור נתונים גבוהה-ממדי כולל הפחתת dimensionality באמצעות t-סנה, מגוון אוטומטיות וידניות קיבוץ באשכולות שיטות heatmaps, זרימה גבוהה-ממדי הרומן חלקות.
Read Article
Cite this Article
Sidhom, J., Theodros, D., Murter, B., Zarif, J. C., Ganguly, S., Pardoll, D. M., Baras, A. ExCYT: A Graphical User Interface for Streamlining Analysis of High-Dimensional Cytometry Data. J. Vis. Exp. (143), e57473, doi:10.3791/57473 (2019).
Copy