La méthode Updegraff est la méthode la plus largement utilisée pour l’estimation de la cellulose. L’objectif principal de cette démonstration est de fournir un protocole updegraff détaillé pour l’estimation de la teneur en cellulose dans les échantillons de biomasse végétale.
La cellulose est le polymère le plus abondant sur Terre généré par la photosynthèse et le principal composant porteur des parois cellulaires. La paroi cellulaire joue un rôle important dans la croissance et le développement des plantes en fournissant la force, la rigidité, le taux et la direction de la croissance cellulaire, le maintien de la forme cellulaire et la protection contre les facteurs de stress biotiques et abiotiques. La paroi cellulaire est principalement composée de cellulose, lignine, hémicellulose et pectine. Récemment, les parois cellulaires végétales ont été ciblées pour la production de biocarburants et de bioénergie de deuxième génération. Plus précisément, la composante cellulose de la paroi cellulaire végétale est utilisée pour la production d’éthanol cellulosique. L’estimation de la teneur en cellulose de biomasse est essentielle pour la recherche fondamentale et appliquée sur les paroi cellulaires. La méthode Updegraff est simple, robuste et la méthode la plus utilisée pour estimer la teneur en cellulose cristalline de la biomasse végétale. La fraction insoluble de mur brut d’alcool de cellules au traitement avec le réagent d’Updegraff élimine les fractions d’hémicellulose et de lignine. Plus tard, la fraction résistante à la cellulose réaccétique Updegraff est soumise à un traitement à l’acide sulfurique pour hydrolyser l’homopolymère de cellulose en unités de glucose monomères. Une ligne de régression est développée en utilisant diverses concentrations de glucose et utilisée pour estimer la quantité de glucose libérée sur l’hydrolyse de cellulose dans les échantillons expérimentaux. Enfin, la teneur en cellulose est estimée en fonction de la quantité de monomères de glucose par essai colorimétrique anthrone.
La cellulose est le principal composant porteur de charges des parois cellulaires, qui est présent dans les parois cellulaires primaires et secondaires. La paroi cellulaire est une matrice extracellulaire qui entoure les cellules végétales et est principalement composée de cellulose, lignine, hémicellulose, pectine et protéines matricielles. Environ un tiers de la biomasse végétale est la cellulose1 et elle joue un rôle important dans la croissance et le développement des plantes en fournissant la force, la rigidité, le taux et la direction de la croissance cellulaire, le maintien de la forme cellulaire et la protection contre les facteurs de stress biotiques et abiotiques. La fibre de coton contient 95% de cellulose2 contenu, tandis que les arbres contiennent 40% à 50% de cellulose selon les espèces végétales et les typesd’organes 3. La cellulose est composée d’unités répétées de cellobiose, un disaccharide de résidus de glucose reliés par β-1,4 liaisons glycosidiques4. L’éthanol cellulosique est produit à partir du glucose dérivé de la cellulose présente dans les parois cellulairesvégétales 5. La fibre cellulosique est composée de plusieurs micro fibrilles dans lesquelles chaque micro fibril agit comme unité centrale avec 500-15000 monomères de glucose1,6. L’homopolymère de cellulose est synthétisé par des complexes de synthase de cellulose embarqués par membrane plasmatique (CSC)1,7. Les protéines individuelles de synthase de cellulose A (CESA) synthétisent des chaînes de glucane et les chaînes de glucanes adjacentes sont reliées par des liaisons hydrogène pour former la cellulose cristalline1,8. La cellulose existe sous plusieurs formes cristallines avec deux formes prédominantes, la cellulose Iα et la cellulose Iβ sous forme de formes indigènes9. Dans les plantes supérieures, la cellulose existe sous forme de cellulose Iβ tandis que la cellulose végétale inférieure existe sous forme Iα10,11. Dans l’ensemble, la cellulose joue un rôle important en donnant de la force et de la rigidité aux parois des cellules végétales.
Les biocarburants de première génération sont principalement produits à partir de amidon de maïs, de sucres de canne et de sucres de betterave, qui sont des sources alimentaires, tandis que les biocarburants de deuxième génération se concentrent sur la production de biocarburants à partir de matériaux non alimentaires de paroi cellulaire à base de cellules debiomasse végétale 12. L’estimation précise de la teneur en cellulose cristalline est non seulement importante pour la recherche fondamentale sur la biosynthèse de la cellulose et la dynamique des paroi cellulaires, mais aussi pour la recherche appliquée sur les biocarburants et les bioprodits. Diverses méthodes ont été développées et optimisées pour l’estimation de la cellulose dans la biomasse végétale, et la méthode Updegraff est la méthode la plus largement utilisée pour l’estimation de la cellulose. La première méthode rapportée pour l’estimation de cellulose était par Croix et Bevan en 190813. La méthode était basée sur le principe de la chloration et de l’extraction alternatives par sulfate de sodium. Cependant, la cellulose obtenue par les protocoles originaux et modifiés de la méthode Cross et Bevan a montré la contamination de petites fractions de lignine en plus d’une quantité substantielle de xylans et mannans14. En dépit de plusieurs modifications pour enlever la lignine et les hémicelluloses de la fraction de cellulose, la méthode de Cross-Bevan a conservé une quantité considérable de mannans avec la cellulose. Plus tard, la méthode de Kurschner a été développée en employant l’acide nitrique et l’éthanol pour extraire la cellulose15. Cette méthode a déclaré que la lignine totale et 75% des pentosans ont été enlevés, mais les résultats réels de cellulose étaient les mêmes que ceux estimés par la méthode de chloration de Cross et Bevan. Une autre méthode (Norman et Jenkins) a été développée en employant le méthanol-benzène, le sulfate de sodium, et l’hypochlorite de sodium pour extraire la cellulose16. Cette méthode a également conservé une fraction de lignine (3%) et des quantités importantes de pentosans conduisant à une estimation précise de la cellulose. Plus tard, Kiesel et Semiganowsky ont utilisé une approche différente pour hydrolyser la cellulose en utilisant 80% d’acide sulfurique concentré, et les sucres réduits hydrolysés ont été estimés par la méthode de Bertrand17. Les deux méthodes, Waksman et Stevens18 et Salo14,19 quiont été développées sur la base de la méthode de Kiesel et Semiganowsky, ont également donné 4-5% moins de contenu en cellulose par rapport aux méthodes antérieures20.
La méthode Updegraff est la méthode la plus utilisée pour estimer la teneur en cellulose cristalline. Cette méthode a été décrite pour la première fois par Updegraff pour la mesure de la cellulose en 196921. La méthode Updegraff intègre la méthode Kurschner (utilisation d’acide nitrique), les méthodes Kiesel et Seminowsky (hydrolyse de cellulose dans les monomères de glucose utilisant de l’acide sulfurique) avec quelques modifications, et l’essai anthrone de Viles et Silverman pour une estimation colorimétrique simple du glucose et de la teneur en cellulose cristalline22. Le principe de cette méthode est l’utilisation de l’acide acétique et de l’acide nitrique (réagent updegraff) pour éliminer l’hémicellulose et la lignine des tissus végétaux homogénéisés, qui laisse la cellulose résistante à l’acide acétique/nitrique pour un traitement et une estimationultérieurs 15. La cellulose résistante à l’acide acétique/nitrique est traitée avec 67% d’acide sulfurique pour casser la cellulose en monomères de glucose et les monomères de glucose libérés sont estimés par essai anthrone21,23. Plusieurs modifications de la méthode originale d’Updegraff ont été employées pour simplifier la procédure et l’estimation de cellulose par l’essai anthrone24. Dans l’ensemble, cette méthode peut être divisée en cinq phases. Dans la première phase, le matériel végétal est préparé. Dans la deuxième phase, la paroi cellulaire brute est séparée de la biomasse totale, car la cellulose est le composant clé des parois cellulaires végétales. Plus tard, dans la troisième phase, la cellulose est séparée des composants non cellulosiques de la paroi cellulaire en traitant avec le réaccente Updegraff. Dans la quatrième phase, la cellulose résistante à l’acide acétique/nitrique est divisée en monomères de glucose par traitement à l’acide sulfurique. Le traitement acide sulfurique de la cellulose entraîne la formation de composés 5 hydroxyméthylfurfural de la réaction des monomères de glucose avec de l’acide sulfurique. Enfin, dans la dernière phase, l’anthrone génère un complexe bleu verdâtre en bouillant avec le composé furfural généré dans la phaseprécédente 25. Cette méthode colorimétrique à base d’anthrone a été utilisée pour la première fois en 1942 par Dreywood. Anthrone est un colorant qui identifie les composés furfural de pentose et de produits déshydratés à l’hexose tels que les produits déshydratés 5 hydroxyméthylfurfural, dans des conditions acides. La réaction avec l’hexose produit une couleur intense et une meilleure réponse comparée aux pentoses25. La quantité de glucose lié est mesurée par absorption du spectrophotomètre à 620 nm et l’intensité du complexe bleu verdâtre est directement proportionnelle à la quantité de sucre dans l’échantillon. Les valeurs d’absorption mesurées ont été comparées à une ligne standard de régression de courbe de glucose pour calculer la concentration de glucose de l’échantillon. La teneur mesurée en glucose a été utilisée pour estimer la teneur en cellulose de la biomasse végétale.
Les fibres de coton sont des fibres naturelles produites à partir des oléagineux. La fibre de coton est une cellule unique avec la teneur en cellulose ~95%2 avec la teneur élevée en cellulose cristalline avec des applications étendues dans l’industrie textile31. Comme, fibre de coton contient ~ 95% cellulose, nous avons utilisé des tissus de racine de coton pour la démonstration de l’estimation de la teneur en cellulose cristalline. Les tissus racinaires de coton…
The authors have nothing to disclose.
Nous remercions le ministère des Sciences des plantes et des sols et Cotton Inc. pour leur appui partiel à cette étude.
Acetone | Fisher Chemical | A18-500 | Used in the protocol |
Anthrone | Sigma Aldrich | 90-44-8 | For colorimetric assay |
Centrifuge | Eppendorf | 5424 | For centrifugation |
Chloroform | Mallinckrodt | 67-66-3 | Used in the protocol |
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) | Sigma Aldrich | 6381-92-6 | Used in the protocol |
Ethanol | Millipore Sigma | EM-EX0276-4S | Used in the protocol |
Filter paper | Whatman | 1004-090 | Positive control |
Glacial acetic acid | Sigma | SKU A6283 | Used in the protocol |
Heat block/ ThermoMixer F1.5 | Eppendorf | 13527550 | For controlled temperatures |
Incubator | Fisherbrand | 150152633 | Used for drying plant sample |
Measuring Scale | Mettler Toledo | 30243386 | For specific quantities |
Methanol 100 % | Fisher Chemical | A412-500 | Used in the protocol |
Microplate (96 well) | Evergreen Scientific | 222-8030-01F | For anthrone assay |
Nitric acid | Sigma Aldrich | 695041 | Used in the protocol |
Polypropylene Microvials (2 mL) / screw capped tubes | BioSpec Products | 10831 | For high temperatures |
Spectrophotometer(Multimode Detector) | Beckmancoulter DTX880 | 1000814 | For measuring absorbances |
Spex SamplePrep 6870 Freezer / Mill | Spex Sample Prep | 68-701-15 | For grinding plant tissues into fine powder |
Sulphuric acid | J.T.Baker | 02-004-382 | Used in the protocol |
Sodium dodecyl sulfate (SDS) | Sigma Aldrich | 151-21-3 | Used in the PSB buffer |
Tubes (2 mL) | Fisher Scientific | 05-408-138 | Used in the protocol |
Tris Hydrochloride | Sigma Aldrich | 1185-53-1 | Used in the PSB buffer |
Ultrapure distilled water | Invitrogen | 10977 | Used in the protocol |
Vacuum dryer (vacufuge plus) | Eppendorf | 22820001 | For drying samples |
Vortex mixer | Fisherbrand | 14-955-151 | For mixing |
Waterbath | Thermoscientific | TSGP02PM05 | For temperature controlled conditions at specific steps |
Weighing Paper | Fisher Scientific | 09-898-12A | Used in the protocol |