Presentiamo un protocollo per l’isolamento e la congelamento-fratturazione di vescicole extracellulari (EV) provenienti da cellule uroteliali cancerose. La tecnica di congelamento-frattura ha rivelato il diametro e la forma dei veicoli elettrici e, come caratteristica unica, l’organizzazione interna delle membrane EV. Questi sono di immensa importanza per capire come i veicoli elettrici interagiscono con le membrane riceventi.
Le vescicole extracellulari (EV) sono strutture limitate dalla membrana rilasciate dalle cellule nello spazio extracellulare e sono implicate nella comunicazione intercellulare. I veicoli elettrici sono costituiti da tre popolazioni di vescicole, vale a dire microvescicole (MV), esosomi e corpi apoptotici. La membrana limitante degli EV è coinvolta in modo cruciale nelle interazioni con le cellule riceventi, che potrebbero portare al trasferimento di molecole biologicamente attive alle cellule riceventi e, di conseguenza, influenzare il loro comportamento. La tecnica di microscopia elettronica a frattura da congelamento viene utilizzata per studiare l’organizzazione interna delle membrane biologiche. Qui, presentiamo un protocollo per l’isolamento MV da cellule uroteliali cancerose in coltura e la frattura da congelamento dei MV nelle fasi di congelamento rapido, fratturazione, produzione e pulizia delle repliche e analizzandole con microscopia elettronica a trasmissione. I risultati mostrano che il protocollo per l’isolamento produce una popolazione omogenea di veicoli elettrici, che corrispondono alla forma e alle dimensioni dei veicoli commerciali leggeri. Le particelle intramembrana si trovano principalmente nella faccia protoplasmatica della membrana limitante. Quindi, la frattura da congelamento è la tecnica di scelta per caratterizzare il diametro, la forma e la distribuzione delle proteine di membrana dei MV. Il protocollo presentato è applicabile ad altre popolazioni di veicoli elettrici.
Le vescicole extracellulari (EV) sono vescicole limitate alla membrana rilasciate dalle cellule nello spazio extracellulare. Le tre principali popolazioni di veicoli elettrici sono esosomi, microvescicole (MV) e corpi apoptotici, che differiscono per origine, dimensioni e composizione molecolare 1,2,3. La composizione dei veicoli elettrici riflette il profilo molecolare della cellula donatrice e il suo stato fisiologico (cioè sano o malato)4,5. Ciò offre ai veicoli elettrici un immenso potenziale nella diagnosi, nella prognosi e nella terapia delle malattie umane e hanno promettenti applicazioni mediche per l’uso nella medicina personalizzata 6,7,8.
I veicoli elettrici sono mediatori della comunicazione intercellulare. Contengono proteine biologicamente attive, lipidi e RNA, che interferiscono con i processi biologici nella cellula ricevente e possono modificarne il comportamento 9,10. Tuttavia, la composizione della membrana limitante EV è cruciale per l’interazione con la membrana cellulare ricevente.
Le fonti di veicoli elettrici sono fluidi corporei e terreni di coltura condizionati. Per isolare una popolazione EV, è necessario utilizzare una tecnica di isolamento adeguata. Ad esempio, la centrifugazione a 10.000 × g produce una frazione arricchita in MV, mentre forze centrifughe di ≥ 100.000 × g producono una frazione arricchita in esosomi11,12. La frazione isolata di veicoli elettrici deve essere convalidata in termini di purezza, dimensioni e forma. A tal fine, l’International Society for Extracellular Vesicles 2018 ha raccomandato tre classi di tecniche di imaging ad alta risoluzione: microscopia elettronica, microscopia a forza atomica e microscopia a super-risoluzione basata sulla microscopia ottica13. Nessuna di queste tecniche può fornire informazioni sull’interno della membrana EV.
La microscopia elettronica a frattura da congelamento è una tecnica di rottura di campioni congelati per rivelare le loro strutture interne, in particolare dando una visione dell’interno della membrana. Le fasi di preparazione del campione sono (1) congelamento rapido, (2) fratturazione, (3) realizzazione della replica e (4) pulizia della replica14. Nella fase 1, il campione è (facoltativamente) fissato chimicamente, crioprotetto con glicerolo e congelato in freon liquido. Nella fase 2, il campione congelato viene fratturato in un’unità di congelamento-frattura, che espone l’interno del doppio strato di membrana. Nella fase 3, le facce fratturate esposte sono ombreggiate con platino (Pt) e carbonio (C) per produrre repliche. Nel passaggio 4, il materiale organico viene rimosso. La replica viene analizzata al microscopio elettronico a trasmissione (TEM). Per un’interpretazione accurata delle micrografie, è necessario seguire le linee guida per il loro corretto orientamento14,15. In breve, la direzione delle ombre nella micrografia è un riferimento per orientare la micrografia (cioè per determinare la direzione dell’ombreggiatura pt) e, di conseguenza, per determinare forme convesse e concave (Figura 1). Due viste interne chiamate facce fratturate del doppio strato di membrana possono essere viste come risultato della scissione della membrana mediante fratturazione del congelamento: la faccia protoplasmatica (P-face) e la faccia esoplasmatica (E-face). La faccia P rappresenta il foglietto di membrana adiacente al protoplasma cellulare, mentre la faccia E rappresenta il foglietto di membrana adiacente allo spazio extracellulare. Le proteine di membrana integrali e le loro associazioni sono viste come particelle intramembrana sporgenti14,15.
Qui, l’obiettivo è applicare la tecnica della frattura da congelamento per caratterizzare i MV in termini di dimensioni, forma e struttura della loro membrana limitante. Qui presentiamo un protocollo per l’isolamento e la congelamento-fratturazione di CV provenienti da cellule uroteliali cancerose della vescica invasive umane.
La caratterizzazione dei MV, o di qualsiasi altra popolazione di veicoli elettrici isolati, è di primaria importanza per iniziare prima di iniziare analisi a valle come studi “omici” o studi funzionali11,18. Qui, i veicoli elettrici di cellule T24 uroteliali invasive del cancro della vescica umano sono stati isolati mediante centrifugazione e, seguendo il protocollo fornito per l’analisi mediante microscopia elettronica a frattura da congelamento, abbiamo dimostrato che la frazione isolata è stata arricchita in ML11,13. L’isolato dei MV era privo di detriti cellulari o organelli, confermando un protocollo di isolamento e purificazione di successo.
La combinazione di fissazione chimica e congelamento, che sono passaggi critici del protocollo, ha mantenuto la forma sferica dei veicoli elettrici12. Tuttavia, sono necessarie precauzioni quando si valuta il diametro ev mediante congelamento-fratturazione17. Poiché la frattura passa attraverso il campione in modo casuale, le membrane MV sono divise nei loro piani equatoriale e non equatoriale. Per fornire un metodo rigoroso per analizzare le immagini di campioni fratturati da congelamento e in ombra, Hallett et al. hanno dimostrato che il diametro medio delle vescicole è 4/π volte la dimensione effettiva del diametro vescicolare sull’immagine17. Tenendo conto di ciò, i veicoli elettrici delle celle T24 sono stati calcolati per avere un diametro di 304 nm, che si adatta all’intervallo di distribuzione teorica delle dimensioni della MV di 100-1000 nm19.
La fratturazione del congelamento può integrare la colorazione negativa, la tecnica TEM più ampiamente utilizzata per visualizzare i veicoli elettrici. Con la colorazione negativa, il campione viene comunemente fissato chimicamente, essiccato e attaccato a una griglia TEM e contrastato con la soluzione di uranile. Senza supporti multimediali, i veicoli elettrici tendono a collassare, il che conferisce loro un aspetto a forma di coppa. Con la fratturazione del congelamento, mostriamo che i MV sono sfere, che riflettono la loro forma negli spazi extracellulari e nei fluidi corporei12. Con ciò, i nostri risultati sono anche in accordo con le osservazioni dei veicoli elettrici nelle sezioni crio-ultrasottili20.
Un vantaggio cruciale della tecnica di congelamento-frattura è il suo potere di risolvere l’organizzazione interna della membrana limitante, che è un fattore chiave per capire come i veicoli elettrici sono mirati e interagiscono con le membrane riceventi. Qui, abbiamo analizzato le membrane dei veicoli commerciali leggeri, ma la fratturazione del congelamento potrebbe rivelare l’organizzazione della membrana di qualsiasi altra popolazione di veicoli elettrici. I MV sono formati dal germogliamento della membrana plasmatica; pertanto, si prevede che le proteine della membrana plasmatica e i cluster proteici si trovino nella membrana MV. I nostri risultati hanno supportato che i MV delle cellule T24 contenevano particelle intramembrana, presentando proteine di membrana integrali. Sulla base della distribuzione delle particelle tra la faccia E e la faccia P, è ragionevole aspettarsi che le particelle osservate nei MV siano uroplakins delle proteine transmembrana, che sono specifiche delle cellule uroteliali21,24. Le particelle osservate erano sparse, il che è in accordo con studi precedenti che riportavano una riduzione delle uroplachine durante la carcinogenesi uroteliale 21,22,23. Tuttavia, per studiare ulteriormente la composizione proteica delle membrane MV, si raccomanda l’uso della tecnica di immunodepurazione replica (FRIL) con frattura da congelamento. FRIL è un aggiornamento della tecnica di congelamento-frattura presentata ed è dedicato a rivelare l’identità delle proteine nelle repliche mediante riconoscimento anticorpale24,25. Per riassumere, la tecnica di congelamento-frattura è una tecnica di microscopia elettronica adatta alla caratterizzazione della membrana limitante EV, nonché alla forma, alle dimensioni e alla purezza delle frazioni EV isolate. Il protocollo presentato può essere utilizzato anche per la valutazione di altre popolazioni di veicoli elettrici isolati; pertanto, la tecnica di congelamento-fratturazione merita l’inclusione nelle linee guida della International Society for Extracellular Vesicles per gli studi che esplorano l’organizzazione delle membrane limitanti EV.
The authors have nothing to disclose.
Questa ricerca è stata finanziata dall’Agenzia di ricerca slovena (finanziamento di base della ricerca n. P3-0108 e progetto J7-2594) e il programma MRIC UL IP-0510 Infrastructure. Questo lavoro contribuisce all’azione COST CA17116 International Network for Translating Research on Perinatal Derivatives into Therapeutic Approaches (SPRINT), sostenuta da COST (European Cooperation in Science and Technology). Gli autori desiderano ringraziare Linda Štrus, Sanja Čabraja, Nada Pavlica Dubarič e Sabina Železnik per l’aiuto tecnico nella coltivazione cellulare e nella preparazione dei campioni e Marko Vogrinc, Ota Širca Roš e Nejc Debevec per l’aiuto tecnico nella preparazione del video.
A-DMEM | ThermoFisher Scientific, USA | 12491015 | |
Balzers freeze-fracture device | Balzers AG, Liechtenstein | Balzers BAF 200 | |
Centrifuge | Eppendorf, Germany | model 5810R | |
CO2 incubator HeraCell | Heraues, Germany | ||
Copper carriers | Balzers | BB 113 142-2 | 100+ mesh |
Copper grids | SPI, United States | 2010C | |
Culture flask T75 | TPP, Switzerland | growing surface 75 cm2 | |
F12 (HAM) | Sigma-Aldrich, Germany | 21765029 | |
FBS | Gibco, Life Technologies, USA | 10500064 | |
Glazed Porcelain Plate 6 Well | Fischer Sientific, United States | 50-949-072 | |
Glycerol | Kemika, Croatia | 711901 | final concentration 30 % (v/v) |
Glutaradehyde | Serva, Germany | 23114.01 | final concentration 2.5 % (v/v) |
GlutaMAX | Gibco, Life Technologies | 35050-079 | final concentration 4 mM |
Penicillin | Gibco, Life Technologies | 15140163 | final concentration 100 U/ml |
Phase-contast inverted microscope | Nikon, Japan | model Eclipse | |
Rotor | Eppendorf, Germany | A 4-44 | |
Rotor | Eppendorf, Germany | F-34-6-38 | |
Serological pipetts | TPP, Switzerland | 50mL volume | |
Sodium hypochloride solution in water | Carlo Erba, Italy | 481181 | |
Stereomicroscope | Leica, Germany | ||
Streptomycin | Gibco, Life Technologies | 35050038 | final concentration 100 mg/mL |
Transmission electron microscope | Philips, The Netherlands | model CM100 | working at 80 kV |
Tweezers | SPI, United States |