Summary

Isolatie en directe neuronale herprogrammering van muisastryoten

Published: July 07, 2022
doi:

Summary

Hier beschrijven we een gedetailleerd protocol om sterk verrijkte culturen van astrocyten te genereren die zijn afgeleid van verschillende regio’s van het centrale zenuwstelsel van postnatale muizen en hun directe omzetting in functionele neuronen door de geforceerde expressie van transcriptiefactoren.

Abstract

Directe neuronale herprogrammering is een krachtige benadering om functionele neuronen te genereren uit verschillende startcelpopulaties zonder door multipotente tussenproducten te gaan. Deze techniek houdt niet alleen grote beloften in op het gebied van ziektemodellering, omdat het bijvoorbeeld fibroblasten voor patiënten met neurodegeneratieve ziekten kan omzetten in neuronen, maar vertegenwoordigt ook een veelbelovend alternatief voor celgebaseerde vervangingstherapieën. In deze context was een belangrijke wetenschappelijke doorbraak de demonstratie dat gedifferentieerde niet-neurale cellen in het centrale zenuwstelsel, zoals astrocyten, in vitro konden worden omgezet in functionele neuronen. Sindsdien heeft in vitro directe herprogrammering van astrocyten in neuronen substantiële inzichten opgeleverd in de moleculaire mechanismen die ten grondslag liggen aan gedwongen identiteitsconversie en de hindernissen die efficiënte herprogrammering voorkomen. Resultaten van in vitro experimenten uitgevoerd in verschillende laboratoria zijn echter moeilijk te vergelijken vanwege verschillen in de methoden die worden gebruikt om astrocyten te isoleren, te kweken en te herprogrammeren. Hier beschrijven we een gedetailleerd protocol om astrocyten met hoge zuiverheid betrouwbaar te isoleren en te kweken uit verschillende regio’s van het centrale zenuwstelsel van muizen op postnatale leeftijd via magnetische celsortering. Verder bieden we protocollen om gekweekte astrocyten te herprogrammeren tot neuronen via virale transductie of DNA-transfectie. Dit gestroomlijnde en gestandaardiseerde protocol kan worden gebruikt om de moleculaire mechanismen te onderzoeken die ten grondslag liggen aan het behoud van de celidentiteit, de vaststelling van een nieuwe neuronale identiteit, evenals het genereren van specifieke neuronale subtypen en hun functionele eigenschappen.

Introduction

Het centrale zenuwstelsel van zoogdieren (CZS) is zeer complex en bestaat uit honderden verschillende celtypen, waaronder een groot aantal verschillende neuronale subtypen 1,2,3,4,5,6. In tegenstelling tot andere organen of weefsels 7,8,9 heeft het CZS van zoogdieren een zeer beperkt regeneratief vermogen; neuronaal verlies na traumatisch hersenletsel of neurodegeneratie is onomkeerbaar en resulteert vaak in motorische en cognitieve tekorten10. Gericht op het redden van hersenfuncties, worden verschillende strategieën om verloren neuronen te vervangen intensief onderzocht11. Onder hen is directe herprogrammering van somatische cellen in functionele neuronen in opkomst als een veelbelovende therapeutische aanpak12. Directe herprogrammering, of transdifferentiatie, is het proces van het omzetten van een gedifferentieerd celtype in een nieuwe identiteit zonder door een intermediaire proliferatieve of pluripotente toestand te gaan 13,14,15,16. Gepionierd door de identificatie van MyoD1 als een factor die voldoende is om fibroblasten om te zetten in spiercellen 17,18, is deze methode met succes toegepast om verschillende celtypen te herprogrammeren in functionele neuronen 19,20,21.

Astrocyten, de meest voorkomende macroglia in het CZS 22,23, zijn om verschillende redenen een bijzonder veelbelovend celtype voor directe neuronale herprogrammering. Ten eerste zijn ze wijd en gelijkmatig verdeeld over het CZS, wat een overvloedige locobron voor nieuwe neuronen oplevert. Ten tweede zijn astrocyten en neuronen ontwikkelingsmatig nauw verwant, omdat ze een gemeenschappelijke voorouder delen tijdens de embryonale ontwikkeling, de radiale gliacellen24. De gemeenschappelijke embryonale oorsprong van de twee celtypen lijkt neuronale conversie te vergemakkelijken in vergelijking met herprogrammering van cellen uit verschillende kiemlagen19,21. Bovendien wordt patrooninformatie die door astrocyten wordt geërfd door hun radiale glia-oorsprong ook gehandhaafd in volwassen astrocyten 25,26,27, en lijkt het bij te dragen aan het genereren van regionaal geschikte neuronale subtypen 28,29,30. Daarom is het onderzoeken en begrijpen van de omzetting van astrocyten in neuronen een belangrijk onderdeel van het bereiken van het volledige potentieel van deze techniek voor op cellen gebaseerde vervangingsstrategieën.

De omzetting van in vitro gekweekte astrocyten in neuronen heeft geleid tot verschillende doorbraken op het gebied van directe neuronale herprogrammering, waaronder: i) de identificatie van transcriptiefactoren die voldoende zijn om neuronen uit astrocyten te genereren 15,19,31, ii) het ontrafelen van moleculaire mechanismen veroorzaakt door verschillende herprogrammeringsfactoren in dezelfde cellulaire context 32 , en iii) het benadrukken van de impact van de ontwikkelingsoorsprong van de astrocyten op het induceren van verschillende neuronale subtypen 28,29,33. Bovendien ontrafelde in vitro directe conversie van astrocyten verschillende belangrijke hindernissen die directe neuronale herprogrammeringbeperken 34,35, zoals verhoogde reactieve zuurstofsoorten (ROS) productie34 en verschillen tussen het mitochondriale proteoom van astrocyten en neuronen35. Vandaar dat deze waarnemingen sterk het gebruik van primaire culturen van astrocyten ondersteunen als een model voor directe neuronale herprogrammering om verschillende fundamentele vragen in de biologie te onderzoeken12, gerelateerd aan het onderhoud van de celidentiteit, wegversperringen die veranderingen in het lot van cellen voorkomen, evenals de rol van het metabolisme bij herprogrammering.

Hier presenteren we een gedetailleerd protocol om astrocyten te isoleren van muizen op postnatale (P) leeftijd met een zeer hoge zuiverheid, zoals aangetoond door het isoleren van astrocyten uit het muizenmerg29. We bieden ook protocollen om astrocyten te herprogrammeren in neuronen via virale transductie of DNA-plasmidetransfectie. Geherprogrammeerde cellen kunnen worden geanalyseerd op 7 dagen na transductie (7 DPT) om verschillende aspecten te beoordelen, zoals herprogrammeringsefficiëntie en neuronale morfologie, of kunnen gedurende enkele weken in cultuur worden gehouden om hun rijping in de loop van de tijd te beoordelen. Belangrijk is dat dit protocol niet specifiek is voor ruggenmergastrocyten en gemakkelijk kan worden toegepast om astrocyten te isoleren uit verschillende andere hersengebieden, waaronder de corticale grijze stof, middenhersenen en cerebellum.

Protocol

De volgende procedure volgt de richtlijnen voor dierverzorging van het Helmholtz Zentrum München in overeenstemming met de richtlijn 2010/63/EU inzake de bescherming van dieren die voor wetenschappelijke doeleinden worden gebruikt. Zorg ervoor dat u voldoet aan de richtlijnen voor dierverzorging van de instelling waar de dissectie wordt uitgevoerd. 1. Voorbereiding van dissectie-, dissociatie- en cultuurmaterialen OPMERKING: Bereid alle kweekreagenti…

Representative Results

Primaire culturen van astrocyten bereiken doorgaans 80% -90% confluentie tussen 7 en 10 dagen na MAC-sortering en plating (figuur 1B). Over het algemeen levert een enkele T25-kweekkolf ongeveer 1-1,5 x 106 cellen op, wat voldoende is voor 20-30 coverslips bij het zaaien van cellen met een dichtheid van 5-5,5 x 104 cellen per put. De dag na het plateren bedekken cellen meestal 50% -60% van het coverslipoppervlak (figuur 1C). In dit stadium b…

Discussion

Primaire culturen van muizenastrocyten zijn een opmerkelijk in vitro modelsysteem om directe neuronale herprogrammering te bestuderen. In feite, ondanks dat ze geïsoleerd zijn in een postnatale fase, brengen cellen typische astrocytenmarkers29 tot expressie, behouden ze de expressie van patroongenen 28,29 en behouden ze het vermogen om zich te vermenigvuldigen, vergelijkbaar met in vivo astrocyten op een vergelijkbare leeftijdvan 38</sup…

Divulgaciones

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

We willen Ines Mühlhahn bedanken voor het klonen van de constructies voor herprogrammering, Paulina Chlebik voor virale productie en Magdalena Götz en Judith Fischer-Sternjak voor commentaar op het manuscript.

Materials

0.05% Trypsin/EDTA Life Technologies 25300054
4', 6-Diamidino-2-phenyindole, dilactate (DAPI) Sigma-Aldrich D9564
anti-mouse IgG1 Alexa 647 Thermo Fisher A21240
anti-Mouse IgG1 Biotin Southernbiotech Cat# 1070-08; RRID: AB_2794413
anti-mouse IgG2b Alexa 488 Thermo Fisher A21121
anti-rabbit Alexa 546 Thermo Fisher A11010
Aqua Poly/Mount Polysciences Cat# 18606-20
B27 Supplement Life Technologies 17504044
BDNF Peprotech 450-02
bFGF Life Technologies 13256029
Bovine Serum Albumine (BSA) Sigma-Aldrich Cat# A9418
cAMP Sigma Aldrich D0260
C-Tubes Miltenyi Biotec 130-093-237
DMEM/F12 Life Technologies 21331020
Dorsomorphin Sigma Aldrich P5499
EGF Life Technologies PHG0311
Fetal Bovine Serum PAN Biotech P30-3302
Forskolin Sigma Aldrich F6886
GDNF Peprotech 450-10
gentleMACS Octo Dissociator Miltenyi Biotec 130-096-427
GFAP Dako Cat# Z0334; RRID: AB_100013482
Glucose Sigma Aldrich G8769
GlutaMax Life Technologies 35050038
HBSS Life Technologies 14025050
Hepes Life Technologies 15630056
Lipofectamine 2000 (Transfection reagent) Thermo Fisher Cat# 11668019
MACS SmartStrainer 70µm Miltenyi Biotec 130-098-462
MiniMACS Seperator Miltenyi Biotec 130-042-102
Mouse anti-ACSA-2 MicroBeat Kit  Miltenyi Biotec 130-097-678
Mouse IgG1 anti-Synaptophysin 1 Synaptic Systems Cat# 101 011 RRID:AB_887824)
Mouse IgG2b anti-Tuj-1 (βIII-tub) Sigma Aldrich T8660
MS columns Miltenyi Biotec 130-042-201
N2 Supplement Life Technologies 17502048
Neural Tissue Dissociation Kit  Miltenyi Biotec 130-092-628
NT3 Peprotech 450-03
octoMACS Separator Miltenyi Biotec 130-042-109
OptiMEM – GlutaMAX (serum-reduced medium) Thermo Fisher Cat# 51985-026
Penicillin/Streptomycin Life Technologies 15140122
Poly-D-Lysine Sigma Aldrich P1149
Rabbit anti-RFP Rockland Cat# 600-401-379; RRID:AB_2209751
Rabbit anti-Sox9 Sigma-Aldrich Cat# AB5535; RRID:AB_2239761
Streptavidin Alexa 405 Thermo Fisher Cat# S32351
Triton X-100 Sigma-Aldrich Cat# T9284

Referencias

  1. Johnson, T. S., et al. Spatial cell type composition in normal and Alzheimers human brains is revealed using integrated mouse and human single cell RNA sequencing. Scientific Reports. 10 (1), 18014 (2020).
  2. Lake, B. B., et al. Neuronal subtypes and diversity revealed by single-nucleus RNA sequencing of the human brain. Science. 352 (6293), 1586-1590 (2016).
  3. Mayer, C., et al. Developmental diversification of cortical inhibitory interneurons. Nature. 555 (7697), 457-462 (2018).
  4. Nowakowski, T. J., et al. Spatiotemporal gene expression trajectories reveal developmental hierarchies of the human cortex. Science. 358 (6368), 1318-1323 (2017).
  5. Sagner, A., Briscoe, J. Establishing neuronal diversity in the spinal cord: a time and a place. Development. 146 (22), (2019).
  6. Zeisel, A., et al. Molecular architecture of the mouse nervous system. Cell. 174 (4), 999-1014 (2018).
  7. Iismaa, S. E., et al. Comparative regenerative mechanisms across different mammalian tissues. NPJ Regenerative Medicine. 3, 6 (2018).
  8. Lange, C., Brand, M. Vertebrate brain regeneration – a community effort of fate-restricted precursor cell types. Current Opinion in Genetics & Development. 64, 101-108 (2020).
  9. Poss, K. D. Advances in understanding tissue regenerative capacity and mechanisms in animals. Nature Reviews Genetics. 11 (10), 710-722 (2010).
  10. Grade, S., Gotz, M. Neuronal replacement therapy: previous achievements and challenges ahead. NPJ Regenerative Medicine. 2, 29 (2017).
  11. Barker, R. A., Gotz, M., Parmar, M. New approaches for brain repair-from rescue to reprogramming. Nature. 557 (7705), 329-334 (2018).
  12. Bocchi, R., Masserdotti, G., Gotz, M. Direct neuronal reprogramming: Fast forward from new concepts toward therapeutic approaches. Neuron. 110 (3), 366-393 (2022).
  13. Di Tullio, A., et al. CCAAT/enhancer binding protein alpha (C/EBP(alpha))-induced transdifferentiation of pre-B cells into macrophages involves no overt retrodifferentiation. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. 108 (41), 17016-17021 (2011).
  14. Fishman, V. S., et al. Cell divisions are not essential for the direct conversion of fibroblasts into neuronal cells. Cell Cycle. 14 (8), 1188-1196 (2015).
  15. Heinrich, C., et al. Directing astroglia from the cerebral cortex into subtype specific functional neurons. PLoS Biology. 8 (5), 1000373 (2010).
  16. Treutlein, B., et al. Dissecting direct reprogramming from fibroblast to neuron using single-cell RNA-seq. Nature. 534 (7607), 391-395 (2016).
  17. Tapscott, S. J., et al. MyoD1: a nuclear phosphoprotein requiring a Myc homology region to convert fibroblasts to myoblasts. Science. 242 (4877), 405-411 (1988).
  18. Taylor, S. M., Jones, P. A. Multiple new phenotypes induced in 10T1/2 and 3T3 cells treated with 5-azacytidine. Cell. 17 (4), 771-779 (1979).
  19. Berninger, B., et al. Functional properties of neurons derived from in vitro reprogrammed postnatal astroglia. Journal of Neuroscience. 27 (32), 8654-8664 (2007).
  20. Marro, S., et al. Direct lineage conversion of terminally differentiated hepatocytes to functional neurons. Cell Stem Cell. 9 (4), 374-382 (2011).
  21. Vierbuchen, T., et al. Direct conversion of fibroblasts to functional neurons by defined factors. Nature. 463 (7284), 1035-1041 (2010).
  22. Bass, N. H., Hess, H. H., Pope, A., Thalheimer, C. Quantitative cytoarchitectonic distribution of neurons, glia, and DNa in rat cerebral cortex. The Journal of Comparative Neurology. 143 (4), 481-490 (1971).
  23. Yoon, H., Walters, G., Paulsen, A. R., Scarisbrick, I. A. Astrocyte heterogeneity across the brain and spinal cord occurs developmentally, in adulthood and in response to demyelination. PLoS One. 12 (7), 0180697 (2017).
  24. Taverna, E., Gotz, M., Huttner, W. B. The cell biology of neurogenesis: toward an understanding of the development and evolution of the neocortex. Annual Review of Cell and Developmental Biology. 30, 465-502 (2014).
  25. Batiuk, M. Y., et al. Identification of region-specific astrocyte subtypes at single cell resolution. Nature Communication. 11 (1), 1220 (2020).
  26. Boisvert, M. M., Erikson, G. A., Shokhirev, M. N., Allen, N. J. The aging astrocyte transcriptome from multiple regions of the mouse brain. Cell Reports. 22 (1), 269-285 (2018).
  27. Ohlig, S., et al. Molecular diversity of diencephalic astrocytes reveals adult astrogenesis regulated by Smad4. The EMBO Journal. 40 (21), 107532 (2021).
  28. Herrero-Navarro, A., et al. Astrocytes and neurons share region-specific transcriptional signatures that confer regional identity to neuronal reprogramming. Science Advances. 7 (15), (2021).
  29. Kempf, J., et al. Heterogeneity of neurons reprogrammed from spinal cord astrocytes by the proneural factors Ascl1 and Neurogenin2. Cell Reports. 36 (3), 109409 (2021).
  30. Mattugini, N., et al. Inducing Different Neuronal Subtypes from Astrocytes in the Injured Mouse Cerebral Cortex. Neuron. 103 (6), 1086-1095 (2019).
  31. Heins, N., et al. Glial cells generate neurons: the role of the transcription factor Pax6. Nature Neuroscience. 5 (4), 308-315 (2002).
  32. Masserdotti, G., et al. Transcriptional mechanisms of proneural factors and REST in regulating neuronal reprogramming of astrocytes. Cell Stem Cell. 17 (1), 74-88 (2015).
  33. Rao, Z., et al. Molecular mechanisms underlying Ascl1-mediated astrocyte-to-neuron conversion. Stem Cell Reports. 16 (3), 534-547 (2021).
  34. Gascon, S., et al. Identification and successful negotiation of a metabolic checkpoint in direct neuronal reprogramming. Cell Stem Cell. 18 (3), 396-409 (2016).
  35. Russo, G. L., et al. CRISPR-mediated induction of neuron-enriched mitochondrial proteins boosts direct glia-to-neuron conversion. Cell Stem Cell. 28 (3), 524-534 (2021).
  36. Guo, S., et al. Nonstochastic reprogramming from a privileged somatic cell state. Cell. 156 (4), 649-662 (2014).
  37. Hu, X., et al. Region-restrict astrocytes exhibit heterogeneous susceptibility to neuronal reprogramming. Stem Cell Reports. 12 (2), 290-304 (2019).
  38. Ge, W. P., Miyawaki, A., Gage, F. H., Jan, Y. N., Jan, L. Y. Local generation of glia is a major astrocyte source in postnatal cortex. Nature. 484 (7394), 376-380 (2012).
  39. Price, J. D., et al. The Ink4a/Arf locus is a barrier to direct neuronal transdifferentiation. The Journal of Neuroscience. 34 (37), 12560-12567 (2014).
  40. Heinrich, C., et al. Generation of subtype-specific neurons from postnatal astroglia of the mouse cerebral cortex. Nature Protocols. 6 (2), 214-228 (2011).
  41. Batiuk, M. Y., et al. An immunoaffinity-based method for isolating ultrapure adult astrocytes based on ATP1B2 targeting by the ACSA-2 antibody. The Journal of Biological Chemistry. 292 (21), 8874-8891 (2017).

Play Video

Citar este artículo
Hersbach, B. A., Simon, T., Masserdotti, G. Isolation and Direct Neuronal Reprogramming of Mouse Astrocytes. J. Vis. Exp. (185), e64175, doi:10.3791/64175 (2022).

View Video