该协议描述了在高压下进行微生物实验,以研究原位生物采矿过程。该实验方法采用一种摇动的高压反应器,该反应器装有一个金钛反应细胞,在酸性、富含铁的介质中含有微生物培养基。
研究地下微生物过程的实验室研究,如深矿床中的金属浸出(生物采矿),存在共同和具有挑战性的障碍,包括需要复制的特殊环境条件,例如高压在某些情况下,酸性溶液。前者需要一个适合加压至100bar的实验装置,而后者需要一个具有高耐腐蚀性和与容器壁发生不需要的化学反应的流体容器。为了满足这些在原位生物采矿领域的应用条件,本研究在摇动高压反应器内使用了一种特殊的柔性金钛反应单元。所述系统允许在缺氧、压力控制、高度化学惰性实验环境中通过硫驱动微生物铁还原来模拟原位生物采矿。柔性金钛反应单元可以容纳高达 100 mL 的样品溶液,可在系统保持所需压力的同时,在任何给定时间点进行采样。实验可以在从小时到几个月的时间尺度上进行。组装高压反应器系统相当耗时。然而,当在化学腐蚀性流体中发生在地球深层地下的复杂和具有挑战性的(微生物)过程时,这一系统的优点大于缺点。结果发现,即使在高压下,微生物联合体也是活跃的,但代谢率明显较低。
在过去十年中,为尽量减少采矿对环境的影响而作出的努力有所增加。露天开采,用于开采矿石(例如,富含铜的硫化矿石),挖掘活动以及开采珍贵矿石后剩余的大量废石和加工矿石遗骸,对周围景观产生影响金属,如铜。直接从地下矿石中提取铜将大大减少这些影响。原位生物采矿技术是这一过程的一个有前途的候选技术。本出版物描述了利用刺激的微生物活性将贵金属从矿石中提取到地下的水溶液中。因此,例如,富含铜的溶液可以很容易地泵回表面,以进一步浓缩金属。
许多实验室对亲矿石浸酸微生物的活性进行了研究,研究参数为2、3、4、5、6等。然而,由于环境表面实验室条件(近1 bar)和静水条件(±100 bar)深度为1000米的地下环境实验室条件之间的差异,对微生物活动的压力影响没有很好的记录。因此,通过不同的实验途径,研究了压压对微生物铁还原的影响。在这里,详细介绍了最合适的技术。
高压反应器被广泛用于研究地球地下压力和温度的反应。这种反应器由底部的一个反应器容器组成,该容器可以包含具有微生物培养的流体样品。位于反应堆容器顶部,反应堆头为安全措施和监测传感器(如温度或压力)提供了多种连接和接口。大多数高压反应器由不锈钢制成。这种材料具有高弹性和良好的加工性能,但不锈钢表面的耐腐蚀性并不适合每种应用。例如,如果研究高酸性或高还原水溶液,则可能发生与反应器壁有关化合物的显著反应。避免这种情况的一个方法是将衬垫插入反应堆容器,例如由硼硅酸盐玻璃7制成的衬垫。它易于清洁,可以通过高压灭菌进行灭菌。此外,它不受酸性或减少水溶液的攻击。尽管衬垫可以帮助防止溶液或微生物在不锈钢反应器壁溶液中的人工反应,但仍然存在一些问题。其一,如果形成腐蚀性气体,如硫酸盐还原细菌产生的硫化氢,这种气体可能与位于衬套上方的反应器头的未覆盖表面发生反应。另一个缺点是,在保持压力的同时,不可能从反应器中取出样品。
为了克服这些限制,高压反应器内部专门开发了柔性反应单元,用于各种应用。柔性聚四氟乙烯(PTFE)细胞8设计用于高盐盐水盐的溶解度研究。然而,该系统的局限性是,一些气体很容易渗透到PTFE。此外,这种材料仍然具有相对较低的温度稳定性。因此,通过设计一个带有钛头9的柔性金包,将放置在不锈钢高压反应器内,从而改进了该系统。金表面耐酸性或减少溶液和气体的耐腐蚀。当彻底钝化以形成连续的二氧化钛层时,钛表面也高度惰性。在通过连接的钛取样管从该反应单元取样时,金袋体积缩小。系统的内部压力通过将相同体积的水(如取样)泵入容纳反应单元的不锈钢高压反应器来维持。在实验过程中,通过摇动或倾斜高压反应器超过90°,使反应单元内的样品保持运动。
反应单元由图1中描述的部件组成:金袋、钛领、钛头、不锈钢垫圈、钛压缩螺栓环、钛取样管(带不锈钢腺体和用于高压锥形和领圈)的钛取样管。螺纹连接两侧,和钛阀。金袋为圆柱形金质(Au 99.99),壁厚为0.2毫米,外径为48毫米,长度为120毫米。
所有钛部件均由车间由钛 2 级棒定制。图 2中可以看到衣领、头、垫圈和压缩螺栓环的尺寸。钛取样管是钛毛细管,外径6.25毫米,壁厚1.8毫米,内径2.65毫米。通过高压锥和螺纹连接将其固定在钛头和钛阀中,确保钛对钛表面的密封。高压钛阀配有缓慢开口杆,即使在高压下也能进行非常可控的打开或采样。这个系统被用于许多研究10,11,12。
提出在酸性溶液中进行微生物反应的高压实验方法是在实验室环境中模拟深层地下生物过程的有力工具。
涉及许多手动工作步骤,其中一些需要特别注意。一般说来,在组装柔性金钛电池和反应器头的各个部件时,不得使用过度力(第3节和第4节)。如果忽略制造商的规格(例如,最大压力、温度、扭矩),则可能导致泄漏和/或材料故障。
清洗黄金和钛部件(第2.2节)是一个不可或缺的工作步骤,不仅对这个实验,特别是对于涉及(在)有机反应的实验。以前在金细胞中实验的残留物可能会导致不必要的反应,从而对结果产生偏差。当组装的金钛电池安装在反应器头时,最好快速准确地工作,因为此时少量的氧气可以进入金细胞。在离开手套箱之前关闭取样阀是减少环境气氛与金电池内部交换的良好第一措施。
一旦反应器被放置在摇动装置中,将摇动运动速度设置为±170°/分钟非常重要。如果高压反应器移动过快,则使用时,由于重力效应或沉积物或岩石样品的锋利边缘,可能会发生金细胞破裂。
此方法可用于其他研究领域。柔性金钛反应单元具有可用于各种科学研究的潜力,9研究在高压和高温下以及高腐蚀性流体或气体中的反应。
在地下70°C以上的深层微生物在矿物表面存在的情况下,即使在高压下,也能刺激分子氢或有机酸(如醋酸)的产生。除了本研究中研究的硫化合物外,这些产品和其他化合物在原位生物浸出过程中可能诱发微生物活性升高。
应用包括测定水流体中气体和离子的溶解度、热液喷口系统17条件下的地球化学反应、同位素分馏18的定量、CO期间地球化学反应2固存19,在源岩石20形成的油气形成过程中的非生物过程,以及本研究中21号地下高压处的微生物反应。
The authors have nothing to disclose.
我们感谢罗伯特·罗森鲍尔(USGS,Menlo Park)分享了他在柔性金钛反应细胞方面的专业知识,并感谢乔治·谢德(BGR)在汉诺威建立改进系统的初始阶段提供的意见。我们要感谢许多科学家(包括卡佳·海申、安德烈亚斯·里塞、詹斯·格鲁格-特拉普、西奥多·阿尔珀曼)在汉诺威的设置,这些项目在前进的道路上做出了一些小小的改进,克里斯蒂安·西格为高压反应堆的摇动装置。我们感谢劳拉·卡斯特罗(马德里康普卢坦塞大学)对SEM的观察。最后,我们要感谢尼尔斯·沃尔基为本文制作了这个高质量的视频。这项工作得到了欧盟Horizon 2020项目BIOMOre(赠款协议#642456)的支持。
Acetone | Merck | 100013 | |
CaN2O6 | Fluka | 31218 | |
Conax compression seal fittings | Conax Technologies | PG2-250-B-G | sealant could be selected according to temperatures in experiment |
Copper paste | Caramba | 691301 | |
Copper paste | CRC | 41520 | |
CoSO4x7H2O | Sigma | 10026-24-1 | |
CrKO8S2x12H2O | Roth | 3535.3 | |
CuSO4x5H2O | Riedel de Haen | 31293 | |
Disposable cuvettes | Sigma | z330388 | |
Ethanol absolute | Roth | 9065.3 | |
FE-SEM | JEOL | model no. JSM-6330F | |
Ferrozine | Aldrich | 180017 | |
Fe2(SO4)3x7H2O | Alfa Aesar | 33316 | |
FeSO4x7H2O | Merck | 103965 | |
Gold cell | Hereaus GmbH | manufactured according to dimensions supplied by customer | |
High-pressure reactor | PARR Instruments | model no. 4650 Series | reactors from other vendors could be used, too |
High-pressure syringe pump | Teledyne ISCO | DM-100 | |
HCl | Roth | 6331.3 | |
HNO3 | Fluka | 7006 | |
H3BO3 | Sigma | B6768 | |
KCl | Sigma | P9541 | |
KH2PO4 | Merck | 104873 | |
L-(+)-Ascorbic acid/Vitamin C | Applichem | A1052 | |
Light microscope | Leica DM3000 | ||
MgSO4x7H2O | Merck | 105886 | |
(NH4)2SO4 | Sigma | A4418 | |
NaMoO4x2H2O | Sigma | 331058 | |
NaO3Sex5H2O | Sigma | 00163 | |
NaO3V | Sigma | 590088 | |
Na2SO4 | Merck | 106649 | |
Na2WO4x2H2O | Sigma | 72069 | |
NiSO4x6H2O | Sigma | 31483 | |
Omnifix Luer | BRAUN | 4616057V | |
pH meter | Mettler Toledo | ||
Redox potential meter | WTW | ORP portable meter | |
Safe-Lock Tubes, 2 mL | Eppendorf | 0030120094 | |
Serum bottle | Sigma | 33110-U | |
Spectrophotometer | Thermo Scientific | model no. GENESYS 10S | |
Sterican Hypodermic needle | BRAUN | 4657519 | |
Stoppers | Sigma | 27234 | |
Sulfur powder | Roth | 9304 | |
Thoma Chamber | Hecht-Assistent | ||
Titanium parts of reaction cell | Titan-Halbzeug GmbH | 121-238 | manufactured by workshop at BGR according to dimensions supplied from Titanium grade 2 rods from Titan-Halbzeug GmbH |
Titanium valve | Nova Swiss Technologies | ND-5002 | |
Whatman membrane filters nylon | Sigma | WHA7402004 | |
ZnSO4x7H2O | Sigma | Z4750 |