Deneysel otoimmün ensefalomiyelit (EAE), multipl sklerozun bir hayvan modeli olarak hizmet eder. Bu makalede EAE’de spinal kord inflamasyonu, demiyelinizasyon ve aksonal yaralanmayı skorlamaya yönelik bir yaklaşım anlatılmaktadır. Ek olarak, canlı farelerde aksonal hasarın değerlendirilmesini kolaylaştıran, fare serumundaki çözünür nörofilament ışık seviyelerini ölçmek için bir yöntem sunulmaktadır.
Deneysel otoimmün ensefalomiyelit (EAE), multipl sklerozun (MS) yaygın immün temelli bir modelidir. Bu hastalık kemirgenlerde, miyelin kılıfının protein bileşenleri ve Tam Freund adjuvanı (CFA) ile aktif bağışıklama yoluyla veya miyelin proteini / CFA ile hazırlanmış kemirgenlerden miyelin spesifik T efektör hücrelerinin saf kemirgenlere aktarılmasıyla indüklenebilir. EAE’nin şiddeti tipik olarak artan felç derecesini ölçen 5 puanlık bir klinik ölçekte puanlanır, ancak bu ölçek EAE’den iyileşme derecesini değerlendirmek için uygun değildir. Örneğin, inflamasyonun çözülmesine rağmen bazı EAE modellerinde (örneğin, miyelin oligodendrosit glikoprotein [MOG] peptit kaynaklı EAE modeli) klinik puanlar yüksek kalmaktadır. Bu nedenle, klinik skorlamayı, merkezi sinir sisteminde (MSS) hücresel hasarın altında yatan mekanizmaları incelemek için bir araç sağlayan EAE’nin histolojik skorlaması ile tamamlamak önemlidir.
Burada, farelerden omurilik ve beyin kesitlerini hazırlamak ve boyamak ve omurilikte inflamasyon, demiyelinizasyon ve aksonal hasarı puanlamak için basit bir protokol sunulmaktadır. Omurilikte lökosit infiltrasyonunu skorlama yöntemi, EAE’de beyin inflamasyonunu skorlamak için de uygulanabilir. Canlı farelerde genel CNS hasarının derecesi hakkında geri bildirim sağlayan bir Küçük Molekül Testi (SIMOA) testi kullanılarak farelerin serumundaki çözünür nörofilament ışığını (sNF-L) ölçmek için bir protokol de açıklanmaktadır.
Deneysel otoimmün ensefalomiyelit (EAE), insan demiyelinizan hastalığı Multipl Skleroz (MS) için en yaygın fare modelidir1. IFN-γ (gama) ve IL-17 üreten T yardımcı hücrelerinin2 infiltrasyonu, inflamatuar monositlerin3 infiltrasyonu, perivasküler ve submeningeal inflamatuar demiyelinizan lezyonların4 oluşumu ve merkezi sinir sisteminde (MSS) akson hasarı4 oluşumunu içeren klasik MS inflamatuar patolojisi de EAE 5,6,7,8,9’da gözlenir. EAE ve MS arasındaki immün mekanizmalardaki benzerlik, EAE’yi MS için natalizumab, fingolimod, dimetil fumarat ve glatiramer asetat dahil olmak üzere bir dizi onaylanmış immün temelli tedavinin etkinliğini ve etki mekanizmalarını test etmek için uygun bir klinik öncesi model haline getirmiştir (1,5’te gözden geçirilmiştir). Bazı EAE rejimleri, beyinde submeningeal inflamasyon, kronik demiyelinizasyon, omurilik atrofisi, sinaps ve nöron kaybıdahil olmak üzere aksonal hasarın ötesinde ilerleyici MS patolojisinin diğer yönlerini modellemektedir 6,10,11,12. Bu nedenle, EAE, MS için nöroprotektif tedavilerin etkinliğini taramak için faydalıdır.
EAE, kemirgenlerde çeşitli şekillerde indüklenir. Aktif bağışıklama en yaygın indüksiyon yöntemidir ve kemirgenlerin ısıyla öldürülmüş Mycobacterium tuberculosis13 ile desteklenmiş CFA’da emülsifiye edilmiş miyelin antijenleri (tam proteinler veya peptitler) ile aşılanmasını içerir. Farenin türüne bağlı olarak, boğmaca toksini (PTX), hastalığın penetransını artırmak için aşılamanın 0. ve 2. gününde de uygulanır13. EAE ayrıca, miyelin / CFA primli farelerden elde edilen miyelin spesifik T hücrelerinin sağlıklı farelere14 evlat edinilerek aktarılmasıyla indüklenebilir veya ana miyelin antijenlerine özgü T hücresi reseptörlerini aşırı eksprese eden farelerde kendiliğinden gelişebilir5.
EAE hastalığının şiddeti ve ilerlemesi genellikle ayrı bir 5 puanlık klinik ölçek kullanılarak puanlanır: 1 – kuyruk gevşekliği, 2 – arka bacak veya ayak güçsüzlüğü, 3 – bir veya her iki arka bacakta tam felç, 4 – ön ayak zayıflığı, 5 – can çekişen veya ölü13. Bu klinik skorlama sistemi, hastalık başlangıcında ortaya çıkan artan felcin ilerlemesini belgelemede sağlamdır, ancak CNS inflamatuar ataklarından iyileşme derecesini yakalamada daha az hassastır. Örneğin, hem zorlukla yürüyen farelere hem de kolayca yürüyen ancak ayak kavrama zayıflığı sergileyen farelere EAE ölçeğinde 2 puan verilir. Kalıcı akson hasarı veya kaybının varlığına bağlı olarak, enflamatuar yanıtın çözülmesine rağmen EAE’nin akut sonrası fazında skorlar yüksek kalabilir9. EAE 9,16,17,18’de klinik eksikliklerdeki farklılıkları daha iyi yakalamak için daha rafine skorlama sistemleri, davranış testleri, arka bacak ve kavrama gücü ölçümleri ve kızılötesi izleme sistemleri geliştirmeye yönelik çeşitli girişimlerde bulunulmuştur; Bununla birlikte, bu daha karmaşık skorlama ölçümleri, altta yatan nörolojik defisitlere karşı doku hasarına karşı inflamasyonun katkısını ayırt etmemektedir. Bu nedenle, EAE’nin şiddetini skorlamak için altın standart yaklaşım hem klinik hem de histolojik skorlama yapmaktır.
Burada, fare omuriliği ve beyin örneklerinin, EAE’de meydana gelen stokastik lezyon oluşumu sürecini yakalayacak şekilde parafine nasıl kesileceği ve gömüleceği için bir protokol açıklanmaktadır. Orijinal olarak Kluver ve Barrera19 tarafından oluşturulan ve CNS’deki miyelini tespit eden Luxol fast blue (LFB) ile bölümlerin nasıl boyanacağına dair bir protokol de sunulmaktadır. Kesitler ya tek başına LFB ile boyanır (demiyelinizasyon analizi için) ya da enflamatuar lezyonları görselleştirmeye ve skorlamaya yardımcı olmak için hematoksilen ve eozin (H&E) ile boyanır. Ticari olarak temin edilebilen antikorlar, immünohistokimyasal (IHC) teknikler ve halka açık yazılımlar kullanılarak omurilikteki toplam lökositlerin (CD45), miyelin kaybını ve yaralı akson sayısını (SMI-32) ölçmek için protokoller de sağlanmıştır. Omurilikteki lökositleri ölçmek için kullanılan protokol, beyindeki lökositleri ölçmek için de uygulanabilir.
Beyindeki aksonal kayıp ve hasarın histolojik değerlendirmesi, beyin beyaz cevher yolları birbirine paralel çalışmadığı için omurilikten nispeten daha zordur. Serum nörofilament ışığının (sNF-L) ölçümü, MS20,21’de nöronal hasar için umut verici bir biyobelirteç olarak ortaya çıkmıştır. Son çalışmalar bu teknolojiyi EAE 22,23,24’e genişletmiştir. Burada, bir Küçük Molekül Testi (SIMOA) testi kullanılarak canlı farelerde serum nörofilament ışığını (sNF-L) ölçmek için bir yöntem sunulmaktadır. Bu yöntem sadece az miktarda serum gerektirir ve canlı farelerde sadece yarım gün içinde yapılabilir ve test edilen bir tedavinin genel CNS hasarını nasıl etkilediğine dair hızlı geri bildirim sağlar. Burada açıklanan yöntemlerin tümü, herhangi bir cinsiyet veya suştaki farelere uygulanabilir.
Omuriliğin histolojik boyanması, özellikle hastalığın akut sonrası fazında hastalığın iyileşme derecesinde tedavi grupları arasında farklılıklar olduğu durumlarda, EAE hastalığının ciddiyetini değerlendirmede önemli bir araçtır. İmmün hücre infiltrasyonu (CD45), miyelin (LFB) ve aksonal hasar (SMI-32) için boyama, farelerde değişen klinik skorların altında yatan nedeni karakterize etmeye yardımcı olur. Burada tarif edilen histolojik boyama protokolü, miyelin ve aksonal hasarın derecesinin yanı sıra inflamasyonun bir perspektifini sağlar. Ayrıca, gösterilen sonuçlar, EAE’deki genel nöronal hasarın derecesini değerlendirmek için bir yöntem olarak sNF-L ölçümünü doğrulamaktadır.
Bu analiz için kritik parametreler, araştırmacıların bölümlerin kimliğine kör olmalarını ve farklı fareler arasında omuriliğin her seviyesinde eşdeğer örnekleme olmasını sağlamaktır. Bunun nedeni, inflamasyonun şiddetinin kordonun daha düşük seviyelerinde daha yüksek olabilmesidir. Bir diğer kritik parametre ise deney gruplarının büyüklüğüdür. Omurilikler ve beyinler, mütevazı etki boyutlarına sahip tedaviler veya genotiplere sahip gruplar arasında önemli farklılıklar görmek için tipik olarak son noktada grup başına 6-8 fareden toplanır. Seçilen farelerin, ortalaması alındığında, tüm grubun temsili ortalama puanlarına sahip olmasını sağlamak da önemlidir. Sorun giderme ile ilgili olarak, protokol konusunda deneyimsiz olanların karşılaştığı yaygın bir sorun, omuriliğin yetersiz bir süre boyunca sabitlenmesi ve omurgadan kolayca ekstrüde edilmemesidir. Bu durumda, omurilik, ince makas kullanılarak dikenli süreçler boyunca kırpılarak ve omuriliği ortaya çıkarmak için kolonu açarak kolondan manuel olarak diseke edilebilir. Alternatif olarak, dokular antikor boyamanın başarısına müdahale etmeden birkaç gün daha sabitlenebilir. Burada tarif edilen antikor klonları, formalin içinde 2 haftaya kadar sabitlenmiş dokuda çalışır.
Omurilik parçalarını gömmek beceri ve pratik gerektirir. Bölümlerin enine kesitte mi yoksa uzunlamasına kesitte mi düştüğünü daha iyi görselleştirmek için göz luplarının takılması ve gömme istasyonunun üzerine bir lamba yönlendirilmesi önerilir. Omurilik parçalarının boylarının brütlenme sırasında 2 mm’den az tutulması, enine kesitte düşmelerine yardımcı olacaktır. Daha az deneyimli kullanıcılar için karşılaşılan bir diğer yaygın sorun, LFB’nin gece boyunca inkübasyon sırasında buharlaşması ve lamın yarısının lekeli ve yarısının lekesiz kalmasıdır. Buharlaşmayı önlemek için, cam boyama kabı termoplastik film ve ardından plastik sargı ile kapatılmalıdır. Buharlaşma meydana gelirse ve bölümler eşit olmayan şekilde lekelenirse, slaytların lityum karbonat ile tamamen maviden arındırılması ve gece boyunca LFB’de tekrar boyanması önerilir. Diğer bir yaygın sorun, kullanıcıların LFB’den sonra gri maddeyi tamamen maviden arındırmamasıdır. Protokoldeki diğer adımlara geçmeden önce yeterli miktarda mavilikten arındırmaya ulaşıldığından emin olmak için mikroskop altında tek tek bölümleri incelemek çok önemlidir. Ek olarak, CD45 ve SMI-32 IHC boyaları sağlam bir performans gösterse de, alınan her yeni antikor lotu için ön deneylerde antikor konsantrasyonlarını kontrol etmek hala önemlidir. Bu, pozitif bir kontrol bölümünde (EAE omuriliği) çeşitli antikor konsantrasyonlarının test edilmesiyle yapılabilir. İlk kez boyama, primer antikor eklenmeden tek başına sekonder antikordan oluşan negatif bir kontrol de içermelidir. Son olarak, slaytlar veya bölümler arasında boyama eşit olmayabileceğinden, görüntü analizinde tek tek görüntülerin eşiklenmesi çok önemlidir.
Bu protokol ücretsiz olarak kullanılabilen yazılımları kullanır. Bir işlemciye, katıştırıcıya veya mikrotoma erişiminiz yoksa, bu adımlar bu hizmetleri sunan hastane tabanlı bir patoloji çekirdeğine kaynaklanabilir. Ayrıca, bir slayt tarayıcıya erişiminiz yoksa, omurilik veya beyin bölgelerinin TIFF görüntülerini kaydetmek için bir video kamera ile donatılmış bir ışık mikroskobu kullanılabilir. Mikroskop tabanlı bir iş akışı için, LFB veya LFB/H&E kesitlerini düşük güçte (40x büyütme) yakalayın ve CD45 ve SMI-32 boyama için, omuriliğin ventral, dorsal ve lateral kısımlarında ortalanmış en az dört pencereyi görüntüleyin (CD45 için 200x büyütme ve SMI-32 için 400x büyütme). Lekelenmeyi tarif edilene benzer şekilde ölçmek için bu görüntüler üzerinde görüntü analizi yapılabilir.
EAE’yi skorlamak için hangi histolojik yaklaşımın benimseneceği kararı, klinik skorların gruplar arasında ne kadar farklılık gösterdiğine bağlıdır. Örneğin, EAE klinik skorunda ciddi farklılıklar varsa (bir grup EAE aldı ve bir grup almadı), bu genellikle periferik aracılı inflamasyondaki farklılıklarla ilgilidir. Bu durumda, LFB/H&E boyalı kesitlerde demiyelinizan lezyonların varlığı için skorlama yeterlidir ve gruplar arasındaki farklılıkları ortaya koyacaktır. Gruplar başlangıçta klinik skorda daha benzerse ve bunun yerine klinik iyileşme derecesinde farklılıklar varsa (örneğin, Şekil 5A’daki deney), hastalık kronikliğindeki farklılıkların inflamasyon veya doku hasarındaki farklılıklarla ilişkili olup olmadığını ayırt etmek için beyin sapı ve beyincikteki beyin iltihabının skorlanması da dahil olmak üzere burada özetlenen tam histolojik iş akışını uygulamak en iyisidir. CD45 sayımı ile değerlendirildiği gibi inflamasyondaki farklılıklar bulunursa, T hücreleri (anti-CD3), infiltre eden monosit / makrofajlar (Mac3) ve mikroglia (Iba-1 / TMEM119) için boyama yapmak için daha fazla IHC çalışması yapılabilir (önerilen antikor klonları Ek Tablo 3’tedir). Mikroglia aktivasyonu, çift etiketli Iba-1+TMEM-19+ mikroglia üzerinde Iba-1 boyamanın yoğunluğundaki bir artış ve bölüm32’de Sholl analizi ile değerlendirilebilen mikroglia süreçlerinin artan geri çekilmesi ile yansıtılır. Ayrıca, beyin ve omurilikteki bağışıklık popülasyonlarının sıklığı ve fenotipinin daha derin bir karakterizasyonunu yapmak için akış sitometrisi veya tek hücreli RNA dizilimi gibi teknikler uygulanabilir.
SMI-32+ aksonlarının sayımı, EAE 32,33 ve MS34’te akson hasarını tespit etmek için hassas bir yöntemdir. SMI-32, kesilen nörofilamentlerin uç ampullerinde biriken ağır veya orta fosforile olmayan nörofilament formunu tespit eder. Yaralı aksonları tespit etmenin bir alternatifi, akson taşınmasının bozulmasının bir sonucu olarak aksonlarda birikebilen amiloid öncü proteini (APP) ile boyamadır33. SMI-32 ve APP için boyama paterni, her ikisi de akson hasarını yansıtsa da, tipik olarak örtüşmez, bu da farklı patolojileri tespit ettiklerini gösterir33. Hem omurilikte hem de beyinde devam eden aksonal hasarın hızlı ve hassas bir ölçüsü olan sNF-L’yi ölçerek akson hasarının histolojik ölçümleri de tamamlanabilir. Canlı farelerde yarım günde yapılabilmesi avantajını sunar. Bu yöntemin bir dezavantajı, kitlerin pahalı olması ve makinenin oldukça uzmanlaşmış olmasıdır. sNF-L kitini satan şirket, SIMOA makinesine erişimi olmayanlar için servis ücreti sunuyor. Akson hasarını değerlendirmenin bir alternatifi, omuriliğin12 toluidin mavisi lekeli bölümlerindeki aksonları sayarak veya omurilik beyaz cevheri32 alanlarında SMI-31 tarafından tespit edilen nörofilament demetlerini sayarak akson kaybını puanlamaktır. Bunların her ikisi de SMI-32 veya sNF-L ölçümünden daha zahmetli yaklaşımlardır.
EAE klinik skorları gruplar arasında farklılık gösteriyorsa, ancak inflamasyon, demiyelinizasyon ve aksonal hasar için skorlama gruplar arasında farklılıklar ortaya koymuyorsa, GFAP kullanarak astrosit aktivasyonu için boyama yapmak yararlı olabilir (önerilen antikor klonu için Ek Tablo 3’e bakınız). Astrosit aktivasyonu, GFAP boyamasında bir artış ile ilişkilidir ve bunun, DA sıçanındaki kronik EAE dahil olmak üzere bazı EAE modellerinde EAE ilerlemesi ile ilişkili olduğu gösterilmiştir35.
Sonuç olarak, bu protokol EAE’nin histolojik skorlamasını yapmak için yöntemleri açıklar ve bir analiz iş akışı sağlar.
The authors have nothing to disclose.
Dr. Raymond Sobel’e (Stanford Üniversitesi) beyin ve omurilik bölümlerini küçültme ve düzeltme yöntemini gösterdiği için teşekkür ederiz. Toronto Fenogenomik Merkezi’nden Kyle Roberton ve Milan Ganguly’ye gömme yöntemini öğrendikleri ve beyin ve omurilik bölümlerimizin çoğunu kestikleri için teşekkür ederiz. Dr. Matthew Cussick ve Dr. Robert Fujinami’ye (Utah Üniversitesi) omurilikte submeningeal ve perivasküler inflamasyonu puanlama protokollerini paylaştıkları için teşekkür ederiz. CD45 antikorunun klonunu paylaştığı için Shalina Ousman’a teşekkür ederiz. Xiofang Lu’ya doku işlemcisi ve doku gömme istasyonu eğitimi ve bu ekipmanın St. Michael Hastanesi’ndeki Keenan Biyomedikal Araştırma Merkezi’ndeki bakımı için teşekkür ederiz. Bu çalışma, MS Kanada’dan (SED’ye) bir Biyomedikal hibe ile desteklenmiştir. Carmen Ucciferri, Kanada Hükümeti’nden bir öğrenci tarafından desteklenmektedir. Nuria Alvarez-Sanchez, Keenan doktora sonrası bursu tarafından desteklenmektedir.
10% Neutral Buffered Formalin | Sigma Aldrich | HT501128-4L | Used to fix spinal cord and brain specimens |
1000 mL Glass Beaker | Pyrex | 1000 | |
15 mL Falcon Tube | Starstedt | 62.554.100 | Fixing and storing spinal cord and brain |
250 mL Erlenmeyer Flask | Pyrex | 4980 | |
500 mL Glass Beaker | Pyrex | 1003 | |
92 mm x 16 mm Petri Dishes | Starstedt | 82-1473-001 | Used in the tissue grossing procedure |
95% Ethyl Alcohol | Commercial Alcohols | P016EA95 | Dehydration and rehydration steps |
ABC Elite Kit | Vector Labratories | PK6100 | Used for immunohistochemistry labeling |
Aqua Hold 2 PAP Pen | Cole Parmer | UZ-75955-53 | Used for drawing around tissue sections in Immunohistochemical Staining |
Avidin/Biotin Blocking Kit | Vector Labratories | SP-2001 | |
Biosafety Cabinet | Any | ||
Biotinylated rabbit anti-rat IgG | Vector Labratories | BA-4000 | Used for CD45 staining |
C57BL6/J Mice | Jackson Laboratory | Stock # 664 | These mice were used in experiments shown in paper. |
Centrifuge | Thermo Fisher Scientific | Sorvall ST Plus | |
CitriSolv | Fisher Scientific | 04-355-121 | Used for de-waxing. Is an alternative to xylene |
DAB Kit | Vector Labratories | SK-4100 | Used for developing in immunohistochemistry |
ddH2O | – | – | |
Disposable Scalpel | Magna | M92-10 | Used for grossing spinal cord and brain |
DWK Life Sciences (Wheaton) glass staining dish | Cole Parmer | UZ-48585-60 | Used for histochemical staining and washes |
DWK Life Sciences (Wheaton) glass staining rack | Cole Parmer | 10061392 | Used for immunohistochemistry and histochemistry |
Eosin Y | Bioshop | 173772-87-1 | Stains cytoplasm |
Feather Microtome Blades | Fisher Scientific | 12-634-1C | Used for sectioning paraffin |
Filter Paper | Whatman | 1001110 | Used to filter the formalin (during grossing) and the luxol fast blue |
Fine Surgical Scissors | Fine Science Tools | 14160-10 | Used to snip brain and the skull |
Fumehood | Any | ||
Gibco DPBS | Fisher Scientific | 14190944 | |
Glacial Acetic Acid | BioShop | ACE333.4 | Used in the luxol fast blue staining procedure |
Histoplex Histology Containers | Starplex Scientific | 565-060-26 | Fixing spinal cord and brain |
Hydrogen Peroxide | Fisher Chemicals | H325-500 | Used to remove endogenous peroxidase in the tissue |
ImageJ | NIH | https://imagej.nih.gov/ij/download.html | |
Kimtech Science Kimwipes | Kimberly Clark Professional | 34155 | Used for immunohistochemistry |
Lens paper | VWR | 52846-001 | Used for trapping spinal cord species in cassette during processing |
Light microscope | Any | ||
Lithium carbonate | Sigma Aldrich | 554-13-3 | De-blueing after luxol fast blue staining |
Luxol blue | Sigma Aldrich | 1328-51-4 | Stains CNS myelin |
M.O.M Immunodetection Kit | Vector Labratories | BMK-2202 | Used to stain SMI-32 |
Methanol | Fisher Chemicals | A454.2 | Used for fixation |
Mayer's Hematoxylin | Electron Microscopy Sciences | 26381-02 | Stains nuclei |
Micro-Adson Forceps with Teeth | Fine Science Tools | 11027-12 | Used for reflecting the skull during dissections |
Microcentrifuge | Eppendorf | Model 5417R | |
Microvette Capillary Tubes CB 300 Z | Starstedt | 16.440.100 | Used for blood collection |
Micrscope Cover Glass | Fisher Scientific | 12545A | Used for coverslipping |
Mini Shaker | VWR | 12620-938 | Used for making buffers |
NF light kit | Quanterix | 103186 | This kit can be used for detection of mouse or human soluble neurofilament in serum |
Nitrile Gloves | VWR | 76307-462 | Safety |
Normal Goat Serum | Vector Labratories | S-1000 | Blocking reagent |
Normal Rabbit Serum | Vector Labratories | S-5000 | Blocking reagent |
OmniSette Tissue Cassettes | Fisher Scientific | M4935FS | Used for embedding spinal cord and brain |
p1000 Pipette and Tips | various | ||
p200 Pipette and Tips | various | ||
Paraffin Embedding station | Leica Biosystems | Model EG1160 | |
Paraplast Tissue Infiltration/Embedding Medium | Leica Biosystems | 39601006 | Used for embedding spinal cord and brain |
Permount Mounting Medium | Fisher Chemicals | SP15-100 | Used for mounting coverslips on slides |
pH meter | Fisher Scientific | 13636AB315B | Used for pHing buffers |
Plastic Transfer Pipettes | Fisher Scientific | 13-711-20 | Used for pHing buffers |
Potassium Chloride | BioShop | 7447-40-7 | Used for making PBS |
Potassium Phosphate Monobasic | BioShop | 7778-77-0 | Used for making PBS |
Pressure Cooker | Nordic Ware | Tender Cooker | |
Purified rat anti-mouse CD45 | Vector Labratories | 553076 | Detects leukocytes |
Reagent grade alcohol 100% | VWR | 89370-084 | Dehydration and rehydration steps |
Reagent grade alcohol 70% | VWR | 64-17-5 | Dehydration and rehydration steps |
Rotary Microtome | Leica Biosystems | Model RM2235 | |
Simoa Machine | Quanterix | HD-X | |
Slide Scanner | Zeiss | AxioScan.Z1 | |
SMI-32 mouse IgG1 antibody | Biolegend | 801701 | Detects damaged axons |
Sodium Chloride | BioShop | 7647-14-5 | Used for making PBS |
Sodium Phosphate Dibasic | Bioshop | 7558-79-4 | Used for making PBS |
Standard Adson Forceps | Fine Science Tools | 11150-10 | Used for dissection steps |
Superfrost Plus Microscope slides | Fisher Scientific | 12-550-15 | Used to collect sections |
Surgical Tough Cuts | Fine Science Tools | 14110-15 | Used to cut through the spine, body wall, and skin |
Tissue Processor | Leica Biosystems | Model TP1020 | |
Tri-soldium citrate | Thermo Fisher Scientific | 03-04-6132 | Used for antigen retrieval |
Tween-20 | BioBasic | 9005-64-5 | Used for washing sections |
X-P Pierce XP-100 plate seal | Excel Scientific | 12-140 | Used for the sNF-L Assay |
Xylene | Fisher Chemicals | 1330-20-7 | Used for de-waxing and clearing sections |
Funnel | Cole Parmer | RK-63100-64 | Used to filter formalin before grossing tissue |
Stir Plate | Any | Used to make solutions | |
Oven | Any | Used to bake tissue sections after cutting | |
Parafilm | Bemis | 13-374-10 | Used to seal LFB staining dish |
Microwave | Any | Timing may vary depending on the microwave model | |
Bovine Serum Albumin (BSA) | Sigma Aldrich | 9048-46-8 | Used to make blocking buffer |
1.5 mL Microcentrifuge Tubes | Fisher Scientific | 05-408–129 | Used to store mouse serum samples |
Vortex | Any | Used to prepare samples for sNF-L assay | |
Waterbath | Any | Used to warm enzyme substrate for sNF-L assay |