כאן אנחנו מדגימים כיצד מולקולה בודדת לוקליזציה מופעל צילום מיקרוסקופ יכול להתבצע על הטרמינל עצבים מוטוריים של חיים דרוזופילה melanogaster השלישי instar זחל.
מספר גדל והולך של טכניקות במיקרוסקופ סופר רזולוציה מסייעים לחשוף את המנגנונים המפקחים על העולם הסלולרי ננו. מולקולה בודדת הדמיה הוא צובר תאוצה כפי שהיא מספקת גישה יוצאת דופן הפריט החזותי של מולקולות בודדות בתאים חיים. כאן, אנו מתארים את הטכניקה שפיתחנו כדי לבצע מעקב יחיד-חלקיקים לוקליזציה מופעל צילום מיקרוסקופ (sptPALM) בהזחלים דרוזופילה . סינפטית תקשורת מסתמך על חלבונים presynaptic מפתח שפועלים על ידי עגינה, הטרמה, קידום הפיוז’ן של המכילים נוירוטרנסמיטר שלפוחית עם קרום פלזמה. מגוון רחב של אינטראקציות חלבון-חלבון, חלבון-ליפיד בחוזקה מווסת תהליכים אלה ולהציג החלבונים presynaptic ולכן שינויים הניידות המשויכים כל אחד המאורעות מפתח. חוקרים כמה ניידות של חלבונים אלה להרכב שלהם תפקיד פיזיולוגי, חיה חיים שלמים חיוני להבנת מנגנון הפעולה המדויק שלהם. חילוץ חלבון ניידות עם רזולוציה גבוהה ב- vivo דורשת התגברות על מגבלות כגון שקיפות אופטית, נגישות, עומק החדירה. נתאר כמה חלבונים פלורסנט photoconvertible מתויג כדי החלבון presynaptic Syntaxin-1A ניתן דמיינו באמצעות תאורה עקיפה קלה, מעקב אחר בתחנה עצבים מוטוריים או לאורך האקסון של נוירון מוטורי השלישית של instar דרוזופילה זחל.
תקשורת עצביים מסתמך על שחרור נוירוטרנסמיטר, אשר מתרחשת באמצעות היתוך גרעיני מוסדר של המכילים נוירוטרנסמיטר הסינפטיות עם קרום פלזמה1. זה תהליך הנקרא אקסוציטוזה2,3,4,5,6 הוא דינמי מאוד והוא יכול להיות למעלה או למטה-מוסדר על פי תנודות בשיעור של גירוי7. החלבונים המעורבים בתהליכים אלה כפופים תנועה בראונית ולהציג ולכן nanoscopic הארגון לשמר מגוון של איגוד פעולות לחזק אלה פונקציות פיזיולוגיים. קרום פלזמה חלבונים הם מאוד דינמי, המאפשר רוחבי השמנה של מולקולות אל תוך nanoclusters קרום פלזמה7,8,9,10,11, 12. ככזה, חוקרים את הניידות של חלבונים אלה מסייעת להבהיר שלהם למצב של פעולה8. חלבונים סינפטיים כגון מסיסים N-ethylmaleimide פקטור רגיש מצורף חלבון הקולטנים (מלכודות), לדוגמה Syntaxin-1A, ידועים כעת שהפגינו ניידות מהירה רוחבית, כמו גם לרוחב השמנה nanoclusters שיכול לשרת כמו מולקולרית מחסני ואתרי שלפוחית פיוז’ן9,13,14,15.
ההתפתחות האחרונה של חלבונים פלורסנט photoconvertible, כגון monomeric (ז)16,Eos17 קאךה18, אפשרה את הרזולוציה nanoscopic של קרום פלזמה עצביים חלבונים באמצעות גישות כאלה לוקליזציה מופעל צילום מיקרוסקופ (דקל), שחזור אופטי סטוכסטי מיקרוסקופ (סערה)14,15,19. התפתחויות אלה אפשרו חקירות לתוך הניידות ואת nanoclustering של חלבונים ביולוגי בתרבית תאים חיים, נוירונים. לאחרונה, מחקרים בוצעו להבהיר (ברזולוציות דומה גבוהה) הדינמיקה והארגון של חלבונים אלה ממברנה בתוך הנוירונים של אורגניזמים חיים שלמים כזה . מאסכאלאס, Caenorhabditis elegans, ו- דרוזופילה melanogaster14,20,21,22.
חוקרים את הדינמיקה והארגון של יישום חלבון ויוו דורשת לא רק שימוש הכלים שפותחו לאחרונה סופר-רזולוציה הדמיה (כגון דקל, סערה, photoconvertible fluorophores), אלא גם את היכולת להתגבר על מכשולים כאלה כמו נגישות של החלבון ואת עומק החדירה של הלייזר הדמיה. הדמיה חלבונים תאיים על חיים שלמים הוא מטבעו מאתגר כמו זה הדמיה חלבונים על מבנים מוטבע עמוק בתוך רקמות החיים של החיה ללא פגע, כגון ההיפוקמפוס עכבר ללא פגע. לפיכך, חלבונים או קרוב לפני השטח של הרקמה הם צילמו בקלות רבה יותר. קושי נוסף עם דימות in vivo הוא הבטחת הפארמצבטית מעבר בעלי חיים. כפי האנטומיה עלולות להיות שונות דוגמא אחת לאחרת, בחירת מבנה בקלות של שכפול בדגימות שונות בבעלי חיים שלמים גם להוכיח מאתגר. השימוש של מבנים סטריאוטיפית, כגון synapses, לעזור עם התגברות על קשיים אלה.
מחקרים שנעשו לאחרונה יש תמונה חלבון ניידות בבעלי חיים עם האפידרמיס שקוף אופטית כגון Caenorhabditis elegans22, בזמן חקירות אחרות יש תמונה ארגון החלבונים על פני השטח של איבר/רקמות, לדוגמה הדמיה אקטין בנוירונים בקליפת המוח דרך הגולגולת של העכבר חי21. במקרים מסוימים, הרדמה שימשו כדי לשמור את החיה משותק; עם זאת, הרדמה מסוים עשוי להשפיע לרעה החלבון עניין. לפיכך לבחון אמצעים חלופיים כדי לשמור על חיות משותק במהלך דימות ויוו כדי למזער את השגיאה.
אזהרה נוספת כדי סופר-רזולוציה הדמיה ויוו היא לייזרים המשמש כדי להאיר את החלבונים עניין עלול להשפיע לרעה את הרקמה שמסביב, ולכן שמירה על עוצמת עירור נמוך ככל האפשר מומלץ. תאורה של הרקמה שמסביב על ידי הלייזר גם נוטה להגביר את האות רקע. השימוש בעוצמה נמוכה עירור מסייעת להפחית את הרקע, לפרסמה להיות זה עלול להוביל לירידה התשואה פוטון חלבון פלואורסצנטי. רקע חיסור במהלך ניתוח יכול לשמש אלטרנטיבה אומר להפחית את האות רקע לפני ניתוח תמונות.
דרוזופילה מציג אורגניזם אידיאלי ויוו הדמיה כפי שהיא מספקת כלים גנטיים ומבוססת על חקירת פונקציה של חלבונים ספציפיים. הרצף הפעלת נגד הזרם (UAS)-מערכת Gal4 מאפשרת הבעה טמפורלית המרחבי של חלבונים, ולכן ניתן לתמרן עצבית23, כך התרמו-גנטית גירוי באמצעות דרוזופילה ארעית המשפחה תת פוטנציאלי קולטן A1 (dTRPA1)24 או באופטו-גנטית גירוי באמצעות far-red-העביר CsChrimson25 יכול להיות משולב עם הדמיה14. אנו היה להתגבר על הרבה סיבוכים של ביצוע ויוו מולקולה בודדת הדמיה במערכת זו, תאר איך מעקב יחיד-חלקיק יכול להתבצע בהזחלים לחלל השלישי melanogaster דרוזופילה .
פרוטוקול זה מתאר מולקולה בודדת מעקב של חלבונים מתויג mEos2 בצומת עצב-שריר של הזחל לחלל השלישי דרוזופילה . כדי למנוע ביטוי יתר של חלבון מהונדס, ביטוי Syntaxin-1A-mEos2 היה מונע על ידי יזם Syntaxin-1A אנדוגני. מחקרים של חלבונים סינפטיים ניידות בעיקר היה מוגבל במבחנה לחקירות של תאים בתרבית, נוירונים בקליפת המוח9,11,12,13. אם חלבונים אלה שהפגינו חתימות ניידות דומה-חיים אינו ידוע בעיקר. כדי להמחיש יחיד-חלבון ניידות ויוו, מגבלות כגון שקיפות אופטית, נגישות ועומק חדירה צריך להתגבר. לנתח ההכנה זחל והצגה של צמתי neuromuscular מוטבע על פני השטח של השריר, לנו למנוע את סוגיית אופטי שקיפות ונגישות. ניסיונות התמונה ניידות יחיד-המולקולה בתצורה רגילה של TIRF עלו בתוהו. עם זאת, השימוש תאורה עקיפה מעט מאפשר לייזר עירור מוגברת חודר לעומק. יתר על כן, סיכות minutien להשתמש כדי לשתק את הזחל עזר כדי למנוע כל השפעה שלילית אפשרי השימוש הרדמה על חלבון ניידות. זה אפשרי להשתמש מטרות הגדלה גבוהה יותר, כגון ה-100 x שמן טבילה מטרות, כדי להמחיש מולקולות יחיד בתוך vivo. עם זאת, ההגדלה מוגברת עשוי להגביר את occurance של נשתל בפוקוס. בנוסף, השתמשנו בעוצמה נמוכה יותר (~ 30%) 561 ננומטר לייזר בהצלחה את התמונה מולקולות יחיד-מסופי עצבים מוטוריים. בדיקות נוספות עשויים להידרש לשימוש עוצמת הלייזר נמוך יותר.
פרוטוקול זה מתאים להמחיש את הניידות של חלבונים סינפטיים תוך הקרבה של קרום פלזמה עצביים. באמצעות גישה זו, הניידות של החלבון מוקש – Syntaxin-1A ואת autophagosome מאוגדים חלבון Atg18a – כבר בהצלחה שבעורך vivo בתוך14,26. הניידות של חלבונים על נוירון מוטורי אקסונים ניתן גם חקר27. עם זאת, חקירת הניידות של חלבונים על מוח או בחוט הגחון עצב יכול להתברר כקשה להעריך עקב האות רקע המיוצר על ידי הרקמה הבסיסית; בנוסף, להמחיש חלבון ניידות על מבנה המוח באותו ידרוש fluorescently תיוג את מבנה המוח (כדי לוודא replicability), יהיה צורך להשתמש הדמיה כפולה-מצלמה.
השיטות הקיימות זמינים עבור סופר-רזולוציה מיקרוסקופיה ב דרוזופילה מוגבלות בעיקר עוברי הדמיה, ולא יותר פיתחו השלישי לחלל זחל38,39. הבעיה העיקרית עם פרוטוקולים אלה היא כי הם תשואה מספר נמוך של מסלולים באזור עם תמונה, ומכאן למנוע ניתוח מעמיק של ניידות הברית22,40. שלנו אין ויוו מולקולה בודדת מעקב פרוטוקול יש את היכולת לייצר מספר רב של מסלולים, ולכן ניתן להשתמש במודלים של בעלי חיים אחרים כגון Caenorhabiditis elegans דג זברה. אכן, כל שרשרת NMJ שנוצר מסלולים ~ 2,400 שהופך אותו מתאים לניתוח מצבים ניידים שונים של מעברים בין מדינות אלה,14,27. בנוסף, אין ויוו מולקולה בודדת הדמיה אסטרטגיות רבות מסתמכים על השימוש בהרדמה כדי לשתק את חיות20,22, אשר עלולה לשנות את הפונקציה הפיזיולוגיות תחת אשר הסתיימה ההדמיה. כאן אנחנו אופטימיזציה פרוטוקול “ללא הרדמה” לשתק את הזחלים באמצעות סיכות minutien.
שימוש פוטנציאלי של פרוטוקול זה ייתכן המדגימה את הניידות של חלבונים בשלושה ממדים. התפתחויות אחרונות סופר-רזולוציה מיקרוסקופיה לאפשר ניידות חלבון מטמיעים במבחנה ב- ‘x’, ‘y’ ו- ‘z’ מידות41,42. השיטה הנוכחית שלנו אינו חשבון לניידות של חלבונים בציר ‘z’. עדיין העצב המוטוריים דרוזופילה מסוף הוא מבנה כדורי, בגישה בעתיד יקר יהיה לכמת חלבון ניידות ב- נפח תלת מימדי43. הדמיה ב z-המימד הוא ריאלי באמצעות עדשת אסטיגמטי. לחלופין, במצב TIRF44,45, z-הרזולוציה הוא גם גדל. עם זאת, בניסויים שלנו, השתמשנו תאורה עקיפה מעט להמחיש מולקולות יחיד של syntaxin1A-mEos2 ללא העדשה אסטיגמטי.
לסיכום, זמינות של שני הטרנסגניים דרוזופילה לטוס מלאי המבטאים חלבונים מתויג עם חלבון photoconvertible, PDMS בסיס לנתח הזחל מהונדס, וכן מיקרוסקופ TIRF מצויד עם האפשרות של שינוי זווית תאורה הם הכלים החשובים ביותר הדרוש כדי להמחיש חלבונים יחיד כפי שמתואר פרוטוקול זה.
The authors have nothing to disclose.
אנו מודים ז’אן-בפטיסט Sibarita, דניאל Choquet (IINS, CNRS/אוניברסיטת בורדו) על תמיכתם די עם הניתוח מולקולה בודדת. במיוחד תודה ניק Valmas, ג’סיקה Mcgaw (QBI, אוניברסיטת קווינסלנד) על עזרתם עם הווידאו מקליט, קריינות, כמו גם איור עיצוב גרפי. עבודה זו נתמכה על ידי הפרויקט גילוי המועצה מחקר אוסטרלי (AR) (DP170100125 ל- F.A.M.), המועצה למחקר אוסטרלי (ליף גרנט LE0882864 ל- F.A.M.), מלגת העתיד מועצת המחקר האוסטרלי (גרנט ליף (FT100100725 B.V.S.), LE130100078 כדי F.A.M.) NHMRC הפרוייקט הענק (APP1103923 כדי B.V.S.). F.A.M. הוא עמית מחקר בכיר NHMRC (ONT1060075).
PDMS (Sylgard 184 silicone elastomer kit) | Dow Corning Corporation | 000000000001064291 | |
Glass-bottomed Culture Dish | In Vitro Scientific | D29-20-1.5-N | |
Optical Stereo-microscope | Olympus | SZ51 | |
Curved Tweezers (Style 5/45) | Electron Microscopy Sciences | 0208-5AC-PO | |
Minutien Pins (0.1mm) | Fine Science Tools | 26002-10 | |
Schneider's Insect Medium | Sigma, Life Sciences | S0146 | |
Vannas Spring Scissors | Fine Science Tools | 15000-00 | |
Fine Forceps (Dumont #5) | Fine Science Tools | 11254-20 | |
ELYRA PS.1 Microscope | Zeiss | PS.1 | |
Phosphate Buffered Saline (PBS) | Lonza | 17-515Q | |
Paraformaldehyde (16%) | Electron Microscopy Sciences | 15710 | |
Triton X-100 | Sigma-Aldrich | T-9284 | |
Normal Goat Serum | Sigma-Aldrich | G9023 | |
Maxyclear snaplock microcentrifuge Tube (1.7 mL) | Axygen | MCT-175-C | |
Zen Black acquisition software | Carl Zeiss, 2012 | ||
Metamorph software | Molecular Devices | 7.7.8 | PALM Tracer Plugin |
Fly strain | w1118; HA-Sx1A-mEos2 |