代謝産物分析のためのタンデム液体クロマトグラフィー - 質量分析に基づくアプローチ<em>黄色ブドウ球菌</em

細菌性病原体は、ホスト環境内の多くの課題に取り組まなければなりません。免疫細胞による直接攻撃に加えて、ホストはまた、栄養免疫^1、2を生成^し 、細菌の生存および複製に必須の栄養素を隔離します。これらの厳しい環境を生き残るためには、細菌性病原体は、病原性因子を展開します。これらの要因のいくつかは、細菌が免疫応答を回避することができます。他の要因は、組織由来成分^3、4、5を消費して不足している栄養素を補充するために、細菌を可能にすることができるようなヒアルロニダーゼ、thermonuclease、およびリパーゼなどの消化酵素を分泌が挙げられます。実際、細菌が毒性^、6因子⁷の産生に対する細胞の生理学的状態を結ぶ調節系を進化させてきました^、 <sクラス= "外部参照"> ^8、9、10アップ。

証拠の成長体は、代謝および毒性を結ぶ重要な調節因子としてのコーディを指します。第ジペプチドパーミアーゼ（DPP）遺伝子¹¹のリプレッサーとして枯草菌で発見が、コーディは、現在、ほぼ全ての低G + Cグラム陽性細菌^12,13によって産生されることが知られており、炭素に関与する遺伝子の多数を調節して窒素代謝^{14、15、16、17、18、19。}病原性の種では、コーディも最も重要な病原性遺伝子の一部^20、21の発現を制御し^、EF "> ^{22、23、24、25、26、27}コーディは二つの配位子のクラスによってDNA結合タンパク質として活性化される：分岐鎖アミノ酸（BCAA、イソロイシン、ロイシン、およびバリン[ILV]）及びGTP。これらの栄養素が豊富である場合、コーディは抑制する（またはいくつかの場合において、刺激）転写を。これらの栄養素は限らなるように、コーディ活性は徐々に中央代謝に接続された様々な代謝経路を介してその再ルーティング前駆段階的転写応答をもたらす、低減されます^{28、29、30。}
質量分析（LC-MS）に連結されたタンデム液体クロマトグラフィーを正確に小分子の細胞内代謝物^31を同定および定量することができる強力な技術です。相互コンダクタンスとペアになったときriptome分析（ 例えば、RNA-配列）、この解析ワークフローは、環境または栄養ストレスに応答して起こる生理的変化への洞察を提供することができます。ここでは、LC-MSを介した黄色ブドウ球菌細胞とその後の分析からの代謝産物の抽出のための方法を提示します。このアプローチは、 黄色ブドウ球菌の生理学上のコーディの多面的な効果を発揮するために使用されています。