APTrack é um plugin de software desenvolvido para a plataforma Open Ephys que permite a visualização de dados em tempo real e o rastreamento do limiar elétrico em malha fechada de potenciais de ação neuronais. Nós usamos isso com sucesso em microneurografia para nociceptores de fibra C humana e nociceptores de fibra C e fibra Aδ de camundongo.
Nociceptores são uma classe de neurônios aferentes primários que sinalizam estímulos nocivos potencialmente nocivos. Um aumento na excitabilidade do nociceptor ocorre em condições de dor aguda e crônica. Isso produz atividade contínua anormal ou limiares de ativação reduzidos para estímulos nocivos. A identificação da causa desse aumento da excitabilidade é necessária para o desenvolvimento e validação de tratamentos baseados em mecanismos. O rastreamento do limiar elétrico de um único neurônio pode quantificar a excitabilidade do nociceptor. Por isso, desenvolvemos um aplicativo para permitir tais medições e demonstrar seu uso em humanos e roedores. O APTrack fornece visualização de dados em tempo real e identificação do potencial de ação usando um gráfico raster temporal. Algoritmos detectam potenciais de ação por cruzamento de limiares e monitoram sua latência após estimulação elétrica. O plugin então modula a amplitude da estimulação elétrica usando um método up-down para estimar o limiar elétrico dos nociceptores. O software foi construído sobre o sistema Open Ephys (V0.54) e codificado em C++ usando o framework JUCE. Ele roda em sistemas operacionais Windows, Linux e Mac. O código fonte aberto está disponível (https://github.com/ Microneurography/APTrack). Os registros eletrofisiológicos foram obtidos de nociceptores em uma preparação pele-nervo de camundongo usando o método de fibras provocadas no nervo safeno e em voluntários humanos saudáveis usando microneurografia no nervo fibular superficial. Os nociceptores foram classificados pela resposta a estímulos térmicos e mecânicos, bem como pelo monitoramento da lentificação da velocidade de condução dependente da atividade. O software facilitou o experimento simplificando a identificação do potencial de ação através do gráfico raster temporal. Demonstramos o rastreamento do limiar elétrico em malha fechada em tempo real de potenciais de ação de um único neurônio durante a microneurografia humana in vivo, pela primeira vez, e durante registros eletrofisiológicos ex vivo de fibras C e Aδ em camundongos. Estabelecemos uma prova de princípio mostrando que o limiar elétrico de um nociceptor humano sensível ao calor da fibra C é reduzido pelo aquecimento do campo receptivo. Este plugin permite o rastreamento do limiar elétrico de potenciais de ação de um único neurônio e permite a quantificação de mudanças na excitabilidade do nociceptor.
Os nociceptores são neurônios aferentes primários do sistema nervoso periférico que são ativados por eventos evidentes ou potencialmente lesivos aos tecidos e desempenham um papel protetor crítico na dor aguda1. Registros eletrofisiológicos de nociceptores de fibra C e Aδ em modelos animais, voluntários humanos saudáveis e pacientes têm revelado sensibilização e atividade espontânea anormal em diversas condições de dor 2,3,4,5,6,7. A compreensão dos mecanismos subjacentes a essas alterações na excitabilidade do nociceptor em pacientes poderia possibilitar intervenções terapêuticas direcionadas8. No entanto, existem poucos instrumentos para avaliar diretamente a excitabilidade do nociceptor, particularmente em pacientes9, mas o potencial para a utilidade de tais ferramentas é bem reconhecido10,11.
O rastreamento do limiar elétrico do nervo inteiro pode ser usado para examinar a excitabilidade axonal em humanos12. Entretanto, como neurônios periféricos grandes e mielinizados contribuem desproporcionalmente para a amplitude do potencial de ação do composto sensorial, o rastreamento do limiar elétrico do nervo inteiro não permite a avaliação da função das fibras C11,13. De fato, em um estudo anterior, o rastreamento do limiar elétrico do nervo total em coortes de dor neuropática crônica com neuropatia diabética e polineuropatia induzida por quimioterapia não mostrou diferenças na excitabilidade axonal11.
Em um estudo anterior, o rastreamento do limiar elétrico no nível de um único neurônio foi usado para examinar a excitabilidade de nociceptores de fibra C durante registros de fibras provocadas em uma preparação ex vivo pele-nervo de rato14. Os autores demonstraram que o aumento da concentração de potássio, as condições ácidas e a bradicinina aumentaram a excitabilidade do nociceptor da fibra C, refletido por um limiar elétrico reduzido para a geração do potencial de ação. Além disso, o aquecimento do campo receptivo dos nociceptores sensíveis ao calor reduziu seu limiar elétrico, enquanto os nociceptores insensíveis ao calor exibiram um aumento em seu limiar elétrico14. Isso fornece uma prova importante de que o rastreamento do limiar elétrico de um único neurônio é possível e pode ser útil, mas atualmente não há soluções de software e/ou hardware disponíveis para permitir tais investigações, particularmente para estudos em humanos.
Em humanos, a microneurografia é o único método disponível para avaliar diretamente as propriedades eletrofisiológicas das fibras C15. Essa abordagem tem sido utilizada para demonstrar disfunção nociceptora em pacientes com dor crônica 2,3,4,5,6,7. A microneurografia pode detectar potenciais de ação de um único neurônio; no entanto, devido à baixa relação sinal-ruído, os pesquisadores utilizam a técnica de marcação para caracterizar a atividade da fibra C16. Na técnica de marcação, a estimulação elétrica supralimiar é aplicada aos campos receptivos de fibra C na pele. Essa estimulação elétrica gera um potencial de ação que ocorre em latência constante, determinada pela velocidade de condução da fibra C. As fibras C apresentam lentificação dependente da atividade, em que sua velocidade de condução diminui e, portanto, sua latência de condução aumenta durante os períodos de descarga do potencial de ação17. Em condições basais, as fibras C normalmente não geram potenciais de ação na ausência de estímulos nocivos e, portanto, sua latência de condução em resposta à estimulação elétrica de baixa frequência é constante. Estímulos mecânicos, térmicos ou farmacológicos, que evocam disparo, induzem lentificação dependente da atividade, o que aumenta a latência dos potenciais de ação evocados pela estimulação elétrica de baixa frequência concomitante. Isso permite a identificação objetiva das respostas aos estímulos não elétricos aplicados no contexto de uma baixa relação sinal-ruído. Portanto, a lentificação dependente da atividade pode ser usada para caracterizar funcionalmente as fibras C16. De fato, diferentes classes funcionais de fibras C exibem padrões distintos de lentificação dependente da atividade nos paradigmas de estimulação elétrica que envolvem a variação da frequência de estimulação18,19. Essa variabilidade na latência dos potenciais de ação da fibra C representa um desafio para algoritmos projetados para monitorá-los.
A atividade contínua em um nociceptor leva ao aumento da variabilidade em sua latência durante a estimulação elétrica de baixa frequência, e isso é novamente devido à lentificação dependente da atividade. Essa variabilidade aumentada, ou jitter, é uma medida proxy quantificável da excitabilidade2. Outras causas de variabilidade na latência do potencial de ação incluem o flip-flop, em que ramos terminais alternados de um único neurônio são estimulados, o que faz com que o potencial de ação evocado tenha duas (ou mais) latências basais mutuamenteexclusivas 20. Finalmente, mudanças na temperatura dos ramos terminais de um neurônio periférico também causam mudanças na latência do potencial de ação de forma termodinâmica, com o aquecimento aumentando a velocidade de condução e o resfriamento diminuindo a velocidade de condução19. Assim, qualquer software que busque realizar o rastreamento do limiar elétrico em malha fechada de fibras C nociceptivas deve permitir mudanças na latência dos potenciais de ação evocados eletricamente.
Para atingir nosso objetivo de rastreamento de limiar elétrico entre espécies de nociceptores de fibra C, desenvolvemos o APTrack, um plugin de software de código aberto para a plataforma Open Ephys21, para permitir rastreamento de limiar elétrico em tempo real, de malha fechada, e rastreamento de latência. Fornecemos dados de prova de conceito demonstrando que o rastreamento do limiar elétrico do nociceptor de fibra C durante a microneurografia humana é possível. Além disso, mostramos que esta ferramenta pode ser utilizada em eletrofisiologia ex vivo de roedores, possibilitando estudos translacionais entre humanos e roedores. Aqui, descreveremos em detalhes como os pesquisadores podem implementar e usar essa ferramenta para auxiliar seu estudo da função e excitabilidade do nociceptor.
APTrack é um plugin de software para uso com a plataforma Open Ephys. Escolhemos esta plataforma por ser de código aberto, flexível e barata de implementar. Sem incluir o custo do estimulador de corrente constante, todo o equipamento necessário para começar a usar o plugin poderia ser comprado por cerca de US $ 5.000 USD no momento da escrita. Esperamos que isso permita aos pesquisadores implementar o APTrack em seus estudos de eletrofisiologia de nervos periféricos com mais facilidade. Além disso, os pesquisadores podem modificar livremente o software para atender às suas necessidades experimentais. É importante ressaltar que essa ferramenta permitiu o rastreamento do limiar elétrico de nociceptores únicos de fibra C, pela primeira vez, em humanos.
Quanto maior a relação sinal-ruído, melhor os algoritmos conseguem identificar potenciais de ação. A relação sinal-ruído durante a microneurografia foi suficiente na maioria dos nossos registros, mas os usuários devem estar atentos ao risco de degradação do sinal ao longo do tempo. Isso é particularmente importante para protocolos experimentais mais longos, pois se a amplitude do potencial de ação rastreado cair abaixo do limiar de detecção, a amplitude de estimulação será aumentada erroneamente; Isso pode ser atenuado por experimentadores monitorando o plug-in e, em seguida, ajustando as configurações, se necessário. A relação sinal-ruído é melhorada com a filtragem passa-banda, mas transientes maiores ainda podem ser identificados erroneamente como potenciais de ação se chegarem durante a janela de tempo da caixa de pesquisa. O risco de identificar erroneamente o ruído transitório como um potencial de ação pode ser reduzido estreitando a janela de tempo durante a qual o plugin procura potenciais de ação e otimizando as configurações de limite. No entanto, ainda existem situações que podem ser encontradas que impedem o desempenho do plugin. A atividade espontânea pode causar dificuldades se potenciais de ação de maior amplitude estiverem dentro da janela da caixa de pesquisa do algoritmo, pois eles serão erroneamente identificados como o potencial de ação alvo. Além disso, a atividade espontânea no neurônio de interesse pode significar que a estimulação elétrica cai durante seu período refratário, causando falha na geração de um potencial de ação. Dificuldades no uso do software também podem surgir quando neurônios aferentes primários exibem flip-flop, em que ramos terminais alternados de um único neurônio são estimulados, fazendo com que o potencial de ação evocado tenha duas (ou mais) latências basais mutuamenteexclusivas 20. Durante gravações de neurônios exibindo flip-flop com altas relações sinal-ruído, realizamos com sucesso o rastreamento de latência e limiar elétrico aumentando a largura da caixa de pesquisa para encapsular todas as velocidades de condução potenciais que o neurônio exibia. No entanto, o limiar elétrico pode variar dependendo do ramo terminal do neurônio que está sendo excitado, o que é provavelmente em parte devido a diferenças na distância do local da estimulação elétrica para os terminais nociceptores alternativos. Trabalho adicional sobre o processo de identificação do potencial de ação para incluir, por exemplo, a correspondência de modelos é viável e poderia ser integrado a este software. Os plugins GUI para parada de banda ou filtragem de ruído adaptável também podem ser usados a montante do APTrack na cadeia de sinais, caso sejam desenvolvidos.
Consideramos o limiar elétrico determinado como sendo a corrente necessária para eliciar um potencial de ação em 50% das vezes, sobre um número definido pelo usuário de estímulos elétricos, tipicamente 2-10. A morfologia da estimulação elétrica é de 0,5 ms e pulsos positivos de onda quadrada. Isso não é o mesmo que determinar a reobase, uma medida comumente usada de excitabilidade neuronal. O plugin poderia ser adaptado para determinar a reobase. No entanto, buscamos uma medida mais simples, pois mudanças dinâmicas na excitabilidade, como aquelas hipotetizadas para ocorrer durante o aquecimento, teriam sido mais difíceis de quantificar com mudanças de reobase do que nossa estimativa de limiar elétrico.
Este software pode ser usado em experimentos com humanos e roedores. Isso é possível graças ao suporte flexível para os sistemas de estimulação elétrica. O software funcionará com qualquer estimulador que aceite uma tensão de comando analógico ou possa ser interligado manualmente com um motor de passo. Para a microneurografia, foi utilizado um estimulador de corrente constante marcado com CE, projetado para uso em pesquisas humanas e cuja estimulação foi controlada por um mostrador. Estimuladores que aceitam comandos analógicos de tensão podem ser barulhentos, pois não desconectam o circuito entre os estímulos, ou seja, qualquer zumbido ou ruído de 50/60 Hz na entrada analógica será transmitido para a gravação. Um estimulador que requer um sinal de gatilho TLL adicional para conectar o circuito, permitindo que um estímulo em uma corrente análoga à entrada de tensão analógica seja gerado, é ideal para uso com o plugin. Isso evita que o ruído seja transmitido para a gravação entre os estímulos.
O software utiliza um método simples up-down para estimar o limiar elétrico. Isso tem sido usado em testes psicofísicos há muitas décadas25. De acordo com o método up-down, o algoritmo de rastreamento do limiar elétrico para modular a amplitude da estimulação considera apenas a amplitude e a resposta da estimulação anterior no cálculo da amplitude da estimulação seguinte. Isso significa que a amplitude de estimulação oscilará em torno do limiar elétrico verdadeiro, produzindo uma taxa de disparo de 50%, supondo que o limiar seja estável. O tamanho mínimo de um incremento ou decremento é de 0,01 V; isso é equivalente a 0,01 mA supondo que o estimulador tenha uma relação de entrada/saída de 1 V:1 mA e resolução suficiente para conseguir mudanças de passo tão pequenas. O plugin atualizará a estimativa ao vivo do limiar elétrico do potencial de ação alvo toda vez que ele atingir uma taxa de disparo de 50% sobre um número definido pelo usuário de estímulos anteriores (2-10). Post hoc, recomenda-se o uso de uma média móvel da amplitude de estimulação nos últimos 2-10 estímulos para estimar o limiar elétrico, e deve-se notar que essa estimativa só será precisa quando a taxa de disparo for relativamente estável em 50%. Tanto nas estimativas ao vivo quanto nas post-hoc do limiar elétrico, há um equilíbrio entre resolução, confiabilidade e tempo a ser considerado. O uso de etapas menores de incremento e decremento aumentará a precisão da estimativa do limiar elétrico, mas aumentará o tempo necessário para encontrar o novo limiar elétrico inicialmente e após a perturbação. O cálculo do limiar elétrico sobre um maior número de estímulos prévios proporcionará melhor confiabilidade, mas aumentará o tempo necessário para se chegar a uma estimativa precisa.
O APTrack foi projetado para uso em registros de nervos periféricos, especificamente para rastrear os limiares elétricos das fibras C durante perturbações experimentais e patológicas durante períodos em que a latência do potencial de ação pode variar dependendo da atividade neuronal subjacente. Este método permitirá o exame não só da excitabilidade axonal, mas também dos potenciais geradores de nociceptores em voluntários e pacientes saudáveis. Antecipamos que outras áreas da eletrofisiologia podem adotar e adaptar esta ferramenta para uso em qualquer experimento que necessite do rastreamento do limiar elétrico de uma atividade bloqueada por estímulo. Por exemplo, isso poderia ser facilmente adaptado para estimulação optogenética com pulsos de luz acionados a partir do APTrack. O plugin é de código aberto e está disponível para pesquisadores sob uma licença GPLv3. Ele é construído sobre a plataforma Open Ephys, que é um sistema de aquisição de dados adaptável, de baixo custo e de código aberto. O plugin fornece ganchos adicionais para plugins downstream para extrair as informações potenciais de ação e fornecer interfaces de usuário adicionais ou paradigmas adaptativos. O plugin fornece uma interface de usuário simples para a visualização e acompanhamento de latência de potenciais de ação em tempo real. Ele também pode reproduzir dados anteriores e visualizá-los usando o gráfico raster temporal. Além disso, ele também pode executar o rastreamento de latência durante a reprodução de dados anteriores. Embora existam outros pacotes de software disponíveis para rastreamento de latência em tempo real, eles não são de código aberto e não podem executar o rastreamento de limiar elétrico26,27. O APTrack tem uma vantagem sobre os métodos tradicionais de identificação de potenciais de ação de latência constante a partir de traços de tensão, pois usa um gráfico raster temporal para a visualização dos dados. Além disso, nossas experiências de uso em experimentos com baixas relações sinal-ruído indicaram que o método de visualização de gráficos raster temporais permite a identificação de potenciais de ação de latência constante que podem ter sido perdidos.
O rastreamento do limiar do nervo total é um método amplamente utilizado para avaliar a excitabilidade axonal13. O rastreamento do limiar elétrico de um único neurônio em fibras C de roedores tem sido usado anteriormente para quantificar a excitabilidade do nociceptor14, e sua utilidade em humanos é reconhecida10,11; No entanto, até agora, isso não era possível. Nós fornecemos uma nova ferramenta de código aberto para medir diretamente a excitabilidade de um único nociceptor em estudos eletrofisiológicos de nervos periféricos de roedores e humanos. O APTrack permite o rastreamento de limiar elétrico em tempo real, de código aberto, de potenciais de ação de neurônio único em humanos, pela primeira vez. Prevemos que facilitará estudos translacionais de nociceptores entre roedores e humanos.
The authors have nothing to disclose.
Gostaríamos de agradecer aos nossos financiadores por seu apoio: Academia de Ciências Médicas (J.P.D., A.E.P.), Versus Arthritis (J.P.D., A.E.P.), Jean Golding Institute Seedcorn Grant (J.P.D., A.E.P., G.W., A.C.S., M.M.P.) e Biotechnology and Biological Sciences Research Council parceria de treinamento colaborativo doutorado com Eli Lilly (G.W.T.N.). Gostaríamos de estender nossos agradecimentos a todos os colaboradores para o desenvolvimento do APTrack. Também gostaríamos de agradecer aos nossos voluntários que participaram dos experimentos de microneurografia e aos nossos colaboradores do Envolvimento e Engajamento do Paciente e do Público por suas inestimáveis contribuições.
12V DC Power Supply | NA | NA | To power uStepper S-lite. Required for dial-controlled stimulators. |
36 Pin Electrode Adapter Board | Intan Technology | C3410 | APTrack Dependency. For connecting electrode input to headstage. $255 USD as of March 2021. |
APTrack Plugin | NA | NA | https://github.com/Microneurography/APTrack |
Bipolar Ag/AgCl Recording Electrode | Custom | NA | Recording electrode for the skin-nerve preparation. Or equivalent. |
Bipolar Concentric Stimulating Electrode | World Precision Instruments | SNE-100 | For electrical stimulation in the mouse skin-nerve preparation. Or equivalent. |
Bipolar Transcutaneous Stimulating Electrode | Custom | NA | For transcutaneous electrical stimulation while searching for single-neuron action potentials during microneurography. |
BNC T Splitter (1+) | NA | NA | APTrack Dependency. Any standard BNC T splitter. |
BNC to BNC cables (3+) | NA | NA | APTrack Dependency. Any standard BNC cables. |
C6H11NaO7 | Merck | S2054 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
CaCl2 | Merck | C5670 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
Digitimer DS4 Constant Current Stimulator | Digitimer | DS4 | Constant current stiulator for animal research. £1,695 GBP as of September 2022. |
Digitimer DS7 Constant Current Stimulator | Digitimer | DS7A | Constant current stiulator for human research. £3,400 GBP as of September 2022. |
Electroaccupuncture Classic Plus Stimulating Electrodes | Harmony Medical | NA | For fixed position intradermal electrical stimulation of the dorsal aspect of the foot during human microneurography. |
Glucose | Fisher Scientific | G/0450/60 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
HDMI Cable | NA | NA | APTrack Dependency. Any standard passive HMDI cable. To connect OE I/O Board to OE Acquisition Board. |
KCl | Merck | P9541 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
MgSO4 | Acros Organics | 213115000 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
Mineral Oil | Merck | 330779 | Electrical insulation for nerve recordings in th skin-nerve preparation. Or equivalent. |
NaCl | Merck | S9888 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
NaHCO3 | Merck | S6014 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
NaHCO3 | Merck | S0751 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
Open Ephys Acquisition Board | Open Ephys | NA | APTrack Dependency. Includes USB cable to connect to computer and mains socket power supply. €2,955 EUR as of September 2022. |
Open Ephys Graphical User Interface | Open Ephys | NA | https://github.com/open-ephys/plugin-GUI |
Open Ephys I/O Board | Open Ephys | NA | APTrack Dependency. For ADC voltage inputs via BNC cables. €12.5 EUR without connectors, €85 EUR with connectors as of September 2022. |
PulsePal V2 | Sanworks | 1102 | APTrack Dependency. Open-source DAC and train generator. $725 USD pre-assembled as of September 2022. Approx. $275 USD for self-assembly. |
RHD 6ft SPI Cable | Intan Technology | C3206 | APTrack Dependency. For connecting headstage to OE Acquisition Board. $295 USD as of March 2021 |
RHD2216 16ch Bipolar Headstage | Intan Technology | C3313 | APTrack Dependency. For data acquisition and digitization. $725 USD as of March 2021. Or equivalent RHD2000 series headstage. |
Sucrose | Fisher Scientific | S/8560/60 | Skin-nerve preparation synthetic interstitial fluid constituent. Or equivalent. |
TCS-II Thermal Stimulator | QST.Lab | NA | For thermal stimualtion of nociceptor receptive fields during human microneurography. |
Tungsten Microelectrode Pair (Active + Reference) | FHC | 30085 | For microneurography recordings. 35mm. |
Ultrasound Scanner iQ+ | Butterfly Network | NA | For ultrasound-guided electrode insertion during microneurography. |
USB 3.0 5kV RMS Isolation | Inota Technology | 7055-D | For isolating human microneuroography participant from computer. €459 EUR as of September 2022. |
USB-A to micro USB-B cable (2) | NA | NA | APTrack Dependency. To connect computer to PulsePal and to uStepper S-lite if using stepper-stimulator interfacing. |
uStepper S-lite + NEMA17 motor | uStepper | NA | To interface with stimulators via a control dial. €50 EUR as of September 2022. |
Von Frey Filaments | Ugo Basile | 37450-275 | For mechanical stimulation of receptive fields during sensory phenotyping of nociceptors. |