Sinirsel nüfus tarafından hızlandırılmış video mikroskobu esaslı bilgisayar yazılımı Post-processing takip izlemek için sağlam bir protokol açıklanmıştır. Bu yöntem canlı görüntüleme deneyler sırasında seçili bir popülasyondaki biyolojik olayları tanımlamak için güçlü bir araç temsil eder.
Sinir hücre popülasyonlarının, nükleer silahların yayılmasına karşı farklılaşma veya hücre kader kararlar, gibi önemli biyolojik olaylar kontrol mekanizmaları anlama sinir sistemini etkileyen birçok hastalık için tedavi edici tasarım stratejileri için çok önemli olacak. Hareketsiz görüntüler onların son sonuçlar hücre popülasyonlarının izlemek için geçerli yöntemleri itimat ve genellikle tek kişilik hücrelerde davranış özellikleri tanımlamak için yeterli zamansal çözünürlük sağlamak başarısız. Ayrıca, hücre ölümü değişimler, bir hücre nüfus, seyreltme, yayma veya hücreleri çözümlemek için kullanılan veri işaretleyicilerini düşük verimlilik içinde davranış heterojenite sonuçları eksik veya yanlış okuma için götürecek tüm önemli handikapları bulunmaktadır. Bunun tersi olarak, bu olayların her biri izlemek için güçlü bir araç performans canlı görüntüleme ve uygun koşullar altında izleme tek hücre temsil eder. Burada, post-processing tarafından takip time-lapse video mikroskobu iletişim kuralı, belirli yazılım istihdam sinirsel nüfus tek hücre çözünürlükte izlemek için kullanılmıştır. Açıklanan yöntemlerden farklı sinirsel nüfus hücre biyolojisi ve soyu ilerleme ile ilgili temel soru çözmek araştırmacılar etkinleştirin.
Sinirsel nüfus yeniden oluşturmak için yeni ve daha etkili tedavi stratejileri geliştirmek için öncelikle rejeneratif sinirsel potansiyele sahip hücreleri korumak temel mekanizmaları anlamak gerekir. Bu hedefin peşinde sendika, nükleer silahların yayılmasına karşı/farklılaşma, modu ve bölünme, hücre döngüsünün uzunluğu, göçmen kapasiteleri, canlılığızamanlaması dengesini düzenleyen faktörler kapsamlı bir bilgi gerektirir. Birçok yıl1için istihdam bir teknik yaklaşım olmasına rağmen canlı görüntüleme ve doğrudan gözlem hala yukarıda listelenen olayları izlemek için en iyi seçenek kalır. Son nokta çıktıları üzerinde merkezli birçok diğer yaklaşımların aksine görüntüleme yaşamak ve tek hücre izleme bilgilerini bir deney2,3,4,5, uzunluğu boyunca sağlar 6. böylece, zamansal çözünürlük eklenmesini sağlar hücre ölümü, türdeş olmayan hücre davranış veya hücre kader kararlar, aksi takdirde geçmek olabilir tespit edilmesi gibi pek çok diğer kritik olayları fark edilmeden. İdeal olarak, bu özellikler hücrelerinin en iyi tek hücre düzeyi içinde vivo takip edilmelidir nerede her iki iç (hücre özerk) ve dışsal (hücre niş) ipuçlarını dikkate alınır.
Vitro durum olaylar doğal çevre çoğaltmak değil bir ortamda gerçekleşen, ancak, genellikle bu protokollerin kullanılacağını düşük yoğunluklu kültür koşulları içsel özelliklerini ortaya çıkarmak daha uygun olmakla birlikte, hücreleri. Ayrıca, sadece büyüme orta değiştirerek çevreleyen ortamın, daha basit bir kontrol olabilir çevresel faktörler yanı sıra her sinir niş tanımlar extrinsic faktör bireysel rolünü araştırmak için değerli bir araç teşkil edebilir patolojik senaryoları7,8,9,10,11,12,13‘ te bağlı olmak. Bu nedenle, ne zaman doğru yapılandırılmış, burada, önerilen Protokolü olduğu gibi canlı görüntüleme daha önce numaralandırılan sorulara yönelik olarak uygun vitro çözümü sağlar.
Kısacası, bu protokol donanım, yazılım, kültür koşulları ve izleme tek hücreli tarafından izleyen bir canlı görüntüleme deneyi başarıyla gerçekleştirmek için gereken temel adımları açıklar. Bu yaklaşımın temel yönleri Biyoloji ve soy progresyon birden çok sinir örneğin alınma olasılığını ortaya çıkarmak için yardımcı olur değerli bilgiler sunar.
Canlı görüntüleme en önemli değerlerden biri doğru soy izleme, sinirsel bir nüfus lineage ilerlemesinde önemli yönlerini elucidating gerçekleştirmek için olasılık var. Soy izleme tanımlayıcısı olarak tanımlanır ve tek bir Dede, tüm döl izleme için sonraki clone klon kurucusu21oluşmuştur. Dikkat çekici, alternatif yöntemler (örneğin, viral iletim veya çok renkli muhabir yapıları21) izleme lineage için istihdam sayede nihai sonucu resimler üzerinde temel alır ve ille öyle kritik bir dezavantajı var tüm sıra oluşturmaktadır. Bu o hücre ölümü, heterojenlik hücre nüfus, seyreltme, yayılan veya zavallı verimliliği ile birlikte diğer önemli handikapları işaretlerinin davranış anlamına gelir, sonuçlar2eksik veya yanlış okuma için neden. Ayrıca, canlı görüntüleme modu ve hücre bölünmesi, hücre büyümesi, göç, nükleer silahların yayılmasına karşı farklılaşma, hücre döngüsü süresi, neurite karşı zamanlaması gibi sinirsel nüfusun biyolojinin önemli özellikleri analiz etmek araştırmacı sağlar kader seçimi (başkalaşım) veya dönüşüm (yeniden programlama) hücre oluşumu, karmaşıklık ve uzunluğu.
Ayrıca, canlı görüntüleme kolayca tek hücreleri gibi örneğin, veri almak için amaçlanan diğer analizi ile tamamlanmaktadır RNA sıralama. Ancak, canlı görüntüleme ve diğer teknikleri kombine fayda elde etmek için daha önce filmlerde izlenen bu hücreleri daha sonra yeniden tanımlanır ve ayrı ayrı ikincil analizi için toplanan gerektirir. Bu konum koordinatları, belirli hücreleri floresan muhabirleri uygulayarak veya grup hücreleriyle dağıtım başvuruları olarak analiz dahil mikroskoplar kullanarak elde edilebilir. Gerçekten de, transcriptome profil kombinasyonu ve tek tek hücreler davranışını yeni moleküler cues hücreleri Biyolojide yer aydınlatmak için güçlü bir yol gösterebilir.
Bir yetersiz hücre kültür yoğunluğu bir canlı görüntüleme deneyi olumsuz etkileyebilir ana sorunlardan biri. Daha önce belirtildiği gibi yüksek yoğunluklu kalite ve Uzaysal çözünürlük görüntülerin izleme tek hücre yapamayız enkaz veya zavallı ayrılma (yığın oluşumu) fazlalığı etkileyebilir. Bu nedenle, farklı hücre popülasyonlarının altında eğitim şartları hücre olası en düşük sayısı hücre kültürü canlılığı ödün vermeden ayarlanmalıdır.
Resim alma sıklığı da çok önemlidir ve özellikle floresan aydınlatma kullanıldığında dikkatle, ayarlanmalıdır. Aşırı maruz kalma aktarılan ve özellikle Floresan ışık hücre canlılığı tehlikeye atabilir. Alternatif olarak, görüntüleri yakalanması arasında aşırı bir gecikme analizi zamansal çözünürlük ile girişime neden olabilir.
Canlı görüntüleme deney sırasında diğer kritik adım odaklanarak periyodik düzeltmesinden olduğunu. Başarısızlık doğru ayarı/yeniden-setting odak mesafe tek hücre izleme engelleyebilir. Ayrıca, kuluçka odası yeterli sıcaklık, nem ve CO2 düzeyleri, hücre ölümüne neden olabilir istenmeyen varyasyonları değişiklik yapılmasına dair korur dikkatle kontrol etmek gereklidir.
Son olarak, PICC gerçekleştirildikten sonra düzgün resim alma son turun xyz sıfır pozisyonundan almak önemlidir. Yanlış xyz sıfır konumunu yeniden ayarlamak zor hücre döl tanımlaması engelleyen faz kontrast ve ayirt görüntüleri maç yapacak.
Bu yaklaşım birçok olumlu yönü olmasına rağmen canlı görüntüleme için bazı sınırlamalar sinirsel örneğin alınma olasılığını, devam. Örneğin, aNSCs başarılı tek hücre izleme gerçekleştirmek için gereken en düşük hücre yoğunluğu Western Blot14gibi biyokimyasal deneyleri istihdam olanaksız kılıyor. Ayrıca, hızlı nüfus bölen izleme gibi serebellar astrocytes ya da N2a hücreleri sınırlıdır geçici olarak sık sık hücre kültürleri izdiham yakınındaki olarak izlemek çok zor. Ayrıca, birçok kültür yöntemleri, hem de doğal biyolojik kısıtlamalar hücreleri, yalıtım ile ilişkili kez hücre canlılığı uzun sürelerle, canlı görüntüleme deneyler süresini sınırlamak ödün. Son olarak, doğal ortamda hücreleri izole hem olumlu hem de olumsuz etkileri vardır. Fizyolojik onların niş izole hücreler davranış biçimleri, modüle önemli sinyaller almak başarısız olabilir aynı zamanda, bu sinyalleri etkisini ayrı ayrı özel sinirsel lineage ilerlemesini test etmek için güçlü bir araç temsil eder nüfus.
Yukarıda açıklanan kısıtlamalar göz önüne alındığında, bu mükemmel metodolojik senaryo canlı görüntüleme, tek hücre izleme deneyleri normal fizyolojik koşullar içinde vivoaltında gerçekleştirmek olacaktır açıktır. Ancak, güncel teknikler tek hücreleri uzun bir süre için beyin2derin bölgelerinde takip edemiyoruz. Bu nedenle, canlı görüntüleme geleceği tam olarak tek hücreleri içinde vivo hücre biyolojisi fizyolojik çevre3girişim mümkün olan en küçük ile analiz amaçlayan bu sınırlama üstesinden üzerinde odaklanmalıdır.
The authors have nothing to disclose.
Beatriz Gaskon şekil 1‘ deki yardım ve sanat eserleri için teşekkür ediyoruz. Ayrıca Dr. C. Norris onun yardım için teşekkür ediyoruz. Burada sunulan iş araştırma hibe, “kırmızı de excelencia Consolider-INGENIO İspanyolca iyon kanal girişimi” tarafından desteklenmiştir (BFU2015-70067REDC), MEC (BFU2014-53654-P), BRADE-CM (S2013/buz-2958), UCM-Santander (PR26/16-18B-3) ve Fundación Ramon Areces hibe programı (PR2018/16-02). Felipe Ortega eder Ramon y Cajal Program İspanyolca Ekonomi Bakanlığı ve rekabet (MEC: RYC-2013-13290).
Poly-D-lysine | Sigma | P0899 | Working solution 0.02 mg mL-1 |
24 wells plate | Falcon | 352047 | |
Dulbecco’s modified Eagle’s medium (DMEM): F12 Nutrient Mixture medium (-L Glutamine) | Invitrogen | 21331-020 | |
DMEM High Glucose medium | Sigma | D6546 | |
Bovine Serum Albumin | Sigma | A6003 | |
Triton X-100 | Merck | 11869 | non-ionic surfactant |
Mouse anti-β III Tubulin | Sigma | T8660 | |
Rabbit anti-GFAP | DakoCytomation | Z0334 | |
Mouse anti-α Tubulin | Sigma | T5168 | |
Anti-Mouse FITC | Jackson Laboratories | 715-095-150 | |
Anti-Rabbit Cy3 | Jackson Laboratories | 711-165-152 | |
Brightfield/Phase contrast/fluoresence microscope | Nikon | TE-2000-E | |
CFI PLAN FLUOR DLLL 10X objetives | Nikon | Ref 280MRH10101 | |
CFI SUPER PLAN FLUOR ELWD AMD 20X objetives | Nikon | Ref 280MRH48230 | |
pE-300 LED fluorescence | Cool LED | Ref Number 1981 | |
310M-201 Incubation system (temperature) | OKO-Lab | Serial Nº VOF007307 | |
Pro-ScanII Motorized stage system | Prior | Serial Nº 60018 | |
High precision microscope camera version 4.2 | ANDOR Zyla | VSC-03650 | |
Specifc software for live imaging with timelapse module: NIS-Elements AR4.5 | Nikon | NIS-Elements AR4.5 -Hasp ID: 13CE819E | |
OKO touch Incubation system (CO2) | OKO-lab | Serial number 1716 | |
Murine Neuro-2a Neuroblastoma Cell line | ATCC | ATCCCCL131 | |
HEPES buffer solution 1 M | Invitrogen | 15630-056 |