Summary

뮤린 소장 상피 오가노이드와 선천적 림프성 세포의 공동 배양

Published: March 23, 2022
doi:

Summary

이 프로토콜은 뮤린 소장 오가노이드를 확립하고, 뮤린 소장 라미나 프로프리아로부터 유형 1 선천성 림프성 세포를 분리하고, 장 상피 세포와 유형 1 선천성 림프 세포 간의 양방향 상호 작용을 연구하기 위해 두 세포 유형 간의 3 차원 (3D) 공동 배양을 수립하기위한 자세한 지침을 제공합니다.

Abstract

오가노이드와 면역 세포의 복잡한 공동 배양은 점막 항상성의 섬세한 균형을 뒷받침하는 양방향 상호 작용을 조사하기위한 다목적 도구를 제공합니다. 이러한 3D 다세포 시스템은 다인자 질환을 해결하고 조직 상주 선천성 림프세포(ILC)와 같은 희귀 세포 유형을 연구할 때 발생하는 기술적 어려움을 해결하기 위한 환원주의 모델을 제공합니다. 이 글에서는 소장 오가노이드와 소장 라미나 프로프리아 유래 헬퍼-유사 타입 1 ILC(ILC1s)를 결합한 뮤린 시스템을 설명하며, 이는 다른 ILC 또는 면역 집단으로 쉽게 확장될 수 있다. ILCs는 점막에서 특히 풍부 한 조직 거주 개체군으로, 항상성을 촉진하고 손상이나 감염에 신속하게 반응합니다. ILCs와의 오가노이드 공동 배양은 이미 장의 새로운 상피 면역 신호 전달 모듈에 대한 빛을 비추기 시작했으며, 다른 ILC 서브 세트가 장 상피 장벽 무결성 및 재생에 어떻게 영향을 미치는지 밝혀 냈습니다. 이 프로토콜은 상피와 면역 세포 사이의 상호 작용에 대한 추가 조사를 가능하게하며, 점막 항상성과 염증의 메커니즘에 대한 새로운 통찰력을 제공 할 수있는 잠재력을 보유하고 있습니다.

Introduction

장 상피와 장 상주 면역 체계 사이의 의사 소통은 장 항상성 1의 유지의핵심입니다. 이러한 상호 작용에 대한 중단은 염증성 장 질환 (IBD) 및 위장 암2를 포함한 국소 및 전신 질환 모두와 관련이 있습니다. 항상성의 한 가지 더 최근에 기술된 중요한 조절자의 주목할만한 예는 장 면역 환경에서 핵심 플레이어로 부상한 선천적 림프성 세포 (ILCs)의 연구에서 비롯됩니다3. ILCs는 장 항상성을 조절하고 사이토카인 매개 신호전달을 통해 염증을 크게 조율하는 이질적인 선천적 면역 세포의 그룹이다4.

뮤린 ILCs는 전사 인자, 수용체, 및 사이토카인 발현 프로필5에 기초한 아류형으로 광범위하게 분할된다. 세포독성 내추럴킬러(NK) 세포 및 헬퍼-유사 타입 1 ILCs(ILC1s)를 포함하는 제1형 ILCs는 T 세포(T-bet)6에서 발현되는 전사인자(eomesodermin) 에옴 및 T-박스 단백질의 발현에 의해 각각 정의되며, T 헬퍼 타입-1(TH1)면역과 관련된 사이토카인을 분비한다: 인터페론-γ(IFNγ) 및 종양 괴사 인자(TNF), 인터루킨(IL)-12에 반응하여, IL-15 및 IL-187. 항상성 동안, 조직-상주 ILC1s는 상피 증식 및 매트릭스 리모델링을 유도하기 위해 변형 성장 인자 β(TGF-β)을 분비한다8. 제2형 ILCs(ILC2s)는 주로 T 헬퍼 타입-2(TH2) 관련 사이토카인의 분비를 통해 기생충 감염에 반응한다: IL-4, IL-5, 및 IL-13, 및 레티노산 관련 고아 수용체(ROR) α(ROR-α)9 및 GATA 결합 단백질 3(GATA-3)10,11,12의 발현을 특징으로 한다. . 마우스에서, 장내 “염증성” ILC2s는 킬러 세포 렉틴-유사 수용체 (서브패밀리 G 멤버 1, KLRG)13의 발현을 추가로 특징으로 하며, 여기서 이들은 상피 터프트-세포 유래 IL-2514,15에 반응한다. 마지막으로, 림프성 조직 유도제 세포 및 헬퍼-유사 타입-3 ILCs(ILC3s)를 포함하는 타입-3 ILCs는 전사 인자 ROR-γt 16에 의존하고, 국소 IL-1β 및 IL-23신호(17)에 반응하여 과립구 대식세포 콜로니 자극 인자(GM-CSF),IL-17, 또는 IL-22를 분비하는 그룹으로 군집된다. 림프성 조직 유도제 세포는 Peyer의 패치에 군집하고 발달18 동안 이러한 이차 림프성 기관의 발달에 결정적이며, ILC3s는 성인 뮤린 소장 라미나 프로프리아에서 가장 풍부한 ILC 아형이다. ILC3s를 갖는 최초의 뮤린 장내 오가노이드 공동배양 시스템 중 하나는 신호 트랜스듀서 및 전사 3의 활성화제에 대한 사이토카인 IL-22의 영향을 분리하기 위해 이용되었고, 전사 3(STAT-3) 매개된 류신-풍부 반복 G 단백질 결합 수용체 5(Lgr5)+ 장 줄기 세포 증식(19)을 포함하는, 재생 ILC-상피 상호작용의 강력한 예이다. ILCs는 기관(20,21) 사이에 각인-이질성을 나타내고, 편광 사이토카인(22)에 반응하여 서브세트 사이에 가소성을 나타낸다. 이러한 조직 특유의 각인과 가소성 차이를 일으키는 요인과 IBD23과 같은 만성 질환에서 그들이 어떤 역할을하는지는 오가노이드 공동 문화를 사용하여 해결할 수있는 흥미로운 주제로 남아 있습니다.

장 오가노이드는 장 상피24,25를 연구하는 성공적이고 신뢰할 수있는 모델로 부상했습니다. 이들은 Wnt 패밀리 멤버 3A (Wnt3a)의 내인성 공급원으로서 파네스 세포를 포함하는 장 상피 Lgr5+ 줄기 세포 또는 전체 단리된 크립트를 배양함으로써 생성된다. 이러한 3D 구조는 합성 하이드로젤(26) 또는 기저 라미나 프로프리아를 모방한 생체재료, 예를 들어 열-가교 기저 세포외 매트릭스(TBEM)에서 유지되며, 특히 상피 성장 인자(EGF), 골 형태유전 단백질(BMP)-억제제 노긴, Lgr5-리간드 및 Wnt-아고니스트 R-Spondin127을 모방하는 성장 인자로 추가로 보충된다. . 이러한 조건 하에서, 오가노이드는 상피 아피코-기저 극성을 유지하고, 오가노이드의 중심에서 흡수성 및 분비 세포로 말단으로 분화되는 신진 줄기 세포 크립트로 장 상피의 크립트-빌리 구조를 재편성하고, 그 후 anoikis28에 의해 내부 슈도루멘으로 흘려진다. 비록 장내 오가노이드 단독으로는 상피 발달과 역동성의 환원주의 모델로서 매우 유리했지만,29,30은 이러한 행동이 면역 구획에 의해 어떻게 조절, 영향 또는 심지어 파괴되는지를 이해하는 데 엄청난 미래의 잠재력을 가지고 있습니다.

다음의 프로토콜에서, 뮤린 소장 오가노이드와 라미나 프로프리아 유래 ILC1s 사이의 공동 배양 방법이 기술되어 있는데, 이는 최근에 이 집단이 어떻게 예기치 않게 염증의 장 시그니처를 감소시키고 대신이 시스템에서 TGF-β을 통한 상피 증식 증가에 기여하는지를 확인하기 위해 사용되었다8.

Protocol

모든 실험은 동물 사용에 대한 모든 관련 규제 및 제도적 지침에 따라 완료되어야합니다. 다음 기사 및 비디오에 설명 된 연구에 대한 윤리적 승인은 동물 사용에 대한 모든 관련 규제 및 제도적 지침에 따라 획득되었습니다. 모든 마우스는 표준 윤리적 절차에 따라 자궁 경부 탈구에 의해 도태되었고, 훈련 된 개인에 의해 수행되었다. 장기 및 조직 수확 전에, 대퇴골 동맥의 ?…

Representative Results

성공적으로 완료되면 새로 격리 된 지하실은 2-4 일 이내에 신진 토굴 구조를 형성해야합니다 (그림 1A). 건강하고 견고한 오가노이드 문화는 활발히 성장해야하며 프로토콜에 자세히 설명 된대로 계대 및 확장 될 수 있습니다. 이 프로토콜은 FACS에 의한 살아있는 ILC1의 단리를 허용하는 RORγtGFP 뮤린 트랜스제닉 리포터 라인으로부터 소장 ILC1의 단…

Discussion

이 프로토콜은 뮤린 소장 오가노이드를 확립하고, 장 해리 프로토콜 동안 림프구의 손실을 최소화하여 희귀 한 ILC1을 분리하고,이 두 구획 사이에 공동 배양을 확립하는 방법을 설명합니다. 이 프로토콜에는 많은 단계가 있으며, 일부는 ILC1에 특이적이지만,이 접근법은 다른 장 면역 세포 유형에 적용될 수 있으며 공동 배양 설정은 개별 연구 질문에 맞게 모듈식으로 조정할 수 있습니다. 몇 가지 ?…

Divulgaciones

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

E.R.은 Wellcome Trust (215027/Z/18/Z)의 박사 학위를 인정합니다. G.M.J.는 Wellcome Trust (203757/Z/16/A)의 박사 학위 펠로우십을 인정합니다. DC는 NIHR GSTT BRC 출신의 박사 과정 학생임을 인정합니다. J.F.N.은 Marie Skłodowska-Curie Fellowship, King ‘s Prize 펠로우십, RCUK / UKRI Rutherford Fund 펠로우십 (MR / R024812 / 1) 및 Wellcome Trust (204394 / Z / 16 / Z)의 과학 종자 상을 인정합니다. 우리는 또한 가이 병원에 본사를 둔 BRC 유세포 측정 핵심 팀에 감사드립니다. Rorc(γt)-GfpTG C57BL/6 리포터 마우스는 G. Eberl(프랑스 파리의 파스퇴르 연구소)으로부터 관대 한 선물이었다. CD45.1 C57BL/6 마우스는 T. Lawrence (King ‘s College London, London)와 P. Barral (King ‘s College London, London)에 의해 친절하게 주어졌다.

Materials

Reagents
2-Mercaptoethanol Gibco 21985023
Anti-mouse CD45 (BV510) BioLegend 103137
Anti-mouse NK1.1 (PE) Thermo Fisher Scientific 12-5941-83
B-27 Supplement (50X), serum free Gibco 17504044
CD127 Monoclonal Antibody (APC) Thermo Fisher Scientific 17-1271-82
CD19 Monoclonal Antibody (eFluor 450) Thermo Fisher Scientific 48-0193-82
CD3e Monoclonal Antibody (eFluor 450) Thermo Fisher Scientific 48-0051-82
CD5 Monoclonal Antibody (eFluor 450) Thermo Fisher Scientific 48-0031-82
CHIR99021 Tocris 4423/10
COLLAGENASE D, 500MG Merck 11088866001
Cultrex HA- RSpondin1-Fc HEK293T Cells Cell line was used to harvest conditioned RSpondin1 supernatant, the cell line and Materials Transfer Agreement was provided by the Board of Trustees of the Lelands Stanford Junior University (Calvin Kuo, MD,PhD, Stanford University)
DISPASE II (NEUTRAL PROTEASE, GRADE II) Merck 4942078001
DMEM/F12 (1:1) (1X) Dulbecco's Modified Eagle Medium Nutrient Mixture F-12 (Advanced DMEM/F12) Gibco 11320033
DNASE I, GRADE II Merck 10104159001
Dulbecco's Modified Eagle Medium (1X) Gibco 21969-035
Ethilenediamine Tetraacetate Acid Thermo Fisher Scientific BP2482-100
FC block 2B Scientific BE0307
Fetal Bovine Serum, qualified, hear inactivated Gibco 10500064
GlutaMAX (100X) Gibco 3050-038
Hanks' Balanced Salt Solution (10X) Gibco 14065056
HBSS (1X) Gibco 12549069
HEK-293T- mNoggin-Fc Cells Cell line was used to harvest conditioned Noggin supernatant, cell line acquired through Materials Transfer Agreement with the Hubrecth Institute, Uppsalalaan8, 3584 CT Utrecht, The Netherlands, and is based on the publication by Farin, Van Es, and Clevers Gastroenterology (2012).
HEPES Buffer Solution (1M) Gibco 15630-056
KLRG1 Monoclonal Antibody (PerCP eFluor-710) Thermo Fisher Scientific 46-5893-82
Live/Dead Fixable Blue Dead Cell Stain Kit, for UV excitation Thermo Fisher Scientific L23105
Ly-6G/Ly-6C Monoclonal Antibody (eFluor 450) Thermo Fisher Scientific 48-5931-82
Matrigel Growth Factor Reduced Basement Membrane Matrix, Phenol Red-free, LDEV-free Corning 356231
N-2 Supplement (100X) Gibco 17502048
N-acetylcysteine (500mM) Merck A9165
NKp46 Monoclonal Antibody (PE Cyanine7) Thermo Fisher 25-3351-82
PBS (1 X) 7.2 pH Thermo Fisher Scientific 12549079
PBS (10X) Gibco 70013032
Percoll Cytiva 17089101
Recombinant Human EGF, Animal-Free Protein R&D Systems AFL236
Recombinant Human IL-15 GMP Protein, CF R&D Systems 247-GMP
Recombinant Human IL-2 (carrier free) BioLegend 589106
Recombinant Mouse IL-7 (carrier free) R&D Systems 407-ML-005/CF
UltraComp eBeads Thermo Fisher Scientific 01-2222-42
Y-27632 dihydrochloride (ROCK inhibitor) Bio-techne 1254
Plastics
50 mL tube Falcon 10788561
1.5 mL tube Eppendorf 30121023
10 mL pippette StarLab E4860-0010
15 mL tube Falcon 11507411
25 mL pippette StarLab E4860-0025
p10 pippette tips StarLab S1121-3810-C
p1000 pippette tips StarLab I1026-7810
p200 pippette tips StarLab E1011-0921
Standard tissue culture treated 24-well plate Falcon 353047
Equipment
Centrifuge Eppendorf 5810 R
CO2 and temperature controled incubator Eppendorf Galaxy 170 R/S
Flow Assisted Cellular Sorter BD equipment FACS Aria II
Heated shaker Stuart Equipment SI500
Ice box
Inverted light microscope Thermo Fisher Scientific EVOS XL Core Imaging System (AMEX1000)
p10 pippette Eppendorf 3124000016
p1000 pippette Eppendorf 3124000063
p200 pippette Eppendorf 3124000032
Pippette gun Eppendorf 4430000018
Wet ice

Referencias

  1. Martini, E., Krug, S. M., Siegmund, B., Neurath, M. F., Becker, C. Mend your fences. Cellular and Molecular Gastroenterology and Hepatology. 4 (1), 33-46 (2017).
  2. Peterson, L. W., Artis, D. Intestinal epithelial cells: regulators of barrier function and immune homeostasis. Nature Reviews Immunology. 14, 141-153 (2014).
  3. Diefenbach, A., Gnafakis, S., Shomrat, O. Innate lymphoid cell-epithelial cell modules sustain intestinal homeostasis. Immunity. 52 (3), 452-463 (2020).
  4. Ebbo, M., Crinier, A., Vély, F., Vivier, E. Innate lymphoid cells: major players in inflammatory diseases. Nature Reviews Immunology. 17 (11), 665-678 (2017).
  5. Vivier, E., et al. Innate lymphoid cells: 10 years on. Cell. 174 (5), 1054-1066 (2018).
  6. Klose, C. S. N., et al. Differentiation of type 1 ILCs from a common progenitor to all helper-like innate lymphoid cell lineages. Cell. 157 (2), 340-356 (2014).
  7. Bernink, J. H., et al. Interleukin-12 and -23 control plasticity of CD127+ group 1 and group 3 innate lymphoid cells in the intestinal lamina propria. Immunity. 43 (1), 146-160 (2015).
  8. Jowett, G. M., et al. ILC1 drive intestinal epithelial and matrix remodelling. Nature Materials. 20 (2), 250-259 (2020).
  9. Wong, S. H., et al. Transcription factor RORα is critical for nuocyte development. Nature Immunology. 13, 229-236 (2012).
  10. Neill, D. R., et al. Nuocytes represent a new innate effector leukocyte that mediates type-2 immunity. Nature. 464, 1367-1370 (2010).
  11. Mjösberg, J., et al. The transcription factor GATA3 is essential for the function of human type 2 innate lymphoid cells. Immunity. 37 (4), 649-659 (2012).
  12. Hoyler, T., et al. The transcription factor GATA-3 controls cell fate and maintenance of type 2 innate lymphoid cells. Immunity. 37 (4), 634-648 (2012).
  13. Huang, Y., et al. IL-25-responsive, lineage-negative KLRG1hi cells are multipotential ‘inflammatory’ type 2 innate lymphoid cells. Nature Immunology. 16, 161-169 (2014).
  14. von Moltke, J., Ji, M., Liang, H. E., Locksley, R. M. Tuft-cell-derived IL-25 regulates an intestinal ILC2-epithelial response circuit. Nature. 529, 221-225 (2016).
  15. Gerbe, F., et al. Intestinal epithelial tuft cells initiate type 2 mucosal immunity to helminth parasites. Nature. 529, 226-230 (2016).
  16. Eberl, G., et al. An essential function for the nuclear receptor RORgamma(t) in the generation of fetal lymphoid tissue inducer cells. Nature Immunology. 5, 64-73 (2004).
  17. Spits, H., et al. Innate lymphoid cells–a proposal for uniform nomenclature. Nature Reviews Immunology. 13, 145-149 (2013).
  18. Mebius, R. E., Rennert, P., Weissman, I. L. Developing lymph nodes collect CD4+CD3- LTbeta+ cells that can differentiate to APC, NK cells, and follicular cells but not T or B cells. Immunity. 7 (4), 493-504 (1997).
  19. Lindemans, C. A., et al. Interleukin-22 promotes intestinal-stem-cell-mediated epithelial regeneration. Nature. 528 (7583), 560-564 (2015).
  20. Meininger, I., et al. Tissue-specific features of innate lymphoid cells. Trends in Immunology. 41 (10), 902-917 (2020).
  21. Dutton, E. E., et al. Characterisation of innate lymphoid cell populations at different sites in mice with defective T cell immunity. Wellcome Open Research. 2, 117 (2018).
  22. Bal, S. M., Golebski, K., Spits, H. Plasticity of innate lymphoid cell subsets. Nature Reviews Immunology. 20, 552-565 (2020).
  23. Bernink, J. H., et al. Human type 1 innate lymphoid cells accumulate in inflamed mucosal tissues. Nature Immunology. 14, 221-229 (2013).
  24. Sato, T., et al. Single Lgr5 stem cells build crypt-villus structures in vitro without a mesenchymal niche. Nature. 459 (7244), 262-265 (2009).
  25. Ootani, A., et al. Sustained in vitro intestinal epithelial culture within a Wnt-dependent stem cell niche. Nature Medicine. 15 (6), 701-706 (2009).
  26. Gjorevski, N., et al. Designer matrices for intestinal stem cell and organoid culture. Nature. 539 (7630), 560-564 (2016).
  27. Sato, T., Clevers, H. Primary mouse small intestinal epithelial cell cultures. Methods in Molecular Biology. 945, 319-328 (2012).
  28. Date, S., Sato, T. Mini-gut organoids: reconstitution of the stem cell niche. Annual Review of Cell and Developmental Biology. 31, 269-289 (2015).
  29. Bartfeld, S. Modeling infectious diseases and host-microbe interactions in gastrointestinal organoids. Biología del desarrollo. 420 (2), 262-270 (2016).
  30. Dutta, D., Heo, I., Clevers, H. Disease modeling in stem cell-derived 3D organoid systems. Trends in Molecular Medicine. 23 (5), 393-410 (2017).
  31. Tallapragada, N. P., et al. Inflation-collapse dynamics drive patterning and morphogenesis in intestinal organoids. Cell Stem Cell. 28 (9), 1516-1532 (2021).
  32. Qiu, Z., Sheridan, B. S. Isolating lymphocytes from the mouse small intestinal immune system. Journal of Visualized Experiments: JoVE. (132), e57281 (2018).
  33. Sato, T., Clevers, H. Growing self-organizing mini-guts from a single intestinal stem cell: mechanism and applications. Science. 340 (6137), 1190-1194 (2013).
  34. O’Rourke, K. P., Ackerman, S., Dow, L. E., Lowe, S. W. Isolation, culture, and maintenance of mouse intestinal stem cells. Bio-protocol. 6 (4), 1733 (2016).
  35. Serra, D., et al. Self-organization and symmetry breaking in intestinal organoid development. Nature. 569 (7754), 66-72 (2019).
  36. Lukonin, I., et al. Phenotypic landscape of intestinal organoid regeneration. Nature. 586 (7828), 275-280 (2020).
  37. Cardoso, V., et al. Neuronal regulation of type 2 innate lymphoid cells via neuromedin U. Nature. 549 (7671), 277-281 (2017).
  38. Gury-BenAri, M., et al. The spectrum and regulatory landscape of intestinal innate lymphoid cells are shaped by the microbiome. Cell. 166 (5), 1231-1246 (2016).
  39. Seehus, C., Kaye, J. In vitro differentiation of murine innate lymphoid cells from common lymphoid progenitor cells. Bio-protocol. 6 (6), 1770 (2016).

Play Video

Citar este artículo
Read, E., Jowett, G. M., Coman, D., Neves, J. F. Co-Culture of Murine Small Intestine Epithelial Organoids with Innate Lymphoid Cells. J. Vis. Exp. (181), e63554, doi:10.3791/63554 (2022).

View Video