A detailed protocol describing the SSTD NMR method is presented here to help new users apply this new method to obtain the kinetic parameters of their own systems undergoing chemical exchange.
Este protocolo detalhado descreve a nova transferência de spin Saturação Diferença Nuclear Magnetic Resonance protocolo (SSTD RMN), recentemente desenvolvido no nosso grupo para estudar processos de mútuo local de permuta química que são difíceis de analisar por métodos tradicionais. Tal como o nome sugere, este método combina o método da rotação Saturação de transferência utilizadas para as moléculas pequenas, com a transferência de saturação Diferença método (DST) RMN empregue para o estudo de interacções proteína-ligando, medindo a transferência de saturação rotação transiente juntamente aumentando os tempos de saturação (compilação curvas -up) em pequenas moléculas orgânicas e organometálicas submetidos a permuta química.
As vantagens deste método em relação às existentes são: não há necessidade de se chegar a coalescência dos sinais de troca; o método pode ser aplicado enquanto um sinal dos locais de troca é isolado; não há necessidade de medir a T 1 ou atingir a saturação em estado estacionário; va constante de velocidadelores são medidos directamente, e os valores de t 1 são obtidos na mesma experiência, utilizando apenas um conjunto de experiências.
Para testar o método, estudamos a dinâmica da rotação impedida de -dimethylamides N, N, para a qual está disponível a quantidade de dados para comparação. Os parâmetros termodinâmicos obtidos utilizando SSTD são muito semelhantes aos reportados (técnicas de transferência de spin-de saturação e de análise de linha-forma). O método pode ser aplicado a substratos mais difíceis que não podem ser estudadas através de métodos anteriores.
Prevemos que o experimental simples configurar e a ampla aplicabilidade do método para uma grande variedade de substratos vai fazer isso uma técnica comum entre os químicos orgânicos e organometálicos sem extensa experiência em RMN.
permuta química geralmente refere-se a qualquer processo intermolecular ou intramolecular, em que um núcleo se move a partir de um ambiente para outro, em que os seus parâmetros de RMN (de desvio quimico, acoplamento escalar, acoplamento dipolar, taxa de relaxação) diferem. Existem numerosos exemplos de permuta química de moléculas orgânicas e organometálicas (por exemplo, barreiras rotativas, biarilos em barreiras lançando anel e equilíbrio conformacional, inversão de azoto, a ligação do ligando, de permuta de ligandos degenerada e tautomerização). 03/01 A taxa de troca química está relacionada com a termodinâmica da barreira do processo de troca e, portanto, seu estudo é de importância crucial para entender a dinâmica molecular desses sistemas.
O sinal clássico de troca dinâmica em NMR é uma mudança dramática na linha-forma dos sinais de RMN como as mudanças de temperatura. A baixas temperaturas, o processo é lento e dois desvios químicos são distintos observed. A altas temperaturas, os dois sinais de fundir-se um sinal, que é conhecido como "coalescência". A temperaturas intermédias, os sinais de tornar-se muito amplo. Esta sensibilidade do espectro de RMN de permuta química torna RMN um método muito eficiente para estudar a dinâmica de moléculas em solução. Dois métodos têm sido utilizados principalmente no estudo de processos dinâmicos em solução:. Análise linha forma, 4-7 e saturação de spin experiências de transferência 8-9 Além disso, também vale a pena mencionar o método 10 eo CIFIT programa de transferência de inversão 11 para a extração direta de constantes de velocidade, que são uma abordagem relativamente eficiente para medições de câmbio em sistemas simples. Embora estes métodos dão muito bons resultados na maioria dos casos, que, no entanto, têm uma série de inconvenientes. A principal desvantagem da análise line-forma é as altas temperaturas necessárias para atingir a coalescência em algumas amostras. 12 As principais questões a considerar quando se carrying a rotação experiências de transferência de saturação são: os longos tempos de saturação necessários para atingir a constante de transferência de saturação de estado entre os locais de troca, e a necessidade de determinar a longitudinal tempo de relaxamento constante, t 1, o qual pode ser difícil, se não existe sobreposição dos diferentes sinais na região de estudo 13.
Como parte das nossas investigações nos mecanismos organometálicos, 14-16 nosso grupo está a estudar o comportamento fluxional de complexos de platina-Allène em solução. Esta é uma tarefa complexa que envolve, pelo menos, três processos diferentes, sendo um deles a troca π-face ou rotação do metal em torno de um eixo das aleno. Encontramos que as experiências de VT e técnicas de análise de linha-forma que têm sido empregadas antes em sistemas similares normal, 17-19 não eram adequadas em nosso estudo, devido a uma rotação muito lenta no nosso complexo de platina-allene que fez a temperatura de coalescência do signais de juro superior à temperatura de decomposição do complexo.
A fim de superar esta limitação, desenvolvemos e informou recentemente um novo protocolo NMR (SSTD RMN) para estudar processos de mútua local de permuta química. 20 Como o nome sugere este método combina o método de rotação Saturação Transferência usado para pequenas moléculas, com a transferência de saturação Diferença método NMR empregada para o estudo das interações proteína-ligante, 21-24 medindo transitória rotação de transferência de saturação ao longo aumentando os tempos de saturação (build-up curvas) em pequenas moléculas submetidas a permuta química.
Com este novo método (SSTD RMN) que têm mostrado que se pode obter os parâmetros cinéticos de permuta química intramolecular em pequenas moléculas orgânicas e organometálicas com algumas vantagens adicionais em relação às abordagens tradicionais: não é necessária a coalescência dos sinais, de modo que uma gama de temperatura mais flexível pode ser usadono estudo; sinal de sobreposição não interfere, embora pelo menos uma das ressonâncias troca deve ser isolado; não há necessidade de medir a T 1 ou atingir a saturação em estado estacionário; os valores das constantes de velocidade são medidos directamente e os valores de t 1 são obtidos na mesma experiência, utilizando apenas um conjunto de experiências. Outra vantagem notável da metodologia SSTD RMN é que, em contraste com LineShape análise, a determinação das constantes de velocidade cinética não é limitado pelo aumento da temperatura de coalescência associados com elevados campos magnéticos. Assim, nossa metodologia é, então, muito bem apropriado para ambos os campos magnéticos de baixa e alta. Este artigo destina-se a ajudar os novos usuários aplicar este novo método para seus próprios sistemas passando por permuta química, e descreve a preparação da amostra, arranjo experimental, aquisição de dados, e um exemplo de processamento e análise de dados em uma molécula orgânica simples.
One of the more obvious advantages of this methodology is that the rate constants and the relaxation time for a given temperature can be obtained with a single set of experiments, with a robust pulse sequence (the same used for STD experiments to study protein-ligand interactions, which is typically found within the available set of experiments from the spectrometer manufacturer). This simplifies the experimental setup since there is no need to measure T1 or reach steady state saturation. Besides, it is remarkable that this method does not depend on the magnet strength, as coalescence methods. On the other hand, the main limitation is that this technique cannot be applied to chemical exchange processes too fast or too slow, which would depend on the temperature range of the NMR machine or the solvents used.
This new technique for the calculation of kinetic parameters can be applied to a great variety of substrates and its applicability has already been demonstrated with some interesting molecules.21 The kinetic parameters of the 4-N,N-dimethylamido[2.2]paracyclophane, a challenging substrate in which the signal of one of the methyl groups of interest is overlapped with other signals from the molecule, were successfully calculated using SSTD NMR. Interestingly, this methodology can be applied as long as one of the signals of study is isolated. SSTD NMR is also a useful protocol for the calculation of kinetic parameters in molecules in which the coalescence temperature is so high that the molecule decomposes before reaching it. This is the case with PtCl2(dimethylallene)(pyridine), in which the methodology was successfully applied without the need of reaching coalescence. The choice of solvents and temperatures is critical to obtain good results, since the chemical exchange rates can vary significantly with these parameters. Moreover, in addition to the criteria in a normal NMR experiment, key steps in a SSTD NMR experiment are the selectivity of the irradiation as well as the temperature control. Both factors have to be precise to guarantee the success of the experiment.
The representative results presented here are for the kinetics of intramolecular chemical exchange, but the technique can also be applied to study the kinetics of intermolecular chemical exchange and also ligand exchange, common processes in the dynamic behavior of transition metal complexes.
Finally, providing a proper modification of the equations is made,32 this method could be extended to deal with multi-site exchange and unequal populations, as it has been done in former double resonance experiments,8-9 increasing the usefulness of this technique for the study of chemical exchange processes in challenging compounds.
The authors have nothing to disclose.
Funding by the University of East Anglia, the EPSRC (EP/L012855/1) and the EU (H2020-MSCA-IF-2014-EF-ST-658172) is gratefully acknowledged (MTQ).
N,N-dimethylacetamide | Aldrich | 38840 | Acute toxicity |
Toluene-d8 | Fluorochem | D-005 | Flammable and toxic |
500MHz 7" Select Series NMR Tubes | GPE LTD | S-5-500-7 | |
TopSpin 2.1 | TopSpin program, Bruker Corp., http://www.bruker.com/products/mr/nmr/nmr-software/software/topspin/ (2015). | ||
Origin 6.0 | Origin 6.0 software, OriginLab Corp., http://originlab.com. | ||
Bruker Avance III 500 MHz fitted with 5mm broadband observed BBFOplus Z-gradient SmartProbeTM probe | Bruker Corp., http://www.bruker.com | ||
Bruker Avance I 500 MHz Inverse Triple Resonance NMR spectrometer fitted with a 5mm TXI Z-gradient probe | Bruker Corp., http://www.bruker.com | ||
Ceramic Spinner standardbore shimsystems (5 mm) | Bruker Corp., http://www.bruker.com | H00804 |