Bu protokol, beyinde AAV tabanlı bir viral sistem ve hücre tanımlaması ve daha fazla analiz için izin veren bir FLEX synapsin odaklı GFP muhabiri kullanarak doğrudan yeniden programlanmış internöronlar içinde vivo üretmeye yönelik hedefler.
Fonksiyonel ve Subtype özgü nöronların içine beyin Resident glia dönüştürme aynı zamanda situ hücre kaderi çalışmak için araçlar oluştururken, alternatif hücre replasman tedavilerin gelişimine doğru bir adım sağlar. Bugüne kadar, in vivo yeniden programlama ile nöronlar elde etmek mümkün olmuştur, ancak bu nöronların veya nasıl olgun hassas fenotipi ayrıntılı olarak analiz edilmedi. Bu protokolde, AAV tabanlı bir viral vektör sistemi kullanarak, in vivo yeniden programlanmış nöronların daha verimli bir dönüşüm ve hücreye özgü kimliğini tanımladık. Ayrıca, yeniden programlanmış hücrelerin nöronal olgunlaşma fonksiyonel değerlendirme için bir protokol sağlar. Flip-eksizyon (Flex) vektörler enjekte ederek, hücre yeniden programlama için hedef olarak hizmet beyin belirli hücre türlerine yeniden programlama ve synapsin odaklı muhabir genler içeren. Bu teknik, yeni yeniden programlanmış nöronların kolay tanımlanması için izin verir. Sonuçlar, elde edilen yeniden programlanmış nöronların işlevsel olarak zaman içinde olgun olduğunu, sinaptik kontakları almasını ve farklı türde internöronların elektrofizyolojik özelliklerini gösterdiğimi göstermektedir. Ascl1, Lmx1a ve Nurr1 transkripsiyon faktörlerini kullanarak, yeniden programlanmış hücrelerin çoğunluğu hızlı spiking, parvalbumin içeren interneurons özellikleri vardır.
Bu yöntemin genel hedefi verimli bir şekilde beyin yerleşik glia in vivo fonksiyonel ve Subtype özgü nöronlar gibi parvalbumin-interneurons ifade dönüştürmek için. Bu bir eksojen hücre kaynağına gerek kalmadan beyin hastalıkları için alternatif bir hücre replasman tedavisinin gelişmesine yönelik bir adım ileri sağlar. Aynı zamanda hücre kader anahtarları situ çalışma için bir araç oluşturur.
Beyin yeni nöronlar üretmek için sadece sınırlı bir kapasiteye sahiptir. Bu nedenle, nörolojik hastalıklarda, beyin tamiri için eksojen hücre kaynaklarına ihtiyaç vardır. Bunun için, birincil dokudan hücreler, kök hücre türetilen hücreler ve yeniden programlanmış hücreler dahil olmak üzere yıllar boyunca farklı hücre kaynakları yoğun araştırmaya maruz kalmıştır1,2,3. Doğrudan nöronlar içine Resident beyin hücrelerinin yeniden programlama beyin içinde roman nöronlar oluşturmak için hastanın kendi hücrelerini kullanır gibi beyin tamiri için çekici bir yöntem sağlayabilir son bir yaklaşımdır. Bugüne kadar, birkaç rapor içinde vivo yeniden programlama beyin Viral vektör teslimat ile göstermiştir4,5,6,78,9 gibi farklı beyin bölgelerinde korteks, omurilik, striatum ve orta beyin5,10,11, yanı sıra bozulmamış ve lezioned beyin5,8,11,12. İnhibitör ve uyarıcı nöronlar elde edilmiştir4,8, ancak bu hücrelerin hassas fenotipi veya işlevselliği henüz ayrıntılı olarak analiz edilmedi.
Bu protokolde, in vivo yeniden programlanmış nöronların daha verimli bir şekilde yeniden programlanması ve hücreye özgü tanımlaması açıklanmaktadır. İşlevsellik ve immünohistokimyasal özelliklere dayalı nöronal olgunlaşma ve fenotip karakterizasyonu işlevsel değerlendirme için bir protokol sağlıyoruz.
Biz bir CRE-indüklenebilir AAV vektör ve bir GFP muhabir in vivo yeniden programlanmış nöronlar tanımlamak için kullanılır. Viral vektörler bu seçim retrovirüs7,8kullanımına alternatif olarak, hedeflenen hücrelerin sayısını artırarak, hem bölme ve beyin bölünmeyen hücreleri bulaşan avantajına sahiptir. Bir nöron özgü synapsin odaklı FLEX muhabiri (GFP), özellikle yeni oluşturulan nöronlar algılamak için bize sağladı. Önceki çalışmalar, aynı zamanda belirli hücre türlerinde yeniden programlama genler ve gazetecilerin ifade izin in vivo yeniden programlama7,9için Subtype özgü Rehberleri kullandık. Ancak, bu yöntem muhabir ve nöronal işaretçileri ortak ifade postmortem analizi ile yeniden programlanmış nöronların daha fazla tanımlanması gerekir. Burada açıklanan bir neuron-specific muhabir, kullanımı, doğrudan bir kimlik sağlar. Bu başarılı bir dönüşüm doğrudan bir kanıtı sağlar ve yama kelepçe Elektrofizyoloji için gerekli olan bir canlı hücre kimlik sağlar.
In vivo doğrudan yeniden programlama CRE-fare suşları ifade AAV FLEX vektörler kullanılarak elde edilebilir. Yeniden programlama etkinliğine ilişkin fare suşları arasındaki farklılıkların gözlendiği dikkate alınmalıdır. Striatum içinde vivo yeniden programlama için, NG2-CRE fare hattı diğer suşları ile karşılaştırıldığında daha verimli olduğu kanıtlanmıştır. Yeni bir hayvan gerinim kullanmaya başlamadan önce, hayvanların yaşı genellikle bu protein ifadesinin özgüllüğünü etkilediği için, zaman içinde CRE ifadesi ile ilgili fare sağlayıcı kurallarını kontrol etmek önemlidir. NG2 glia dışındaki hücrelerde CRE ifadesi için bir risk olduğu için çalışmalarda, 12 haftadan büyük hayvanlar in vivo yeniden programlama için kullanılmadı. Sadece Synapsin-FLEX-GFP yapı ile enjekte kontrol hayvanların sürekli varlığı ve izlenmesi tavsiye edilir. Bu, hiçbir yeniden programlama genleri (ALN) kullanılırsa, mevcut olmamalıdır GFP-pozitif hücreler için hayvanların izlenmesi sağlar.
Yeni yeniden programlanmış nöronlar tanımlamak için, bu protokolde açıklanan bir neuron-specific tanımlama yöntemi çok önemlidir. Bu, bir Homotopik bölgede yeniden programlama yaparken, özellikle alaka düzeyi olan endojen çevreleyen hücrelerden yeniden programlanmış nöronların uygun bir şekilde tanımlanması ve ayırt edilmesini sağlar.
Viral enjeksiyon için doğru yapıyı hedeflemek de önemlidir. Bu nedenle, viral enjeksiyon için stereotaktik cerrahi önemlidir ve özellikle beynin küçük yapılarını hedeflerken, doğruluk ile yaklaşmak gerekir.
Daha önce de aynı yeniden programlama faktörleri kullanarak in vitro yeniden programlama deneylerine dayanan in vivo yeniden programlama sonucunu tahmin etmek için güvenilir olmadığını11 göstermiştir. Bu nedenle tüm ilgi faktörleri in vivo olarak test edilmesi gerekir. Bizim ellerimizde, pek çok farklı faktör kombinasyonu, bu genlerin diğer nöronların gelişimine bağlı olmasına rağmen, aynı nöronların alt tipini (yani,11 in vivo interneurons) verir.
Yeniden programlanmış nöronlar için tam hücreli yama kelepçe hassas bir tekniktir ve doku işleme iyi bir sonuç için önemlidir. Buz gibi soğuk Krebs çözeltisi ile perfüzyon doku kalitesini arttırır. Ayrıca, yamalı nöronların dikkatle tedavi edilmesi gerekir. Yeniden programlanmış nöronlar olgunlaşma ve fenotipi kimlik biraz tüm hücreli yama kelepçe kullanılarak değerlendirilebilir olsa bile, bu hücreler tamamen onların endojen meslektaşları ile karşılaştırılabilir değildir. Yeniden programlanmış hücre kimliğini daha fazla onaylamak için genom sıralaması (örn. RNA sıralaması) gibi ek analiz türleri kullanılmalıdır.
Burada açıklanan teknik, nöronal değişimin beyinde gerekli olduğu gelecekteki tedavilerin gelişimi için düşünülebilir. In vivo yeniden programlama hala erken aşamalarında ve insanlara çeviri henüz öngörülmüştür rağmen, bu teknik, beyin ve çalışma hücresi olgunlaşma in vivo eksojen gen fonksiyonunu değerlendirmek için bir yöntem sağlayabilir.
The authors have nothing to disclose.
Marcella birtele Avrupa Birliği Horizon 2020 programı (H2020-MSCA-ıTN-2015) tarafından Marie Skłodowska-Curie yenilikçi eğitim ağları ve Grant Sözleşmesi No. 676408 altında finanse edilmiştir. Daniella Rylander Ottosson Isveç Araştırma Konseyi (2017-01234) tarafından finanse edilmiştir.
REAGENTS FOR AAV5 CLONING AND VIRAL VECTOR PREPARATION | |||
pAAV-CA-FLEX | AddGene | 38042 | |
Ascl1 | AddGene | 67291 | NM_008553.4 |
Lmx1a | AddGene | 33013 | NM_0033652.5 |
Nurr1 | AddGene | 35000 | NM_013613.2 |
GFP-syn | AddGene | 30456 | |
LoxP (FLEX) sequence 1 | GATCTccataacttcgtataaagtatcctatac gaagttatatcaaaataggaagaccaatgcttc accatcgacccgaattgccaagcatcaccatcg acccataacttcgtataatgtatgctatacgaa gttatactagtcccgggaaggcgaagacgcgga agaggctctaga |
||
LoxP (FLEX) sequences 2 | tactagtataacttcgtataggatactttatac gaagttatcattgggattcttcctattttgatc caagcatcaccatcgaccctctagtccacatct caccatcgacccataacttcgtatagcatacat tatacgaagttatgtccctcgaagaggttcgaa ttcgtttaaacGGTACCCTCGAC |
||
pDP5 | Plasmid Factory | PF435 | |
pDP6 | Plasmid Factory | PF436 | |
Phosphate-Buffered Saline (PBS) | Thermo Fisher Scientific | 10010023 | |
FBS (Fetal bovine serum) | Thermo Fisher Scientific | 10500064 | |
Penicillin streptomycin | Thermo Fisher Scientific | 15140122 | |
DMEM (Dulbecco's Modified Eagle Medium)+ Glutamax | Thermo Fisher Scientific | 61965026 | |
DPBS (Dulbecco's Phosphate Buffer Saline) | Thermo Fisher Scientific | 14190094 | |
HEK293 cells | Thermo Fisher Scientific | 85120602-1VL | |
Flasks | BD Falcon | 10078780 | 175 cm2 |
Tris H-CL | Sigma Aldrich | 10812846001 |
For TE buffer use 10 mM, pH 8.0; for lysis buffer use 50mM, pH 8.5; for IE buffer use 20 mM, pH 8.0; for elution buffer use 20 mM, pH 8.0
|
EDTA | EDTA: Invitrogen | EDTA: AM9260G |
For TE buffer use 1 mM EDTA
|
Ultrapure water |
see Ultrapure water system
|
||
CaCl2 | SigmaAldrich | C5080 | 2.5 M |
Dulbecco´s phosphate-buffered saline (DPBS) | Thermo Fisher Scientific | 14190136 | |
NaCl | Sigma-Aldrich | S3014 |
FOR HBS use 140 mM; for Lysis Buffer use 150 mM; for IE buffer use 15 mM; for elution buffer use 250 mM
|
MgCl2 | Sigma-Aldrich | M8266-100G |
For lysis Buffer: 1 mM
|
Ultracentrifuge sealing tubes | Beckman Coulter | Quick-Seal® Polypropylene Tube | |
OptiPrep™ Density Gradient Medium | Sigma Aldrich | D1556-250ML | |
10-mL syringe-18G needle | BD | 305064 | |
Laboratory glass bottles | VWR | ? | |
Anion exchange filter | PALL laboratory | MSTG25Q6 |
Acrodisc unit with Mustang Q membrane
|
Centrifugal filter unit | Merck | Z740210-24EA |
Amicon Ultra-4 device
|
Endotoxin-Free Plasmid DNA Isolation Kits | Thermo Fisher Scientific | A33073 | |
Na2PO4 | Sigma-Aldrich | S7907 | |
HEPES | Sigma-Aldrich | H7523 | 15 mL |
Falcon tube | Thermo Fisher Scientific | Corning 352196 | |
Falcon tube | Thermo Fisher Scientific | Corning 352070 | |
Glass Vials | Novatech | 30209-1232 |
CGGCCTCAGFGAGCGA
|
Forward Primer for Inverted Terminal Repeat (ITR) sequence |
GGAACCCCTAGTGATGGAGTT
|
||
Reverse Primer for Inverted Terminal Repeat (ITR) sequence |
CACTCCCTCTCTGCGCGCTCG
|
||
5´FAM / 3´BHQ1 probe | Jena Bioscience | ||
0.22 mm filter | Merck | SLGV004SL | Millex-GV filter |
EQUIPMENT AAV5 VIRAL VECTOR PREPARATION | |||
Freezer -20 °C | |||
Freezer -80 °C | |||
Fridge +4 °C | |||
AAV viral room | |||
Ultrapure Water system | Merck | Milli-Q® IQ 7000 | |
Vortex mixer | VWR | 444-0004 | |
Ultracentrifuge | Beckman Coulter | Beckman Optima LE-80K Ultracentrifuge | |
Autoclave | Tuttnauer | 2540 EL | |
Polymerase Chain Reaction (PCR) | BioRad | C1000 Touch Thermal Cycler | |
Quantitative PCR (qPCR) | Roche | LightCycler® 480 System | |
Centrifuge | Thermo Fisher Scientific | Sorvall ST16 | |
Water Bath | Thermo Fisher Scientific | TSGP02 | |
ANIMAL MODEL | |||
NG2-Cre mice | Jackson | NG2-CrexB6129, Stock #008533 | |
REAGENTS FOR INJECTION OF REPROGRAMMING FACTORS INTO THE BRAIN | |||
Water | |||
Saline | Apoteket AB | 70% | |
Ethanol | Solveco | ||
Isolfurane | Apoteket AB |
Dilute to 1% solution with warm water.
|
|
Virkon | Viroderm | 7511 | |
Pentobarbital | Apoteket AB | P0500000 |
i.p. for terminal procedure at the dose of 60 mg/ml.
|
Sucrose | Merck | S0389-500G | |
Trypan Blu | Thermo Fisher Scientific | 15250061 | |
Retrobeads | Lumafluor | R170 | |
Buprenorphine | Apoteket AB | ||
EQUIPMENT FOR INJECTION OF REPROGRAMMING FACTORS INTO THE BRAIN |
From RSG Solingen.
|
||
Scissors | VWR | 233-1552 | From Biochem. |
Tweezers | VWR | 232-0007 | |
Forcep | VWR | 232-0120 | |
Scalpel holder | VWR | RSGA106.621 | Number 20. |
Scalpel | VWR | RSGA106.200 | |
Stereotaxic frame | Stoelting Europe | 51500D | |
Mouse ear bars | Stoelting Europe | 51648 | 5 ul |
Syringe with Removable needle | Hamilton Company | 65 |
0,75 inner diameter and 1.5 outer diameter.
|
Glass capilaries | Stoelting | 50811 | |
Glass capillary puller | Sutter company | P-1000 | |
Dental drill | Agnthos AB | 1464 | |
Shaver | Agnthos AB | GT420 | |
Isoflurane Chamber and pump | Agnthos AB | 8323101 | 2 mL |
Syringes | Merck | Z118400-30EA | 25G |
Needles | Merck | Z192414 Aldrich | |
Mouse and neonatal rat adaptor for stereotaxic fram | Stoelting | 51625 | |
Heating pad | Braintree scientific, inc | 53800M |
From Covidien 2187.
|
Cotton gauze | Fisher Scientific | 22-037-902 | |
Rubber tube | Elfa Distrelec | HFT-A-9.5/4.8 PO-X BK 150 | |
Cotton swabs | Fisher Scientific | 18-366-473 | |
REAGENTS FOR WHOLE-CELL PATCH CLAMP RECORDINGS | |||
NaCl | Sigma-Aldrich | S3014 | |
KCl | Sigma-Aldrich | P9333 | |
NaH2PO4-H2O | Sigma-Aldrich | S9638 | |
MgCl2-6 H2O | Sigma-Aldrich | M2670 | |
CaCl2-6 H2O | Sigma-Aldrich | C8106 | |
MgSO4-7 H2O | Sigma-Aldrich | 230391 | |
NaHCO3 | Sigma-Aldrich | S5761 | |
Glucose | Sigma-Aldrich | G7021 |
see Ultrapure Water system
|
Ultrapure Water | Prepare 1 or 2M. | ||
KOH | Sigma-Aldrich | P5958-500G | |
K-D-gluconate | Sigma-Aldrich | G4500 Sigma | |
KCl | Sigma-Aldrich | P9541 | |
KOH-EGTA (Etilene glycol-bis-N-tetracetic acid) | Sigma-Aldrich | E3889 Sigma | |
KOH- Hepes acid (N-2-hydroxyethylpiperazine-N’-2-ethanesulfonic acid) | Sigma-Aldrich | H7523 | |
NaCl | Sigma-Aldrich | S3014 | |
Mg2ATP | Sigma-Aldrich | A9187 | |
Na3GTP | Sigma-Aldrich | G8877 | |
Biocytin | Sigma-Aldrich | B4261 | |
Picrotoxin | Merck | P1675 Sigma | |
CNQX | Merck | C239 Sigma | |
Ice | |||
EQUIPMENT FOR WHOLE-CELL PATCH CLAMP RECORDINGS | |||
Borosilicate glass pipette | Sutter Company | B150-86-10 | |
Glass capillary puller | Sutter company | P-1000 | |
Vibratome | Leica | Leica VT1000 S | |
WaterBath | Thermo Fisher Scientific | TSGP02 | |
Clampfit software | Molecular Devices | ||
Multiclamp software | Molecular Devices | ||
REAGENTS FOR IMMUNOHISTOCHEMISTRY |
Use at a concentration of 4%. CAUTION: PFA is a potent fixative. Avoid ingestion and contact with skin.
|
||
Paraformaldehyde (PFA) | Merck Millipore | 1040051000 |
Use at a concentration of 0.1%.
|
Triton X-100 | Fisher Scientific | 10254640 |
Donkey.Use at a concentration of 1 : 400.
|
Serum | Merck Millipore | S30-100ML |
Reconstitute the powder in Milli-Q water to 1 mg/mL. Aliquot and store at -20°C, light sensitive. Use at a concentration of 1 : 500.
|
4′,6-Diamidino-2′-phenylindole dihydrochloride (DAPI) | Sigma Aldrich | D9542 |
1: 600 in KPBS-T.
|
streptavidin- Cy3 | Thermo Fisher Scientific | 434315 | 1:5000, rabbit. |
Anti-GAD65/67 | Abcam | 1:2000, mouse. | |
Anti-PV | Sigma | P3088 | 1:200, goat. |
Anti-Chat | Merk | AB143 | 1:5000, rabbit. |
Anti-NPY | Immunostar | 22940 | |
K2HPO4 | Sigma-Aldrich | P3786 | |
NaCl | Sigma-Aldrich | S3014 | |
KH2PO4 | Sigma-Aldrich | NIST200B | 1:1000, chicken. |
Anti-GFP | Abcam | ab13970 | |
Mounting solution | Merck | 10981 |
Polyvinyl alcohol mounting medium with DABCO®, antifading
|
OCT | Agar Scientific | ||
Glycerol | Sigma-Aldrich | G9012-100ML | |
Distilled water | |||
Anti-freeze solution | Tissue Pro Technology | AFS05-1000N, 1000 mL/ea. | |
EQUIPMENT FOR IMMUNOHISTOCHEMISTRY | |||
Inverted fluorescence microscope | Leica | DMI6000 B | |
Confocal microscope | Leica | TCS SP8 laser scanning confocal microscope. | |
Prism | GraphPad | ||
Microtome | Leica | SM2010R |