発癌は、癌細胞とがん微小環境との相互作用を伴うプロセスである。分子事象を分析するためには、癌の開発中の異なる段階で異なる細胞集団を単離する必要がある。基底細胞癌のマウスモデルを用いて、発癌の間に、細胞分析のためのプロトコールを述べる。