Ce protocole fournit une méthode pour étudier l’infection de mycobactérie de tuberculose dans les macrophages humains M1- ou M2-polarisés basés sur la différenciation des monocytes périphériques de sang aux cellules macrophage-comme qui sont infectées par la souche virulente GFP-étiquetée H37Rv, et analysées avec la cytométrie de flux utilisant un panneau de 10 couleurs comprenant l’expression des marqueurs M1/M2 choisis.
Les macrophages humains sont les principales cellules hôtes de l’infection intracellulaire de Mycobacterium tuberculosis (Mtb) et jouent ainsi un rôle central dans la lutte immunitaire contre la tuberculose. Nous avons établi un protocole expérimental pour suivre la polarisation immunitaire des cellules dérivées des myéloïdes en cellules macrophages M1 (classiquement activées) ou M2 (alternativement activées) par l’évaluation avec un panneau de cytométrie de flux de 10 couleurs qui permet la visualisation et la caractérisation profonde de la tonte vert fluorescent-protéine (GFP) étiquetée dans divers sous-ensembles de macrophages. Les monocytes obtenus auprès de donneurs de sang sains ont été polarisés en cellules M1 ou M2 en utilisant la différenciation avec le facteur macrophage-colonie-stimulant des granulocytes (GM-CSF) ou le facteur stimulant macrophage-colonie (M-CSF) suivi de la polarisation avec IFN-γ et lipopolysaccharide (LPS) ou IL-4, respectivement. Les cellules M1 et M2 entièrement polarisées ont été infectées par le Mtb-GFP pendant 4 heures avant que les macrophages détachés infectés par le vtt ne soient tachés de cytométrie d’écoulement à 4 ou 24 heures après l’infection. L’acquisition de l’échantillon a été effectuée avec la cytométrie du débit et les données ont été analysées à l’aide d’un logiciel d’analyse de cytométrie de flux. Le gating manuel aussi bien que la réduction de dimensionnalité avec l’approximation et la projection multiples uniformes (UMAP) et l’analyse phénographique ont été exécutés. Ce protocole a eu comme conséquence la polarisation effective de M1/M2 caractérisée par des niveaux élevés de CD64, CD86, TLR2, HLA-DR et CCR7 sur les cellules M1 non infectées, alors que les cellules M2 non infectées ont montré une forte régulation des marqueurs phénotypes M2 CD163, CD200R, CD206 et CD80. Les cellules polarisées par M1 contenaient généralement moins de bactéries que les cellules polarisées par M2. Plusieurs marqueurs M1/M2 ont été régulés après l’infection à vtt, ce qui suggère que le vtt peut moduler la polarisation des macrophages. En outre, 24 groupes cellulaires différents de différentes tailles se sont révélés répartis de façon unique entre les cellules non infectées et infectées par le vtt M1 et M2 à 24 heures après l’infection. Ce protocole de cytométrie de flux M1/M2 pourrait être utilisé comme colonne vertébrale dans la recherche sur le mtb-macrophage et être adopté pour des besoins spéciaux dans différents domaines de recherche.
Les macrophages sont des cellules immunitaires qui contribuent de manière significative à la régulation de l’homéostasie tissulaire, de l’inflammation et des pathologies de la maladie. Étant une composante essentielle de l’immunité innée, la lignée monocyte-macrophage des cellules exprime des phénotypes hétérogènes en réponse à des indices environnementaux modifiés, qui reflètent leur plasticité et leur adaptation à différents endroits anatomiques et immunologiques1. Selon les facteurs de croissance, cytokines et autres médiateurs présents dans le microenvironnement, les macrophages ont été classés en deux populations réversibles majeures, chacune ayant un rôle différent dans le contrôle bactérien et ledégagement 2: les macrophages polarisés M1 pro-inflammatoires et classiquement activés et les macrophages polarisés M2 anti-inflammatoires, alternativement activés, qui ont été initialement nommés pour imiter la nomenclature cellulaire T helper (Th)3. Ce regroupement de macrophages polarisés immunitaires est souvent considéré comme simpliste, car l’activation et la différenciation des macrophages ne sont pas linéaires, mais plus exactement illustrées comme un continuum où chaque population a des caractéristiques et des rôles fonctionnels différents dans les résultats du développement et de la progressionde la maladie 4,5,6,7. Néanmoins, il existe de nombreux avantages expérimentaux avec le modèle macrophage M1/M2 qui peuvent être utilisés dans plusieurs domaines de recherche différents.
Mycobacterium tuberculosis (Mtb) est l’agent causal de la tuberculose et a été estimé à infecter une personne sur deux et est considéré comme l’agent infectieux le plus mortel au monde (Rapport mondial sur la tuberculose 2019). Puisque les voies respiratoires sont la voie principale de l’infection de vtt, les macrophages alvéolaires sont les cellules hôtes préférées pour être infectées par la tuberculose et représentent à la fois les barrières primaires et le réservoir infectieux pour la tuberculose dans les poumons. La polarisation des macrophages en réponse à différents stimuli a été largement étudiée au fildes ans 7 et dans la plupart des travaux publiés, La polarisation M1 des cultures monocytes in vitro est induite par granulocyte-macrophage colony stimulating factor (GM-CSF) avec IFN-γ et LPS8,9, tandis que la polarisation M2 est induite par macrophage Colony Stimulating Factor (M-CSF) et IL-410,11. Les macrophages M1 sont des cellules effectrices puissantes qui médiation les réponses antimicrobiennes contre les pathogènes intracellulaires et ont un rôle essentiel dans l’immunité antitumorale12. Les macrophages M2, d’autre part, ont une fonction anti-inflammatoire, une capacité phagocytique élevée et sont principalement impliqués dans la cicatrisation des plaies et la réparation des tissus ainsi que dans les infections parasitaires12. Par conséquent, les macrophages M1 sont considérés comme plus efficaces dans le contrôle intracellulaire de la tonte par rapport aux macrophages M213. Cependant, les bactéries de Mtb ont également le potentiel de moduler la polarisation de macrophage pour subvertir l’immunité innée14,15,16,17.
Bien qu’il soit courant de générer des macrophages à partir de la différenciation des monocytes obtenus à partirdu sang périphérique 18, les macrophages pourraient également être générés à partir de cellules souches pluripotentes induites (IPSCs)19 ou de macrophages dérivés de la moelleosseuse à partir de souris 20,21. Ce sont des techniques réalisables pour étudier les cellules macrophages primaires obtenues à partir de progéniteurs monocytes/macrophages qui prolifèrent et se différencieront en une population homogène de cellules macrophages matures. Cependant, ces protocoles fournissent rarement la connaissance approfondie sur le phénotype et la fonction des cellules obtenues ni expliquent l’hétérogénéité normale observée parmi les macrophages obtenus in vivo. Comme le vtt est un agent pathogène humain strict, il y a aussi un avantage à étudier le vtt dans les systèmes modèles humanisés. La cytométrie de flux est une technologie puissante qui offre la possibilité d’évaluer les caractéristiques phénotypiques et fonctionnelles multiples des cellules simples dans la suspension22, quelquechose qui pourrait être assez difficile avec les cellules adhérentes telles que les macrophages qui sont également connus pour être autofluorescents23,24. En plus du détachement chimique des macrophages fermement adhérents, l’infection de vtt peut poser un facteur de stress significatif aux cellules qui ajoute un autre niveau de complexité dans les analyses cytométriques de flux des macrophages Mtb-infectés.
Dans ce protocole expérimental, nous avons employé un modèle précédemment établi d’infection humaine de macrophage basé sur la polarisation immunisée des cellules périphériques-sang-monocyte-dérivées primaires qui sont infectées par la souche virulente de Mtb de laboratoire H37Rv, et analysées avec la cytométrie de flux utilisant un panneau de 10 couleurs comprenant l’expression des marqueurs M1 et M2choisis 25. Ce protocole fournit une méthode efficace et reproductible pour étudier les réponses à l’infection à vtt dans les macrophages polarisés dérivés des monocytes M1 ou M2. En outre, l’utilisation de la cytométrie du débit sur les macrophages infectés par les vtt adhérents nous permet d’étudier une variété de marqueurs de surface associés aux macrophages conventionnels M1 et M2 et leur réponse longitudinale à l’infection par le vtt. Fait important, ce protocole peut facilement être adopté pour des études d’infections avec d’autres agents pathogènes, dans des études antitumorales ou dans des études de conditions inflammatoires, pour le dépistage des médicaments, etc. et pourrait également être exploité pour l’évaluation de la polarisation macrophage M1/M2 dans des échantillons cliniques humains.
Ce protocole expérimental décrit la polarisation efficace des cellules dérivées des myéloïdes en phénotypes M1 ou M2, y compris l’évaluation avec un panneau de cytométrie de flux de 10 couleurs qui permet la visualisation et la caractérisation profonde de la tonte étiquetée GFP dans divers sous-ensembles de macrophages. Bien que la tuberculose soit une ancienne maladie humaine, il n’existe actuellement aucun modèle standard d’or pour étudier les interactions Mtb-macrophage, et la cytométrie du flux multicolore des macrophages pourrait être compliquée par rapport aux analyses des réponses des lymphocytes. Peu de protocoles disponibles pour la différenciation in vitro des monocytes humains aux macrophages présentent une connaissance approfondie du type de macrophages générés. Un protocole de base pour la polarisation des macrophages et l’évaluation cytométrique du flux de l’activation des macrophages à l’aide d’un solide panel de marqueurs peut probablement faciliter une telle caractérisation et offrir des possibilités d’explorer d’autres caractéristiques des cellules polarisées traitées dans différentes conditions. Cela comprend des analyses des cellules cultivés in vitro ainsi que des analyses de cellules in vivo dans des échantillons cliniques, c’est-à-dire des suspensions PBMC et unicell cellules à partir de liquides organiques (c.-à-d. lavage bronchoalveolar) ou de tissus homogénéisés. Par conséquent, la différenciation et/ou l’état d’activation des monocytes et des macrophages obtenus des patients pourraient être liés aux résultats de la maladie. L’expansion du CD16+CD163+ monocytes dans le sang périphérique ont été rapportées dans les patients pulmonaires deTB 30. Une fréquence accrue de CD163+ cellules a également été détectée dans la peau enflammée des patients atopiques de dermatite31. De même, il a été démontré que les macrophages semblables à cd206+ M2 inhibent la prolifération et la différenciation des cellules dans le microenvironnement du tissu adipocyte32 et qu’ils sont enrichis en échantillons de moelle osseuse chez des patients atteints de leucémie myéloïde aiguë (LAM)29. Un rapport élevé des cellules CD64 (M1) à CD163 (M2) dans le sang entier des patients présentant l’ostéoarthrite s’est trouvé pour être associé à la sévéritéde la maladie 33. Une autre étude a employé CD86 (M1) et CD163 (M2) pour démontrer que l’expression élevée de M1 dans le tissu a corrélé à de pires résultats dans un sous-groupe des tumeurs malignes decerveau 34.
Il y a plusieurs avantages significatifs de ce protocole expérimental de cytométrie d’écoulement de M1/M2. Ce modèle offre l’occasion d’étudier les réponses immunitaires innées à l’infection virulente à la tonte et peut être développé pour contenir des études sur les réponses immunitaires adaptatives en ajoutant des lymphocytes T autologues ainsi que des macrophages M1 ou M2 dans les réactions mixtes des lymphocytes (MLR). Le protocole convient également au dépistage et au dépistage des différents composés immunomodulateurs et antimicrobiens. Ici, nous avons précédemment étudié les effets de la vitamine D et de l’inhibiteur de l’histone deacetylase phénylbyrate sur les cellules dérivées des myéloïdes après l’infection àvtt 25,35. La cytométrie d’écoulement M1/M2 pourrait également être employée pour évaluer l’activation de macrophage après conditionnement avec des supernatants de culture cellulaire ou le plasma patient. Bien que les études in vivo sur la co-infection tuberculeuse par le VIH ou les helminthes ou la comorbidité tb-diabète puissent être difficiles, le modèle M1/M2 moins complexe peut faciliter les études sur les comorbidités in vitro. De même, le protocole pourrait être exploité pour des études de transmission afin d’examiner l’infectiosité des cellules mtb ou d’étudier la capacité de présentation phagocytique et antigène des cellules M1/M2 individuelles. La cytométrie d’écoulement M1/M2 est également attrayante pour une utilisation dans les études de biomarqueurs et de vaccins, pour suivre le pronostic de la maladie pendant le traitement et pour tester des thérapies ciblant les cellules dérivées des myéloïdes. Fait important, un certain nombre de méthodes différentes pourraient être appliquées parallèlement à la cytométrie du débit pour l’évaluation simultanée des phénotypes de polarisation des macrophages et des réponses fonctionnelles à l’aide de microscopie confocale (Figure 3D), PCR en temps réel, tache occidentale, analyses de multiplexe et ELISA des facteurs solubles dans le supernatant de culture aussi bien que l’évaluation de l’infectivité et de la croissance bactériennes intracellulaires utilisant GFP-expression (cytométrie de flux et microscopie confocale) et unités de formation de colonie (CFU). L’infection des cellules M1 ou M2 par la bactérie Mtb-GFP permet également de trier les cellules non infectées et infectées par la tuberculose à partir du même échantillon pour une seule analyse de séquençage de l’ARN cellulaire.
Le protocole décrit a également certaines limites, y compris les inconvénients techniques et scientifiques. L’inconvénient de l’utilisation de macrophages dérivés des monocytes provenant de donneurs de sang humains est que la variabilité du donneur est souvent élevée et le fait que les cellules ne sont pas polarisées dans l’environnement physiologique des tissus humains. Une grande variabilité de l’efficacité de la polarisation M1/M2 ou de l’infectiosité du vtt entre les donneurs peut entraîner des problèmes avec les variations intra-et interexpérimentales, une faible puissance statistique et la nécessité d’inclure de nombreux donneurs pour obtenir des résultats fiables. En outre, l’adhérence plastique des monocytes des PBMCs a comme conséquence un nombre donneur-dépendant des monocytes/puits qui peuvent par la suite fournir un MOI arbitraire qui pourrait avoir un impact sur la polarisation de macrophage et la viabilité cellulaire après l’infection de Mtb. Les étapes critiques du protocole impliquent un lavage approprié pour empêcher d’autres types de cellules de contaminer les cultures cellulaires qui pourraient également affecter la polarisation des macrophages. Bien qu’un MOI trop faible puisse imiter l’infection tuberculeuse latente, un MOI trop élevé tuera les cellules, soulignant l’importance d’utiliser un MOI approprié. En outre, il pourrait être difficile de récupérer des cellules fermement adhérentes lors du détachement, ce qui peut entraîner une représentation biaisée de certains sous-ensembles de macrophages utilisés pour les analyses de cytométrie du flux. Une étape cruciale dans l’analyse de cytométrie de flux implique l’utilisation appropriée de la matrice de compensation de perles et des contrôles négatifs tels que les cellules non tachées ou fmo (Fluorescence Minus One) contrôles pour assurer le gating manuel correct.
Une autre limitation implique la polarisation des monocytes dérivés du sang et non de l’environnement tissulaire local. La marque de fabrique de la tuberculose humaine est la formation de granulomes dans les tissus infectés par la tuberculose et, par conséquent, l’immunopathologie dans la tuberculose devrait être étudiée de préférence au site tissulaire local. Cependant, les monocytes sont recrutés au poumon à partir du sang périphérique lors de l’inflammation/ infection, où les cellules peuvent se différencier en macrophages en présence de cytokines inflammatoires tels que GM-CSF12. Fait important, dans le milieu physiologique des tissus in vivo, il y a probablement une grande hétérogénéité de polarisation des macrophages, y compris un mélange et différents ratios de diverses populations de macrophages de type M1 et M2 qui contribuent au sort de l’infection tuberculeuse36. Nous avons précédemment développé un modèle humain de tissu pulmonaire organotypique qui permet des études 3D de la formation de granulome macrophage-24 dans TB37. Il pourrait être intéressant d’exploiter le protocole actuel de polarisation M1/M2 en combinaison avec le modèle des tissus pulmonaires pour étudier plus avant la formation de granulomes tuberculeux, les fonctions effectrices et le rapport M1/M2 dans les tissus expérimentaux.
Ce protocole de flowcytometry M1/M2 pourrait facilement être adapté pour inclure un panneau étendu des marqueurs myéloïdes utiles pour l’évaluation des dispositifs liés aux réponses inhibitrices aussi bien qu’inflammatoires. Il y a un grand intérêt de recherche dans les molécules inhibitrices de point de contrôle immunitaire telles que PD-1, SIRP-α, IDO et arginases qui pourraient moduler des réponses de macrophage38. Dans ce contexte, la polarisation des cellules myéloïdes pourrait également impliquer d’autres stimuli qui favorisent les macrophages immunoréglementaires (Mreg) ou les cellules suppressrices dérivées des myéloïdes (MDSC) qui se sont manifestées comme impliquées dans plusieurs maladies dont la tuberculose38. Les panneaux de cytométrie d’écoulement plus avancés des sous-ensembles macrophages M1/M2/Mreg peuvent également inclure la coloration intracellulaire des cytokines/chimiokines IL-1β, TNF-α, IL-10 et MCP-1 ou d’autres facteurs solubles ou molécules effectrices telles que l’oxyde nitrique inductible (iNOS) et les peptides antimicrobiens. Ceci pourrait augmenter les possibilités d’étudier des réponses polyfonctionnelles de macrophage, semblables à ce qui a été abondamment décrit pour des cellules T39.
Actuellement, les panneaux de coloration de cytométrie d’écoulement peuvent inclure jusqu’à 30-40 couleurs, qui fournit la capacité d’immunophénotyper plusieurs sous-ensembles cellulaires et molécules simultanément. La mise en place expérimentale de base de ce protocole de cytométrie d’écoulement M1/M2 peut être utilisée comme une colonne vertébrale compatible avec la plupart des cytomètres anciens et nouveaux flux et peut être construite et adaptée aux besoins individuels, y compris les défis posés par le travail avec la tonte virulente dans un environnement BSL-3. Aujourd’hui, des techniques de réduction de la dimensionnalité telles que l’UMAP sont disponibles dans les nouvelles versions du logiciel de cytométrie de flux, qui permet l’analyse d’un grand nombre de paramètres générés dans les études unicelliques qui est essentiel pour améliorer la visualisation et l’interprétation des données de haute dimension40. Les améliorations technologiques constantes de la cytométrie du débit se poursuivront probablement au cours des prochaines années, y compris la combinaison du phénotypage multi-paramétrique ainsi que des capacités modernes de tri cellulaire, où ce protocole pourrait s’avérer utile dans plusieurs tests d’infection à vtt à base de macrophages.
The authors have nothing to disclose.
Nous remercions nos collègues de l’Agence suédoise de santé publique, Matilda Svensson et Solomon Ghebremichael, pour leur aide dans le laboratoire BSL-3.
Ces travaux ont été soutenus par des subventions de la Fondation suédoise du cœur et du poumon (HLF) (2019-0299 et 2019-0302 à SB), du Conseil suédois de la recherche (VR) (2014-02592, 2019-01744 et 2019-04720 à SB), la Fondation pour la prévention de la résistance aux antibiotiques (Resist), les Fondations Karolinska Institutet et KID to SB (financement partiel de l’enseignement doctoral pour Marco Loreti) de l’Institut Karolinska. ML a reçu le soutien de la Swedish Children’s Cancer Foundation (TJ2018-0128 et PR2019-0100).
8-well chamber slides | Lab-Tek | 154534 | |
BD Comp bead plus | BD | 560497 | |
Bovine Serum Albumin | Sigma-Aldrich | A7906 | |
DAPI Mounting media | Vector Laboratories | H-1200-10 | |
EDTA (0.5 M) | Karolinska University hospital, Huddinge | N/A | |
Falcon 6-well Flat Bottom plates | Corning Life Sciences | 353046 | |
Fetal bovine serum (FBS) | Sigma-Aldrich | F7524 | |
Formaldehyde | Sigma-Aldrich | F8775 | |
Glycerol (70%) | Karolinska University hospital, Huddinge | N/A | |
GM-CSF | Peprotech | 300-03 | |
Goat anti-mouse IgG Alexa Fluor 594 secondary antibody | Invitrogen | R37121 | Secondary antibody for CD64 |
Goat anti-Rabbit IgG Alexa Fluor 594 secondary antibody | Invitrogen | A-11037 | Secondary antibody for CD163 |
HEPES | GE Healthcare Life Sciences | SH30237.01 | |
IFN-γ | Peprotech | 300-02 | |
IL-4 | Peprotech | 200-04 | |
L-Glutamine | GE Healthcare Life Sciences | SH30034.01 | |
LPS (Escherichia coli O55:B5) | Sigma-Aldrich | L6529 | |
Lymphoprep | Alere Technologies AS | 11508545 | |
M-CSF | Peprotech | 300-25 | |
Middle Brook 7H10 agar plates | Karolinska University hospital, Huddinge | N/A | |
Middle Brook 7H9 media | Karolinska University hospital, Huddinge | N/A | |
Mouse anti-human CD64 primary antibody | Bio-Rad | MCA756G | Clone: 10.1 |
Na-pyruvate | GE Healthcare Life Sciences | SH300239.01 | |
Normal goat serum | Jackson ImmunoResearch | 005-000-121 | |
Rabbit anti-human CD163 primary antibody | GeneTex | GTX81526 | Polyclonal |
RPMI 1640 | Life Technologies Corporation | SH30096.01 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | X-100 | |
TubeSpin bioreactor tubes | TPP Techno Plastic Products AG | 87050 | |
Tween-20 | Sigma-Aldrich | P9416 | |
Tween-80 | Sigma-Aldrich | P4780 |