Burada, Caenorhabditis elegans’taki test bileşiklerinin poliglutamin agregasyonu, nöronal ölüm ve kemoavoidans davranışı dahil olmak üzere nöroprotektif aktivitelerini ve çoklu fenotiplerin örnek bir entegrasyonunu değerlendirmek için bir protokol sunuyoruz.
Yaşa bağlı yanlış katlanma ve patojenik proteinlerin agregasyonu çeşitli nörodejeneratif hastalıklardan sorumludur. Örneğin, Huntington hastalığı (HD) esas olarak huntingtin proteininde genişlemiş bir glutamin sistemini kodlayan bir CAG nükleotid tekrarı tarafından yönlendirilir. Bu nedenle, poliglutamin (poliQ) agregasyonunun ve özellikle agregasyonla ilişkili nörotoksisitenin inhibisyonu, HD ve diğer poliQ ile ilişkili durumların önlenmesi için yararlı bir stratejidir. Bu yazıda, test bileşiklerinin HD’ye karşı nöroprotektif kapasitesini değerlendirmek için yerleşik poliQ transgenik Caenorhabditis elegans modellerini kullanarak genelleştirilmiş deneysel protokoller tanıtılmaktadır. AM141 suşu, poliQ agregasyon testi için seçilmiştir, çünkü ayrık floresan agregaların yaşa bağlı bir fenotipi, poliQ::YFP füzyon proteinlerinin kaslara özgü ekspresyonu nedeniyle yetişkin aşamasında vücut duvarında kolayca gözlemlenebilir. Buna karşılık, ASH nöronlarında poliQ-genişlemiş yolların güçlü ekspresyonuna sahip HA759 modeli, nöronal ölüm ve kemoavoidans davranışını incelemek için kullanılır. Hedef bileşiklerin nöroprotektif kapasitesini kapsamlı bir şekilde değerlendirmek için, yukarıdaki test sonuçları nihayetinde doğrudan karşılaştırma ve doğrudan görüntüleme şeklinde çoklu fenotiplerin profillendiği bir radar çizelgesi olarak sunulmaktadır.
HD’de ilerleyici nörodejenerasyon, CAG trinükleotid tekrarları 1,2,3 tarafından kodlanan anormal bir poliQ gerilmesi ile patojenik mutant huntingtin’i içerir. 37’den fazla glutamin tekrarına sahip mutant huntingtin proteinleri, HD hastalarının beyinlerinde ve hayvan modellerinde 4,5 birikmeye ve birikmeye eğilimlidir ve bu da sonuçta nörodejenerasyona yol açar6. PoliQ agregalarının hastalık patolojisindeki rolleri konusunda netlik olmamasına rağmen,5, poliQ agregasyonunun inhibisyonu ve ilişkili toksisitesi, HD ve diğer poliQ hastalıkları için yararlı bir terapötik stratejidir 4,7,8.
Nöronal sinyal yolaklarındaki korunum ve yapımı kolay transgenik hastalık modelleri nedeniyle, Caenorhabditis elegans nörolojik bozuklukların araştırılmasında majör bir model organizma olarak yaygın olarak kullanılmaktadır 9,10,11,12. Örneğin, agregasyona eğilimli poliQ genişlemelerini ifade eden transgenik C. elegans modelleri, seçici nöronal hücre kaybı, sitoplazmik agrega oluşumu ve davranışsal kusurlar gibi HD benzeri özellikleri objektif olarak taklit edebilir13. Test numunelerinin yerleşik poliQ nematod modellerinde bu fenotipleri tersine çevirmek için potansiyel etkilerinin araştırılması, polisakkaritler 7,14,15, oligosakkaritler16, doğal küçük moleküller17,18 ve bitkisel özler ve formüller 19,20 gibi çeşitli umut verici terapötik adayların tanımlanmasına yol açmıştır.
Burada açıklanan iki ana polyQ C. elegans modeli ve Astragalus membranaceus7’den izole edilmiş bir polisakkarit olan astragalan üzerine yapılan çalışmada örneklendiği gibi potansiyel uygulamalar için ilgili protokollerdir. C. elegans’taki poliQ agregasyon testi için kullanılan model, sarı floresan proteinine (YFP) kaynaşmış 40 kalıntıdan (polyQ40) oluşan bir poliQ yolu olan Q40::YFP füzyon proteininin ekspresyonu nedeniyle yetişkinliğe ulaştığında vücut duvarı kasında dağılmış floresan punkta’yı gösteren transgenik suş AM141’dir.21,22 . HA759 suşu, hem yeşil floresan proteini (GFP) hem de Htn-Q150’yi (150 kalıntıdan oluşan insan avcılığından türetilmiş bir poliQ yolu) ASH nöronlarında güçlü bir şekilde ancak diğer nöronlarda zayıf bir şekilde ifade ettiği için nöronal sağkalım ve kemoavoidans davranışını incelemek için kullanıldı ve ilerleyici nörodejenerasyon ve ASH hücresi ölümü 7,13 ile sonuçlandı. Terapötik adayların nöroprotektif potansiyelinin kapsamlı bir özeti, farklı tahlillerden elde edilen sonuçların entegre edilmesiyle sağlanır.
PoliQ agregasyonu ve proteotoksisite, Huntington hastalığı 13 gibi poliQ bozukluklarının önemli özellikleri olduğundan,AM141 suşunda poliQ agregasyon testi, HA759 suşunda ASH nöronal sağkalım testi ve HA759 suşunda kemosensoriyel kaçınma testi dahil olmak üzere test bileşiklerinin nöroprotektif kapasitesini kapsamlı bir şekilde değerlendirmek için birden fazla model ve yöntemin kullanılmasını öneriyoruz. Burada sunulan protokoller, hem poliQ agregasyonu hem de ilişkili nörotoksisite 7,14,15,16,17,19,20 üzerindeki inhibitör etkiler de dahil olmak üzere, test numunelerinin poliQ toksisitesine karşı nöroprotektif kapasitelerini değerlendirmek için kullanılmış ve HD ve diğer poliQ hastalıkları için ilaç keşfindeki potansiyellerini göstermiştir.
PolyQ toplama tahlilinde poliQ agregalarının tespiti ve sayımı için otomatik bir görüntüleme ve analiz sistemi tanıtılmıştır. Bu yöntem, yüksek verimli ve zaman verimli olma avantajlarına sahiptir ve zahmetli sayım işleminde önemli ölçüde azaltılmış öznel hatalarla sonuçlanır. 384 delikli bir plakanın tamamı için, görüntü alma ve analizinin tamamlanması yalnızca <1 saat sürer. Bununla birlikte, geleneksel mikroskobik görüntüleme yöntemi de bu laboratuvarda otomatik görüntüleme cihazıkullanılmadan benzer bir performans göstermiştir 7.
Her zaman noktası için tipik bir Q40::YFP toplama testinde tedavi başına toplam 100-150 nematod önerilir ve bu da her biri 10-15 nematod içeren replika kuyucuklarda gerçekleştirilebilir. Bununla birlikte, L1 larvalarının bazı tedavilere veya daha yüksek konsantrasyonlara karşı daha duyarlı olabileceği belirtilmelidir. Bu nedenle, daha yüksek dozlarda test bileşikleri büyümelerini engelleyebilir, bu da yavaş büyüme nedeniyle yanlış pozitif sonuçlara yol açabilir ve böylece poliQ agregasyonunu geciktirebilir. Genellikle, bu endişeyi gidermek ve test bileşiklerinin uygun konsantrasyon aralığını sağlamak için bir gıda temizleme testi yapılabilir23.
PoliQ nörotoksisite testlerinde kullanılan HA759 transgenik nematodları, koekspres OSM-10::GFP ve Htn-Q150’yi test ederek bilateral ASH duyusal nöronlarını net bir şekilde tanımlamayı mümkün kılar. Bu nedenle, ASH nöron sağkalımı GFP ekspresyonunun varlığı veya yokluğu ile değerlendirilir; Genellikle, kontrol nematodlarındaki ASH nöronlarının ~% 40-75’i ölmüştür23,24. İlginçtir ki, HA759 suşunda pqe-1 (poliglutamin arttırıcı-1) genetik mutant arka planı (pqe-1; Htn-Q150), poliQ aracılı toksisiteyi hızlandırır, çoğu ASH nöronunun üç gün içinde, hatta 15 ° C’de bile ölümüne yol açar ve bu nedenle bu suş, daha önce bildirildiği gibi nöronal sağkalım testi için 15 ° C’de yetiştirilir23,24.
HA759 nematodlarında ASH nöronlarının fonksiyonel kaybı, hücre ölümü ve protein agregalarının saptanmasından önce ortaya çıkabilir13; Bu nedenle, ozmotik kaçınma davranışı testi, poliQ aracılı toksisitenin değerlendirilmesi için gereklidir. Düşük sıcaklıkta daha az aktif HA759 nematodlarının davranışsal deneyler üzerindeki potansiyel etkisini en aza indirmek için, kaçınma testi plakaları, bu suşu kullanan nöronal sağkalım testinde olduğu gibi 15 ° C’de değil, nemlendirilmiş 23 ° C’lik bir inkübatörde inkübe edilir. Ek olarak, Htn-Q150 / OSM-10: GFP transgenik nematodlarının burun dokunuşuna karşı oldukça hassas olduğu bildirilmiştir; Bu nedenle, ASH nöron fonksiyonunun alternatif bir tespiti burun dokunma testi13’tür.
The authors have nothing to disclose.
Bu makalede kullanılan protokollerin geliştirilmesine ve iyileştirilmesine yardımcı olan Huang Lab’ın eski üyelerine, özellikle Hanrui Zhang, Lingyun Xiao ve Yanxia Xiang’a teşekkür ederiz. Bu çalışma 111 Projesi (hibe numarası B17018) ve Hebei Eyaleti Doğa Bilimleri Vakfı (hibe numarası H2020207002) tarafından desteklenmiştir.
C. elegans strains | |||
AM141 rmIs133 [unc-54p::Q40::YFP] |
Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | https://cgc.umn.edu/strain/AM141 | |
HA759 rtIs11 [osm-10p::GFP + osm-10p::HtnQ150 + dpy-20(+)] |
Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | https://cgc.umn.edu/strain/HA759 | |
E. coli strains | |||
NA22 | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | https://cgc.umn.edu/strain/NA22 | |
OP50 | Caenorhabditis Genetics Center (CGC) | https://cgc.umn.edu/strain/OP50 | |
Reagent | |||
Agar | Shanghai EKEAR Bio-Technology Co., Ltd. | EQ1001-500G | https://www.ekear.com |
Agarose | Biowest | 111860 | |
Butanedione | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd. | 80042427 | https://www.reagent.com.cn/goodsDetail/d027c00e64c9404d9aa41391fbb59 5d0 |
Cholesterol | Sigma-Aldrich | C8667 | https://www.sigmaaldrich.cn/CN/zh/product/sigma/c8667?context=product |
Glycerol | Aladdin Co., Ltd. | G116203 | https://www.aladdin-e.com/zh_cn/g116203.html |
Peptone | Guangdong HuanKai Microbial Science and Technology Co., Ltd. | 050170B | https://www.huankai.com/show/21074.html |
Sodium azide | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd. | 80115560 | https://www.reagent.com.cn/goodsDetail/5e981aa807664e26af 551e96ff5f07cd |
Sodium hydroxide | Sinopharm Chemical Reagent Co., Ltd. | 10019718 | https://www.reagent.com.cn/goodsDetail/450dfdb1132a4d8a817 d3d8c68ec25e6 |
Sodium hypochlorite solution | Guangzhou Chemical Reagent Factory | 7681-52-9 | http://www.chemicalreagent.com/product/DetailProduct.aspx?id=125 |
Tryptone | Oxoid Ltd. | LP0042B | https://www.thermofisher.cn/order/catalog/product/LP0042B#/LP0042B |
Yeast extract | Oxoid Ltd. | LP0021B | https://www.thermofisher.cn/order/catalog/product/LP0021B#/LP0021B |
Equipment | |||
384-well cell culture plate | Nest Biotechnology Co., Ltd. | 761001 | https://www.cell-nest.com/page94?_l=en&product_id=85 |
48-well cell culture plate | Nest Biotechnology Co., Ltd. | 748001 | https://www.cell-nest.com/page94?_l=en&product_id=85 |
90 mm Petri dish | Sangon Biotech (Shanghai) Co., Ltd. | F611003 | https://www.sangon.com/productDetail?productInfo.code=F611003 |
Autoclave | Panasonic | MLS-3781L-PC | |
Dissecting microscope | ChongQing Optical Co., Ltd. | ZSA0745 | http://www.coicuop.com/plus/view.php?aid=64 |
Fluorescence microscope | Guangzhou Micro-shot Optical Technology Co., Ltd. | Mshot MF31-LED | https://www.mshot.com/article/442.html |
High-content imaging system | Molecular Devices | ImageXpress Pico | https://www.moleculardevices.com/products/cellular-imaging-systems#High-Content-Imaging |
Microcentrifuge | GeneCompany | GENESPEED X1 | https://www.genecompany.com/index.php/Home/Goods/goodsdetails/gid/189.html |
Microscope digital camera | Guangzhou Micro-shot Optical Technology Co., Ltd. | MS60 | https://www.mshot.com/article/677.html |
Microwave | Midea Corp. | M1-211A | https://www.midea.cn/10000/10000000001 00511264425.html |
Parafilm M | Sigma-Aldrich | P7793-1EA | https://www.sigmaaldrich.cn/CN/en/product/sigma/p7793?context=product |
Shaker | Zhicheng Inc. | ZWY-2102C | http://www.zhicheng.net/Product/0865291356.html |
Software | |||
Image acquisition and analysis software | Molecular Devices | MetaXpress | https://www.moleculardevices.com/products/cellular-imaging-systems/acquisition-and-analysis-software/metaxpress |
OriginPro | OriginLab Corp. | Version 9.8.5.204 | 1. Software introduction: https://www.originlab.com/index.aspx?go=Products/Origin 2. Instruction for creating a radar chart: https://www.originlab.com/doc/Origin-Help/RadarChart-Graph 3. Video tutorial for creating a radar chart: https://www.originlab.com/videos/details.aspx?pid=1813 |