Caenorhabditis elegans’ta rutin olarak kullanılan RNA girişimi (RNAi) için bir dağıtım yöntemi olan bakteriler tarafından üretilen dsRNA’nın oral yoldan uygulanması, burada yetişkin sivrisineklere başarıyla uygulanmıştır. Yöntemimiz, enjeksiyon kullanmadan sağlam ters genetik çalışmalarına ve iletimi engelleyen vektör çalışmalarına izin verir.
RNA girişimi, yirmi yıldır ters genetik analiz için yoğun olarak kullanılan bir araç olmuştur. Yetişkin sivrisineklerde, çift sarmallı RNA (dsRNA) uygulaması, öncelikle önemli ölçüde zaman gerektiren ve saha uygulamaları için uygun olmayan enjeksiyon yoluyla gerçekleştirilmiştir. Bu sınırlamaların üstesinden gelmek için, burada dsRNA’nın yetişkin Anopheles gambiae’ye oral yoldan verilmesi yoluyla RNAi’nin sağlam aktivasyonu için daha etkili bir yöntem sunuyoruz. HT115 (DE3) Escherichia coli suşunda uzun dsRNA’lar üretildi ve yetişkin sivrisineklere pamuk topları ad-libitum üzerinde% 10 sakarozda ısıdan öldürülen dsRNA içeren bakterilerin konsantre bir süspansiyonu sunuldu. Pamuk topları tedavi süresince her 2 günde bir değiştirildi. Bu yöntemin doublesex’i (cinsiyet farklılaşmasında rol oynayan bir gen) veya çatal kafasını (tükürük bezi transkripsiyon faktörünü kodlayan) hedeflemek için kullanılması, sırasıyla kantitatif Gerçek Zamanlı PCR (qRT-PCR) veya floresan konfokal mikroskopi ile ölçüldüğü gibi, hedef gen ekspresyonunun ve / veya protein immünofloresan sinyalinin azalmasına neden olmuştur. Tükürük bezi morfolojisinde de defektler gözlendi. Bu son derece esnek, kullanıcı dostu, düşük maliyetli, zaman verimli dsRNA dağıtım yöntemi, böcek vektör fizyolojisi ve ötesi için önemli olan hedef genlere geniş çapta uygulanabilir.
Birçok hastalık sivrisinekler tarafından bulaşır, bu da sivrisinek fizyolojisi ve genetiğinin incelenmesini önemli bir girişim haline getirir. RNAi’nin bu organizmalarda kullanımı son 20 yılda öne çıkmış ve birçok sivrisinek geninin 1,2,3,4,5 fonksiyonel karakterizasyonuna izin vermiştir. DsRNA dağıtımı için en yaygın kullanılan teknik, sivrisineklere zarar verebileceği ve önemli zaman ve çaba gerektiren dezavantajları olan mikroenjeksiyon olmuştur. RNAi için oral dağıtım yöntemleri test edilmiştir, ancak esas olarak sivrisineklerin larva aşamasında 6,7,8,9. Yetişkin sivrisineklerde dsRNA’nın oral yoldan verilmesi tam olarak araştırılmamıştır ve vektör biyolojisi ve vektör kontrolünün incelenmesi için yararlı bir araç olabilir.
Sıtma, enfekte bir dişi sivrisinek enfekte olmamış bir konakçıdan kan unu aldığında ve sıtma parazitleri içeren tükürük enjekte ettiğinde Anopheles sivrisinekleri tarafından bulaşır10. Nihayetinde bir sivrisinek tükürüğünde bulaşması için, parazit sivrisinek bağışıklık sisteminden kaçma, midgut bariyerinin geçişi ve tükürük bezlerinin istilası da dahil olmak üzere birçok engelin üstesinden gelmelidir11. Sivrisinek tükürük bezi (SG) mimarisi parazit invazyonunun anahtarıdır ve bu mimari hem anahtar tükürük bezi eksprese edilen transkripsiyon faktörleri hem de cinsel dimorfizmin belirleyicileri tarafından kontrol edilir. Tükürük bezlerinin hücresel spesifikasyonu ve homeostatik bakımı ve kan beslenmesinde işlev gören tükürük proteinlerinin üretimi ve sekresyonu için çeşitli yüksek oranda korunmuş transkripsiyon faktörleri gereklidir12,13,14. Çatal başı (Fkh), böcek SG yapısının ve işlevinin önemli bir düzenleyicisi olarak işlev gören kanatlı bir sarmal transkripsiyon faktörüdür (meyve sinekleri ve ipekböceği güvesi üzerindeki çalışmalara dayanarak)15,16,17,18,19,20. Drosophila SG’lerde Fkh, SG sağkalımını ve tükürük üretimini teşvik etmek için SG’ye özgü bir temel sarmal-döngü-sarmal (bHLH) transkripsiyon faktörü olan Adaçayı ile birlikte işlev görür19. Drosophila’da tükürük üretiminin önemli, pozitif bir eş düzenleyicisi, salgı yolu genlerinin ekspresyonunu düzenleyen iyi çalışılmış bir lösin fermuar transkripsiyon faktörü olan CrebA’dır21,22,23. Ayrıca, kadın tükürük bezlerinde, sadece kan beslenmesinde değil, aynı zamanda parazitlerin bu dokuyu istila etme kabiliyetinde de önemli bir rol oynayan güçlü bir morfolojik farklılaşma derecesi vardır24.
Tükürük bezi sağkalımını, yapısını, fizyolojisini ve cinsel dimorfizmini belirlemede rol oynayan genlerin çoğu, karmaşık uzaysal zamansal ekspresyon profillerine sahiptir25,26,27 ve RNAi’yi indüklemek için dsRNA’nın geleneksel dağıtım yöntemleri, bu veya diğer dokulardaki bu tür genleri hedeflemede her zaman etkili değildir. Bununla birlikte, larva evresinde dsRNA’nın oral yoldan verilmesi Aedes aegypti ve An. gambiae sivrisinekleri, dsx geninin 9,28 dişiye özgü formunu susturmak için başarıyla kullanılmıştır. Sivrisinek tükürük bezlerinde dsRNA kullanan önceki çalışmalar, büyük miktarlarda dsRNA’ya ihtiyaç duyulmasına rağmen, susturma etkisinin nispeten uzun süreli (en az 13 gün) olduğunu bulmuştur29. Burada, dsx, fkh veya CrebA için diziye özgü dsRNA’yı eksprese eden ısıdan öldürülmüş E. coli suşu HT115’in (DE3) yetişkin dişi sivrisineklerde bu genlerin RNAi susturulmasını indükleme yeteneği test edilmiştir. An. gambiae’de dsRNA kaynaklı gen yıkımının oral yoldan uygulanması, mRNA seviyelerinde belirgin azalmalar ve bu genlerin fonksiyon kaybı ile tutarlı fenotiplerle. Bu nedenle, bu yaklaşım muhtemelen çeşitli tükürük bezi genlerinin işlevini yıkmak için çalışacaktır.
DsRNA’yı An. gambiae sivrisineklerine oral besleme yoluyla etkili bir şekilde verme yeteneği, hem laboratuvarda hem de sahada vektör biyolojisi çalışmaları için geniş etkilere sahiptir. Mikroenjeksiyon uzun zamandır sivrisineklerde kimyasalların, antikorların, RNAi’nin ve genetik modifikasyon stratejilerinin tercih edilen dağıtım şekli olarak kabul edilmektedir43,44. Önemli fiziksel manipülasyonun, hücresel hasarın ve stresin sonucu, büyük ölçekli veya saha uygulamaları için potansiyel olarak uygun olabilecek oral teslimatın kullanılmasıyla önlenebilir. Önceki çalışmalar, RNAi’nin bireysel bir yetişkin sivrisinek29 içinde her yerde hareket ettiğini ve tükürük bezleri de dahil olmak üzere tüm dokularda etkilere izin verdiğini öne sürmüştür. Sivrisinekleri, uzun bir zaman dilimi boyunca asenkron olarak sindirilen çok sayıda dsRNA eksprese eden E. coli ile besleyerek, bir kafesteki tüm bireyler arasında RNAi’ye tutarlı ve düzgün bir şekilde maruz kalma potansiyeli elde edilebilir. Bu yöntem, çok sayıda sivrisinek beslemeye ve hedef gene bağlı olarak ortaya çıkan fenotiplerin potansiyel değişkenliğini analiz etmeye izin verir. Bununla birlikte, önemli bir husus, pamuk lifinde bakterilerin ve dolayısıyla dsRNA’nın heterojen dağılımı olasılığıdır. Sivrisinek şekeri beslemesi için günlük olarak kullanılan 400 μL bakteri, daha önce9 tarif edildiği ve hesaplandığı gibi yaklaşık ≤4.6 μg dsRNA içerecektir, ancak her bir sivrisinek tarafından yutulan dsRNA miktarı ayrı ayrı belirlenmemiştir. dsRNA yapılarının oluşturulması rutin hale gelirse, bu basit tedavi protokolü bu tekniğin herhangi bir sivrisinek araştırmacısı tarafından hızlı bir şekilde asimilasyonuna izin verir. A priori, tedavi sırasında harcanan zaman (günde 30 dakika), benzer numune boyutlarına mikroenjeksiyon öğrenmek ve uygulamak için geçen zamana kıyasla önemsizdir.
Beslenme dsRNA, model organizma Caenorhabditis elegans45’te ters genetik çalışmalar için rutin olarak kullanılmaktadır. Bu yoğun kullanım seviyesi, oral dağıtım yaklaşımının değerini vurgulamaktadır. Dönüştürülmüş E. coli’de, C. elegans46,47’de var olana benzer şekilde, An. gambiae genom çapında bir kütüphanenin oluşturulması, sivrisineklerde artan bir ölçekte hızlı ters genetik taramaya izin verecektir. Bununla birlikte, yöntemin etkinliğinin büyük ölçüde transkriptin endojen seviyelerine ve ekspresyonun hedef doku ile sınırlı kalmayıp daha geniş bir şekilde ifade edilip edilmediğine bağlı olduğunu belirtmek önemlidir 4,8,44. Ek olarak, bazı insektisitlerin sivrisineklerden davranışsal kaçınmaya neden olabileceğine dair kanıtlar vardır48 ve içlerinde potansiyel olarak olumsuz etkilere neden olan bakterilerle beslenmek benzer kaçınma modellerini tetikleyebilir. Sivrisineklerin alternatif bir besin kaynağına sahip olmadığı laboratuvarın kontrollü ortamında, E. coli ile şekerli sudan kaçınma seçenekleri yoktu ve besleyici bir kaynağa duyulan ihtiyaç muhtemelen bakterilerden kaçınma içgüdüsünü geçersiz kılacaktı. Bununla birlikte, stratejinin daha az kontrollü ortamlarda kullanılması amaçlanıyorsa bu dikkate alınmalıdır.
Aynı anda birden fazla geni hedeflemek mümkün olabilir (bir yapı, birden fazla yapı veya dönüştürülmüş bakteriyel izolatların bir karışımını kullanarak), ancak etkinliği değerlendirmek için daha ileri çalışmalara ihtiyaç vardır. Bu noktada dikkat edilmesi gereken bir diğer önemli nokta, tek veya birden fazla hedef kullanıldığında olası hedef dışı veya sinerjik etkilerin değerlendirilmesidir. Uygun kontrol genlerinin ve gruplarının oluşturulması deney tasarımının önemli bir parçasıdır. Ayrıca, bu yaklaşımın diğer patojenleri veya virüsleri hedeflemek için kullanılabileceğini tahmin etmek caziptir49. Sivrisineklerde RNAi indüksiyonuna yönelik önceki çalışmalar, reaktifin doğrudan enjekte edildiği koşullar altında gerçekleştirildi, bu nedenle E. coli mevcut değildi. E. coli , zaman içinde dsRNA’nın daha yavaş salınmasına izin veren koruyucu bir bölme sağlayabilir ve maruz kalmanın çok daha uzun bir süre boyunca az ya da çok sürekli olmasını sağlar29.
Son olarak, bu sonuçlar, bu tekniğin etkilerinin, maruz kalmanın zaman dilimini (uzunluk ve başlangıç günü) ve kullanılan E. coli miktarını ayarlayarak ayarlanabilir olduğunu göstermektedir. Bu özellik, deneme yanılma yoluyla optimal nakavt koşullarını tanımlayarak temel genlerin (dsx ve fkh) işlevlerini incelememizi sağladı. Bu, ilgilenilen hedef genlerin bu teknik kullanılarak araştırılma olasılığını büyük ölçüde artırır.
Özetle, RNAi’nin yetişkin sivrisineklere oral yoldan verilmesinin basit, çok yönlü ve sivrisinek gen fonksiyonunu incelemek ve sivrisinek kaynaklı hastalıkların vektör kontrolü için yeni ve dövülebilir araçların oluşturulması için güçlü bir yaklaşım olabileceği bulunmuştur.
The authors have nothing to disclose.
Yazarlar, Entomoloji Şubesi ve CDC’deki Paraziter Hastalıklar ve Sıtma Bölümü içindeki personele ve bilim insanlarına ve Brian Trigg ve Michelle Chiu’ya JHU’daki bakteri hazırlama konusundaki yardımları ve / veya bu çalışmanın yararlı tartışmaları için teşekkür etmek istemektedir. JHMRI Insectary ve yöneticisi Chris Kizito’ya An. gambiae sivrisineklerine erişim ve yetiştirme için teşekkür ederiz. Wei Huang’a (JHSPH) bu çalışmada kullanılmak üzere plazmidler PJet GFP ve pPB47 GFP elde etmedeki yardımı için teşekkür ederiz. Bu çalışma için finansman şu kişiler tarafından sağlanmıştır: NIH R21AI153588 (DJA’ya), Johns Hopkins Sıtma Araştırma Enstitüsü Doktora Sonrası Bursu (MW’ye); ve Good Ventures Vakfı ve Açık Hayırseverlik Projesi’nden CDC Vakfı’na sıtma araştırmalarına yardımcı olmak için sivrisineklerde kadın gelişiminin kriyoprezervasyonunu ve bastırılmasını destekleme, Açık Hayırseverlik Projesi, 2017. JHU Mikroskop Tesisi personelinin yardımını ve kullanılan mikroskop için geçerli NIH hibe desteğini derinden takdir ediyoruz (NIH Hibe No: S10OD016374). Bu makaledeki bulgular ve sonuçlar yazarlara aittir ve CDC’nin görüşlerini temsil etmek zorunda değildir. Ticari adların kullanımı yalnızca tanımlama amaçlıdır ve Hastalık Kontrol ve Önleme Merkezleri, Halk Sağlığı Hizmeti veya ABD Sağlık ve İnsani Hizmetler Bakanlığı tarafından onaylandığı anlamına gelmez.
1 Kb Plus DNA Ladder | Thermo Fisher Scientific | 10787018 | |
2x Yeast Extract Tryptone (2xYT) Medium | BD Difco | DF0440-17 | |
AAPP | n/a | n/a | Antisera. 1:50 dilution (rabbit); gift from Fabrizio Lombardo |
AccuStart II PCR Supermix | Quantabio | 95137-100 | |
Agarose | Millipore Sigma | A9539 | |
Ampicillin | Millipore Sigma | A5354 | |
Anopheles gambiae G3 | BioDefense and Emerging Infections (BEI) Malaria Research and Reference Reagent Resource Center (MR4) | MRA-112 | |
BugDorm | BioQuip | 1452 | |
Centrifuge 5810R | Eppendorf | P022628181 | |
CrebA | DSHB | CrebA Rbt-PC | Antisera. 1:50 dilution (rabbit); generated by the Andrew Lab |
Damiens diet | BioServ | ||
DAPI | Life Technologies | n/a | 4′,6-diamidino-2-phenylindole; 1:200 dilution. |
Defibrinated sheep blood | HemoStat | DSB050 | |
Escherichia coli HT115 (DE3) | |||
Ethidium bromide | Millipore Sigma | E7637 | |
High-Capacity cDNA Reverse Transcription Kit | Thermo Fisher Scientific | 4368814 | |
Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside | Millipore Sigma | I5502 | |
JM109 Competent cells | Promega | L2005 | |
Luria Broth Media | Thermo Fisher Scientific | 10855001 | |
Mucin 2 | Proteintech | Muc2; 27 675-1-AP | Antisera. 1:100 dilution (mouse). |
Nanodrop 2000 | Thermo Fisher Scientific | ||
Nile Red | Sigma | n/a | Lipid dye; 1:50 dilution. |
Owl EasyCast B2 Mini Gel Horizontal Electrophoresis | Thermo Fisher Scientific | Model B2 | |
pGEMT easy | Promega | A3600 | |
Power SYBR-green PCR master MIX | Applied Biosystems | 4367659 | |
PureLink PCR purification kit | Thermo Fisher Scientific | K31001 | |
QuantaStudio 6 | Applied Biosystems | ||
QuantStudio6 Real Time PCR System | Applied Biosystems | ||
Rab11 | n/a | n/a | Antisera. 1:100 dilution (rabbit); generated by the Andrew Lab |
Rh-WGA | Vector Labs | n/a | Rhodamine-conjugated wheat germ agglutinin (chitin, O-GlcNAcylation dye); 1:40 dilution |
Sage | n/a | n/a | Antisera. 1:50 dilution (rat); generated by the Andrew Lab |
T4 DNA ligase | Promega | M1801 | |
Tetracycline | Millipore Sigma | 87128 | |
Trizol | Thermo Fisher Scientific | 15596018 | |
Zeiss LSM700 fluorescence confocal microscope | Zeiss | ||
ANTIBODIES | |||
Chicken anti-Rat IgG (H+L), Alexa Fluor 647 | Thermo Fisher Scientific | A21472 | |
Goat anti-Mouse IgG (H+L), Alexa Fluor 647 | Thermo Fisher Scientific | A28181 | |
IgG (H+L) Goat anti-Rabbit, Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A27034 | |
Rabbit anti-Goat IgG (H+L), Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A27012 | |
PRIMERS | |||
ACT-2f: TACAACTCGATCATGAAGTGCGA | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | qRT-PCR primer |
ACT-3r: CCCGGGTACATGGTGGTACCGC CGGA |
CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | qRT-PCR primer |
FKH_RNAi_F: GCCGACTTATGCTTAGCCCA | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | qRT-PCR primer |
FKH_RNAi_R: TAGCCGTCAATTCCTCCTGC | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | qRT-PCR primer |
newDSX-f: AGAGGGCGGGGAAATTCTAGT | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | qRT-PCR primer |
newDSX-r: GGGCTTGTGGCAGTACGAATA | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | qRT-PCR primer |
S7qf1: AGAACCAGCAGACCACCATC | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | qRT-PCR primer |
S7qr1: GCTGCAAACTTCGGCTATTC | CDC Biotechnology Core Facility Branch | n/a | qRT-PCR primer |