Summary

Overvågning af GPCR-β-arrestin1/2 interaktioner i realtid levende systemer til at fremskynde Drug Discovery

Published: June 28, 2019
doi:

Summary

GPCR-β-arrestin interaktioner er et spirende felt i GPCR Drug Discovery. Nøjagtige, præcise og nemme at opsætte metoder er nødvendige for at overvåge sådanne interaktioner i levende systemer. Vi viser en strukturel komplementation assay til at overvåge GPCR-β-arrestin interaktioner i realtid levende celler, og det kan udvides til enhver GPCR.

Abstract

Interaktioner mellem G-protein koblede receptorer (GPCRs) og β-arrestins er vitale processer med fysiologiske konsekvenser af stor betydning. I øjeblikket, karakterisering af nye lægemidler mod deres interaktion med β-arrestins og andre cytosolisk proteiner er yderst værdifuld inden for GPCR Drug Discovery især under studiet af GPCR partisk agonisme. Her viser vi anvendelsen af en ny strukturel komplementation assay til præcist at overvåge receptor-β-arrestin interaktioner i realtid levende systemer. Denne metode er enkel, præcis og kan nemt udvides til enhver GPCR af interesse, og det har også den fordel, at det overvinder uspecifikke interaktioner på grund af tilstedeværelsen af en lav ekspressions promotor til stede i hvert vektorsystem. Denne strukturelle komplementerings analyse giver nøglefunktioner, der muliggør en nøjagtig og præcis monitorering af receptor-β-arrestin-interaktioner, hvilket gør den velegnet i studiet af partisk agonisme af ethvert GPCR-system samt GPCR c-Terminus ‘ fosforylering koder ‘ skrevet af forskellige GPCR-kinaser (GRKs) og post-translationelle modifikationer af arrestins, der stabiliserer eller destabiliserer receptor-β-arrestin-komplekset.

Introduction

Gpcrs repræsenterer målet på næsten 35% af de nuværende stoffer på markedet1,2 og en klar forståelse af deres farmakologi er afgørende i udviklingen af nye terapeutiske stoffer3. Et af de vigtigste aspekter i GPCR Drug Discovery, især under udviklingen af partiske agonister er karakteriseringen af nye ligander mod receptor-β-arrestin interaktioner4 og β-arrestin interaktioner med andre cytosolisk proteiner såsom som clathrin5.

Det er blevet dokumenteret, at β-arrestin afhængig signalering spiller en central rolle i neurologiske lidelser såsom bipolar lidelse, svær depression, og skizofreni6 og også alvorlige bivirkninger i nogle medikamenter såsom morfin7.

Nuværende metoder, der anvendes til at overvåge disse interaktioner normalt ikke repræsenterer faktiske endogene niveauer af proteiner i studiet, i nogle tilfælde viser de svage signal, foto blegning og afhængigt af GPCR det kan være teknisk udfordrende at oprette8. Denne nye strukturelle komplementation analyse bruger lav ekspression promotorer vektorer for at efterligne endogene fysiologiske niveauer og giver høj følsomhed i forhold til de nuværende metoder9. Ved hjælp af denne fremgangsmåde, det var muligt at nemt karakterisere Galanin receptor-β-arrestin1/2 og også β-arrestin2-clathrin interaktioner10. Denne metode kan anvendes bredt til enhver GPCR af særlig interesse, hvor β-arrestins spiller en vigtig fysiologisk funktion, eller deres signalering er relevant i nogle sygdomme.

Protocol

1. strategi for primer-design Design primere til at introducere gener af interesse i pBiT 1.1-C [TK/LgBiT], pBiT 2.1-C [TK/SmBiT], pBiT 1.1-N [TK/LgBiT] og pBiT 2.1-N [TK/SmBiT] vektorer. Vælg mindst en af disse tre steder som en af de to unikke restriktionsenzymer, der er nødvendige for retningsbestemt kloning på grund af tilstedeværelsen af et in-frame stop codon, der opdeler det multicloning site som vist i figur 111. Inkorporer nu…

Representative Results

Ved hjælp af den procedure, der præsenteres her, blev interaktioner mellem en prototypiske GPCR og to β-arrestin isoformer overvåget. Glucagon som peptidreceptor (GLP-1r) konstruktioner blev fremstillet ved hjælp af primere indeholdende NheI og EcoRI enzym restriktionssteder og klonet i vektorer pBiT 1.1-C [TK/LgBiT] og pBiT 2.1-C [TK/SmBiT], mens der i tilfælde af β-arrestins blev to yderligere vektorer brugte pBiT 1.1-N [TK/LgBiT] og pBiT 2.1-N [TK/SmBiT] ved brug af enzym begrænsnings lokaliteter BgIII og EcoR…

Discussion

Ved hjælp af den metode, der præsenteres her, kan interaktioner mellem GPCR og β-arrestin1/2 overvåges i realtids levende systemer ved hjælp af denne GPCR-β-arrestin strukturel komplementerings analyse. I denne henseende var vi i stand til at observere differentialet β-arrestin rekruttering mellem de to β-arrestin isoformer af GLP-1r (en prototypiske klasse B GPCR), vi også observeret en dissociation af receptor-β-arrestin kompleks et par minutter efter at have nået den maksimale lysende signal.

<p class="…

Divulgaciones

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Dette arbejde blev støttet af tilskud fra forskningsprogrammet (NRF-2015M3A9E7029172) fra det nationale forskningsinstitut i Korea (NRF) finansieret af Ministeriet for videnskab, IKT og fremtidig planlægning.

Materials

Antibiotics penicillin streptomycin Welgene LS202-02 Penicillin/Streptomycin
Bacterial Incubator JEIO Tech IB-05G Incubator (Air-Jacket), Basic
Cell culture medium Welgene LM 001-05 DMEM Cell culture medium
Cell culture transfection medium Gibco 31985-070 Optimem 1X cell culture medium
CO2 Incubator NUAIRE NU5720 Direct Heat CO2 Incubator
Digital water bath Lab Tech LWB-122D Digital water bath lab tech
DNA Polymerase proof reading ELPIS Biotech EBT-1011 PfU DNA polymerase
DNA purification kit Cosmogenetech CMP0112 miniprepLaboPass Purificartion Kit Plasmid Mini
DNA Taq Polymerase Enzynomics P750 nTaq DNA polymerase
Enzyme restriction BglII New England Biolabs R0144L BglII
Enzyme restriction buffer New England Biolabs B72045 CutSmart 10X Buffer
Enzyme restriction EcoRI New England Biolabs R3101L EcoRI-HF
Enzyme restriction NheI New England Biolabs R01315 NheI
Enzyme restriction XhoI New England Biolabs R0146L XhoI
Fetal Bovine Serum Gibco Canada 12483020 Fetal Bovine Serum
Gel/PCR DNA MiniKit Real Biotech Corporation KH23108 HiYield Gel/PCR DNA MiniKit
Ligase ELPIS Biotech EBT-1025 T4 DNA Ligase
Light microscope Olympus CKX53SF CKX53 Microscope Olympus
lipid transfection reagent Invitrogen 11668-019 Lipofectamine 2000
Luminometer Biotek/Fisher Scientific 12504386 Synergy 2 Multi-Mode Microplate Readers
NanoBiT System Promega N2014 NanoBiT PPI MCS Starter System
Nanoluciferase substrate Promega N2012 Nano-Glo Live Cell assay system
PCR Thermal cycler Eppendorf 6336000015 Master cycler Nexus SX1
Poly-L-lysine Sigma Aldrich P4707-50ML Poly-L-lysine solution
Trypsin EDTA Gibco 25200-056 Trysin EDTA 10X
White Cell culture 96 well plates Corning 3917 Assay Plate 96 well plate

Referencias

  1. Sriram, K., Insel, P. A. GPCRs as targets for approved drugs: How many targets and how many drugs?. Molecular Pharmacology. 93 (4), 251-258 (2018).
  2. Hauser, A. S., Attwood, M. M., Rask-Andersen, M., Schiöth, H. B., Gloriam, D. E. Trends in GPCR drug discovery: new agents, targets and indications. Nature Reviews Drug Discovery. 16 (12), 829-842 (2017).
  3. Langmead, C. J., Summers, R. J. Molecular pharmacology of GPCRs. British Journal of Pharmacology. 175 (21), 1754005-1754008 (2018).
  4. Lohse, M. J., Hoffmann, C. Arrestin Interactions with G Protein-Coupled Receptors. Handbook of Experimental Pharmacology. 219, 15-56 (2014).
  5. Kang, D. S., et al. Structure of an arrestin2-clathrin complex reveals a novel clathrin binding domain that modulates receptor trafficking. Journal of Biological Chemistry. 284, 29860-29872 (2009).
  6. Park, S. M., et al. Effects of β-Arrestin-Biased Dopamine D2 Receptor Ligands on Schizophrenia-Like Behavior in Hypoglutamatergic Mice. Neuropsychopharmacology. 41 (3), 704-715 (2016).
  7. Zhu, L., Cui, Z., Zhu, Q., Zha, X., Xu, Y. Novel Opioid Receptor Agonists with Reduced Morphine-like Side Effects. Mini-Reviews in Medicinal Chemistry. 18 (19), 1603-1610 (2018).
  8. Smith, J. S., Lefkowitz, R. J., Rajagopal, S. Biased signalling: from simple switches to allosteric microprocessors. Nature Reviews Drug Discovery. 17 (4), 243-260 (2018).
  9. Dixon, A. S. NanoLuc Complementation Reporter Optimized for Accurate Measurement of Protein Interactions in Cells. ACS Chemical Biology. 11 (2), 400-408 (2016).
  10. Reyes-Alcaraz, A., Lee, Y. N., Yun, S., Hwang, J. I., Seong, J. Y. Conformational signatures in β-arrestin2 reveal natural biased agonism at a G-protein-coupled receptor. Communications Biology. 3, 1-128 (2018).
  11. Promega. . Nanobit Protein Protein Interaction System Protocol. , (2019).
  12. Life Biomedical. . HiYield Gel/PCR Fragments Extraction Kit. , (2019).
  13. New England BioLabs. . Ligation Calculator. , (2019).
  14. . . Cosmo Genetech. , (2019).
  15. Baggio, L. L., Drucker, D. J. Biology of incretins: GLP-1 and GIP. Gastroenterology. 132, 2131-2157 (2007).
  16. ProMega. . NanoGLO Endurazine and Vivazine Live Cell Substrates Technical Manual. , (2019).
  17. Ali, R., Ramadurai, S., Barry, F., Nasheuer, H. P. Optimizing fluorescent protein expression for quantitative fluorescence microscopy and spectroscopy using herpes simplex thymidine kinase promoter sequences. FEBS Open Bio. 8 (6), 1043-1060 (2018).

Play Video

Citar este artículo
Reyes-Alcaraz, A., Lee, Y., Yun, S., Hwang, J., Seong, J. Y. Monitoring GPCR-β-arrestin1/2 Interactions in Real Time Living Systems to Accelerate Drug Discovery. J. Vis. Exp. (148), e59994, doi:10.3791/59994 (2019).

View Video