פרוטוקול זה מדגים שיטה פשוטה וחזקה לחקר גדילת אקסון באתרו ודינמיקת חרוט גדילה. הוא מתאר כיצד להכין פרוסות מוח חריפות רלוונטיות מבחינה פיזיולוגית ex vivo ומספק צינור ניתוח ידידותי למשתמש.
במהלך ההתפתחות העצבית, אקסונים מנווטים בסביבה קליפת המוח כדי להגיע ליעדם הסופי וליצור קשרים סינפטיים. אצטרובלים גדילה – המבנים החושיים הממוקמים בקצות הדיסטליים של פיתוח אקסונים – מבצעים את התהליך הזה. חקר המבנה והדינמיקה של חרוט הגדילה חיוני להבנת ההתפתחות האקסונאלית והאינטראקציות עם מערכת העצבים המרכזית (CNS) הסובבת אותה ומאפשרות לה ליצור מעגלים עצביים. זה חיוני כאשר מתכננים שיטות לשילוב מחדש של אקסונים במעגלים עצביים בעקבות פגיעה במחקר בסיסי ובהקשרים פרה-קליניים. עד כה, ההבנה הכללית של דינמיקת חרוט הצמיחה מבוססת בעיקר על מחקרים של נוירונים שעברו תרבית בשני ממדים (דו-ממדיים). למרות שהם ללא ספק בסיסיים לידע הנוכחי של דינמיקה מבנית של חרוט גדילה ותגובה לגירויים, מחקרים דו-ממדיים מציגים באופן שגוי את הסביבה התלת-ממדית הפיזיולוגית (התלת-ממדית) שבה נתקלים מדוכים של גדילה עצבית ברקמת CNS שלמה. לאחרונה, ג’לים של קולגן שימשו כדי להתגבר על חלק מהמגבלות הללו, מה שאפשר לחקור את ההתפתחות העצבית בתלת-ממד. עם זאת, הן סביבות דו-ממדיות סינתטיות והן סביבות תלת-ממדיות חסרות רמזי איתות בתוך רקמת מערכת העצבים המרכזית, המכוונים את ההרחבה ואת איתור הנתיב של אקסונים מתפתחים. פרוטוקול זה מספק שיטה לחקר אקסונים ואצטרובלים גדילה באמצעות פרוסות מוח אורגנוטיפיות, שבהן אקסונים מתפתחים נתקלים ברמזים פיזיקליים וכימיים רלוונטיים מבחינה פיזיולוגית. על ידי שילוב של כוונון עדין באלקטרופורציה של רחם ואקס רחם כדי לספק בדלילות כתבים פלואורסצנטיים יחד עם מיקרוסקופיה ברזולוציה גבוהה במיוחד, פרוטוקול זה מציג צינור מתודולוגי להדמיה של דינמיקת אקסון וחרוט גדילה באתרם. יתר על כן, כלול תיאור מפורט של ערכת כלים של ניתוח נתוני הדמיה ארוכי טווח ותאים חיים.
נוירונים הם תאים מקוטבים מאוד המייצגים את היחידה החישובית הבסיסית במערכת העצבים. הם מקבלים ופולטים מידע המסתמך על מידור של אתרי קלט ופלט: דנדריטים ואקסונים, בהתאמה1. במהלך הפיתוח, אקסונים מתרחבים תוך ניווט בסביבה מורכבת מדהימה כדי להגיע ליעדם. ניווט האקסון מונחה על ידי חרוט הצמיחה, מבנה חושי הממוקם בקצה האקסון המתפתח. חרוט הצמיחה אחראי על איתור רמזים סביבתיים ותרגומם לארגון מחדש מרחבי דינמי של השלד הציטוסקלטוןשלו 2,3. התגובות המורפו-מכניות המתקבלות מורות לחרוט הגדילה להתארך או לסגת מהרמז המפעיל, מה שמוביל לתמרוני אקסון ספציפיים.
ההבנה הנוכחית של הרחבת אקסון ודינמיקת חרוט גדילה נובעת ממחקרים המעריכים צמיחת אקסון על פני מצעים דו-ממדיים (דו-ממדיים) 2,4,5,6,7. מחקרים חלוציים אלה זיהו יחסי גומלין מתוחכמים בין אצטרובלים של גדילה למצעי גדילה וחשפו הבדלים בולטים התלויים במאפייני המצע כגון דבקות וקשיחות 8,9. בהנחיית תובנות אלה, הושערו רמזים סביבתיים חוץ-תאיים כדי להכתיב את צמיחת האקסון, כאשר שלד חרוט הצמיחה ביצע צמיחה זו 2,10,11,12. יש לציין כי נוירונים יכולים להרחיב אקסונים במצעים שאינם דביקים (למשל, פולי-ליזין, פולי-אורניתין)13. יתר על כן, קשיחות המצע יכולה להשפיע על קצב גדילת האקסון ללא תלות בקומפלקסים של דבקות תאים8. לפיכך, חקר דינמיקת חרוט גדילה במצעים דו-ממדיים בלבד אינו יכול להעריך במדויק את מאזן הכוחות הנובעים מהאינטראקציה של אצטרובלים של גדילה אקסונאלית עם סביבות תלת-ממדיות (תלת-ממדיות) רלוונטיות מבחינה פיזיולוגית, כגון אלה שנמצאו ב- vivo.
כדי להתגבר על המגבלות של המבחנים הדו-ממדיים, נחקרו דינמיקות של צמיחת אקסון וצמיחה של חרוטים במטריצות תלת-ממדיות 8,9. מטריצות אלה מציבות הקשר פיזיולוגי רב יותר, אך מאפשרות לחקור מנגנונים פנימיים של צמיחת אקסון. היא מאפשרת בדיקת חרוט גדילה באופן חד-תאי במגוון מצבים וטיפולים פרמקולוגיים9. בסביבות תלת-ממדיות כאלה, אקסונים הציגו דינמיקה ייחודית של שלד ציטוסקטלי וגדלו מהר יותר מאלו שנצפו בתאי עצב בתרבית דו-ממדית9. מחקרים אלגנטיים אלה הדגימו את השפעתו של ממד נוסף על הארגון מחדש של שלד חרוט הצמיחה, וכתוצאה מכך על התנהגותו.
למרות היתרונות לכאורה שמציגות מטריצות תלת-ממדיות על פני משטחים דו-ממדיים בתמיכה בהתפתחות עצבית דמוית-יליד ובצמיחת אקסון, הן עדיין פיגום סינתטי פשוט שאינו יכול לשקף את המורכבות של הדינמיקה שנצפתה ברקמת מערכת העצבים המרכזית (CNS). כאן, מסירת פלסמידי כתבים על ידי אקס רחם ובאלקטרופורציה של רחם שולבה עם תרבית פרוסות אורגנוטיפיות במוח והדמיה ברזולוציה סופר-רזולוציה חיה באתרה כדי לנתח דינמיקה של חרוט גדילה בהקשר פיזיולוגי. מתודולוגיה זו מאפשרת הדמיה של אקסונים מתפתחים תוך התנסות בתלת-ממדיות של סביבות in vivo ובמורכבות ההרכב הפיזיקוכימי שלהן. לבסוף, מתוארים נהלים ידידותיים למשתמש למדידת צמיחת אקסון ודינמיקת חרוט צמיחה באמצעות תוכנות מורשות וציבוריות נפוצות.
האופן שבו אצטרובלים של גדילה חשים ומגיבים לסביבתם כדי לתאם הרחבה והכוונה בו-זמנית של אקסון עדיין נתון לוויכוח 3,18. מחקרים חלוציים במצעים דו-ממדיים סיפקו הצצה למנגנונים המולקולריים הבסיסיים היוצרים את הכוחות המניעים את דינמיקת חרוט הצמיחה במהלך היווצרות אקסון, צמיחה וניווט 2,10,11,12,19. לאחרונה, מחקרים במטריצות תלת-ממדיות חשפו כמה השפעה יש למימד שלישי בהתנהגות של חרוט הצמיחה וכתוצאה מכך בצמיחת אקסון 8,9. עם זאת, המנגנונים המורכבים המנחים את דינמיקת חרוט הצמיחה in vivo עדיין צריכים להיבדק ביסודיות.
הכנת תרביות פרוסות אורגנוטיפיות ממוחות IUE או EUE נמצאת בשימוש נרחב ומתועדת היטב. זה הפך לסטנדרט זהב המאפשר למדענים לקבל תובנות על ההתפתחות וההתנהגות של נוירונים ברקמת המוחהחיה 20,21. ואכן, טכניקה זו נוצלה בהצלחה בשילוב עם טכניקות הדמיה שונות ברזולוציה גבוהה כדי לדמיין תהליכים מולקולריים ספציפיים ואירועים מורפולוגיים באתרם. מחקרים כאלה כוללים, בין היתר, היווצרות אקסון והרחבה19,22, נדידה עצבית בקליפת המוח 19,22,23,24, דינמיקה של סנטרוזומים 25,26, דינמיקה של מיקרוטובול27, כמו גם הדינמיקה התפקודית של תאים טרום-תאיים ופוסט-סינפטיים28,29.
פרוטוקול זה מטפל בפער בנויירוביולוגיה הניסויית, ומדמיין את דינמיקת חרוט הגדילה של התפתחות נוירונים בקליפת המוח באתרם, בתרביות פרוסות מוח חריפות ex vivo , ובכלים לניתוח הנתונים המתקבלים.
תרביות פרוסות מוח חריפות נוצלו כדי לקבוע פרוטוקול זה מכיוון שהן (1) עם תרגול כלשהו, קלות ליצירה; (2) להציג מערכת נגישה לחקר אצטרובלים גדילתיים המוטמעים בסביבה מעין פיזיולוגית מלאה, אך שקופים מספיק כדי לאפשר הדמיה של תאים חיים ברזולוציה גבוהה; (3) ניתן להרחיב לשימושו עם מספר עצום של קווי עכבר מהונדסים; (4) בשילוב עם IUE או EUE, מספקים פוטנציאל כמעט בלתי מוגבל לספק כלים מולקולריים להערכת הביצועים של אצטרובלים ואקסונים של גדילה in vivo תחת משטרי אובדן/רווח של תפקוד, יחד עם כתבים פלואורסצנטיים ובדיקות שלד ציטוסקלטון.
מתודולוגיה זו תוארה בהקשר של EUE ו- IUE. למרות שעדיין מדובר בשיטה אמינה ביותר, EUE הביאה לעלייה בשכיחות של פרוסות מוח שהראו רשת RG לא מאורגנת בהשוואה לאלה שהתקבלו עם IUE כשיטת אספקה (איור 4C). הפרעות במערך RG משפיעות מאוד על הנדידה העצבית ועל דפוס התארכות האקסון30,31. אלה הם פרמטרים מרכזיים המנבאים היכן למצוא אקסונים לניתוח בזמן נתון ואת סוג הסביבה שהם מנווטים בה. פרוסות מוח עם רשת RG משובשת באופן משמעותי בדרך כלל פוגעות בריבוד נוירונים בקליפת המוח. זה, בתורו, מייצר אקסונים עם מסלולים כאוטיים. לכן, מומלץ מאוד לשלוט בשלמות המבנית של רשת RG. באופן מעניין, שלמות מבנית ירודה מתואמת עם גיל מוגבר של המוח העוברי. ואכן, השפעות כאלה בעוברי E12.5-E13.5 צעירים יותר בדרך כלל לא נצפו19.
הפרוטוקול הנוכחי הוא יסודי ופשוט. עם זאת, ישנם כמה צעדים קריטיים שבהם יש לנקוט בזהירות ובתשומת לב מיוחדת כדי להשיג תוצאות אופטימליות. אלה צוינו במפורש בפרוטוקול וכוללים (1) כוונון כמות הדנ”א המשמשת באלקטרופורציה כדי לקבל תיוג דליל; (2) הימנעות מנזק במהלך מיצוי המוח; (3) שליטה בטמפרטורת האגרוז במהלך מעטפת המוח; (4) פתרון בעיות באחוזים האידיאליים של אגרוז עבור מוחות בגיל נתון; ו-(5) בחירה של פלואורופורים, שהניסיון שלהם עוקב אחריהם. במהלך אופטימיזציה של הפרוטוקול, נבדקו הביצועים של מספר פלואורופורים בהדמיית תאים חיים באתרם. גרסאות GFP מונומריות EGFP ו-NeonGreen להכנת הפלסמידים המתויגים של LifeAct ו-Lyn נבחרו לפרוטוקול זה (איור 5A,B). בנוסף, גרסת ה-RFP mScarlet נבדקה ונמצאה מתאימה מאוד למערך זה (הנתונים לא מוצגים). כמו כן נבדקו tRFP (דימר) ו-ZsGreen (טטרמר) (איור 5C ווידאו משלים 1, מימין). פלואורופורים סופר-בהירים אלה המתקפלים במהירות מומלצים כאשר השיטה דורשת יצירת אותות פלואורסצנטיים מהירים לאחר מסירת DNA.
פרקטיקה נפוצה בשימוש בתרביות פרוסות היא שימוש בפרוסות ממוחות שונים כדי לבחון שליטה ומצבי ניסוי. זה מייצג מקור אינהרנטי של שונות לא רצויה. כאן נעשה שימוש במערכת ביטוי המאפשרת שינוי בלתי תלוי של תאי עצב שכנים וביטוי של כתבים לזיהוי. שימו לב שבהדגמה זו (איור 5C), לא היו הבדלים בין תאי עצב המבטאים אף אחד מהפלואורופורים. עם זאת, כדוגמה, תערובת פלסמידים כזו בשילוב עם קו עכברים מהונדס בעל גן רגיש ל-Cre יתויגו עם נוירוני tRFP (רגישים ל-Dre) שנשארו כסוג פראי. לעומת זאת, ה-ZsGreen (גם הוא רגיש ל-Cre) יתייג את הנוירונים הרקומבינציה. לפיכך, אצטרובלים של שני הגנוטיפים השונים, וככל הנראה גם פנוטיפים, יכולים להיחקר זה לצד זה בו זמנית באותה פרוסת מוח.
לוקליזציה של אקסונים ומדוכים צמיחה לניתוח היא שיקול חשוב. נוירונים בקליפת המוח מקוטבים בזמן שהם נודדים באופן רדיאלי מאזור החדר (VZ) לעבר הצלחת בקליפת המוח (CP). במהלך תהליך זה, נוירונים יוצרים תהליך מוביל (דנדריט עתידי) ותהליך נגרר שיהפוך לאקסון, ובסופו של דבר יצטרף לאקסונים חלוציים באזור הביניים (IZ), ויקים דרכי אקסון32. לכן, כדי ללכוד חרוטים של גדילה אקסונאלית, ההדמיה נעשתה על סיבים אקסונאליים ב-IZ, כולל אקסונים היוצאים מה-CP ואקסונים שנוצרו מוקדם שכבר קשורים לחבילות אקסונליות; או בסופו של דבר, בסיבים שחוצים את ה-IZ ומתרחבים מתחתיו (איור 7).
פרוטוקול זה מאפשר לבצע הדמיה ברזולוציה גבוהה במיוחד של נוירונים בתוך פרוסות אורגנוטיפיות. מבחינה היסטורית, פיזור אור היה בעיה משמעותית שעמדה בפני הדמיה בעת הדמיה של דגימות עבות. במהלך שני העשורים האחרונים, התקדמות נרחבת בטכנולוגיות אופטיות אפשרה הדמיה של דגימות עבות. כאן, מטרה למרחק עבודה ארוך שימשה כדי לדמיין מבנים קטנים יותר טוב יותר, כגון אצטרובלים צמיחה. באופן בלתי נמנע, פרוטוקול זה אינו לוכד אירועים מפורטים יותר כגון זרימת אקטין מדרדרת או דינמיקה של מיקרוטובול. המטרה למרחק עבודה ארוך, המחייבת צמצם נומרי נמוך יותר (NA), שומרת על מידע מפרוסות עבות. עם זאת, ניתן היה גם להתאים את הפרוטוקול הזה לשימוש עם מטרות של מרחק עבודה קצר יותר. זה דרש העברה חלקה של פרוסות לתבשיל עם תחתית זכוכית כדי לשמור על שלמות המבנה. עם זאת, שימוש בשיטה זו הביא להישרדות קצרה יותר – ~ 15 שעות – עקב אובדן חילופי גזים (נתונים שלא הוצגו). שלא כמו תרבויות דו-ממדיות, אצטרובלים של גדילה בתלת-ממד תופסים נפח גדול יותר ודורשים פיצוי תנועה-תוצר בציר z. כדי להגדיל את היכולת לצלם אירועים מפורטים, יש להשתמש בטכנולוגיה קונפוקלית מודרנית. לכן, מומלץ להשתמש במנוע z-stack בסריקה מהירה, כגון z-Galvo הזמין במיקרוסקופים קונפוקליים רגישים ביותר33.
יש לציין כי פרוטוקול זה מציג שלוש מגבלות עיקריות. ראשית, לעתים קרובות מאתגר לשלוט ברמות הביטוי/מספר התאים המבטאים של כל פלסמיד נתון in vivo. זה מציג שונות בין כל הפרוסות גם כאשר שומרים על אותו ריכוז פלסמיד. לכן, הבחירה של האלמנטים הרגולטוריים בווקטורי הביטוי המשמשים חייבת להיות קבועה מראש בזהירות. שנית, הדמיה של אירועים מפורטים באמצעות תוספות ממברנה אינה אפשרית כיום. ניתן להתגבר על מגבלה שנייה זו עם העדכונים המתודולוגיים שהוצעו בפסקה הקודמת. לבסוף, אצטרובלים גדילה רגישים מאוד לאור ויכולים להפוך במהירות לפומבינציה. לכן, הדמיה תכופה של אצטרובלים גדילה, במשך 5 דקות בלבד באמצעות מיקרוסקופים לסריקת לייזר, יכולה לעתים קרובות למוטט את אצטרובל הצמיחה. בהקשר זה, ניתן להתאים התקדמות חדשה במכשירים שנוצרו במיקרוסקופיה של יריעות אור להדמיה ארוכת טווח של פרוסות המוח34.
פרוטוקולים כאלה צפויים לפתוח אפיקי מחקר חדשים, ולאפשר הבנה טובה יותר של מה שנדרש כדי שחרוט גדילה יקרא ויגיב לעבר סביבת in vivo מורכבת, וחשוב מכך, כדי לפענח את המכניקה של משחק הגומלין המתוחכם הזה.
The authors have nothing to disclose.
ברצוננו להודות למריה יוג’ניה ברניס על צילום הנהלים. אנו מודים גם לאמילי ברנסייד, אמילי הנדלי, ת’ורבן פיטרלה, מקס שלסקי וסינה שטרן על שקראו את כתב היד ודנו בו. אנו אסירי תודה לעוזרות הטכניות הבולטות שלנו, ג’סיקה גונייה, בלנקה רנדל ואנה-טואן פאם. אנו מכירים בתמיכה החשובה של מתקן מיקרוסקופ האור של DZNE ומתקן בעלי החיים. עבודה זו נתמכה על ידי Deutsche Forschungsgesellschaft (DFG), הקרן הבינלאומית למחקר בפרפלגיה (IRP) וכנפיים לחיים (עד F.B). F.B. הוא חבר באשכול המצוינות ImmunoSensation2, SFBs 1089 ו- 1158, והוא חתן פרס רוג’ר דה ספולברך.
Adson Forceps | Fine Science Tools | 11006-12 | |
Alexa Fluor 488 | Invitrogen | A21202 | Goat Anti-Mouse |
Alexa Fluor 647 | Invitrogen | A21236 | Goat Anti-Mouse |
Anti-Vimentin antibody | sigma-Aldrich | V2258-.2ML | Monoclonal mouse, clone LN-6, ascites fluid |
B27 supplement | ThermoFisher Scientific | 17504044 | |
Betadine | B. Braun | 3864154 | |
Biozym Sieve GP Agarose | Biozyme | 850080 | |
Braunol, Sprühflasche | B. Braun | 3864073 | |
Buprenorphine (Temgesic) | GEHE Pharma | 345928 | |
DAPI | sigma-Aldrich | D9542 | |
DMZ unevirsal electrode puller | Zeitz | NA | |
Electric razor | Andes | NA | ProClip UltraEdge Super 2-Speed model |
Enrofloxacin (Baytril) | Bayer | 3543238 | 2,5% (wt/vol) |
Eppendorf microloader pipette tips | FischerScientific | 10289651 | |
Fast Green FCF | Sigma-Aldrich | F7252-5G | Dye content ≥ 85 % |
Fetal Bovine Serum | ThermoFisher Scientific | 10500064 | |
Fiji 2.1.0 | NIH | NA | https://imagej.net/software/fiji/downloads |
Fine Scissors | Fine Science Tools | 14058-09 | ToughCut/Straight/9cm |
FluoroDish Cell Culture Dish | World Precision Instruments | FD5040-100 | |
Fluoromount Aqueous Mounting Medium | sigma-Aldrich | F4680-25ML | |
Glucose | MedPex | 3705391 | 5% |
GlutaMAX Supplement | ThermoFisher Scientific | 35050061 | |
Glycine | Sigma-Aldrich | G8898 | |
HBSS | Life Technologies | 14025092 | calcium, magnesium, no phenol red |
Horse serum | Pan-Biotech | P30-0711 | |
Imaris 9.7.2 | Bitplane | NA | https://imaris.oxinst.com/products/imaris-for-neuroscientists |
Isoflurane | Virbac | NA | |
Isotonic saline solution | B. Braun | 8609261 | 0.90% |
Leica VT1200 S vibratome | Leica | 14048142066 | |
LSM 880 with Airyscan | Zeiss | NA | |
Metacam | Venusberg Apotheke | 8890217 | 5 mg/ml |
Mice | Janvier Labs | NA | C57BL/6JRj |
Micro-Adson Forceps | Fine Science Tools | 11018-12 | |
Micropipette Storage Jar | World Precision Instruments | E210 | 16.16.27 |
Microsoft Excel | Microsoft | NA | https://www.microsoft.com/en-us/microsoft-365/p/excel/cfq7ttc0k7dx?activetab=pivot:overviewtab |
Millicell Cell Culture Insert | EMD Millipore | PICM0RG50 | 30 mm, hydrophilic PTFE, 0.4 µm |
Moria Perforated Spoons | Fine Science Tools | 10370-18 | |
Moria Spoon | Fine Science Tools | 10321-08 | |
Neurobasal Medium, minus phenol red | ThermoFisher Scientific | 12348017 | |
Neuropan-2 supplement | Pan-Biotech | P07-11010 | |
Normal goat serum | Abcam | ab138478 | |
Olsen-Hegar Needle Holder with Scissors | Fine Science Tools | 12002-12 | |
p-Tub-alpha-1-Dre | Addgene | 133925 | |
p-Tub-alpha-1-iCre | Addgene | 133924 | |
p-Tub-alpha-1-LifeAct-GFP | Addgene | 175437 | |
Parafilm | VWR | 52858-000 | |
Paraformaldehyde | sigma-Aldrich | P6148 | |
PBS | Sigma-Aldrich | P3813-10PAK | |
pCAG-lox-rox-STOP-rox-tRFP-lox-Lyn-ZsGreen | Addgene | 175438 | |
pCAG-lox-STOP-lox-Lyn-mNeonGreen | Addgene | 175257 | |
Penicillin-Streptomycin | ThermoFisher Scientific | 15140122 | |
PicoNozzle Kit v2 | World Precision Instruments | 5430-ALL | |
Platinum Tweezertrodes | Harvard Apparatus | 45-0487 | 1 mm / 3 mm |
QIAGEN Maxi kit | QIAGEN | 12162 | |
Reflex wound closure Clip | World Precision Instruments | 500344-10 | 7 mm |
Sekundenkleber Pattex Mini Trio | Lyreco | 4722659 | |
Square wave electroporation system ECM830 | Harvard Apparatus | W3 45-0052 | |
Sterile gauze | Braun Askina | 9031216 | |
Sterile lubricant eye ointment | Bayer Vital | PZN1578675 | |
Sterile surgical gloves | Sempermed | 14C0451 | |
Sucrose | Roth | 4621.2 | |
Supramid 5-0 surgical silk sutures | B. Braun | NA | |
Thin-wall glass capillaries | World Precision Instruments | TW100-4 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X100 | |
Vannas spring scissors | Fine Science Tools | 15000-03 | |
µ-Slide 8 Well Glass Bottom | Ibidi | 80827 |