Deze studie presenteert een protocol voor het genereren van 2D-monolagen in de darm van runderen uit organoïden, en biedt verbeterde toegang voor het bestuderen van interacties tussen gastheer en ziekteverwekker. Het bevat methoden voor het beoordelen van de integriteit en functionaliteit van het membraan, het bevorderen van in vitro modellen die de gastro-intestinale fysiologie van runderen nabootsen. Deze aanpak belooft aanzienlijke biomedische en agrarische voordelen, waaronder verbeterde behandelingsstrategieën.
De vooruitgang van de kennis van de gastro-intestinale fysiologie en haar ziekten hangt in kritische mate af van de ontwikkeling van nauwkeurige, soortspecifieke in vitro-modellen die in vivo darmweefsels getrouw nabootsen. Dit is met name van vitaal belang voor het onderzoeken van gastheer-pathogeen interacties bij runderen, die belangrijke reservoirs zijn voor pathogenen die ernstige risico’s voor de volksgezondheid met zich meebrengen. Traditionele 3D-organoïden bieden beperkte toegang tot het apicale oppervlak van het darmepitheel, een hindernis die wordt overwonnen door de komst van 2D-monolaagculturen. Deze culturen, afgeleid van organoïde cellen, bieden een blootgesteld luminaal oppervlak voor meer toegankelijk onderzoek. In dit onderzoek wordt een gedetailleerd protocol geïntroduceerd voor het maken en onderhouden van 2D-monolaagculturen uit cellen van runderorganoïden in de dunne en grote darm. Deze methode omvat protocollen voor het beoordelen van membraanintegriteit door middel van transepitheliale elektrische weerstand en paracellulaire permeabiliteit, naast immunocytochemische kleuringstechnieken. Deze protocollen leggen de basis voor het opzetten en karakteriseren van een 2D-monolaagkweeksysteem voor runderen, waarbij de grenzen van deze methodetoepassingen worden verlegd in biomedisch en translationeel onderzoek dat van belang is voor de volksgezondheid. Het gebruik van deze innovatieve benadering maakt de ontwikkeling mogelijk van fysiologisch relevante in vitro modellen voor het onderzoeken van zowel normale als zieke toestanden van de darmfysiologie van runderen. De implicaties voor de biomedische en agrarische vooruitgang zijn ingrijpend en maken de weg vrij voor effectievere behandelingen voor darmaandoeningen bij runderen, waardoor zowel het dierenwelzijn als de voedselveiligheid worden verbeterd.
De cultuur van intestinale epitheliale stamcellen in driedimensionale (3D) culturen, bekend als darmorganoïden, markeert een aanzienlijke vooruitgang in de in-vitrotechnologie voor het onderzoeken van darmfuncties, voeding en interacties met ziekteverwekkers 1,2. Deze organoïden bootsen de complexe structuur van het in vivo darmepitheel na door zichzelf te repliceren en te organiseren in 3D-formaties die verschillende darmcellijnen omvatten3. Deze functie benadrukt hun aanzienlijke potentieel om het begrip van de darmbiologie vooruit te helpen.
De toenemende belangstelling voor het toepassen van darmorganoïdetechnologie op landbouwhuisdieren maakt verfijning van kweek- en onderhoudstechnieken noodzakelijk 4,5. De relevantie van deze technologie wordt onderstreept door de potentiële impact ervan op het bestuderen van de darmgezondheid van landbouwhuisdieren, die een cruciale rol speelt in hun productiviteit en bijgevolg in de economie van de voedsel-dierindustrie door het dierenwelzijn en de operationele kosten te beïnvloeden 6,7. In het bijzonder is het gebruik van intestinale organoïde culturen om de darmfunctie van runderen te onderzoeken van het grootste belang, gezien hun rol als reservoirs voor zoönotische darmpathogenen, zoals Salmonella spp. en Escherichia coli (E. coli) O157:H78. Deze ziekteverwekkers zijn gelokaliseerd in bepaalde segmenten van de darm, waardoor het essentieel is om darmorganoïde-kweekmethoden te differentiëren per darmsegment om de precisie in onderzoeken te verbeteren9.
Een belangrijk obstakel bij de studie van darmorganoïden is de beperkte toegang tot het apicale oppervlak van de epitheelcel10. Wanneer gekweekt in een extracellulaire matrix (ECM), oriënteren de cellen zich van nature zo dat het basale oppervlak naar buiten wijst en het apicale oppervlak naar binnen is gericht10. Om deze uitdaging aan te gaan, worden methoden gepresenteerd waarbij 3D-organoïden worden gedissocieerd in afzonderlijke cellen en deze worden gezaaid in semi-permeabele celcultuurinserts. Deze opstelling brengt een interface tot stand tussen het apicale oppervlak en een basolateraal compartiment. Dit protocol toont aan dat cellen afkomstig van darmorganoïden van runderen een coherente 2D-monolaag kunnen vormen, zoals blijkt uit metingen van transepitheliale elektrische weerstand (TEER) en paracellulaire permeabiliteitstests. Bovendien wordt de ontwikkeling van cellulaire polariteit met borstelranden en tight junctions in de organoïde-afgeleide 2D-monolaagcellen bevestigd door immunofluorescentie en elektronenmicroscopie, die de eigenschappen van het in vivo darmepitheel weerspiegelen.
In deze studie vertegenwoordigt het ileum het dunne darmkanaal en het rectum het grote darmkanaal. Deze selecties zijn gebaseerd op relevante darmpathogenen zoals Salmonella spp., die het ileum11 kan verplaatsen, en E. coli O157:H7 waarvan bekend is dat het voornamelijk het rectum9 bij runderen koloniseert. De selectie van deze specifieke darmsegmenten benadrukt de noodzaak om darmorganoïdekweekmethoden af te stemmen op het darmgebied voor precisie in onderzoek. Deze methoden beschrijven de procedure voor het effectief kweken van een organoïde-afgeleide 2D-monolaaginterface van deze darmsegmenten, en bieden een robuust model voor het onderzoeken van de darmgezondheid van runderen, pathogene infecties en interacties tussen het darmmicrobioom en de gastheer.
De gezondheid van het darmkanaal is van het grootste belang voor zowel de productiviteit als het algehele welzijn van runderen16. Door gebruik te maken van organoïde-afgeleide 2D-monolaagtechnologie kunnen wetenschappers nu de complexe structuur van het runderdarmepitheel nauwkeuriger nabootsen in een in vitro-setting 5. Deze innovatieve benadering reproduceert niet alleen de diverse cellulaire samenstelling van de darmwand, inclusief de meercellige afstammingslijnen, maar legt ook belangrijke functionele kenmerken vast, zoals slijmafscheiding en de aanwezigheid van microvilli, essentieel voor het begrijpen van darmfysiologie en pathologie3. De ontwikkeling van op maat gemaakte kweekprotocollen voor segmenten van het ileum en het rectum heeft geleid tot een geavanceerd platform dat de capaciteit om de darmgezondheid van runderen te bestuderen aanzienlijk verbetert. Deze uitgekiende aanpak maakt gedetailleerd onderzoek mogelijk naar de interacties tussen zoönotische pathogenen en het darmmilieu van runderen. Het vermogen om de unieke aspecten van het darmecosysteem van runderen in vitro nauwkeurig te repliceren en te bestuderen, is een belangrijke stap in de richting van de ontwikkeling van gerichte strategieën om de gezondheid van vee te verbeteren en de verspreiding van zoönotische ziekten te beperken.
Om een succesvolle ontwikkeling van 2D-monolagen met behulp van darmorganoïden van runderen te garanderen, is het echter van cruciaal belang om de gezondheid en vitaliteit van zowel de organoïden als hun gedissocieerde afzonderlijke cellen te behouden. Zorgvuldige behandeling en het minimaliseren van stress zijn van het grootste belang voor het behoud van de celintegriteit en -functionaliteit, die essentieel zijn voor de effectieve groei van organoïden en de daaropvolgende creatie van een functionerende monolaag. Bovendien is het bereiken van een uniforme monolaag afhankelijk van de succesvolle dissociatie van organoïden tot afzonderlijke cellen zonder grote klonten te vormen. Dergelijke klonten kunnen de celverdeling verstoren en de structuur van de monolaag in gevaar brengen. Daarom is het gebruik van nauwkeurige technieken voor soepele dissociatie cruciaal, wat resulteert in een consistente eencellige suspensie. Bovendien wordt het nuttig om verstoringen tijdens celadhesie en bij het wegspoelen van overtollige niet-hechtende cellen tot een minimum te beperken. Deze aanpak is vooral belangrijk voor het aanpakken van mogelijke problemen met 3D-morfogenese, waardoor de algehele kwaliteit van de monolaag wordt verbeterd.
Een bekende uitdaging met op ECM gebaseerde hydrogels die van biologische oorsprong zijn, is de variatie in samenstelling van batch tot batch17. Hoewel dit niet werd waargenomen met behulp van de beschreven protocollen en materialen, kunnen batch-tot-batch-variaties in ECM-samenstelling uitdagingen vormen voor een succesvolle ontwikkeling van monolagen. Als de vorming van een monolaag in het gedrang komt wanneer ECM-producten, -merken of -lotnummers veranderen, kunnen optimalisatiestappen nodig zijn om de juiste ECM-concentratie te bepalen die nodig is voor het coaten van de celcultuurinserts.
Bovendien is het aanpassen van het kweekmedium aan kamertemperatuur voordat er wijzigingen worden aangebracht een cruciale stap die helpt thermische schokken te verminderen, de gezondheid van cellen te beschermen en de kwaliteit van zowel de organoïde- als de monolaagculturen te behouden. Zachte waspraktijken zijn ook van het grootste belang om de integriteit van de monolaag te behouden tijdens de vorming en daaropvolgende tests, en het vermijden van verstoringen kan onnauwkeurigheden in de resultaten voorkomen. Het vervangen van PBS door Hank’s Balanced Salt Solution (HBSS) leek nuttig bij het minimaliseren van het loskomen van de monolaag wanneer het een probleem werd tijdens herhaaldelijk wassen of langdurige blootstelling aan PBS, zoals in de paracellulaire permeabiliteitstests. Ten slotte is het essentieel om het kweekmedium af te stemmen op de specifieke behoeften van cellen uit verschillende segmenten van het darmkanaal, zoals het ileum en het rectum, om de omstandigheden in vivo nauwkeurig na te bootsen. Deze specificiteit zorgt voor een optimale gezondheid en functionaliteit van de cellen, waardoor een nauwkeurige modellering van de darmfysiologie van runderen en interacties met ziekteverwekkers mogelijk wordt, waardoor deze cruciale stappen in organoïdenonderzoek worden benadrukt.
Naast het toepassen van een zachte celbehandelingspraktijk, is het opbouwen van een goede technische competentie in verband met celtelling en TEER-metingen cruciaal voor de succesvolle ontwikkeling van een functionerende 2D-monolaag. Omdat zowel een te lage als een te hoge zaaidichtheid als gevolg van respectievelijk over- of ondertelling van de cellen kan leiden tot een aangetaste groei van de monolaag. Het wordt aangemoedigd om het aantal cellen zorgvuldig te controleren en te zorgen voor de juiste zaaidichtheid in gevallen waarin onnauwkeurige zaaidichtheden worden vermoed. Bovendien kunnen ontoereikende TEER-meettechnieken leiden tot verstoring van de monolaag door onbedoelde krassen met de elektroden. Door de elektroden voorzichtig in de apicale kamer te plaatsen en bijzondere aandacht te besteden aan het behouden van hun verticale oriëntatie ten opzichte van het membraanoppervlak, kan het risico op onbedoelde schade aan de monolagen worden verkleind.
De hier beschreven methoden voor de paracellulaire permeabiliteitstest zijn overgenomen van een eerder protocol18. Wijzigingen in het gerapporteerde protocol, waaronder meerdere bemonsteringen gedurende 120 minuten en vervanging van het bemonsterde aliquot door gelijke hoeveelheden PBS, worden aangebracht om de nauwkeurigheid en betrouwbaarheid van de resultaten te verbeteren. Het handhaven van het totale volume in de kamer is om verschillende redenen van cruciaal belang: het behoudt het osmotische evenwicht, zorgt voor celintegriteit, handhaaft de concentratiegradiënt die essentieel is voor een nauwkeurige beoordeling van de permeabiliteit en voorkomt veranderingen in de hydrostatische druk die de transportsnelheden kunnen beïnvloeden. Deze praktijk van het aanvullen van de basolaterale kamer met verse PBS die gelijk is aan het volume van de fluorescerende tracer-bevattende PBS die is bemonsterd, is van cruciaal belang voor het behoud van deze omstandigheden, waardoor nauwkeurige en zinvolle evaluaties van de permeabiliteit van de monolaag mogelijk worden. De paracellulaire permeabiliteitstest dient als aanvulling op de TEER-meting door de beweging van tracermoleculen door de monolaag rechtstreeks te beoordelen. Bovendien levert het vergelijken van TEER-waarden in verschillende laboratoria mogelijk geen relevante inzichten op, aangezien deze waarden kunnen worden beïnvloed door tal van variabelen, zoals temperatuur en de specifieke omstandigheden waaronder cellen worden gekweekt, waaronder celtypen, passagenummers en de samenstelling van het kweekmedium19. De paracellulaire permeabiliteitstest biedt een functionele in vitro beoordeling van de effectieve expressie van adherens en tight junctions binnen een epitheliale barrière20.
Hoewel de ontwikkeling van 2D-monolagen uit 3D-organoïden een aanzienlijke vooruitgang betekent in de kweektechnologie, is het belangrijk om de beperkingen van 2D-monolagen te erkennen. Een groot nadeel is dat dit een statisch kweeksysteem blijft, zonder de dynamische stimulatie die in de in vivo omgeving wordt aangetroffen. Bovendien brengt het wijzigen van het zuurstofgehalte in het kweeksysteem uitdagingen met zich mee vanwege de open opstelling met kweekplaten met deksels, waardoor het minder geschikt is voor langdurige co-cultuur met anaërobe bacteriën. Deze beperkingen kunnen mogelijk worden aangepakt door meer dynamische cultuurplatforms in te voeren, zoals microfluïdische systemen21, die een meer gecontroleerde en fysiologisch relevante omgeving bieden. Bovendien is het van cruciaal belang om te erkennen dat, hoewel de huidige kweekomstandigheden rijk zijn aan voedingsstoffen die gunstig zijn voor het behoud van de groei van stamcellen, ze mogelijk niet optimaal zijn voor het induceren van fysiologische differentiatie van de epitheelcellen. Deze discrepantie benadrukt de noodzaak van optimalisatie in toekomstig onderzoek om de in vivo omstandigheden nauwkeurig na te bootsen en het differentiatieproces te ondersteunen. Door deze beperkingen aan te pakken en deze benaderingen te verfijnen, worden het nut en de toepasbaarheid van organoïdekweektechnologieën verbeterd, waardoor de complexe dynamiek en interacties van het maagdarmkanaal in vitro dichter bij het repliceren komen.
Het protocol voor het genereren van 2D-monolagen uit runder-, ileum- en rectumweefsels biedt onderzoekers een waardevol in vitro model van de luminale interface van zowel dunne als dikke darmepitheel. Dit model opent enorme mogelijkheden voor toepassing in fundamentele diervoedingsstudies, met name om te onderzoeken hoe voedingsstoffen onder verschillende omstandigheden worden opgenomen. Een opmerkelijk aandachtsgebied is het onderzoek naar het lekkende darmsyndroom, gekenmerkt door een abnormale toename van de gastro-intestinale permeabiliteit, vaak veroorzaakt door voedingsveranderingen en extreme omgevingstemperaturen22,23. Bovendien dient dit model als een essentieel hulpmiddel voor het onderzoeken van de complexe interacties tussen het darmmicrobioom en zijn gastheer. Het maakt het mogelijk om te bestuderen hoe commensale micro-organismen de gezondheid van het gastheerorganisme kunnen beïnvloeden, waarbij een cruciaal aspect van de veterinaire en medische wetenschap wordt aangepakt 1,24. Bovendien worden door voedsel overgedragen door mensen overgedragen ziekteverwekkers vaak aangetroffen als commensalen in verschillende segmenten van de darm vanrunderen 8,9,25, dit protocol maakt gedetailleerde studies mogelijk van de specifieke omstandigheden waardoor deze zoönotische agentia kunnen gedijen in hun respectievelijke niches.
Tijdens deze studie werd waargenomen dat rectale en ileale organoïde-afgeleide monolagen verschillende voorwaarden vereisen voor een succesvolle ontwikkeling. Met name toen rectale organoïde-afgeleide monolagen aanvankelijk werden gezaaid op celcultuurinserts die waren bereid met 2% ECM-gebaseerde hydrogel in basale media gedurende 1 uur, werden grote gaten en celvervelling opgemerkt. Dit probleem werd opgelost door over te schakelen op een gespecialiseerd rectaal monolaagkweekmedium en de incubatietijd te verlengen tot ‘s nachts voor het zaaien, terwijl ileale organoïde-afgeleide monolagen met succes werden ontwikkeld met behulp van een korter voorbereidingsprotocol. Bovendien verbeterde de toevoeging van CHIR99021 aan het kweekmedium consequent de vorming van rectale monolagen26 , maar was het niet noodzakelijk voor ileale monolagen27. Bovendien hadden ileale monolagen een hogere celdichtheid nodig voor een succesvolle ontwikkeling in vergelijking met rectale organoïden27. Deze geoptimaliseerde omstandigheden (Tabel 1) hebben herhaaldelijk monolagen ontwikkeld die de resistente barrière-integriteit behouden, wat het belang onderstreept van het afstemmen van kweekomstandigheden op het specifieke darmsegment.
Toegang tot een model dat de complexiteit van de meercellige afstamming van de in vivo darm nauwkeurig weergeeft, is van cruciaal belang voor deze onderzoeken. Het stelt onderzoekers in staat om de natuurlijke omstandigheden van het darmmilieu nauwkeurig na te bootsen, wat een betrouwbaardere basis voor experimenten biedt. Met dit protocol zijn onderzoekers uitgerust met een robuust model dat hun onderzoekscapaciteiten verbetert, wat mogelijk kan leiden tot baanbrekende ontdekkingen in hun vakgebied. Deze benadering draagt niet alleen bij aan het begrijpen van darmgezondheid en -ziekten, maar helpt ook bij de ontwikkeling van strategieën om het veebeheer en de voedselveiligheid te verbeteren.
The authors have nothing to disclose.
Deze studie werd gedeeltelijk ondersteund door het Office of the Director National Institutes of Health (K01OD030515 en R21OD031903 aan YMA) en WSU VCS Resident and Graduate Student Research Grant (aan GDD). De auteurs willen het deelnemende slachthuis bedanken voor het leveren van donorvee.
Basal Medium | |||
Advanced DMEM/F12 (1X) | Gibco | 12634-010 | n/a |
GlutaMAX-I (100X) | Gibco | 35050-061 | 2 mM |
HEPES (1M) | Gibco | 15630-080 | 10 mM |
Pen Strep Glutamine (100X) | Gibco | 10378-016 | 1X |
Organoid Culture Medium (Supplements to Basal Medium) | |||
A-83-01 | Sigma-Aldrich | SML0788-5MG | 500 nM |
B27 Supplement (50X) | Gibco | 17504-001 | 1X |
[Leu15]-Gastrin I human | Sigma-Aldrich | G9145-.5MG | 10 nM |
Murine EGF | PeproTech | 315-09-500UG | 50 ng/mL |
Murine Wnt-3a | PeproTech | 315-20-10UG | 100 ng/mL |
N-Acetyl-L-cysteine | MP Biomedicals | 194603 | 1 mM |
N-2 MAX Media Supplement (100X) | R&D Systems | AR009 | 1X |
Nicotinamide | Sigma-Aldrich | N0636-100G | 10 mM |
Noggin Conditioned Medium | n/a | n/a | 10 vol/vol % |
Primocin | InvivoGen | ant-pm-2 | 100 µg/mL |
R-Spondin-1 Conditioned Medium | n/a | n/a | 20 vol/vol % |
SB202190 | Sigma-Aldrich | S7067-25MG | 10 µM |
Monolayer Culture Medium (Supplements to Organoid Culture Medium) | |||
CHIR99021 | Sigma-Aldrich | SML1046-5MG | 2.5 µM |
HI FBS | Gibco | 10438-034 | 20 vol/vol % |
LY2157299 | Sigma-Aldrich | SML2851-5MG | 500 nM |
Y-27632 | StemCellTechnologies | 72308 | 10 µM |
Reagents | |||
Alexa Fluor 488 Mouse anti-E-cadherin | BD Biosciences | 560061 | 1:200 dilution |
Alexa Fluor 647 Phalloidin | Invitrogen | A22287 | 1:400 dilution |
BSA | Cytiva | SH30574.02 | 2 w/vol % |
Cell Recovery Solution | Corning | 354253 | n/a |
DAPI Solution (1 mg/mL) | Thermo Scientific | 62248 | 1:1000 dilution |
DPBS (1X) | Gibco | 14190-144 | n/a |
Fluorescein Isothiocyanate–Dextran | Sigma-Aldrich | FD4-100MG | 0.5 mg/mL |
Matrigel Matrix | Corning | 354234 | n/a |
Paraformaldehyde Solution (4%) | Thermo Scientific | J19943K2 | n/a |
ProLong Gold antifade reagent | Invitrogen | P36930 | n/a |
SNA, EBL, Fluorescein | Vector Laboratories | FL-1301 | 1:100 dilution |
Triton X-100 | Thermo Scientific | A16046.AE | 0.3 vol/vol % |
TrypLE Express | Gibco | 12605-028 | n/a |
Trypan Blue Solution, 0.4% | VWR Life Science | K940-100ML | n/a |
Materials and Equipment | |||
0.4 µm Cell Culture Insert | Falcon | 353095 | |
24-well Cell Culture Plate | Corning | 3524 | |
48-well Cell Culture Plate | Thermo Scientific | 150687 | |
70 µm Sterile Cell Strainer | Fisher Scientific | 22-363-548 | |
96-well Cell Culture Plate | Greiner Bio-One | 655086 | |
Centrifuge | Eppendorf | 5910Ri | |
CO2 Incubator | Thermo Scientific | 370 | |
Epithelial Volt-Ohm Meter | Millipore | Millicell ERS-2 | |
Hemocytometer | LW Scientific | CTL-HEMM-GLDR | |
Inverted Confocal Microscope | Leica Microsystems | SP8-X | |
Inverted Phase-Contrast Microscope | Leica Microsystems | DMi1 | |
Microscope Cover Glass | Fisher Scientific | 12-540-B | |
Microplate Reader | Molecular Devices | SpecrtraMax i3x | |
Microscope Slides | Fisher Scientific | 22-034-486 | |
Pasteur Pipets | Fisher Scientific | 13-678-20C | |
Scalpel Blade | iMed Scientific | – | #11 carbon steel |
Vortex Mixer | Scientific Industries | SI-0236 | |
Software | |||
LAS X imaging software | Leica Microsystems | LAS X 3.7.6.25997 | |
Microplate Reader software | Molecular Devces | SoftMax Pro 7.1.2 |