Qui, presentiamo un protocollo per l’ex vivo determinazione qualitativa dell’antigene-specifiche CD8+ T cellule. L’analisi è possibile con sospensioni di cellule singole da organi o da piccole quantità di sangue. Una vasta gamma di studi richiedono l’analisi delle risposte a cellula T citotossica (vaccinazione e studi di immunoterapia del cancro).
Dopo l’infezione virale, antigene-specifiche CD8+ cellule di T citotossiche (CTL) derivano e contribuire all’eliminazione delle cellule infettate per impedire la diffusione di agenti patogeni. Di conseguenza, la frequenza di antigene-specific CTLs è indicativa della forza della risposta delle cellule T contro un antigene specifico. Tale analisi è importante in immunologia di base, lo sviluppo di vaccini, cancro immunobiologia e l’immunologia adattivo. Nel campo vaccino, la risposta CTL diretta contro componenti di un vettore virale co-determina quanto efficace è la generazione di cellule antigene-specifiche contro l’antigene di interesse (cioè, transgene). Antigene-specifici CTL può essere rilevato sia dalla stimolazione con peptidi specifici seguite da intracellulari di cytokine colorazione o dalla macchiatura diretta dei recettori di cellule T antigene-specifiche (TCR) e analisi di citometria a flusso. Il primo metodo è piuttosto che richiede tempo, poiché è necessario sacrificare degli animali per isolare le cellule da organi. Inoltre, esso richiede l’isolamento del sangue da animali di piccole taglia che è difficile da eseguire. Il secondo metodo è piuttosto veloce, può essere fatto facilmente con piccole quantità di sangue e non è dipenda su funzioni effettrici specifiche, ad esempio attività citolitica. I tetrameri MHC sono uno strumento ideale per rilevare l’antigene-specifici TCR.
Qui, descriviamo un protocollo per rilevare contemporaneamente antigene-specifici CTL per i peptidi immunodominanti del vettore virale VSV-GP (LCMV-GP, VSV-NP) e transgeni (OVA, E7 di HPV 16, eGFP) di MHC I tetramero macchiatura e flusso cytometry. La colorazione è possibile direttamente da sangue o da sospensioni di singola cellula degli organi, quali la milza. Sangue o sospensioni di singole cellule di organi vengono incubate con tetrameri. Dopo colorazione con anticorpi contro CD3 e CD8, antigene-specifici CTL sono quantificati tramite flusso cytometry. Facoltativamente, gli anticorpi contro CD43, CD44, CD62L o altri possono essere inclusi per determinare lo stato di attivazione di CD8 antigene-specifiche+T cellule e di discriminare tra cellule effettrici ed ingenuo.
Lo scopo di questo metodo è quello di valutare la frequenza delle risposte dei linfociti T citotossici (CTL) agli antigeni (più) nel topo da analisi cytometric di flusso senza la necessità di stimolazione del peptide che richiede tempo. Questo metodo analizza la specificità di fenotipo e dell’antigene di sottoinsiemi CTL, in un singolo ciclo di colorazione. Abbiamo ottimizzato il complesso maggiore di istocompatibilità ho (MHC I) tetramero che macchia protocollo per analizzare l’efficacia di nuovi approcci di vaccino, come VSV-GP, una nuova variante del virus stomatite vescicolare (VSV), dove la glicoproteina G del VSV è stata sostituita dalla glicoproteina GP della Coriomeningite linfocitaria virus (LCMV)1,2. Oltre alla risposta umorale, una lettura importante dell’effettività di un vaccino è l’induzione di una risposta CTL contro uno o più antigeni. Come la consistenza e la durata della risposta cellulare sono importanti in questo contesto, è favorevole per monitorare la cinetica delle risposte CTL dall’animale stesso. Questo porterà anche ad una riduzione del numero di animali, un aspetto importante per quanto riguarda i principi delle “3R”3. Quindi, l’analisi da appena 20 µ l di sangue è ottima per questo scopo.
Tetrameri sono stati sviluppati negli anni ‘ 90 tardi4 ed è diventato uno strumento importante nel campo della immunologia delle cellule T. Sono tetrameri fluorescente etichettati complessi di quattro MHC I / molecole del peptide, che si legano alla TCR, specifico per un singolo peptide. Al giorno d’oggi, possono essere acquistati sia già pronti5, custom-ordinato gratuitamente presso l’impianto di Core NIH tetramero Emory University6 o prodotte in laboratorio7. MHC I e II tetrameri sono disponibili, cioè per CD8+ e CD4 cellule+ T, rispettivamente. La potenza del tetramero macchiatura sta nel risparmio di tempo, piuttosto semplice e facile da standardizzare i protocolli8 e sensibilità9. Inoltre, se si lavora con il sangue, gli animali non è necessario essere sacrificato e quantità minime di campione sono necessari. Una sola misurazione non è limitata a un singolo antigene, ma parecchi antigeni possono essere analizzati in una colorazione quando combinando tetrameri coniugati con diversi fluorofori. Antigeni recentemente scoperti, per esempio dagli schermi del peptide, possono essere facilmente incorporati in tetrameri e utilizzati per la quantificazione del sottoinsieme delle cellule T.
Tetramero di colorazione non darà informazioni sulle funzionalità CTL (cioè., produzione di citochina, funzioni effettrici), ma solo specificità. Per ottenere informazioni sulla funzionalità delle cellule T, intracellulare cytokine colorazione (ICS) o analisi enzima Linked Immuno Spot (ELISpot) dovrà essere eseguita8,10. Tetramero macchiatura e ICS/ELISpot, tuttavia, non sono ridondanti, ma piuttosto completano a vicenda. Stimolazione in vitro per indurre la produzione di citochina per ICS/ELISpot altererà il fenotipo a cellula T originale. Tetramero di colorazione, al contrario, lascia la cellula T intatta; il fenotipo originale è conservato e può essere analizzato. Inoltre, un altro grande vantaggio di tetrameri è che la colorazione possono essere combinati con l’ordinamento magnetico e l’arricchimento di cellule antigene-specifiche11. Questo permette l’analisi delle popolazioni rari, così come coltura delle cellule ordinate con antigene-specificità definita — una caratteristica che non è possibile con altri metodi.
Utilizzando il protocollo descritto qui, tetramero colorazione, nonché ICS/ELISpot può essere eseguita da un organo, perché solo pochissimo materiale (sangue: 20 µ l; milza: 1 x 106 cellule) è richiesto per la colorazione del tetramero. Tuttavia, a seconda della frequenza delle cellule antigene-specifiche di interesse, la forza delle rispettive TCR e il contesto sperimentale, la quantità di cellule necessarie potrebbe essere necessario essere scalato o arricchimento magnetico potrebbe essere necessario essere applicato.
Tetrameri sono ampiamente utilizzati, ad esempio per valutare l’efficacia di vaccini (antitumorale)12,13,14,15 o immunoterapia16,17, analisi fenotipica e spaziale localizzazione di cellule T antigene-specifiche sottoinsiemi18,19,20,21,22,23. Il metodo qui descritto è adatto per gli studi, che intendono includere la quantificazione e l’analisi fenotipica di murino antigene-specifiche CD8+ T cellule nella loro analisi in modo rapido e conveniente.
Macchiatura del tetramero è un protocollo piuttosto semplice e senza complicazioni per analizzare il fenotipo e peptide specificità di un linfocita T. L’utilizzo di sangue per l’analisi, come descritto qui, è come minimo dilagante e consente il monitoraggio continuo, ad esempio negli studi di vaccinazione. Nel campo della vaccinazione, la quantificazione delle risposte antigene-specifiche e di vettore è di interesse, come le risposte specifiche del vettore potrebbero ostacolare un’efficace risposta immunitaria contro il vaccino antigene28. Di nota è che con il protocollo descritto qui, entrambe le popolazioni possono essere quantificate simultaneamente in un singolo tetramero di macchiatura, riducendo la variabilità di colorazione e quantità di campione. Tuttavia, a pochi passi devono essere fatte con cura per garantire la corretta misurazione e dati affidabili. Se si utilizza sangue dalla vena caudale per analisi, uno dovrebbe assicurarsi che preriscaldare gli animali per indurre vasodilatazione24. Quindi, sufficiente sangue può essere raccolto in breve tempo, lo stress sugli animali è ridotto e l’analisi è molto meglio, rispetto a se il sangue viene raccolto lentamente. Inoltre, dopo la raccolta dei campioni (sangue o organi), macchiatura diretta è consigliabile per evitare risultati falsi negativi a causa di TCR downregulation. Lo stesso vale per tutti i passaggi successivi: la procedura non deve essere interrotta e tutti i passaggi del lavaggio ridotto al minimo numero (come indicato nel protocollo). Per garantire la corretta colorazione, dovrebbe prestare attenzione a vortice tutte le soluzioni e i campioni prima e dopo incubazione. Ciò è particolarmente importante prima di fissare i campioni per evitare grumi di cellule.
In termini di modifica del protocollo, possono essere utilizzati altri marcatori di superficie e tetrameri, a seconda l’obiettivo dell’analisi. Tuttavia, tutti i reagenti quindi necessario dosare in modo ottimale in combinazione con l’intero pannello di colorazione. Per alcuni i tetrameri specificati qui, ottimizzazione ha rivelato che possiamo aumentare la diluizione consigliata dal produttore (01:10 consigliato, ottimizzato 01:25) (tabella 1). Per compensare la sovrapposizione spettrale, perline di compensazione può essere utilizzato invece di cellule marcate. Per quanto riguarda la scelta del fluorocromo tetramero-accoppiati, si dovrebbe prevedere di utilizzare fluorocromi brillanti, che facilita la rilevazione – soprattutto quando il segnale è basso. Come Dolton e colleghi29, preferiamo usare tetrameri PE – o APC-accoppiati, che possono essere perfettamente combinati in un’unica colorazione e CD8+ T cellule con una specificità del singolo antigene possono essere ben rilevato (Figura 2). Per quanto riguarda la temperatura e l’incubazione volte, esiste una varietà di tetramero condizioni di colorazione. Nel nostro processo di ottimizzazione, abbiamo affrontato questo problema ed abbiamo effettuato tetramero che macchia a condizioni diverse (ad esempio 4 ° C, temperatura ambiente o 37 ° C). Dai risultati ottenuti, si consiglia a macchiare per 20 min a 37 ° C, che è in concordanza con letteratura30,31. Incubazione prolungata dovrebbe essere evitato, come questo può portare a interiorizzazione dei risultati negativi del tetramero30 e false.
La scelta dell’anticorpo giusto per il rilevamento di CD8+ cellule è un’altra questione importante, che ha attentamente considerati (e potenzialmente adattato). Ciò deriva dal fatto che alcuni cloni dell’anticorpo anti-CD8 blocco associazione di tetrameri di TCR, in umano32 così come mouse33 campioni. Per il nostro tetramero protocollo di colorazione, abbiamo selezionato clone 53 – 6.7 a macchiare per CD8 murino+ cellule — un clone che non blocca, ma piuttosto migliora tetramero macchiatura.
Macchiatura del tetramero è piuttosto semplice quando si analizzano le risposte immunitarie prominente al picco della risposta delle cellule T, ad esempio. Tuttavia, potrebbero esistere delle popolazioni che sono un po’ più “problematiche”. Questi esempi includono cellule specifiche per antigeni di bassa affinità (tumore, self), recentemente attivato cellule che successivamente giù-regolato loro recettori o sottoinsiemi di cellule rare (ad es.. ingenuo precursore o memoria popolazioni di cellule). In questi casi, il tetramero classico protocollo di colorazione potrebbe essere necessario essere migliorato o combinato con altri metodi. Ad esempio, il proteina chinasi inibitore (PKI) dasatinib inibisce l’interiorizzazione di TCR e potrebbe essere inserito prima della colorazione tetramero. Tetrameri possono essere stabilizzati anche includendo anti-fluorocromo non coniugata Abs primario dopo la macchiatura tetramero. Inoltre, l’intensità di fluorescenza può essere aumentata tramite l’aggiunta di un secondo anti-Ab fluorocromo-coniugate Ab29,34,35,36. Abbiamo ottimizzato le condizioni in modo selettivo per i tetrameri specificati nel presente protocollo e non include PKI o Abs ulteriori. Tuttavia, per qualsiasi altro tetramero, le condizioni ottimali devono essere regolata singolarmente. Per quanto riguarda le popolazioni rare, tetramero colorazione potrebbe essere necessario essere combinati con arricchimento magnetico11.
Per facilitare e convalidare analisi Citofluorimetrica del tetramero macchiatura, controlli positivi e negativi devono essere inclusi. Come controllo negativo, abbiamo sempre macchia le cellule del mouse ingenui dello stesso ceppo con nostro tetramero di interesse. In alternativa, i campioni possono essere macchiati con tetrameri con peptidi irrilevanti, ma con il fluorocromo stesso come il tetramero di interesse. Tali controlli sono essenziali per escludere falsi segnali positivi, ad esempio., che proviene dalle cellule morenti. Oltre a questo, si consiglia di includere una macchia vive/morte, ad esempio ioduro di propidio (PI). Questo è di particolare importanza se le cellule non sono macchiate direttamente dopo l’isolamento. Un’altra strategia per rimuovere autofluorescence sfondo potrebbe essere di includere diversi marcatori di cellule non-T in un canale. Escludendo le cellule positive in questo canale, popolazioni di cellule non-T possono essere escluso. Come controllo positivo, un campione da un mouse di OT-1 può essere utilizzato per tetramero OVA, ad esempio. Per altri tetrameri, questo deve essere scelto individualmente (ad es.., campione da un mouse, che è stato immunizzato più volte). Allo stesso modo gli altri37, osserviamo anche una down-regulation del recettore CD8 durante l’attivazione di CTL al 7 ° giorno della risposta delle cellule T effettrici. Pertanto, per evitare la perdita di cellule T effettrici attivato tetramero+ , si consiglia di includere le cellule CD8basso nell’analisi (almeno se la misurazione nella fase effettrice).
La qualità e la quantità di informazioni che si possono recuperare da questo protocollo dipende dalla conoscenza circa l’antigene da studiare, la disponibilità e la specificità del tetramero e la qualità della macchina FACS (numero di rivelatori disponibili e laser). Se si lavora con campioni animali, variazione nella risposta immunitaria è naturale e inevitabile. Pertanto, per ottenere risultati significativi da tetramero macchiatura, almeno 3-5 animali dovrebbero essere analizzati. Se fatto, il protocollo descritto qui darà risultati affidabili e riproducibili (esemplare risultato da un esperimento può essere trovato nella Tabella supplementare 1). Come accennato prima, questo metodo è perfettamente adatto per quantificare il fenotipo e la specificità dell’antigene di CD8+ T cellule (Figura 3, 4; Supplemental Figura 1), non solo nel topo ma anche negli esseri umani. Tuttavia, per analizzare CD8+ delle cellule T effettrici le funzioni, come la morte delle cellule indotta da granzyme, ICS e/o ELISpot devono essere eseguite. Tuttavia, si dovrebbe tenere a mente che funzioni a cellula T, come misurato dalla stimolazione in vitro potrebbero non rappresentare la reale situazione in vivo. In vivo, un ambiente soppressivo potrebbe impedire le funzioni delle cellule T che vengono misurate in vitro.
Il relativi propri, tetramero macchiatura non fornisce tutte le informazioni, ma si è evoluto per diventare un metodo essenziale per caratterizzare le risposte delle cellule T e quantificare i sottoinsiemi a cellula T in vitro in un modo molto sensibile38. Tetrameri non possono essere utilizzati solo per quantificare determinati sottoinsiemi, ma anche per isolare quelli39, li localizzare l’ibridazione in situ19,20 e studiare gli antigeni di bassa affinità, come tumore-collegati40, 41. dalla scoperta del tetramero tecnologia4, tetramero macchiatura è diventato uno strumento essenziale in analisi a cellula T e la gamma di applicazioni.
The authors have nothing to disclose.
Questo progetto è stato finanziato dal fondo scienza austriaco FWF (numero di progetto P 25499-B13) e concede la ricerca Orizzonte 2020 dell’Unione europea e il programma di innovazione sotto contratto n. 681032. Il reagente seguente è stato ottenuto attraverso la struttura di nucleo del tetramero NIH: classe I MHC tetramero per nucleoproteina del virus di stomatite vescicolare (RGYVYQGL).
Safety cabinet class 2 | VWR | LBCP302411030 | |
Flow cytometer (e.g. FACSCanto II) | BD | 338962 | |
Analysis platform for flow cytometry analysis (e.g. FlowJo) | Fisher Scientific Co. L.L.C. | NC0887833 | |
Binocular microscopes, VisiScope 100 | VWR | 630-1553 | |
Vortex mixer | Phoenix Instrument | RS-VA 10 | |
Centrifuge suitable for FACS tubes (e.g. Rotanta 460R) | Hettich | 5660 | |
Sterile Scalpel Blades Nr. 10 | Braun | BB510 | |
Cell strainer 40 µm | Sigma | CLS431750 | |
Cell strainer 70 µm | Sigma | CLS431751 | |
Neubauer counting chamber | VWR | 630-1506 | |
Pipettes (20 μL, 200 µL and 1000 μL) | Eppendorf | 4924000037, 4924000061, 4924000088 | |
Pipette tips, sterile (20 µL, 200 µL, 1000 µL) | Biozym | 770050, 770200, 770400 | |
Pipet Boy | Integra | 155 000 | |
Sterile pipettes (5 mL, 10 mL, 25 mL) | Sarstedt | 86.1253.001, 86.1254.001, 86.1685.001 | |
Multistep Pipette, HandyStep S | BRAND | 705110 | |
12.5 ml Combitips for Multistep Pipette | BrandTech Scientific | 702378 | |
Microvette CB 300 K2E | Sarstedt | 16.444 | |
Sterile reaction tubes (1.5 mL, 50 mL) | Sarstedt | 72.692.005, 62.547.254 | |
FACS tubes (non-sterile) | Szabo Scandic | BDL352008 | |
PBS | Lonza | LONBE17-516F | |
Heat-inactivated FCS | ThermoFisher Scientific | 10500064 | |
Formaldehyde | Roth | 4979.1 | |
Sodium azide | Roth | K305.1 | |
PE-Cy7 Rat Anti-Mouse CD3 Molecular Complex | BD | 560591 | Clone 17A2; Lot # 7235504 |
Pacific Blu Rat Anti-Mouse CD8a | BD | 558106 | Clone 53-6.7; Lot # 5058904 |
V450 Rat anti-Mouse CD8a | BD | 560469 | Clone 53-6.7; Lot # 5205945 |
FITC anti-mouse CD43 | BioLegend | 121206 | Clone 1B11; Lot # B233778 |
PE-Cy5 Rat Anti-Mouse CD44 | BD | 553135 | Clone IM7; Lot # 85660 |
APC-Cy7 Rat Anti-Mouse CD62L | BD | 560514 | Clone MEL-14; Lot # 7215801 |
OVA-tetramer/APC | MBL | TB-5001-2 | SIINFEKL, H-2Kb; Lot # T1702008 |
VSV NP-tetramer/PE | MBL | TS-M529-1 | RGYVYQGL, H-2Kb; Lot # 007 |
EGFP-tetramer/PE | MBL | TS-M525-1 | HYLSTQSAL, H-2Kd; Lot # 004 |
LCMV-GP-tetramer/APC | MBL | TB-5002-2 | KAVYNFATC, H-2Db; Lot # T1412006 |
HPV 16 E7-tetramer/APC | MBL | TB-5008-2 | RAHYNIVTF, H-2Db; Lot # T1804003 |