Hier beschreiben wir eine einfache und kostengünstige Technik zur Inokulation und Beobachtung von arbuskulären Mykorrhizapilzen in superabsorbierenden polymerbasierten autotrophen Systemen.
Arbuskuläre Mykorrhizapilze (AM) sind aufgrund ihrer dauerhaften Assoziation mit Pflanzenwurzeln und ihrer Vermehrung in der Rhizosphäre schwer zu manipulieren und zu beobachten. Typischerweise werden AM-Pilze unter in vivo Bedingungen in Topfkultur mit einem autotrophen Wirt oder unter in vitro Bedingungen mit Ri Transfer-DNA transformierten Wurzeln (heterotropher Wirt) in einer Petrischale kultiviert. Darüber hinaus erfolgt die Kultivierung von AM-Pilzen in Topfkulturen in einer undurchsichtigen und unsterilen Umgebung. Im Gegensatz dazu handelt es sich bei der In-vitro-Kultur um die Vermehrung von AM-Pilzen in einer sterilen, transparenten Umgebung. Das superabsorbierende polymerbasierte autotrophe System (SAP-AS) wurde kürzlich entwickelt und hat gezeigt, dass es die Vorteile beider Methoden kombiniert und gleichzeitig ihre jeweiligen Einschränkungen (Opazität und heterotropher Wirt, Sterilität) vermeidet. Hier stellen wir ein detailliertes Protokoll für die einfache Vorbereitung, die Inokulation mit einzelnen Sporen und die Beobachtung von AM-Pilzen in SAP-AS vor. Durch die Modifikation der Petrischalen waren hochauflösende Foto- und Videobeobachtungen an lebenden Proben möglich, die mit den derzeitigen in vivo und in vitro Techniken nur schwer oder gar nicht möglich gewesen wären.
Arbuskuläre Mykorrhizapilze (Glomeromycotina) sind uralte Pflanzenwurzelsymbionten (~500 Ma 1,2), die möglicherweise eine wesentliche Rolle bei der Besiedlung terrestrischer Böden durch Tracheophyten gespielt haben. Diese lange Koevolution zwischen AM-Pilzen und Tracheophyten macht die arbuskuläre Mykorrhiza zu einem Meisterwerk des Mutualismus zwischen den Reichen. AM-Pilzhyphen erhöhen signifikant die Fähigkeit des Wirts, nach Bodennährstoffen zu suchen3, einschließlich der Nährstoffverschleppung zu neuen Wirten über Mykorrhizanetzwerke4. Das Hyphennetzwerk verbessert die Bodenstruktur, und die Produktion von Glomalin könnte die Bodenerosion verringern5. Die Übertragung eines Teils des atmosphärischen Kohlenstoffs auf den Pilzwurzelsymbionten erhöht die Kohlenstoffbindung im Boden6. Insgesamt verbessern AM-Pilze die Widerstandsfähigkeit der Pflanzen sowohl gegenüber abiotischen als auch gegenüber biotischem Stress und haben daher in der Agrarökologie erhebliche Aufmerksamkeit erhalten7. In der Tat haben pilzfreundliche landwirtschaftliche Bewirtschaftungspraktiken am Morgen das Potenzial, den Einsatz chemischer Betriebsmittel für die Pflanzenproduktion zu reduzieren und den Gehalt an organischem Kohlenstoff im Boden zu verbessern – wichtige Ziele, die Landwirte in ihre Bewirtschaftungspraktiken integrieren müssen, um den nationalen und internationalen Verpflichtungen in Bezug auf den Übergang zu nachhaltigen landwirtschaftlichen Praktiken und den Kampf gegen den Klimawandel nachzukommen.
AM-Pilze sind jedoch bodenmikroskopisch kleine Pilze, und ihre Untersuchung ist aufgrund ihrer obligaten Biotrophie und Rhizosphärenverteilung schwierig. Der Boden ist eines der am schwierigsten zu untersuchenden Biotope aufgrund seiner Opazität, der großen Vielfalt an Nischen und der multitrophischen Wechselwirkungen auf allen Skalen. Die Isolierung, Vermehrung und Charakterisierung von AM-Pilzen ist daher schwierig. Bis zur Mitte des 20. Jahrhunderts wurden nur AM-Pilzarten charakterisiert, die Sporokarpe bilden8. Die Mehrheit der AM-Pilzarten produziert jedoch nicht-sporokarpe Sporen mit einem Durchmesser von ~20 μm bis ~500 μm. Die Beschreibung der Boden-Nasssiebtechnik9 eröffnete den Weg zur Beschreibung dieser AM-Pilzarten, und die Rate der Artenbeschreibungen hat seitdem zugenommen. Dennoch stellen AM-Pilze im Vergleich zu Dikarya eine kleine Gruppe von Arten dar.
Fallenkulturen, d.h. die Inokulation mit Sporen oder einer Umweltbodenprobe, die AM-Pilzsporen eines Topfes enthält, der mit autoklaviertem Material wie Turface und Vermiculit und einem sterilisierten Saatgut eines Wirts (Porree, Wegerich) gefüllt ist, ist eine Möglichkeit, AM-Pilze unter kontrollierten Bedingungen zu vermehren10. Der Erfolg der Inokulation kann jedoch nur beurteilt werden, indem nach der Färbung nach dem Vorhandensein von Arbuskeln in Wurzelfragmenten gesucht wird oder eine Teilprobe oder der gesamte Topf nass gesiebt wird, um Sporen zu isolieren. In der Regel wird empfohlen, das System mindestens 6-12 Wochen vor der Analyse der Topfkultur nicht zu stören. Diese Kulturtechnik eignet sich für die Vermehrung der meisten bekannten AM-Pilzarten, aber eine Live-Beobachtung des Pilzsymbionten ist nicht möglich, und der Erfolg der Inokulation ist ungewiss, insbesondere wenn Einzelsporenkulturen versucht werden.
Im Gegensatz dazu kann die In-vitro-Vermehrung von AM-Pilzen dank der Transparenz des Nährmediums11 live überwacht werden, aber diese Kulturtechnik erfordert die Verfügbarkeit von transformierten Wurzeln und das Vorhandensein von Kohlenstoff im Kulturmedium, um in einer sterilen Umgebung zu funktionieren. Die Sporen müssen sterilisiert werden, und zusammen mit der Assoziation mit einem heterotrophen Wirt werden die meisten der bekannten AM-Pilzarten mit dieser Technik nicht erfolgreich vermehrt.
Daher hat die Vermehrung von AM-Pilzen mit den derzeitigen Techniken, obwohl sie etabliert und in den meisten Laboratorien weit verbreitet ist, einige Einschränkungen für die Untersuchung von AM-Pilzen. Paré et al. (2022)12 entwickelten eine In-vivo-Technik , bei der ein transparentes superabsorbierendes Polymer (SAP) in Kombination mit ganzen Pflanzen verwendet wird, um AM-Pilze zu vermehren. Die Technik, die als SAP-basiertes autotrophes System (SAP-AS) konzipiert ist, ist einfach und kostengünstig und kombiniert die Vorteile der Pot-Kultur (Assoziation mit einem autotrophen Wirt, unsterile Bedingungen) und der In-vitro-Kultur (transparentes Medium, Live-Monitoring der Symbioseentwicklung). Hier stellen wir ein Protokoll vor, das erklärt, wie man die Kulturen mit Einzelsporen-Inokulation einrichtet und das SAP-AS für die Beobachtung des extraradikalen Myzels mit hoher Vergrößerung verwendet. Konkret beschreiben wir, wie man Zweikammer-Petrischalen modifiziert, die Nährlösung vorbereitet, das Superabsorberpolymer (SAP) vorbereitet, die Sämlinge vorbereitet, das SAP-AS zusammensetzt und mit einer einzigen Spore impft, die Sporen vorkeimt und die Entwicklung der Symbiose live überwacht.
Die Inokulation ist der kritischste Schritt im Protokoll, und die Pasteur-Pipetten aus extrudiertem Glas erwiesen sich als hervorragendes Werkzeug, um einzelne Sporen von AM-Pilzen genau zu manipulieren und gleichzeitig ihre Integrität zu bewahren. Die Pasteur-Pipetten aus extrudiertem Glas lassen sich leicht mit der Flamme einer Kerze oder eines Bunsenbrenners formen, und die Öffnung kann unter dem Stereomikroskop an die Größe der zu pipettierenden Spore angepasst werden. Es ist wichtig, die Sporen mit Werkzeugen zu manipulieren, die an die Größe der AM-Pilzsporen angepasst sind (Ergänzende Abbildung 1) und das SAP-AS zu impfen, wenn die Wurzeln der Wirtspflanze lang genug sind, um die Nitex-Membran zu erreichen, wo die Spore abgelagert wird.
Die SAP-AS lassen sich leicht an die Anforderungen des Experiments anpassen. Größere Petrischalen mit mehreren Kompartimenten können verwendet werden, um beispielsweise die Wechselwirkung zwischen eng verwandten Stämmen oder zwischen verschiedenen AMF-Spezies zu überwachen oder die chemische (pH-Wert) oder biologische Umgebung zu verändern (Einführung von Nematoden, Bakterien, Pilzen). Auch verschiedene mykotrophe Wirtspflanzen können genutzt werden, um die AM-Pilze mit Photosynthesen zu versorgen. Die Nährlösung mMS-1 wurde aus der von Bécard und Fortin (1988)15 beschriebenen Minimal-(M)-Medium-Rezeptur abgeleitet, abzüglich der Saccharose, der Vitamine und des Bacto-Agars, um die Kohlenstoffquellen zu begrenzen. Das SAP-AS kann jedoch je nach Versuchszielen mit verschiedenen Nährlösungen ergänzt werden.
Die Vermehrung von AM-Pilzen in SAP-AS erfordert regelmäßiges Gießen. Das begrenzte Volumen an Vermiculit und SAP setzt die Wurzeln und den AM-Pilz Schwankungen der Feuchtigkeit aus, insbesondere in Standard-Petrischalen mit zwei Kammern (10 cm Durchmesser). Die Expansionsfähigkeit und damit die Transparenz der SAP-Körner nimmt mit der Zeit ab. Tatsächlich schränkt das Vorhandensein von Kationen aus der Nährlösung die Ausdehnung des Acrylatnetzwerks nach und nach ein und erfordert den Austausch des SAP nach Monaten. Darüber hinaus können Grünalgen und Schimmel mit der Zeit wachsen, wenn Petrischalen nicht richtig vor Licht geschützt oder überwässert werden.
Bisher wurden sieben AM-Pilzarten erfolgreich in SAP-AS kultiviert, was weit unter der Anzahl der AM-Pilzarten liegt, die in Topfkulturen vermehrt werden können. Sowohl die biotischen als auch die abiotischen Bedingungen in SAP-AS sind jedoch denen in Topfkulturen sehr ähnlich, und es ist wahrscheinlich, dass andere AM-Pilzarten in der Lage sein sollten, sich in SAP-AS zu vermehren. Die direkte Inokulation von Sporen in SAP-AS bietet aufgrund des Vorhandenseins von Wurzelexsudaten und/oder Bakterien wahrscheinlich Umweltbedingungen, die denen der Rhizosphäre in einem natürlichen Boden ähneln, wenn unsterile Sporen/Samen für die Inokulation verwendet werden. Dies sollte der Inokulation mit gekeimten Sporen vorzuziehen sein. Darüber hinaus sind die Bedingungen, die die Sporenkeimung innerhalb von AMF auslösen, noch wenig verstanden, so dass mit mMS-1-Nährlösung hydratisiertes SAP möglicherweise nicht an die Keimung von Sporen anderer AM-Pilzarten angepasst ist. Die Sporenkeimung auf SAP, das mit mMS-1-Nährlösung hydratisiert wurde, wurde getestet, um spezifisch lebensfähige Sporen für den Inokulationsschritt auszuwählen, wobei nur R. irregularis inoculum verwendet wurde.
Die Inokulation und das Monitoring der Entwicklung der AM-Symbiose sind in SAP-AS einfach durchzuführen. Die modifizierten Zwei-Kompartiment-Petrischalen ermöglichen die Kultivierung verschiedener AM-Pilzarten. Paré et al.12 haben sieben verschiedene AMF-Arten aus sechs Gattungen und drei Familien vermehrt. Die Modifikation von Petrischalen mit zwei Kammern ist mit kostengünstigen Werkzeugen leicht zu bewerkstelligen. Die Kosten und die Menge an Materialien (Vermiculit, SAP, Pasteur-Pipette usw.) und Reagenzien (mMS-1), die für die Vorbereitung und Wartung des SAP-AS erforderlich sind, sind begrenzt, so dass eine große Anzahl von SAP-AS zu minimalen Kosten verwaltet werden kann. Die Möglichkeit, das SAP-AS zu stapeln, reduziert auch den Fußabdruck von AM-Pilzkulturen im Vergleich zu Topfkulturen erheblich. So passen z.B. 50 SAP-AS (5 Zehnerstapel) auf ein 1 m langes Regal (Ergänzende Abbildung 2). Diese Eigenschaften machen das SAP-AS zu einer einfachen und kostengünstigen Technik, die mit dem Unterrichten von AM-Symbiose in Gymnasiallaboren oder im Grundstudium an Universitäten kompatibel ist. Besiedelte Körner von SAP können zur Inokulation neuer SAP-AS- oder Topfkulturen verwendet werden.
Das Vorhandensein eines Deckglases auf der Rückseite des Bodens der Petrischale ermöglicht hochauflösende Fotografien und Videos der extraradikalen Pilzstrukturen. Die zytoplasmatische Strömung kann leicht unter Lebensbedingungen untersucht werden, die den natürlichen Bedingungen sehr nahe kommen. Dies ist von großer Bedeutung für die Untersuchung der Funktionen von AM-Pilzen in Bezug auf ihre Myzelien (Nährstoffe, Wassertransport, Bodenstruktur usw.) und für Studien der Hyphenmorphogenese.
AMF vervollständigen ihren biologischen Zyklus in den Pflanzenwurzeln und in der Rhizosphäre. Die Untersuchung von Bodenmikroorganismen ist komplex, da es inhärent schwierig ist, die Bodenumgebung zu beobachten. Das Hauptziel des SAP-AS ist es, eine der Rhizosphäre möglichst ähnliche Umgebung für die Vermehrung von AM-Pilzen zu schaffen und gleichzeitig die Möglichkeit zu erhalten, die Entwicklung der AM-Pilze sehr detailliert zu beobachten. Da dies unsterile Bedingungen impliziert, sollte die Menge an verfügbarem Kohlenstoff begrenzt werden, um die Vermehrung saprotropher Mikroorganismen zu vermeiden. Das Wissen über das Verhalten von AM-Pilzen in der Rhizosphäre ist noch äußerst begrenzt, und das SAP-AS bietet die Möglichkeit, detaillierte Vergleiche zwischen Arten hinsichtlich ihrer Fähigkeit zur Nahrungssuche in der extraradikalen Umgebung, ihrer Sporenproduktion und ihrer Wurzelbesiedlung anzustellen. Dies kann durch das Hinzufügen von Wechselwirkungen mit anderen Bodenarten wie Bakterien, Nematoden, Protisten und Wurzelpilzpathogenen weiter erschwert werden, und das Wissen über die Wechselwirkungen zwischen Bodenmikrobiota kann dank des SAP-AS verbessert werden.
The authors have nothing to disclose.
Wir danken den beiden anonymen Gutachtern für ihre Anregungen. Die Finanzierung dieser Forschung wurde von Agriculture and Agri-Food Canada (AAFC) im Rahmen des Projekts J-002295 (Management and enhancement of AAFC’s biological collections) bereitgestellt.
100 x 15 mm Stackable Bi-Plate | Kord Valmark | 1204U09 | https://www.thomassci.com/Laboratory-Supplies/Petri-Dishes/_/100-x-15-mm-Stackable-Bi-Plate |
12-well plate | Greiner Bio-one | 665180 | https://shop.gbo.com/en/row/products/bioscience/cell-culture-products/cellstar-cell-culture-multiwell-plates/665180.html |
18 mm round glass coverslips | Fisher Scientific | 12-545-100 | https://www.fishersci.com/shop/products/fisherbrand-cover-glasses-circles-11/12545100#?keyword=12-545-100 |
20 mL Syringe PP/PE without needle | Millipore Sigma | Z683620-100EA | https://www.sigmaaldrich.com/CA/en/product/aldrich/z683620?utm_source=google&utm_medium= cpc&utm_campaign=20674735406 &utm_content=157607444391&gc lid=Cj0KCQiA5rGuBhCnARIsAN11 vgQOT_WPRg9WFyBEyoO4b0x1 -F7Tks4houU7VTRS5EiYM9l0F-B oL7saAmFoEALw_wcB |
Acupuncture needle | Lierre | A143-LP1-3075 | https://www.lierre.ca/products/lierre-plus-acupuncture-needles-100pcs?gad _source=1&gclid=Cj0KCQiA5rGuBh CnARIsAN11vgTwupmw51UTdR k9cKr4ewi12W3dyVikenzH3sjdUB4 g41G-_KnvppoaAkbTEALw_wcB& utm_campaign=PMax-needles&utm_content=shopify_CA_ 5213169090694_35001500991622 &utm_medium=cpc&utm_source= google&variant=35001500991622 |
Blotting paper | FLINN | FB0678 | https://www.flinnsci.ca/blotting-paper-12-x-19-pkg.-of-10/fb0678/ |
Commercial or scientific blender or kitchen hand blender | kitchenaid | KHBV53DG | https://www.kitchenaid.ca/en_ca/countertop-appliances/hand-blenders/hand-blender-products/p.variable-speed-corded-hand-blender.khbv53dg.html |
Dremel 199 Carving Bit | Dremel | 2615000199 | https://www.dremel.com/ca/en/p/199-2615000199 |
Dry SAP medium granulometry 1–2 mm | HORTA-SORB MD | 00810085242789 | https://www.horticulturalalliance.com/product/horta-sorb-md-granule/ |
Feather Stainless-Steel Blades for Dissecting Knife Handles | Fisher Scientific | 08-916-5B | https://www.fishersci.ca/shop/products/graham-field-stainless-steel-blades-dissecting-knife-handles-8/089165b |
Glass Pasteur pipettes 230 mm | Kimble | RK-25554-14 | https://www.coleparmer.ca/i/dwk-life-sciences-kimble-disposable-pasteur-pipettes-plugged-end-borosilicate-glass-230-mm-1000-cs/2555414 |
Ink | Sheaffer | 94321 | https://www.amazon.com/Sheaffer-Skrip-Bottled-Black-94231/dp/B002IKKKUU |
Melting guide: modified paint Scraper, 2-in | Mastercraft | #049-7335-8 | https://www.canadiantire.ca/en/pdp/mastercraft-carbon-steel-flexible-spackling-putty-knife-wall-paint-scraper-2-in-0497335p.0497335.html?loc=plp |
Microscopy glass slide | Fisher Scientific | 12-552-5 | https://www.fishersci.com/shop/products/fisherbrand-frosted-microscope-slides-4/125525 |
Nitex nylon mesh filter screen | Dynamic Aqua-Supply Ltd. | NTX30-108 | https://dynamicaquasupply.com/products/nitex-screen?_pos=1&_sid=ffc105328&_ss=r& variant=6945749106731 |
Paper clip | Makanu | Clips-BK-41mm-24 | https://www.amazon.ca/classeur-standard-grandes-trombones-excellentes |
Parafilm | Avantor/vwr | 470201-930 | https://www.avantorsciences.com/ca/en/product/8882964/parafilm |
Plantago lanceolata seeds | ecoumene | NA | https://www.ecoumene.com/produit/semences/herbacees/plantain-lanceole-bio/ |
Polyvinyl alcohol-lactic acid-glycerol (PVLG). | NA | NA | https://invam.ku.edu/recipes |
Pyrography kit with fine tip | Walnut Hollow | 483103 | https://www.walnuthollow.com/collections/creative-wood-burning/products/walnut-hollow-creative-versa-tool |
Silicone sealant | Aqueon | 100165003 | https://www.aqueon.com/products/aquariums/silicone-sealant |
Surgeon scalpel handle | Fisher Scientific | 22-079657 | https://www.fishersci.ca/shop/products/surgical-design-scalpel-handles-blades/22079657#?keyword=scalpel |
Two Speed Rotary Tool Kit | Dremel | 200-1/21 | https://www.dremel.com/ca/en/p/200-1-21-f0130200ah |
Vermiculite | PRO-MIX | 4981110 | https://www.canadiantire.ca/fr/pdp/vermiculite-pro-mix-9-l-0597936p.0597936.html |
X1000 Round Coverslip dia. 30 mm #1 (0.13–0.16 mm) | Fisher Scientific | 12164692 | https://www.fishersci.fi/shop/products/x1000-cover-slip-diam-30-mm-n-1-1/12164692 |