Presenteras är en flexibel informatik arbetsflöde möjliggör multiplex bildbaserad analys av fluorescerande celler. Arbetsflödet kvantifierar nukleära och cytoplasmiska markörer och beräknar markör sloka mellan dessa avdelningar. Förfaranden tillhandahålls för störning av celler med användning av siRNA och tillförlitlig metod för analys av markör detektering genom indirekt immunofluorescens i 96-brunnars format.