Здесь мы показываем как одной молекулы фото активированный локализации микроскопии может осуществляться на терминале двигательного нерва живой Drosophila melanogaster третий Инстар личинки.
Все большее количество суперразрешением микроскопии методы помогают раскрыть механизмы, которые управляют наноразмерных клетчатом мире. Одноместный молекула изображений набирает обороты, как он предоставляет исключительный доступ к визуализации отдельных молекул в живых клетках. Здесь мы опишем технику, которую мы разработали для выполнения одной частицы отслеживания фото активированный локализации микроскопии (sptPALM) у дрозофилы личинок. Синаптической связи основывается на ключевых Пресинаптический белки, которые действуют путем прикрепления, грунтовка и содействия синтез содержащих нейромедиатор везикулы с плазматической мембраны. Широкий спектр взаимодействия протеин протеина и белково липидные жестко регулирует эти процессы и Пресинаптический белки поэтому демонстрируют изменения в мобильности, связанный с каждым из этих ключевых событий. Расследование, как мобильность этих белков коррелирует с их физиологической функцией в нетронутой живой животное имеет важное значение для понимания их точный механизм действия. Извлечение мобильности белка с высоким разрешением в естественных условиях требует преодоления ограничений, таких как Оптическая прозрачность, доступность и глубину проникновения. Мы описываем, как photoconvertible флуоресцентные белки, отмеченных в пресинаптическом белка Синтаксин 1A может быть визуализирована через небольшой наклонный освещения и отслеживается на терминале двигательного нерва или вдоль аксона мотонейрона третьего Инстар дрозофилы Личинка.
Нейронные связи опирается на нейромедиатора релиз, в котором происходит через регулируемые синтез содержащих нейромедиатор синаптических пузырьков с плазматической мембраны1. Этот процесс называется экзоцитоз2,3,4,5,6 очень динамичен и может быть вверх или вниз регулируемой согласно колебания курса стимуляции7. Белков, участвующих в этих процессах подлежат броуновского движения и таким образом отображать наноструктурном Организации, способной выдержать ряд обязательных действий, которые лежат в основе этих физиологических функций. Белки плазмы мембраны очень динамичный, позволяя бокового захвата молекул в нанокластерами на плазматической мембране7,8,9,10,11, 12. Таким образом расследование мобильности этих белков помогает прояснить их режим действий8. Синаптических белков, таких как растворимые N-ethylmaleimide чувствительным фактором вложения белок рецепторы (ловушки), например Синтаксин 1A, теперь известны демонстрируют боковой быстро мобильности, а также боковые треппинга в пределах нанокластерами, который может служить как молекулярная складов и мест для везикул фьюжн9,13,14,15.
Недавнее развитие photoconvertible флуоресцентных белков, таких как мономерные (m) Eos16,17 и18Каэдэ позволила наноструктурном резолюции нейрональных плазмы мембранных белков с помощью подходов таких как фото активированный локализации микроскопии (PALM) и стохастические оптических реконструкции микроскопии (шторм)14,15,19. Эти события позволили расследования мобильность и nanoclustering биологических белков в культивировали живые клетки и нейроны. Совсем недавно были проведены исследования для выяснения (на аналогичных высоких разрешениях) динамика и организации этих мембранных белков в нейронах живых организмов нетронутыми такие Mus musculus, Caenorhabditis elegans и Drosophila melanogaster14,20,21,22.
Изучение динамики и организации белка в естественных условиях требует не только использования недавно разработанных суперразрешением изображений инструментов (таких как пальмы, буря и photoconvertible флуорофоров), но также способность преодолевать препятствия такой как доступность белка и глубина проникновения изображений лазера. Imaging внутриклеточных белков в неповрежденной животное изначально сложным, как изображений белков на структуры, встроенных глубоко в живых тканях нетронутыми животного, например гиппокампа нетронутыми мыши. Следовательно более легко отражаются белки на или вблизи поверхности ткани. Еще одна трудность с imaging в естественных условиях — в деле обеспечения воспроизводимости через животных. Как Анатомия может отличаться от одного образца на другой, выбрав структуру с легкостью репликации в различных образцах нетронутыми животных также может оказаться сложной задачей. Использование стереотипных структур, таких как синапсов, помочь в преодолении некоторых из этих трудностей.
Недавние исследования отображаемого подвижности белков в животных с оптически прозрачные эпидермис например Caenorhabditis elegans22, в то время как другие исследования образ Организации белков на поверхности ткани/органа, например Актин изображений в корковых нейронов через череп живут мыши21. В некоторых случаях обезболивающих средств были использованы для держать животное неподвижной; Однако конкретные анестетиков может отрицательно повлиять на протеина интереса. Альтернативные средства, чтобы сохранить животных неподвижной во время визуализации в естественных условиях следует изучить таким образом свести к минимуму ошибки.
Еще один нюанс суперразрешением изображений, в естественных условиях , что лазеры, используемые для освещения протеинов интереса может отрицательно сказаться на окружающие ткани, и таким образом сохраняя интенсивность возбуждения как можно ниже рекомендуется. Освещение окружающие ткани лазером также имеет тенденцию к увеличению фонового сигнала. Использование низких возбуждения интенсивности помогает снизить фон, оговоркой, что это также может привести к снижению урожайности Фотон флуоресцентный белок. Вычитание фона во время анализа могут использоваться как альтернативное средство для снижения фонового сигнала до анализа изображений.
Дрозофилы представляет идеальный организм для в vivo изображений как он обеспечивает налаженные генетических инструменты для расследования конкретных белков функции. Вверх по течению активации последовательности (УАС)-система Gal4 позволяет временных и пространственных экспрессию белков и поэтому может использоваться для манипулирования синапсах23, что термо генетические стимуляции с помощью дрозофилы переходных рецептор потенциальных суб семья А1 (dTRPA1)24 или опто генетические стимуляции с помощью смещается far красных CsChrimson25 может сочетаться с изображений14. Мы преодолеть многие из осложнений выполнения в vivo сингл молекула изображений в этой системе и теперь описать как сингл частица отслеживание может осуществляться в Drosophila melanogaster третьего возраста личинок.
Этот протокол описывает сингл молекула отслеживания mEos2-тегами белков на нейромышечную стыке дрозофилы третьего возраста личинки. Чтобы избежать гиперэкспрессия трансгенных белка, Синтаксин 1A-mEos2 выражение был обусловлен эндогенного промоутер Синтаксин 1A. Исследования мобильности синаптических белков основном были ограничены в vitro исследования культивируемых клеток и корковых нейронов9,11,12,13. Ли эти белки демонстрируют аналогичные подписи мобильности в живое животное практически неизвестны. Чтобы визуализировать сингл белка мобильности в естественных условиях, ограничения, такие как оптическая глубина проникновения, прозрачности и доступности необходимо будет преодолеть. Рассекает личиночной подготовки и визуализации нервно развязок, внедренные на поверхности мышц, мы избежать проблемы оптической прозрачности и доступности. Попытки изображения одной молекулы мобильности в обычной конфигурации TIRF оказались безуспешными. Однако использование слегка косо освещения позволяет для увеличения возбуждения лазера проникают в глубину. Кроме того minutien контакты, используемые для иммобилизации личинка помог избежать любых возможных неблагоприятных последствий проведения анестезии использования белка мобильности. Это позволяет использовать выше увеличение целей, таких как 100 x нефть погружения целей, чтобы визуализировать одной молекулы в естественных условиях. Однако увеличение масштаба может увеличить возникновение сугробы вне фокуса. Кроме того мы использовали снижение интенсивности (~ 30%) 561 Нм лазер успешно изображение одной молекулы на терминалах двигательного нерва. Использовать меньше мощности лазера, может потребоваться дополнительное тестирование.
Этот протокол является подходящей для визуализации мобильности синаптических белков в близости нейрональных плазматической мембраны. Используя этот подход, мобильность SNARE белка – Синтаксин 1A и связанные белком Atg18a autophagosome – были успешно фотосъемка в vivo14,26. Подвижности белков на мотонейрона аксоны также могут быть исследованы27. Однако исследование подвижности белков на мозг или воспалении брюшины шнур может оказаться трудно оценить из-за высокой фонового сигнала, производимые в основной ткани; Кроме того визуализации подвижности белков на той же структуры мозга потребует дневно тегов структуры мозга (для обеспечения воспроизводимости), и будет необходимо использовать двойной камеры изображения.
Текущие методы, доступные для микроскопии суперразрешением у дрозофилы в основном ограничиваются изображений эмбрионов, вместо того, чтобы более развитые третьего возраста личинок38,39. Основная проблема с этими протоколами, что они дают небольшое количество траекторий в зоне образы и таким образом предотвратить углубленный анализ мобильности государства22,40. Наши в естественных условиях одной молекулы отслеживания протокол имеет способность генерировать большое количество траектории и поэтому могут быть использованы в других животных моделей, таких как Caenorhabiditis elegans и данио рерио. Действительно каждый NMJ цепи генерируется ~ 2400 траекторий, что делает его пригодным для анализа различных мобильных состояний и переходов между этими государствами14,27. Кроме того многие в естественных условиях одной молекулы визуализации стратегии полагаются на использование анестетиков обездвижить животных20,22, который может изменять физиологические функции, под которым делается изображений. Здесь мы оптимизировали «анестезии свободный» протокол для иммобилизации личинки, с помощью minutien штыри.
Возможности использования этого протокола может быть для визуализации подвижности белков в трех измерениях. Последние достижения в микроскопии суперразрешением позволяют белка мобильности будет визуализирован в пробирке в «x», «y» и «z» размеры41,42. Наш текущий метод не учитывает подвижности белков в ось «z». Тем не менее дрозофилы двигательного нерва терминал является структурой сферической и ценный будущий подход будет для количественного определения белка мобильности в трехмерном объеме43. Изображений в измерении z является осуществимым с помощью астигматических линз. Кроме того в режиме TIRF44,45, z резолюции также увеличивается. Однако в наших экспериментах, мы использовали слегка косо освещения для визуализации одной молекулы syntaxin1A-mEos2 без астигматических линз.
В заключение, наличие обоих трансгенных дрозофилы летать запасов выражая белки отмеченных photoconvertible белок, PDMS базы вскрыть трансгенных личинок, а также TIRF микроскопа, с возможность изменения угол освещения являются наиболее важные инструменты, необходимые для визуализации одного белки, как описано в настоящем Протоколе.
The authors have nothing to disclose.
Мы благодарим Жан-Батист Sibarita и Даниэль Choquet (МИИПН, CNRS/Университет Бордо) за их поддержку с анализом одной молекулы. Мы особенно благодарим Valmas Ник и Джессика МакГоу (QBI, университет Квинсленда) за их помощь с видео записи, голос за кадром, а также рисунок графический дизайн. Эта работа была поддержана Австралийский исследовательский совет (AR) Открытие проекта (DP170100125 до Ф.А.М.), Австралийский исследовательский совет (LIEF Грант LE0882864 в Ф.А.М.), будущее стипендий (FT100100725 B.V.S.), Австралийский исследовательский совет (LIEF Грант LE130100078 к Ф.А.М.) и проект NHMRC Грант (APP1103923 B.V.S.). Ф.А.М. является NHMRC старший научный сотрудник (ONT1060075).
PDMS (Sylgard 184 silicone elastomer kit) | Dow Corning Corporation | 000000000001064291 | |
Glass-bottomed Culture Dish | In Vitro Scientific | D29-20-1.5-N | |
Optical Stereo-microscope | Olympus | SZ51 | |
Curved Tweezers (Style 5/45) | Electron Microscopy Sciences | 0208-5AC-PO | |
Minutien Pins (0.1mm) | Fine Science Tools | 26002-10 | |
Schneider's Insect Medium | Sigma, Life Sciences | S0146 | |
Vannas Spring Scissors | Fine Science Tools | 15000-00 | |
Fine Forceps (Dumont #5) | Fine Science Tools | 11254-20 | |
ELYRA PS.1 Microscope | Zeiss | PS.1 | |
Phosphate Buffered Saline (PBS) | Lonza | 17-515Q | |
Paraformaldehyde (16%) | Electron Microscopy Sciences | 15710 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T-9284 | |
Normal Goat Serum | Sigma-Aldrich | G9023 | |
Maxyclear snaplock microcentrifuge Tube (1.7 mL) | Axygen | MCT-175-C | |
Zen Black acquisition software | Carl Zeiss, 2012 | ||
Metamorph software | Molecular Devices | 7.7.8 | PALM Tracer Plugin |
Fly strain | w1118; HA-Sx1A-mEos2 |