The zebrafish is an excellent model system for genetic and developmental studies. Bead implantation is a valuable tissue manipulation technique that can be used to interrogate developmental mechanisms by introducing alterations in local cellular environments. This protocol describes how to perform microbead implantation in the zebrafish embryo.
Zebra balığı gelişimsel biyoloji ve hastalığın çalışma için değerli bir genetik model sistem olarak ortaya çıkmıştır. Balığı insanlar dahil olmak üzere, diğer omurgalıların, hücresel, moleküler, fizyolojik süreçlerde yüksek genomik koruma derecesinin yanı sıra, benzerlikleri vardır. Erken ontogeny sırasında, Zebra balığı embriyolar araştırmacılar, basit bir stereomikroskop kullanılarak organogenez dinamiklerini görselleştirmek için izin optik şeffaftır. Microbead implantasyonu, yerel ortamlarında faktörlerin değiştirilmesi yoluyla doku manipülasyonu sağlayan bir yöntemdir. Bu araştırmacılar, gelişmekte olan embriyonun içindeki spesifik uzaysal ve zamansal noktada salgılanmış peptidler gibi ilgi konusu sinyal molekülleri, herhangi bir sayıda etkilerini tahlil sağlar. Burada, biz detay erken zebrabalıkları gelişimi sırasında manipüle ve implant boncuklar nasıl bir protokol.
Gelişim biyolojisi araştırmacılar, bir organizmanın nasıl oluştuğunu kontrol eden mekanizmaları ortaya çıkarmak için, hücresel, moleküler ve genetik yöntemlerle geniş bir dizi kullanmaktadır. Bu yaklaşımlar arasında, doku manipülasyonu hücre kaderi, hücresel hareketi ve dokuların organizasyonu konusunda karmaşık soruları çözmekte önemli bir araçtır. Lokal doku ortamları değiştirmek için bir yolu, protein ya da diğer sinyal molekülleri 1 odak kaynağı sağlamak için kullanılan mikro-cerrahi uygulanması yoluyla. Deneysel manipülasyon Bu tip yaygın tür kurbağa ve civciv 2 gibi klasik omurgalı embriyoloji modelleri, uygulamaya konmuştur.
Zebra balığı organogenez çalışma için önemli bir omurgalı bir model organizma haline ve insanlarda 6 yüksek genetik koruma payı olarak da hastalık modelleme 3-5 birçok benzersiz avantajlar sağlamaktadır etti. Özellikle, optik saydamlık ve eskiZebra balığı embriyonun gelişim modu, harici doku ontogeny 3-5 gözlem için eşsiz bir bakış açısı sunuyor. Büyük ölçekli ileri genetik ekranlar uygulanması daha fazla çalışma 7,8 ve verimli bir şekilde tek bir laboratuarlarda 9,10 azaltılmış ölçekte gerçekleştirilebilir Alternatif tarama teknikleri tanımlanması için zebra balığı mutant güçlü bir depo üretti. Daha fazla zebrabalıkları ile deneysel çalışmalar transgenik metodolojiler gelişmelere yoluyla kolaylaştırılabilir ve genetik yaklaşımlar 11,12 yanı sıra kimyasal genetik 13-15 tersine olmuştur.
Bu tür mikro uygulanması gibi doku manipülasyon teknikleri yaygın zebrafish istihdam olarak, ama yine de daha da geliştirilmesi sırasında hücre sinyallerini anlamak için yararlı bir araç sağlamak değil. Microbead implantasyon zebra balığı retinada organ oluşumu süreçlerini sorgulamak için kullanılmıştır16,17 kalp 18, beyin 19-22, nöral krest 23 ve 24,25 fin. Bu ve diğer çalışmalarda, boncuk geçişlerini hücre göçü 27 ve eksenel desenlendirme 28 nasıl etkilediğini sinyal molekülleri 26 difüzyonunu anlamak için gelişim sırasında uygulanmıştır. Daha yakın zamanda, mikro-zebra balığı yetişkin 29 yenilenmesi mekanizmaları değerlendirmek için kullanılmıştır. Gelişimsel çalışmalarda, örneğin, Zebra balığı microbead çalışmaları göğüs yüzgeci 25 çalışmalarla bacak oluşum mekanizmalarına anlayışlar sağladı. Zebra balığı göğüs yüzgeci tomurcuk fare, 30 ve civciv 31'inde ön ayakları tomurcuk homolog olduğunu. Omurgalı bacak tomurcuk iki temel sinyal düğümleri vardır: kutuplaştırıcı aktivite Sonic dikenli ifadesi ile ön-to-arka eksen kurar (ZPA) (Shh) ve mansap Hox gen hedeflerinin bölge,ve fibroblast büyüme faktörünün ekspresyonu (FGF'ler) vasıtasıyla kolun distal kimliğine proksimal kurmak için hareket bacak tomurcuk, ucunda mevcut apikal, ektodermal bir sırtın (AER). zebrabalıkları Shh genetik mutantlar, araştırmacılar içine FGF batırılmış mikroboncukları implante Omurgalı uzvun 25 hücre döngüsünün ve büyüme ilerlemesi için gerekli olduğu FGF belirledi. Buna ek olarak Konumsal kimlik oluşturmak FGF ve Shh sinyalizasyon kaskadlar, kimlik 32 posterior anterior kurmak için kutuplaştırıcı bölgenin eylem taklit ederek molekül olarak retinoik asit (RA) tespit civciv bacak tomurcuk kullanarak öncü çalışmalar. Civciv bacak içine RA-batırılmış whatman küçük kağıt parçaları konur katılan Bu deneyler haneli desenlendirme 32 değerlendirmek için. Bundan başka, araştırmacılar, mikro kullanımını kullanan diğer şık çalışma yapmıştır, hücre transplantasyonu ve eksojenZebra balığı RA RA tedavileri Zebra balığı Beyin ve mezoderm 28 içinde uzun menzilli pozisyonel ipuçları sağlamak için hareket ettiğini tespit etmek. Ancak, şu anda birçok soru omurgalı gelişme birçok açıdan sırasında FGF ve RA gibi faktörlerin sinyal rolleri hakkında kalır. RA sinyal etkisi, bir morfogen gibi davranan, böyle RA proksimal böbrek hücreleri kaderlerini 35-39 tip belirten gelişen kalp ve böbrek 34 atalarıdır gibi pek çok organı 33, darbe. Bu tür konuların daha iyi anlaşılması doku manipülasyon ve microbead implantasyon teknikleri kullanılarak deneysel çalışmalar önemli ölçüde yarar olabilir.
Civciv gibi modellere kıyasla daha az çalışma Zebra balığı, içinde microbead implantasyonu ile yapılmıştır ederken, yürütülen edilmiş olanlar son derece bilgilendirici olmuştur. Zebra balığı embriyo microbead implantasyon esaslı araştırma azlığı bir nedeni likel olduğunuy bir engel başarıyla tür manipülasyonlar gerçekleştirmeden oluşturan embriyonun büyüklüğü dayalı, zor teknik zorluklar var olduğu fikri. Ancak, Zebra balığı embriyolar microbead implantasyon uygulaması ile öğrenilen ve tekniğin görsel gözlem yoluyla yardım ve böylece kalkınma mekanizmaları sorgulamak için bir araç olarak takip edilebilirler. Burada, doku oluşumu ve hücre morfogenez ilgili tahlillerde çeşitli iletilmesi için kullanılabilir zebra balığı embriyo, bir mikroboncuk kesin uygulama göstermektedir.
Geçtiğimiz yüzyılda, vücut planı desen ve organogenez anlayışı anıtsal gelişmeler uğramıştır. Doku manipülasyon teknikleri bu hayati süreçler hakkında önemli bilgiler açığa çıkarmak kritik idi. Genetik modifikasyonlar gen fonksiyonu tespit etmek için en yaygın olarak kullanılan yöntemlerden biri, ve bu hücre transplantasyonu olarak mozaik analiz yöntemleri, gen fonksiyonunun otonomisini anlamak için yararlı bir yaklaşım sağlarlar. Microbead implantasyon bu yöntem sinyal molekülleri veya inhibitörleri getirerek bir lokal doku ortamı değiştirmek için araştırmacı sağlayan olarak, gelişimsel dinamikleri nasıl değiştirdiğini belirli molekülleri sorgulamak için başka bir mekan sağlar. Farklı mikro bir dizi farklı boyutlar ve diğer fiziksel özellikler de ilgi deney koşulları için kullanılabilir, öyle ki (örneğin, şarj) mevcut olması, ticari olarak temin edilebilir. Böylece, bir protein veya kimyasal ıslatılır mikroboncuklar implanteBir organizmanın içinde ilgi cal, araştırmacılar gelişim sırasında lokalize etkilerinin araştırılması ve gen veya ilgi ve özellikle biyolojik fenotip (ler) molekülü arasındaki ilişkiyi bulabilirsiniz.
Böyle zebrabalıkları 23 ön neurocranium (ANC) iskelet yapısının artan Kirpi sinyalizasyon etkisini değerlendirmek amacıyla microbead implantasyonu kullanılan Wada tarafından gerçekleştirilen bir ve meslektaşları olarak çalışmalar. Önceki çalışmalar, Shh ANC formasyonu 14 için gerekli olduğunu göstermiştir. Kullanımı Şşş kaplı mikroboncuklar araştırmacılar bu sinyal DÖB kıkırdak oluşumunu teşvik ettiğini belirledi. microbead implantasyon işlemi DÖB Kirpi sinyalizasyon ve kıkırdak oluşumu arasında açık bir bağlantı göstermek için kullanılmıştır. Bilim adamları eritroblastom Yirmi altı transkripsiyonel kontrol araştırdık nerede zebrafish bu doku manipülasyonu tekniğinin bir diğer önemli örnek çalışmalarda gözlenmiştir (ETS) etki faktörler ETS ilgili molekül (Erm) ve erken zebrabalıkları beyin gelişimi 19 sırasında FGF sinyalizasyon tarafından Polyoma arttırıcı aktivatör 3 (Pea3). Microbead implantasyon deneyleri sayesinde, onlar FGF8 ve Fgf3 ektopik erm ve Pea3 ifadesini aktive göstermek başardık. Bu örnekler, gen ekspresyonunu değerlendirmek için 41 yöntemleri ile iyi karakterize edilebilir, doku oluşumu sırasında işbirliği gelişim mekanizma içine anlayış sağlamak için mikro yararını göstermektedir. Böylece, microbead nakli gibi böbrek yol açan orta mezoderm (IM) gibi diğer dokuları, keşfetmek için uygun bir yöntem olabilir. Özellikle, nefron 42 segmentasyon ve 43,44, sadece yüzeysel şu anda anlaşılan süreçler tubulogenesis nasıl etkilediğini farklı moleküller araştırmak için, böbrek gelişim çalışmalarında yardımcı olacaktır. Ayrıca, microbead implantasyonu damızlık için kullanılmaya başlanmıştır ettizebrabalıkları 29] ve y rejenerasyon işlemleri gibi karşılık gelen yetişkin yapılarıyla araştırma yapmak için formüle edilmiştir yöntemlerle nefron 45 veya bağlantılı olduğu gibi, embriyonik doku takiben lazer ablasyonu gibi, organ yenilenmesi model, herhangi bir sayı ile kullanılmak üzere adapte edilebilir 46-49. Son olarak, mikroboncuk implantasyon kanser 50,51 veya doku dejenerasyonu 52,53 insan hastalık modelleri, kullanılmak üzere bir potansiyele sahiptir.
Mevcut protokolde, biz de benzer şekilde, diğer araştırmacılar tarafından açıklanan, ancak video protokolleri 1 ile gösterilmeyen olmuştur Zebra balığı embriyolarının microbead implantasyonu, yöntemini göstermektedir. Minimal uygulama ile biz araştırmacı bazı tecrübeye sahip bir zamanlar bu prosedürün fizibilitesini ilgilidir 8-10 embriyoların yaklaşık oranı / saat, en mikroboncukları implant başardık. Burada gösterilen sonuçlar, çeşitli d o boncuk göstermektedirimensions erken dönemde implante edilebilir ve dikkatle ki bu doku manipülasyonu tekniği embriyo minimal fiziksel bozulma ile uygulanabilir. Vurgulanmalıdır Bir gelişme embriyo mikroboncuk konumlandırmak için bir bıyık / kirpik aracının kullanılmasıdır. Bu ekipman nispeten ucuz ve basit parça mikroboncuk aynı çapta hakkında elde etmek kolaydır ve implantasyon sürecini hızlandırmak yardımcı olur. bıyık / kirpik araştırmacı el becerisi ve tercihine bağlı olarak, henüz narin boncuk işleme aracı bir firma üretmek için istenen uzunlukta kesilebilir. Burada fiziksel implantasyonu gerçekleştirmek için mikroboncukları ve zebra balığı embriyolar işlemek için nasıl tarif ederken son olarak, bu protokol, farklı ilaçlar veya peptidler için özel taşıma prosedürleri anahat değildir. Genel olarak, kimyasal işlem görmüş mikro-organizmanın başka alanlarda istenmeyen etkileri engellemek için, çıkar olan hayvana implante edilmesi gerekir, ve araştırmacılar de olmalıdırçalışmalarını başlatmadan önce bu tür kimyasallarla ilişkili olası güvenlik kaygıları hakkında kurdu.
Sonuç olarak, biz laboratuarda kolayca bulunabilen başlangıç malzemeleri kullanılarak, geniş bir uygulama yelpazesi ile nispeten basit ve etkili bir mikroküre implantasyon yöntemi gösterilmiştir. Sonuçta, biz bu kılavuz Zebra balığı doku manipülasyonu hassas doğası ile araştırmacıların yardımcı olacağını umuyoruz.
The authors have nothing to disclose.
Bu çalışma NIH hibe DP2OD008470 tarafından desteklenmiştir.
Sodium Chloride | American Bioanalytical | AB01915 | |
Potassium Chloride | American Bioanalytical | AB01652 | |
Calcium Chloride | American Bioanalytical | AB00366 | |
HEPES | Sigma Life Science | H4034 | |
Penicillin-Streptomycin solution | Sigma-Aldrich | P4333-20ML | |
N-Phenylthiourea (PTU) | Aldrich Chemistry | P7629 | |
Ethyl 3-aminobenzoate (Tricane) | Fluka Analytical | A5040 | |
Borosilicate glass | Sutter Instruments Co. | BF100-50-10 | |
Flaming/Brown Micropipette puller | Sutter Instruments Co. | Mo. P097 | |
UltraPure Agarose | Invitrogen | 15510-027 | |
Magnesium Sulfate | Sigma-Aldrich | M7506 | |
Methylene Blue | Sigma-Aldrich | M9140 | |
250mL Erlenmeyer Flask | Fischer Scientific | FB-500-250 | |
Falcon Diposable Petri Dishes, Sterile | Corning | 430167 | |
60mm x 15mm | VWR | 25373-085 | |
100mm x 15mm | VWR | 25373-100 | |
150mm x 15mm | VWR | 25373-187 | |
Saint-Gobain Chemware Microspatula | Fischer Scientific | 21-401-50B | |
P-1000 Micropipette tips | Fischer Scientific | 2707402 | |
Low Temperature Incubator | Fischer Scientific | 11 690 516DQ | |
Dimethly Sulfoxide | American Bioanalytical | AB00435 | |
Microbeads (45-106 µm) | Biorad | 140-1454 AG1-X8 | |
Microbeads (45 µm) | Polysciences | 7314 | |
Micro Dissecting Tweezer | Roboz Surgical Instruments Co. | RS-5010 | |
Tungsten Needle | Roboz Surgical Instruments Co. | RS-6065 | |
Capillary tube holder | Globe Scientific Inc. | 51674 |