В данном исследовании представлен метод анализа морфологии митохондрий, основанный на иммуноокрашивании и анализе изображений в тканях мозга мышей in situ. В ней также описывается, как это позволяет обнаруживать изменения в морфологии митохондрий, вызванные агрегацией белков в моделях болезни Паркинсона.
Митохондрии играют центральную роль в энергетическом обмене клеток, и их функция особенно важна для нейронов из-за их высокой потребности в энергии. Поэтому митохондриальная дисфункция является патологическим признаком различных неврологических расстройств, в том числе и болезни Паркинсона. Форма и организация митохондриальной сети очень пластичны, что позволяет клетке реагировать на сигналы и потребности окружающей среды, а структура митохондрий также тесно связана с их здоровьем. Здесь мы представляем протокол изучения морфологии митохондрий in situ на основе иммуноокрашивания митохондриального белка VDAC1 и последующего анализа изображений. Этот инструмент может быть особенно полезен для изучения нейродегенеративных расстройств, поскольку он может обнаруживать тонкие различия в количестве и форме митохондрий, индуцированные агрегатами α-синуклеина, белка, склонного к агрегации, активно участвующего в патологии болезни Паркинсона. Этот метод позволяет сообщить, что дофаминергические нейроны черной субстанции pars compacta, содержащие повреждения pS129, демонстрируют фрагментацию митохондрий (о чем свидетельствует их сниженное соотношение сторон, AR) по сравнению с их здоровыми соседними нейронами в предварительно сформированной модели Паркинсона с внутричерепной инъекцией фибриллы.
Центральная нервная система испытывает сильную потребность в АТФ: нейроны используют АТФ для поддержки ионных градиентов, синтеза нейротрансмиттеров, мобилизации, высвобождения и переработки синаптических везикул, а также для обеспечения локальной трансляции и деградации белков. Более 95% АТФ, используемого мозгом, вырабатывается митохондриями1. Поэтому неудивительно, что митохондриальная дисфункция особенно вредна для нейронов. Фактически, нарушения функции митохондрий играют важную роль в развитии нескольких неврологических заболеваний, включая нейродегенеративные состояния, такие как болезнь Паркинсона (БП) и болезнь Альцгеймера (БА)2,3.
Несколько генов однозначно связаны с белками, кодирующими PD, которые имеют значение для митохондриальной функции и гомеостаза, такими как паркин 4,5,6, PTEN-индуцированная киназа 1 (PINK1)7,8 и DJ-19. Еще одним доказательством роли митохондриальной дисфункции в развитии болезни Паркинсона является то, что лечение ингибиторами комплекса I митохондриальной цепи переноса электронов (такими как ротенон и МФТП) повторяет некоторые аспекты болезни Паркинсона in vitro и in vivo10. Тем не менее, важно отметить, что многие патологические процессы могут приводить к потере нейронов при болезни Паркинсона, наряду с митохондриальным дефицитом: окислительный стресс, изменение гомеостаза кальция, недостаточность убиквитин-протеасомы и аутофагии-лизосомальной систем, а также агрегация белков являются одними из наиболее изученных (рассмотрено в 11,12,13 и).
Митохондрии неоднородны по форме: помимо отдельных единиц, они обычно встречаются в виде протяженных ретикулярных и канальцевых сетей. Структура и расположение клеток митохондрий имеют решающее значение для их функционирования14; На самом деле, митохондриальные сети чрезвычайно динамичны, претерпевая частые процессы деления, слияния и митофагии, чтобы удовлетворить потребности клеток и реагировать на сигналы окружающей среды15,16. Кроме того, морфология митохондрий тесно связана с состоянием их здоровья. Например, при атрофии зрительного нерва человека генетические мутации, снижающие активность митохондрий, приводят к аномальным, тонким и гиперсросшимися митохондриям. С другой стороны, различные заболевания человека имеют аберрантную морфологию митохондрий, включая фрагментацию митохондрий или чрезмерное слияние митохондрий, которые оказывают вредное воздействие на функцию митохондрий (рассмотрено в18). В контексте болезни Паркинсона мы и другие ранее показали, что аномальная форма митохондрий коррелирует с дисфункцией в ответ на агрегаты α-синуклеина19. Несмотря на то, что морфология митохондрий была широко изучена in vitro как в контексте болезни Паркинсона, так и в контексте других заболеваний 20,21,22, протоколы оценки морфологии митохондрий из срезов in vivo отсутствуют. Это делает изучение митохондрий in vivo в контексте таких заболеваний, как болезнь Паркинсона, сильно зависимым от трансгенных животныхили оценки экстрактов среднего мозга, которые не могут обеспечить клеточное разрешение.
Представлен протокол изучения морфологии митохондрий in situ как показателя их функционального состояния и здоровья, основанный на иммуноокрашивании митохондриального белка VDAC124 с последующим анализом изображений на срезах тканей, залитых парафином. Мы также показываем результаты этого протокола in vitro и in vivo моделях БП: клетки нейробластомы с гиперэкспрессией SNCA (Synuclein Alpha) и ткани мозга мышей, подвергшихся внутричерепной инъекции α-синуклеиновых предварительно сформированных фибрилл (PFF). Совместное иммуноокрашивание с антителом к α-синуклеину (в клетках) или phosphoSer129-α-синуклеину pS129 (в мозге мышей) позволило идентифицировать в образцах клетки с агрегированной белковой патологией (гиперэкспрессия фибрилл α-синуклеина и α-синуклеина соответственно), в то время как отрицательные клетки служили непатологическим контролем в тех же образцах. Благодаря этому анализу и данным, описанным здесь, наблюдалось снижение соотношения сторон, что указывает на фрагментацию митохондрий в клетках с гиперэкспрессией SNCA или с поражениями pS129.
В целом, это исследование показывает, что иммуноокрашивание в сочетании с анализом изображений является надежным методом анализа морфологии митохондрий. Фактически, он позволяет количественно определить количество митохондрий, а также некоторые морфологические параметры, такие как соотношение сторон как в клеточной культуре, так и в тканях. Количество митохондрий напрямую связано с функциональным состоянием механизмов деления и слияния образцов, в то время как величина AR зависит от удлинения органеллы. Этот метод может быть особенно ценным для быстрой оценки митохондриальных аномалий в моделях БП, в которых измененная морфология, динамика и функции митохондрий являются хорошо известными патологическими механизмами28,29. α-синуклеин также играет важную роль в развитии болезни Паркинсона: действительно, α-синуклеин является одним из компонентов телец Леви, цитоплазматических фибриллярных агрегатов, которые используются для посмертной диагностики пациентов с БП30. Кроме того, мутации в гене SNCA были обнаружены у пациентов как со знакомой, так и со спорадической болезнью Паркинсона (обзор в31). Было показано, что фосфорилирование α-синуклеина в Ser129 маркирует патологию, подобную тельцу Леви, которая возникает после инсульта PFF и вызывает различные токсические эффекты32,26.
С помощью представленного здесь инструмента нам удалось обнаружить снижение количества митохондрий и значений AR в присутствии как сверхэкспрессированных, так и агрегированных α-синуклеина (клеток с окрашиванием α-синуклеином и нейронов, несущих фосфоSer129α-синуклеин-положительные поражения, соответственно) по сравнению с клетками, лишенными таких повреждений (α-синуклеин- и фосфоS129α-синуклеин-отрицательных клеток). Эти результаты согласуются с предыдущими отчетами, показывающими, как прямые взаимодействия α-синуклеина-митохондрий оказывают токсическое воздействие на функцию митохондрий и гомеостаз при БД26,33 34. Действительно, сообщалось, что у мышей с мутациями α-синуклеина наблюдается повышенное повреждение митохондриальной ДНК35 и митофагия36,37. Кроме того, было описано, что повышенные уровни α-синуклеина способствуют делению/фрагментации митохондрий, индуцируют активные формы кислорода в митохондриях и нарушают регуляцию экспрессии митохондриальных белков в клеточных линиях и мышиных моделях с гиперэкспрессией α-синуклеина 26,38,39.
Важно подчеркнуть, что этот инструмент сильно зависит от антител, используемых для исследования; Тщательная морфологическая оценка используемого окрашивания антител является обязательным условием для обнаружения соответствующего субклеточного компартмента. Поскольку этот метод основан на срезах размером 5 мкм и, следовательно, требует одиночных фокальных плоскостей для анализа митохондриальных структур, отсутствие фенотипа не исключает существования фенотипа, так как возможно, что тонкие различия в морфологии митохондрий не могут быть обнаружены этим методом.
Несмотря на то, что в этой и других работах ранее использовались аналогичные подходы для оценки морфологии митохондрий in vivo40, существует необходимость в том, чтобы подробный протокол был доступен для исследовательского сообщества для этой оценки. Значимость данного исследования заключается в том, что этот метод можно применить к различным моделям заболеваний in vivo для оценки митохондриальных морфологических аномалий и выявления потенциальной патологии, что в конечном итоге может облегчить скрининг соединений свинца для лечения таких нарушений. Хотя этот анализ в настоящее время ограничен тканями, залитыми парафином, преимущество метода заключается в том, что он может быть применен к любой модели заболевания после забора терминальной ткани, что делает его очень универсальным инструментом.
The authors have nothing to disclose.
Мы хотели бы выразить признательность спонсорам этого исследования, в частности, Икербаску, Министерству науки и инноваций Испании, Фонду Майкла Джей Фокса, IBRO и Баскскому центру неврологии Ачукарро.
32 G Hamilton syringe | Hamilton | 7632-01 | |
4',6-diamidino-2-fenilindol, dihidrocloruro (DAPI) | Invitrogen | D1306 | |
4/0 USP 45 cm suture | SSa90 pga | 32345n-36u | |
Alexa fluor 488/594-Donkey anti-Mouse | Invitrogen | A21202; A21203 | green/red dye-Donkey anti-Mouse |
Alexa fluor 594/647-Donkey anti-Rabbit | Invitrogen | A21207 A31573 | red/far red dye-Donkey anti-Rabbit |
AlexaFluor 488-Donkey anti-Chicken | Jackson ImmunoResearch | 703-545-155 | green dye-Donkey anti-Chicken |
Anti-PSer129 α-synuclein EP1536Y (Rabbit) antibody | Abcam | ab51253 | |
Anti-TOM 20 (Mouse) antibody | Santa Cruz | sc-17764 | |
Anti-Tyrosine Hydroxylase (Chicken) antibody | Abcam | ab76442 | |
Anti-VDAC1 (Mouse) antibody | Santa Cruz | sc-390996 | |
Anti-α-synuclein antibody MJFR1 (Rabbit) | Abcam | ab138501 | |
Citrate buffer 100X stock: 120mM citrate buffer, 5% Tween in water (pH 6) | Home-made | ||
Disposable base mold for tissue embedding | Fisher | 22-363-553 | Plastic embedding boxes |
D-MEM F12 | Gibco | A321331020 | |
EVOS M7000 Imaging System | ThermoFisher Scientific | High-content automated fluorescence microscope | |
Fetal Bovine Serum | Gibco | 10270106 | |
Flat optical bottom 96 well plates | Greiner | 675090 | |
FluorSave Reagent | Millipore | 345789-20ML | Mounting reagent |
Glutamine 200 mM | Gibco | 25030-024 | |
ImmEdge Hydrophobic Barrier Pen | Vector Laboratories | H-4000 | PAP-pen |
Lipofectamine and Plus Reagent | Invitrogen | 11668-019; 11514-015 | Transfection reagent and transfection adjuvant |
Matrigel | Corning | 354230 | Coating matrix |
Microtome | ThermoFisher Scientific | ||
Normal Donkey Serum | Gibco | PCN5000 | |
Opti-MEM | Gibco | 31985070 | Transfection medium |
PCDNA4 plasmid (backbone) | Addgene | 41036 | |
Penicillin/Streptomycin solution | Gibco | 15140-122 | |
SH-SY5Y cells/well | ATCC | HTB-11 | |
Xylene substitute | Labbox | 22L36504 | |
Zeiss Axio Imager Apotome 2 | Carl Zeiss | Structured illumination fluorescence imaging system | |
α-synuclein peptide | rpeptide | S-1010-2 |