Questo protocollo descrive il flusso di lavoro per ottenere macrofagi derivati da monociti (MDM) da campioni di sangue umano, un metodo semplice per introdurre in modo efficiente i reporter della complementazione di fluorescenza bimolecolare della caspasi infiammatoria (BiFC) nell’MDM umano senza compromettere la vitalità e il comportamento cellulare e un approccio basato sull’imaging per misurare l’attivazione della caspasi infiammatoria nelle cellule viventi.
Le caspasi infiammatorie includono caspasi-1, -4, -5, -11 e -12 e appartengono al sottogruppo delle caspasi iniziatrici. La caspasi-1 è necessaria per garantire una corretta regolazione della segnalazione infiammatoria ed è attivata dalla dimerizzazione indotta dalla prossimità in seguito al reclutamento agli inflammasomi. La caspasi-1 è abbondante nel lignaggio delle cellule monocitiche e induce la maturazione delle citochine pro-infiammatorie interleuchina (IL)-1β e IL-18 alle molecole secrete attive. Le altre caspasi infiammatorie, caspasi-4 e -5 (e la loro caspasi omologa murina-11) promuovono il rilascio di IL-1β inducendo la piroptosi. Caspase Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) è uno strumento utilizzato per misurare la prossimità indotta da caspasi infiammatoria come lettura dell’attivazione della caspasi. Il prodominio caspasi-1, -4 o -5, che contiene la regione che si lega all’inflammasoma, è fuso a frammenti non fluorescenti della proteina fluorescente gialla Venere (Venus-N [VN] o Venus-C [VC]) che si associano per riformare il complesso fluorescente di Venere quando le caspasi subiscono una vicinanza indotta. Questo protocollo descrive come introdurre questi reporter nei macrofagi primari derivati dai monociti umani (MDM) usando la nucleofezione, trattare le cellule per indurre l’attivazione della caspasi infiammatoria e misurare l’attivazione della caspasi usando la fluorescenza e la microscopia confocale. Il vantaggio di questo approccio è che può essere utilizzato per identificare i componenti, i requisiti e la localizzazione del complesso di attivazione della caspasi infiammatoria nelle cellule viventi. Tuttavia, è necessario considerare controlli accurati per evitare di compromettere la vitalità e il comportamento delle cellule. Questa tecnica è un potente strumento per l’analisi delle interazioni dinamiche della caspasi a livello di inflammasoma e per l’interrogazione delle cascate di segnalazione infiammatoria in MDM viventi e monociti derivati da campioni di sangue umano.
Le caspasi sono una famiglia di proteasi aspartato di cisteina che possono essere raggruppate in caspasi iniziatrici e caspasi boia. Le caspasi del boia comprendono caspasi-3, -6 e -7. Si trovano naturalmente nelle cellule come dimeri e vengono scissi dalle caspasi iniziatrici per eseguire l’apoptosi1. Le caspasi iniziatrici includono caspasi umane-1, -2, -4, -5, -8, -9, -10 e -12. Si trovano come zimogeni inattivi (pro-caspasi) che vengono attivati dalla dimerizzazione indotta dalla prossimità e stabilizzati dalla scissione autoproteolitica 2,3. Le caspasi infiammatorie sono un sottoinsieme delle caspasi iniziatrici2 e comprendono caspasi-1, -4, -5 e -12 negli esseri umani e caspasi-1, -11 e -12 nel topo 4,5. Piuttosto che un ruolo apoptotico, svolgono un ruolo centrale nell’infiammazione. Mediano l’elaborazione proteolitica e la secrezione di pro-interleuchina (IL)-1β e pro-IL-18 6,7, che sono le prime citochine ad essere rilasciate in risposta agli invasori patogeni 8,9. Caspase-1 viene attivato al momento del reclutamento sulla sua piattaforma di attivazione; un grande complesso proteico a peso molecolare chiamato inflammasoma (Figura 1A)10. La dimerizzazione della caspasi-4, -5 e -11 avviene indipendentemente da queste piattaforme attraverso una via infiammatoria non canonica11,12.
Gli inflammasomi canonici sono complessi proteici multimerici citosolici costituiti da una proteina sensore inflammasoma, la proteina adattatrice ASC (proteina simile allo speck associata all’apoptosi contenente una CARD) e la proteina effettrice caspasi-110. Gli inflammasomi canonici più studiati sono la famiglia di recettori NOD-like contenente un dominio pirinico (NLRP), NLRP1 e NLRP3, la famiglia NLR contenente un CARD (NLRC), NLRC4 e l’assente nel melanoma 2 (AIM2). Ognuno di essi contiene un dominio pyrin, una CARD o entrambi i domini. Il dominio CARD media l’interazione tra le caspasi contenenti CARD e i loro attivatori a monte. Pertanto, la molecola di impalcatura ASC, che è composta da un dominio di pirina N-terminale (PYD) e un motivo CARD C-terminale 13,14, è necessaria per il reclutamento di caspasi-1 agli inflammasomi NLRP1 10, NLRP315 e AIM216.
Ogni inflammasoma prende il nome dalla sua unica proteina sensore che riconosce distinti stimoli pro-infiammatori (Figura 1B). Gli attivatori di questo percorso sono chiamati stimoli canonici. Gli inflammasomi fungono da sensori per i componenti microbici e lo stress tissutale e si assemblano per innescare una robusta risposta infiammatoria attraverso l’attivazione delle caspasi infiammatorie17. L’assemblaggio dell’inflammasoma avvia l’attivazione della caspasi-1 per mediare la maturazione e la secrezione dei suoi principali substrati pro-IL-1β e pro-IL-18. Questo processo avviene tramite un meccanismo in due fasi. In primo luogo, uno stimolo primordiale sovraregola l’espressione di alcune proteine inflammasoma e pro-IL-1β attraverso l’attivazione della via NF-κB. In secondo luogo, uno stimolo intracellulare (canonico) induce l’assemblaggio dell’inflammasoma e il reclutamento della procaspasi-1 6,7.
Caspase-4 e caspasi-5 sono gli ortologhi umani della caspasi murina-1111. Sono attivati in modo indipendente dall’inflammasoma dal lipopolisaccaride intracellulare (LPS), una molecola presente nella membrana esterna dei batteri Gram-negativi 18,19,20, e dall’eme extracellulare, un prodotto dell’emolisi dei globuli rossi21. È stato proposto che LPS si leghi direttamente al motivo CARD di queste proteine e induca la loro oligomerizzazione20. L’attivazione della caspasi-4 o della caspasi-5 promuove il rilascio di IL-1β inducendo una forma infiammatoria di morte cellulare chiamata piroptosi attraverso la scissione della proteina gasdermina D (GSDMD)18,19. Inoltre, l’efflusso di ioni potassio derivanti dalla morte piroptotica mediata da caspasi-4 e GSDMD induce l’attivazione dell’inflammasoma NLRP3 e la successiva attivazione della caspasi-122,23. Pertanto, caspasi-4, -5 e -11 sono considerati sensori intracellulari per LPS che sono in grado di indurre l’attivazione della piroptosi e della caspasi-1 in risposta a stimoli specifici11,24.
Figura 1: Caspasi infiammatorie e test della complementazione di fluorescenza caspasi-bimolecolare (BiFC). (A) Diagramma che mostra il sistema caspasi-BiFC, in cui due prodomini caspasi-1 (C1-pro) legati a ciascun frammento non fluorescente di Venere (Venere-C o Venere-N) vengono reclutati nella piattaforma di attivazione NLRP3, costringendo Venere a ripiegarsi e fluorescere. Questo complesso appare come una macchia verde al microscopio e funge da lettura per la prossimità indotta da caspasi infiammatoria, che è il primo passo nell’attivazione della caspasi iniziatrice. (B) Schema che mostra l’organizzazione del dominio dei componenti inflammasoma e delle caspasi infiammatorie. Fare clic qui per visualizzare una versione più grande di questa figura.
Misurare l’attivazione di caspasi iniziatrici specifiche è difficile e non ci sono molti metodi disponibili per farlo con approcci di imaging. Caspase Bimolecular Fluorescence Complementation (BiFC) può essere utilizzato per visualizzare l’attivazione della caspasi infiammatoria direttamente nelle cellule viventi (Figura 1A)25. Questa tecnica è stata recentemente adattata per l’uso in macrofagi derivati da monociti umani (MDM)21. Caspasi BiFC misura il primo passo nell’attivazione della caspasi infiammatoria, la vicinanza indotta per facilitare la dimerizzazione. Viene utilizzata l’espressione di plasmidi che codificano il prodominio caspasi contenente CARD fuso a frammenti non fluorescenti della proteina fluorescente gialla fotostabile Venere (Venus-C [VC]) e Venere-N [VN]). Quando i due prodomini della caspasi vengono reclutati sulla loro piattaforma di attivazione o subiscono una vicinanza indotta, le due metà di Venere vengono portate in prossimità e costrette a ripiegarsi e fluorescere (vedi Figura 1A,B). Ciò fornisce una lettura in tempo reale dell’attivazione di caspasi infiammatorie specifiche.
L’MDM umano esprime abbondantemente geni inflammasoma e recettori di riconoscimento dei modelli che identificano segnali di pericolo e prodotti patogeni. Ciò fornisce un tipo di cellula ideale per l’interrogazione delle vie infiammatorie della caspasi. Inoltre, possono essere derivati dal sangue periferico e persino da campioni di pazienti per valutare l’attivazione della caspasi infiammatoria in uno specifico stato patologico. Questo protocollo descrive come introdurre i reporter della caspasi BiFC nell’MDM usando la nucleofezione, un metodo di trasfezione basato sull’elettroporazione, come trattare le cellule per indurre l’attivazione della caspasi infiammatoria e come visualizzare i complessi di caspasi attivi utilizzando approcci microscopici. Inoltre, questa metodologia può essere adattata per determinare la composizione molecolare di questi complessi, la localizzazione subcellulare, la cinetica e le dimensioni di queste strutture altamente ordinate 25,26,27.
Questo protocollo descrive il flusso di lavoro per ottenere macrofagi da monociti isolati da campioni di sangue umano e un metodo per introdurre in modo efficiente i reporter BiFC della caspasi infiammatoria nell’MDM umano senza compromettere la vitalità e il comportamento cellulare.
Questo protocollo sfrutta la tecnica BiFC35 per etichettare le caspasi infiammatorie nel dominio di reclutamento della caspasi (CARD) con frammenti non fluorescenti della proteina fluoresc…
The authors have nothing to disclose.
Ringraziamo i membri del laboratorio LBH passati e presenti che hanno contribuito allo sviluppo di questa tecnica. Questo laboratorio è supportato da NIH/NIDDK T32DK060445 (BEB), NIH/NIDDK F32DK121479 (BEB), NIH/NIGMS R01GM121389 (LBH). La Figura 2 è stata disegnata utilizzando il software Biorender.
48 well tissue culture2:34 plates | Genesee Scientific | 25-108 | |
10 cm Tissue Culture Dishes | VWR | 25382-166 | |
2 Mercaptoethanol 1000x | Thermo Fisher Scientific | 21985023 | |
8 well chambered coverglass with 1.5 HP coverglass | Cellvis | c8-1.5H-N | |
AutoMACS columns | Miltenyi (Biotec) | 130-021-101 | For automated separation using AutoMACS Pro Separator only |
AutoMACS Pro Separator | Miltenyi (Biotec) | 130-092-545 | For automated separation using AutoMACS Pro Separator only |
AutoMACS Pro Washing Solution | Miltenyi (Biotec) | 130-092-987 | For automated separation using AutoMACS Pro Separator only |
AutoMACS Rinsing Solution | Miltenyi (Biotec) | 130-091-222 | For automated separation using AutoMACS Pro Separator only |
AutoMacs running buffer | Miltenyi (Biotec) | 130-091-221 | For manual or automated separation using QuadroMACS or AutoMACS pro Separator |
Axio Observer Z1 motorized inverted microscope equipped with a CSU-X1A 5000 spinning disk unit | Zeiss | Any confocal microscope equipped with a laser module fitted with laser lines of 568 nm (RFP) and 488 or 512 nm (GFP or YFP) wavelengths can be used | |
AxioObserver A1, Research Grade Inverted Microscope | Zeiss | Any epifluorescence microscope with fluorescence filters capable of exciting 568 nm (RFP) and 488 or 512 nm (GFP or YFP) wavelengths can be used | |
CD14+ MICROBEADS | Miltenyi (Biotec) | 130-050-201 | For manual or automated separation using QuadroMACS or AutoMACS pro Separator |
DPBS without calcium chloride and magnesium chloride | Sigma | D8537-6x500ML | |
DsRed mito plasmid | Clontech | 632421 | Similar plasmids that can be used as fluorescent reporters can be found on Addgene |
Fetal Bovine Serum | Thermo Fisher Scientific | 10437028 | |
Ficoll-Paque PLUS 6 x 100 mL | Sigma | GE17-1440-02 | |
GlutaMAX Supplement (100x) | Thermo Fisher Scientific | 35050079 | |
GM-CSF | Thermo Fisher Scientific | PHC2011 | |
Hemin BioXtra, from Porcine, ≥96.0% (HPLC) | Sigma | 51280-1G | |
HEPES | Thermo Fisher Scientific | 15630106 | |
Inflammatory caspase BiFC plasmids | Available by request from LBH lab | ||
LPS-EB Ultrapure | Invivogen | TLRL-3PELPS | |
LS Columns | Miltenyi (Biotec) | 130-042-401 | For manual separation using QuadroMACS Separator only |
MACS 15 mL Tube Rack | Miltenyi (Biotec) | 130-091-052 | For manual separation using QuadroMACS Separator only |
MACS MultiStand | Miltenyi (Biotec) | 130-042-303 | For manual separation using QuadroMACS Separator only |
mCherry plasmid | Yungpeng Wang Lab | Similar plasmids that can be used as fluorescent reporters can be found on Addgene | |
Neon Transfection System | Thermo Fisher Scientific | MPK5000 | Includes Neon electroporation device, pipette and pipette station |
Neon Transfection System 10 µL Kit | Thermo Fisher Scientific | MPK1096 | Includes resuspension buffer R, resuspension buffer T, electrolytic buffer E, 96 x 10 µL Neon tips and Neon electroporation tubes |
Nigericin sodium salt, ready made solution | Sigma | SML1779-1ML | |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
Poly-D-Lysine Hydrobromide | Sigma | P7280-5mg | |
QuadroMACS Separator | Miltenyi (Biotec) | 130-090-976 | For manual separation using QuadroMACS Separator only |
qVD-OPh | Fisher (ApexBio) | 50-101-3172 | |
RPMI 1640 Medium | Thermo Fisher Scientific | 11875119 | |
Trypsin-EDTA (0.25%), phenol red | Thermo Fisher Scientific | 25200072 | |
UltraPure 0.5 M EDTA, pH 8.0 | Thermo Fisher Scientific | 15575020 | |
Zeiss Zen 2.6 (blue edition) software | Zeiss | Any software used to operate the confocal microscope of choice |