La carcinogénesis es un proceso que implica interacciones entre las células cancerosas y el microambiente del cáncer. Para diseccionar los eventos moleculares, uno necesita para aislar poblaciones de células diferentes en diferentes etapas durante el desarrollo del cáncer. Utilizando un modelo de ratón para el carcinoma de células basales, se describe un protocolo para el análisis de células durante la carcinogénesis.