Imagerie moléculaire avec laser assistée par matrice désorption/ionisation-basée d’imagerie spectrométrie de masse (MALDI-IMS) permet la cartographie simultanée de plusieurs analytes dans des échantillons biologiques. Nous présentons ici un protocole pour la détection et la visualisation de la protéine β-amyloïde sur les tissus cérébraux de la maladie d’Alzheimer et d’angiopathie amyloïde échantillons à l’aide de MALDI-IMS.
La neuropathologie de la maladie d’Alzheimer (ma) est caractérisée par l’accumulation et l’agrégation des peptides β-amyloïde (Aß) en plaques extracellulaires du cerveau. Les peptides bêta-amyloïdes, composées de 40 acides aminés, sont générés à partir des protéines de précurseur de l’amyloïde (APP) par β – et γ-sécrétases. Bêta-amyloïdes sont déposées non seulement dans le parenchyme cérébral, mais aussi en méningées et les parois des vaisseaux cérébraux, appelées angiopathie amyloïde (CAA). Bien qu’une variété de peptides bêta-amyloïdes ont été identifiés, détaillé de production et de distribution de différents peptides Aß dans les tissus pathologiques des AD et CAA n’ont pas été entièrement réglés. Ici, nous développons un protocole laser assistée par matrice désorption/ionisation-basée d’imagerie de spectrométrie de masse (MALDI-IMS) sur les tissus du cerveau humain autopsie afin d’obtenir la cartographie complète de protéine. À cet effet, les prélèvements humains corticales ont été extraites de la banque de cerveaux à la Tokyo Metropolitan Institut de gérontologie. Cryosections congelées sont coupées et transférées à oxyde indium-étain (ITO)-revêtement des lames de verre. Les spectres sont recueillies à l’aide du système MALDI avec une résolution spatiale jusqu’à 20 µm. acide Sinapique (SA) est uniformément réparti sur la diapositive en utilisant un pulvérisateur manuel ou automatique. Avec les avantages techniques actuelles de MALDI-IMS, un ensemble de données typique de diverses espèces de bêta-amyloïdes dans les mêmes sections de cerveaux autopsiés humains peut être obtenu sans sondes spécifiques. En outre, à haute résolution (20 µm) imagerie d’un cerveau et de la grave CAA échantillon montre clairement que Aβ1-36 à Aβ1-41 ont été déposés dans des vaisseaux méningées, tandis que Aβ1-42 et Aβ1-43 ont été déposés au parenchyme cérébral comme plaque sénile (SP). Il est possible d’adopter une approche standard en combinaison avec les observations cliniques, génétiques et pathologiques dans la compréhension de la pathologie d’Alzheimer, CAA, MALDI-IMS et autres maladies neurologiques basé sur la stratégie actuelle.
Afin de faire le diagnostic et pour comprendre la pathogenèse des maladies neurodégénératives, identification moléculaire précise des dépôts pathologiques est essentiel1. Dans le cadre de l’AD, Aβ est produit pour rendre le SPs dans le parenchyme cérébral et déposé dans des récipients bien avant la maladie survenue2,3,4,5,6. Aβ1-42 est le peptide prédominant dans le SP de cerveaux Alzheimer, autres variantes Aβ, par exemple N-terminal ou C-terminal tronqués ou modifiés Aβs, sont également identifiés dans touchés AD cerveau7,8,9, 10. Un tableau complet de l’espèce de large gamme de bêta-amyloïdes dans le cerveau humain, surtout avec les AD et cérébral angiopathie amyloïde cérébrale (CAA)11, aidera les scientifiques comprennent la production de bêta-amyloïdes, du métabolisme et des dépôts.
L’approche classique de la neuropathologie, immunohistochimie (IHC) a été la méthode la plus concluante pour déterminer l’emplacement de Aβs dans le cerveau tissus12,13,14,15. En général, IHC ne peut distinguer des molécules lorsque plusieurs épitopes coexistent simultanément. En revanche, une analyse basé sur la spectrométrie de masse protéomique émergente est une approche valable surtout pour l’analyse des diverses espèces de bêta-amyloïdes dans les tissus du cerveau, qui ne peuvent pas être différenciés avec anticorps16,17. L’analyse conventionnelle de basé sur la spectrométrie de masse des lysats de cerveau et immuno-précipité des échantillons ne parvient pas à détecter de petits peptides bêta-amyloïdes et perd les informations de distribution de bêta-amyloïdes dans le tissu cérébral.
Dans des œuvres antérieures, visualisation des dépôts de bêta-amyloïdes dans le cerveau de souris a été réussie à l’aide d’un modèle animal transgénique de AD, tels que APP23. Toutefois, ce processus doit encore des progrès techniques pour comparer IMS et IHC en ce qui concerne la résolution et la sensibilité de19,18,20. Neuropathologie devrait être étudiée sur le cerveau humain, et nous avons utilisé la technologie MALDI-IMS sur les tissus du cerveau humain autopsie afin d’obtenir des protéines complètes cartographie21. À cette fin, nous avons développé un protocole pour un type de pointe de spectrométrie de masse qui a des avantages à sa rapidité, la sensibilité et la reproductibilité.
Ici, nous avons démontré un protocole détaillé et les résultats de la visualisation d’Aβ et de ses isoformes de plusieurs cerveaux autopsiés avec AD et CAA avec MALDI-IMS. Le profil de dépôts de Aβs a été radicalement changé de Aβ1-42 à ses variations N – et C-terminale. Aβ1-41 a été identifié et visualisé dans les cerveaux humains avec le protocole actuel et a été également validé avec IHC21. Considérant que la morphologie des Aβ déposé par IMS avec une analyse à haute résolution (20 μm) doit être en bon accord avec l’IHC, IMS et IHC tout aussi contribuent à distinguer les dépôts Aβ par leur emplacement et le contenu de protéines, ainsi que par leur morphologie. Comme l’expérience entière décrite ici a été réalisée dans le cortex occipital, étudier la localisation des différentes espèces de bêta-amyloïde dans toutes les régions du cerveau va être généralisé avec des expériences futures en utilisant le protocole actuel.
Étapes critiques au sein du protocole sont des étapes de préparation des tissus pour obtenir un ionisation efficace des protéines agrégées dans les tissus du cerveau humain. Une couche de la matrice est nécessaire pour absorber l’énergie du laser et induire la désorption et ionisation des analytes. Dans ce processus, une section entière de tissu est homogènement recouvert de petits cristaux. Cocristallisation homogène de l’analyte et la matrice est cruciale pour l’imagerie de haute sensibilité et sans artefact. Chacune des méthodes de trois pulvérisation a ses propres avantages. Revêtement de spray manuel est l’une des méthodes plus fréquemment utilisées. L’aérographe est commode ; Cependant, elle nécessite une opération habile. Comme une technique expérimentale précise et reproductible est essentielle, à l’aide d’un pulvérisateur à ultrasons et/ou un pulvérisateur automatique tel que décrit dans les protocoles actuels est recommandé. En ce qui concerne un pulvérisateur à ultrasons, il ne sera pas influencé par l’humidité et la température de la pièce car il est pulvérisé dans une chambre. Pendant ce temps, avec un pulvérisateur automatique, résolution spatiale relativement préservée avec bonne reproductibilité est obtenue. En règle générale, la résolution spatiale obtenue avec l’augmentation de trois méthodes dans l’ordre 1) aérographe 2) automatisme et pulvérisateur 3) par ultrasons.
Plus important encore, ce protocole a été généré pour détecter et visualiser les Aβs dans des échantillons de cerveau autopsiés. La visualisation de Aβs avec l’ISM-MALDI chez les souris APP23 qui est générée comme un modèle animal de AD issu de la mutation de type suédois d’application humaine, ont été signalée plus tôt par d’autres avec une méthode existante18,19. Toutefois, l’ancien protocole appliqué à APP23 n’était pas suffisant pour visualiser Aβ dans sa résolution latérale et la sensibilité. Œuvres antérieures discuté que des concentrations élevées de bêta-amyloïdes à l’extérieur de la limite de tissus sont clairement des artefacts dans APP23 d’imagerie avec leur protocole18,19. Cela signifie que ce qu’on appelle « blur » entre real SPs et IMS images en raison de l’étape d’extraction matrice était inévitable avec l’imagerie MALDI-type. Toutefois, dans le protocole actuel, le flou a disparu et chaque spectre représenté chaque SP unique dans le parenchyme du cerveau.
Comme indiqué ici, nous pouvons retracer Aβ1-41 pour la première fois dans l’AD et la cervelle de CAA MALDI-IMS, ainsi qu’avec l’IHC, avec un anticorps spécifique de notre propre génération21. Selon le modèle de traitement de bêta-amyloïdes, Aβ1-38 dérive Aβ1-45 via Aβ1-42, tandis que Aβ1-41 dérive de Aβ1-45 par γ-sécrétase clivage par étape27,28,29,30,31 . Cela signifie que le protocole actuel prend en charge ce modèle. En ce qui concerne les limites de cette technique, nous devons considérer l’hétérogénéité des échantillons du cerveau humain autopsie. L’étape la plus critique, dans un sens, est d’évaluer le tissu cérébral autopsie qualifié avec la preuve éthique. Avec le protocole actuel sur les tissus du cerveau autopsie qualifié, MALDI-IMS permet de suivre individuellement la toute distribution des molécules complexes ayant de multiples modifications, ainsi que des facteurs inconnus réglementant la pathogenèse de la ma, qui doivent encore être défini. En outre, dans la compréhension de la pathogenèse globale de neuropathologie différentes dans les cerveaux humains âgés, il doit être possible d’adopter une approche standard, en combinaison avec les observations cliniques, génétiques et pathologiques dans les maladies neurologiques MALDI-IMS .
Une autre étape critique de MALDI-IMS est le processus d’exploration de données de l’ensemble des données obtenue, qui est toujours beaucoup de temps. Extraction manuelle des données de chaque distribution de pointe oblige les utilisateurs à cliquer sur chaque image et chercher des distributions qui peuvent être corrélés à la morphologie de l’échantillon analysé. La segmentation spatiale automatique peut être utilisée comme première étape du data mining, donnant un aperçu de l’ensemble de données et permettant la détection rapide des traits marquants. Dans cette approche, les similitudes entre les spectres d’une région donnée sont déterminées statistiquement et spectres similaires sont regroupés dans un seul cluster. Tous les pixels sont codés par couleurs selon leur affectation de cluster (Figure 5). Dans la présente étude AD/CAA, la zone d’intérêt est l’espace des dépôts Aβ en plaque parenchymateuse et les structures vasculaires sous-arachnoïdienne et parenchymateux. Les deux sommets distinctifs qui ont été également validées avec IHC étaient les valeurs de m/z de Aβ1-40 et Aβ1-4221. Ainsi, il est facile de trouver épididymaire m/z avec Aβ1-40 et Aβ1-42, qui a déjà été annoté N – et C-terminal Aβ tronquée, ainsi que des peptides inconnues, pour une analyse ultérieure.
Weller et ses collègues ont signalé que Aβ s’accumule dans les parois des vaisseaux, plus autour des artères que les veines autour de21. En outre, il a été proposé que le liquide interstitiel (ISF) comprend Aβs excrétés par le parenchyme cérébral pour le ganglion via un périvasculaires drainage voie22,23,24,25 ,26. Le protocole actuel pour générer une carte de segmentation basée sur un ensemble de données de MALDI-IMS à 20 µm résolution prend en charge l’existence éventuelle de périvasculaires des voies de drainage du cerveau (Figure 5), qui contribuent de manière significative à la CAA en AD21 , 32. en outre, nous pouvons découvrir les protéines marqueur colocalisés avec plaque et vascularisation méningée en calculant la corrélation entre les valeurs de chaque m/z. Dans la compréhension de la pathogenèse globale de neuropathologie différentes dans les cerveaux humains âgés, il doit être possible d’adopter le MALDI-IMS comme une approche puissante en combinaison avec des données d’IHC établies de clinique, génétique, ainsi que des observations pathologiques dans neurologiques maladies.
The authors have nothing to disclose.
Ce travail a été soutenu en partie par la subvention pour la recherche scientifique sur les domaines innovants (protéine de Brain Aging et démence contrôle 26117004 ; à M.I. et T.M.). Cette recherche a été partiellement prises en charge par le programme de recherche stratégique des Sciences du cerveau de l’Agence japonaise pour la recherche médicale et le développement (AMED). Toutes les expériences ont été menées conformément aux directives d’arrivée.
Cryostat | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | CM1950 | |
Indium tin oxide (ITO)-coated microscope glass slide | Bruker Daltonics | #237001 | |
Blade (disposable) | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | #117394 | |
O.C.T. Compound | Leica Microsystems, Wetzlar, Germany | FSC 22 Blue | |
Scanner | EPSON | GT-980 | |
Air-Brush | GSI Creos | PS274 | |
Compressor | MRHOBBY | Mr.Linear compressor L5 | |
Ultrasonic sprayer | Bruker Daltonics | ImagePrep | |
Automatic sprayer | HTX Technologies | TM Sprayer | |
Confocal-laser-scanning-microscope | Carl Zeiss Inc. | LSM 700 | |
Ultra high speed MALDI instrument | Bruker Daltonics | rapifleX MALDI Tissuetyper | |
MALDI control software | Bruker Daltonics | FlexControl 3.8 | |
Data analysis software | Bruker Daltonics | FlexImaging 5.0 | |
Molecular histology software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Statistical software | SCiLS, Bremen, Germany | SciLS Lab 2016a | |
Sinapinic acid (SA) | Nacalai tesque | 30494-91 | |
Alpha-Cyano-4-hydroxyl-cinnamic acid (CHCA) | Wako | 037-19261 | |
Calibration standard | Bruker Daltonics | ||
Biotinylated anti-mouse IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Biotinylated anti-rabbit IgG antibodies | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | ||
Avidin and biotinylated HRP complex. | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit | |
3,3-diaminobenzidine (DAB) | Vector Laboratories, Inc., Burlingame, CA | Vectastain Elite ABC kit |