ここでは、顕微鏡可視化し、細胞と組織と反応速度論、関数と内局内脱水素酵素の活動を定量化に使用できるプロトコルを提案する.
変更された細胞の代謝は、癌、心血管疾患および感染症を含む多くの病気の特徴です。細胞の代謝運動単位酵素は、彼らの活動は大きく多く、転写などのレベルがあり、mRNA の安定性、翻訳、翻訳後修飾と機能レベルで規制されています。この複雑な規制を意味する究極の活動に関する酵素の機能の不完全な情報を定量的 mRNA 実験、西部のしみ、免疫組織化学など従来の定量的またはイメージング アッセイに収量および/またはその内局。定量的酵素組織化学および組織化学 (すなわち、代謝マッピング)の in situ酵素活性とその速度論、関数とほぼ真に自然状況で内局の詳細な情報を表示します。
NAD(P)+ 、流行などの補因子を減らすために酸化還元反応を実行する酵素、脱水素酵素の活動を検出するプロトコルについて述べる。セルおよびティッシュ セクションは 1 つ脱水素酵素の酵素活性のために特定の媒体で培養しました。その後、調査の主題である脱水素酵素は細胞内サイトにその酵素活性を実行します。反応中間体の化学反応でこれは最終的に脱水素酵素の活性部位に青色の塩を生成します。塩の吸光度は、脱水素酵素の活性の直接測定ではそれゆえ、単色光顕微鏡と画像解析を用いて定量化することができます。このプロトコルの量的側面これらの試金から統計的結論をすることも可能。 にします。
観測的研究以外にもこの手法は特定の酵素の抑制研究に使用できます。この文脈では、代謝マップの真の自然の利点の恩恵を研究でその場で結果を与えて体外酵素阻害試験より生理学的に関連あります。すべてでは、代謝マップは携帯または組織レベルでの代謝の研究に不可欠な技術です。技術を採用するは簡単です、詳細な包括的かつ統合された代謝情報を提供します、迅速な定量分析が可能します。
細胞生理学の本質的な基礎代謝です。代謝すべての生理学的なプロセスに必要なエネルギーは、細胞、生体高分子の生合成のためのビルディング ブロックを提供、廃棄物、有毒物質および逆アセンブルに関する生体のホメオスタシスを調節して不要なまたは機能不全の細胞成分のリサイクル。酵素は、ほぼすべての重要な細胞の化学反応の触媒、したがって細胞生理学における運動単位は。1,2
酵素の活動が多くのレベルで堅く調整される、従って定量的酵素組織化学、細胞化学 (代謝のマッピングとも呼ばれる) は酵素の活動の場を検討する方法。転写レベルで遺伝子発現 mRNA には調整されます。マイクロ アレイや直接 RNA 配列の現場の交配 (サブ) 携帯に情報を与えるなど、質的の mRNA アッセイなどの定量的な mRNA アッセイを用いた転写制御の効果を定めることができます。mRNA の分子の局在。これにより、転写活性の細胞間の相対的な違いを理解することが可能。解釈および代謝活性に関してこれらの mRNA の試金の妥当性は、複雑な規制がまた配列と mRNA の分子の安定性が DNA から転写された後を編集、mRNA レベルで発生するため。この編集は、タンパク質アイソ フォームの翻訳とリボゾーム、蛋白質の翻訳量を調節します。さらに、タンパク質翻訳のプロセスは制御され、最終的には酵素の発現とそのための活動に影響を与えます。西部にしみが付くことや逆相蛋白ライセート マイクロ アレイ、または質的なタンパク質発現アッセイなど、量的蛋白質式の試金を使用して前述の規制の手順の組み合わせの効果を理解できます。これらの技術、免疫組織染色、免疫細胞化学は、タンパク質の翻訳後修飾とその混雑した微小環境における酵素機能の調節など下流の規制の効果を組み込むに失敗します。さらに、酵素の発現細胞や組織ホモジネートまたは希薄水溶液の精製酵素の活性測定は広く使用される酵素活性の研究、その活動と関連付ける悪いことがあります。しかし、これらの実験は酵素の活性に及ぼす混雑させた区分細胞質やオルガネラを複製に失敗します。さらに、すべての前述の各手法数量または mRNA または酵素発現の局在を決定するが、この統合ではおろか、酵素の発現のこれらの側面の両方の包括的な情報を与えることができません。酵素活性測定と情報。2,3,4
代謝のマッピングでは、酵素の活動を決定する前述の変数のすべての感謝をことができます。さらに、代謝のマッピングは、生きている細胞や組織イメージング細胞や酵素の活動のデータを生成するほぼ真に自然状況を生成する分析中にそのまま保たれる組織の形です。それは酵素の活動の場所として細胞や組織のコンパートメント内の酵素活性の堅牢な定量化の両方詳細な感謝を容易にする画像を生成します。3,4ここに記載した脱水素酵素の活動の代謝マッピング プロトコルは、原則定量的酵素組織化学、6の上に5のすべての利用可能な酵素組織化学的方法の実験室マニュアルに基づいています。定量的代謝マップの画像解析。4
脱水素酵素は、それぞれ NADH、NADPH および FADH2、+NAD, NADP+と流行など正規の補因子を減らすために酸化還元反応を行う酵素です。その他の試薬・基板・特定脱水素酵素およびテトラゾリウム塩の補因子が含まれ、反応媒体のままなセルまたは化学的に固定されていないクライオスタット切片に孵化します。その後、その脱水素酵素はその触媒活性を行い、削減、たとえば、NADP+を NADPH へ。電子キャリアを介して 2 NADPH 分子は最終的に、脱水素酵素のサイトですぐに沈殿物 1 水不溶性の青い塩の分子に 1 半無色の水溶性テトラゾリウム塩の分子を減らします。したがって、沈殿した塩の吸光度は脱水素酵素の地域活動の直接測定は、光学顕微鏡を使用して観察することができます、または単色光顕微鏡と画像解析を用いて定量化します。このプロトコルの量的側面これらの試金から統計的結論をすることも可能。 にします。さらに、この数量は、酵素の速度論的パラメーター最大酵素活性 (Vmax) (Km) 酵素に対する基質の親和性などその場での決定を促進します。3,4,5,6
それは実験、あたりは、孵卵中における一貫性を得るために時間の遅れを最小限に抑えるため 50 ガラス スライドへの付着細胞製剤またはティッシュ セクションの最大を推奨を実現するために重要な代謝のマッピングの実験を計画するとき結果。プロトコル手順は、1 つ以上の実験者によって協力して実行されるとき以上のスライドや培地成分を処理することが可能です。さらに、いくつかの変動は実験の間に存在します。したがって、同一の実験は、各セルの準備から cytospins または各組織サンプルからのセクションで、少なくとも 3 回繰り返す必要があります、適切なコントロールは、各試験に含まれるべき。常に非特異的酵素活性染色を制御する因子存在下で基板の不在で制御培養液を準備します。最も代表的な結果を取得する実験で異なる基板/因子濃度が同じサンプルからティッシュ セクションまたは細胞製剤に適用される実験者による酵素反応速度論解析を実行できるように、線量活動曲線。
細胞の代謝に関する研究は、代謝効果は病態と治療の多くの病気のための重要な研究を実現するために現在、ルネッサンスの経験をしています。1また、代謝研究は、質量分析法、アイソトープ標識核磁気共鳴分光法など、これまでより多くのツールと研究のこの分野を提供する技術の増加空室状況によって支援されています。代謝マップは新しい技術ではありませんが、ほぼ真に自然状況で酵素の活動の統合情報を与えるには、その能力は、この手法がこれまで以上に関連します。2
補因子 NAD+と NADP+脱水素酵素が進化の過程で非常に早く起こったことを示しますすべての生きている細胞であり、細胞の代謝に重要な役割があります。14,15現在、523 酵素触媒反応脱水素酵素として分類され、すべての種の間で発生することがあります。16 、理論的にすべて異なる脱水素酵素反応の活性調べることができます個別にここで説明した代謝マッピング ・ プロトコルをつまむことによって。すべての酵素の反応は、基板とその活動に必要な補助因子による一意です。したがって、各酵素反応の活性は、適切な基質と反応中に補因子代謝マッピング実験を使用して決定できます。しかし、いくつかの酵素のアイソ フォームの細胞内局在で異なる、別アイソ フォームは、ミトコンドリアの機能に対し例えば1 つアイソ フォームは細胞質に反応を触媒します。顕著な例は IDH1 と IDH2、前者は細胞質、後者はミトコンドリアと 2 つの異なる遺伝子によって符号化される 2 つの異なる蛋白質であります。11 1-メトキシ-5-methylphenazinium methylsulfate (メトキシ PMS) と 5 methylphenazinium methylsulfate (PMS) 両方使用できます電子キャリアとしてこれらの実験。前者後者はミトコンドリア膜を通過しません。したがって、ミトコンドリア酵素 (例えばIDH2) の調査は、Mpm を使用してください (例: IDH1) ゾル性細胞質の酵素に関する研究に対し、PMS を使用ください。
PMS の追加を除く多くのテクニック、テトラゾリウム塩の種類を使用するなど、このプロトコルの変化と同様、アジ化ナトリウム、水土台媒体を使用して様々 なインキュベーションと洗浄時間、存在して同様に動作可能性があります。テトラゾリウム塩と代謝のマッピングのアプリケーションは、脱水素酵素に制限はありません。プロトコルに小さな変更を加えるとに、直接機能酵素の活動の評価のため使用することができますも脱水素酵素で代謝経路の上流。グルタミナーゼ酵素、機能を直接17の民本主義前述したグルタミン酸脱水素酵素 glutaminolysis 経路の上流。18理論的には、同じ原理は関数を直接下流または上流、脱水素酵素例えばアコニターゼ、トリカルボン酸 (TCA) の IDH2 と IDH3 の直接上流にあるサイクルその他の酵素に適用できます。表 1 に示す濃度の別の簡単なバリエーションによるインキュベーション中バイアルを各種濃度の阻害剤や補因子基板を作るです。これは、抑制や補因子基板濃度の関数として線量活動曲線の生成可能です。
技術的に言えば、代謝のマッピング実験研究者が基板と因子レベルを反映していないと補助因子基板濃度を選ばなければならないので酵素活性の in situの公平な観察を促進しません。その場でプレゼントされます。さらに、粘性の 18% 反応媒体で PVA の場所および構造の高分子をそのままに保つのに役立つが、反応媒体を介して低分子化試薬の有効拡散を禁止を使用します。3,5したがって、生理学的基質濃度を使用するここで説明実験断固としたな酵素活性は反映していない特定基質濃度で体内の状況が適して内の実験的比較。したがって、代謝マッピング実験の結果は、現在原は、基質、補酵素レベルのコンテキストにおける酵素反応の生産能力 (最大活動) です。また、基板や補因子の濃度とマルチ サンプルを使用 (Vmax) の最大生産能力及び基板/補酵素の酵素の (Km) 親和性公平な比較セル準備、組織や組織の地域。これらのパラメーターは、酵素タンパク質の発現、翻訳後修飾酵素の活性に及ぼす混雑した微小環境の合計の結果です。したがって、代謝のマッピングはまだ蛋白質の表現を決定するまたは精製酵素活性の in vitroの実験よりも酵素活性の優れた反射です。
The authors have nothing to disclose.
R.J.M. は、AMC 博士課程奨学金によってサポートされます。この研究はオランダ癌協会 (KWF グラント UVA 2014-6839) によって支えられました。著者は博士 A. ジョンカーのプロトコルの執筆の彼の助けをありがちましょう。
Adenosine 5′-diphosphate sodium salt | Sigma-Aldrich | A2754 | |
D-Glucose 6-phosphate sodium salt | Sigma-Aldrich | G7879 | |
Disodium hydrogen phosphate (NA2HPO4) | Merck Millipore | 106559 | |
di-Sodium succinate | Sigma-Aldrich | W327700 | |
DL-Isocitric acid trisodium salt hydrate | Sigma-Aldrich | I1252 | |
D-Malic acid | Sigma-Aldrich | 2300 | |
Glycerol Gelatin | Sigma-Aldrich | GG1 | |
L-Glutamic acid | Sigma-Aldrich | G1251 | |
Lithium 6-phospho-D-galactonate | Sigma-Aldrich | 55962 | |
Magnesium chloride | Sigma-Aldrich | M8266 | |
methoxy-Phenazine methosulfate | Serva | 28966.01 | |
Nicotinamide adenine dinucleotide | Sigma-Aldrich | N0505 | |
Nicotinamide adenine dinucleotide phosphate | Sigma-Aldrich | NADP-RO | |
Nitrotetrazolium Blue chloride | Sigma-Aldrich | N6876 | |
Phenazine methosulfate | Serva | 32030.01 | |
Polyvinyl alcohol, fully hydrolyzed | Sigma-Aldrich | P1763 | |
Potassium dihydrogen phosphate (KH2PO4) | Merck Millipore | 104873 | |
Sodium azide | Sigma-Aldrich | S2002 | |
Sodium L-lactate | Sigma-Aldrich | L7022 | |
Bandpass filter | Edmund optics | https://www.edmundoptics.de/optics/optical-filters/bandpass-filters/Hard-Coated-OD-4-10nm-Bandpass-Filters/ | |
Grey-step wedge | Stouffer Industries | http://www.stouffer.net/TransPage.htm |