כאן, אנו מפרטים כיצד לסנכרן את דרוסופילה ליום ביולוגי. זהו הצעד הראשון והחשוב ביותר הנחוץ ללימוד מקצבים ביולוגיים ותרונוביולוגיה.
כמעט אוניברסלי בין אורגניזמים, מקצבים ביולוגיים לתאם פעילות ביולוגית למסלול של כדור הארץ סביב השמש. כדי לזהות גורמים היוצרים קצב זה ולהבין את הפלטים המתווצרים, נדרשת צורך בהתענות של אורגניזמים מודלים לנקודות זמן ביולוגיות מוגדרות. כאן אנו מפרטים הליך להדרך Drosophila רבים לקצב היממה מוגדר. יתר על כן, אנו מפרטים שלבים לאחר ההתעמלות כדי להכין דגימות עבור immunofluorescence, חומצה גרעין, או ניתוח מבוסס מיצוי חלבון.
כמעט לכל האורגניזמים על פני כדור הארץ, מהגדול ביותר ועד לתא יחיד, יש שעון ביולוגי פנימי עם מחזור של יום אחד. זה ידוע בשם השעון הביולוגי (טבע בשנת 1953 על ידי פרנץ Halberg מן המונחים הלטיניים circa = על / בערך ו “מת” = יום)1. למרות שמרכיבים של שעון הליבה ידועים ומנגנוני התפקוד הבסיסיים שלהם מושגים, עדיין יש הרבה מה להבין על איך מקצבים ביולוגיים נשמרים בכל הגוף. חשוב לציין, רגולציה שגויה של מקצבים ביולוגיים קשורה לתוצאות בריאותיות גרועות כולל היווצרות זיכרון לקוי, הפרעות שינה, הפרעה השפעה עונתית, דיכאון, הפרעה דו קוטבית, סוכרת, השמנת יתר, ניוון עצבי,וסרטן 2,,3,,4,5.
Drosophila הוא מודל מבוסס היטב לחקירה של הביולוגיה היממה. ניתן להסבת גנטית וביוכימית, מספרים גדולים מאומנים בקלות (כפי שיהיה מוצג). למעשה, כל שבעת הפרסומים שצוטטו כפרסומים מרכזיים של תמיכה בהענקת פרס נובל לגילוי מקצבים ביולוגיים מינפו את החוזקות הללו שלדרוסופילה מודל 6,,7,,8,,9,,10,,11,,12.
בנוסף, אנו מציגים אסטרטגיות יעילות לאיסוף זבובים מאולפים למטרות של אימון מלוד, חומצה גרעין, או ניתוח מבוסס מיצוי חלבונים. באמצעות אסטרטגיות אלה, ניתן לעבד ולאחסן כמויות גדולות יותר של דגימות לניתוח בעתיד. שיטות אלה הן יתרון מאוד בכך שהם לשחזור יכול להניב מאות זבובים מיומנים שיכולים להיות חלק מ מאגר נתונים גדול.
החוקרים משתמשים בפרוטוקול תדרם זה עם הצלחה ועקביות. הליך זה מאפשר קיבעון של מאגר דגימה גדול שניתן לאחסן לניתוח עתידי. בנוסף, אסטרטגיה זו משמרת את הדפוסים הנוירולוגיים המושרים על ידי תחומים לבדיקה עתידית.
קיבעון לאחסון הוא מרכיב מרכזי של תהליך ההתעקמה כפי שהוא עוזר לייצב את רקמת המוח וזה מאפשר יותר זמן לנתח כל מוח ממאגר הנתונים ובכך למזער פסולת ממוח שמאבדים את הכדאיותבשל גיל 21. המטרה העיקרית היא להסית כמה שיותר זבובים, כך שיש מלאי רציף זמין עבור דיסטוריראש ובסופו של דבר immunofluorescence או חלבון מיצוי כדי לבחון את הממצאים ולקבוע אם התוצאות הן של ביטחון גבוה. כדי להבטיח כי ההמולה היממה נשמרת באמצעות קיבעון, זה חלק בלתי נפרד כי כל מקור של זיהום אור מחוסל. תהליך קיבעון מאפשר Drosophila להיות מאוחסן תוך שמירה על “מכתם הזמן” הנוירולוגי שלה, כך שהם יכולים להיות לנתח מאוחר יותר וניתח ללא הבדלים מורגש זבובים כי הם נותחו ועברו אימון מאולפת מיד לאחר entraination. למטרות קיבעון לפני אימונו-לודרשות, המעבדה קבעה בעקביות כי זבובים הם קיימא לפחות עד חודש אחד. קיבעון עבור הפקת חלבון כתם המערבי להפוך את המוח קיימא ללא הגבלת זמן כאשר מאוחסנים ב -80 ° C.
צעד קריטי נוסף הוא סקסינג של הזבובים. חשוב כי צעד זה נעשה במדויק כמו שיש שני המינים באותו בקבוקון לפני קיבעון יכול להוביל הזדווגות, אשר יניב זבובים חדשים כי הם בגיל צעיר ניתוח חלבון מושחת אם זכרים נבדקים בטעות במקום נקבות או להיפך. בנוסף, כאשר sexing חשוב להסיר דגימות זחלים כי הם לפעמים מחוברים לנקבות. זה מונע את התפתחותו של צוויה חדשה בתוך הבקבוקון הנשי שעלול להשחית תוצאות.
השלב הבא עבור פרוטוקול ההתעוות עשוי להיות עם פריטים הקשורים לניתוח נתונים. המוקד של הפרוטוקול הוא ליקוטליזציה של חלבון, אבל אם יש משתנים אחרים מושפעים על ידי הכשרה היממה, הם חייבים להיחקר דרך שדרות חדשות, לעתים קרובות הדורשים חלבון או שאיבת חומצה גרעין. בנוסף, ישנם חלבונים אחרים של המוח כי עדיין ניתן לנתח באמצעות פרוטוקול זה. הניסויים הקשורים בפרוטוקול ניתחו חלבונים מסוימים, אך רשימת הגנים והחלבונים המותחים תפקיד בביולוגיה היממה לא מיצתה את מצבם. הפרוטוקול יעיל בהשגת המטרה של הקמת שעון ביולוגי, עם זאת, היישומים הם רחבים.
The authors have nothing to disclose.
תודה מיוחדת לאוניברסיטת מיזורי-קנזס סיטי ומעבדת ג’פרי ל. פרייס.
100-1000uL pipette | Eppendorf | ES-1000 | |
10-100uL pipette | Eppendorf | ES-100 | |
16% Paraformaldehyde Solution | 15710 | ||
1X PBS | Caisson Labs | PBL01-6X100ML | |
Agar | Fisher Scientific | BP1423500 | |
Anesthesia Filter Connection Kit | World Precision Instruments | EZ-251A | |
Corn meal | Genesee Scientific | 62-100 | |
Dried Molasses | Food Service Direct | OT280504 | |
Droso-filler Food Pump | geneseesci.com | 59-169 | |
Drosophila Stock bottles, 6 oz square bottom w/ Flugs | geneseesci.com | 32-130BF | |
Drosophila vials, Narrow K-Resin super bulk | geneseesci.com | 32-118SB | |
Dry active yeast | Genesee Scientific | 62-103 | |
Ethanol | IBI Scientific | IB15720 | |
EZ Basic Anesthesia System | World Precision Instruments | EZ-175 | |
Falcon Centrifuge tubes | Corning | 352097 | |
Falcon round bottom tubes | Corning | 352057 | |
Fine point Sharpie marker | Sharpie | 30001 | |
Fisherbrand Nutating Mixer | Fisher Scientific | 88-861-043 | |
Flugs-Narrow Plastic Vials | Genesee Scientific | 49-102 | |
Glass Thermometer | Cole-Palmer | EW-08008-12 | |
Liquid nitrogen hose | Thermo Scientific | 398202 | |
Liquid nitrogen tank-Dewar | Cooper Surgical Inc | 900109-1 | |
Liquid nitrogen transfer vessel | Electron Mircoscopy Sciences | 61891-02 | |
Paintbrushes(Red Sable) Size #0 | Electro Microscopy Sciences | 66100-00 | This is used to separate the flies via sex without causing injury. |
Plastic funnel | Plews and Edelmann | 570-75-062 | |
Polarizing light microscope | Microscope Central | 1100100402241 | Used to more clearly view Drosophila during sexing |
ProPette Pipette Tips | MTC Bio Incorporated | P5200-100U | |
ProPette Pipette Tips | MTC Bio Incorporated | P5200-1M | |
ProPette Pipette Tips | MTC Bio Incorporated | P5200-5M | |
Propionic Acid | Sigma Aldrich | P1386-1L | |
Rayon Balls | Genesee Scientific | 51-100 | |
Reynolds wrap standard aluminum foil | Staples | 1381273 | |
Roaster Oven (Crockpot) | Hamilton Beach | 32950 | |
Scotch 810 Magic Tape | Electron Microscopy Sciences | 77300 | |
Spray bottle with trigger | US Plastic | 66446 | Used to spray ethanol to clean work bend areas |
Tegosept | Genesee Scientific | 20-258 | |
Thermo Scientific Drosophila Incubator | Thermo Scientific | 3990FL | |
Thermo Scientific Revco 4 degree Lab fridge | ThermoFisher Scientific | REL7504D | |
Thermo Scientific Revco Lab Freezer | ThermoFisher Scientific | REL7504A | |
Tween 20 | Anatrace | T1003-1-GA |