We describe a method to establish human enteroids from small intestinal crypts and colonoids from colon crypts collected from both surgical tissue and biopsies. In this methodological article, we present the culture modalities that are essential for the successful growth and maintenance of human enteroids and colonoids.
The epithelium of the gastrointestinal tract is constantly renewed as it turns over. This process is triggered by the proliferation of intestinal stem cells (ISCs) and progeny that progressively migrate and differentiate toward the tip of the villi. These processes, essential for gastrointestinal homeostasis, have been extensively studied using multiple approaches. Ex vivo technologies, especially primary cell cultures have proven to be promising for understanding intestinal epithelial functions. A long-term primary culture system for mouse intestinal crypts has been established to generate 3-dimensional epithelial organoids. These epithelial structures contain crypt- and villus-like domains reminiscent of normal gut epithelium. Commonly, termed “enteroids” when derived from small intestine and “colonoids” when derived from colon, they are different from organoids that also contain mesenchyme tissue. Additionally, these enteroids/colonoids continuously produce all cell types found normally within the intestinal epithelium. This in vitro organ-like culture system is rapidly becoming the new gold standard for investigation of intestinal stem cell biology and epithelial cell physiology. This technology has been recently transferred to the study of human gut. The establishment of human derived epithelial enteroids and colonoids from small intestine and colon has been possible through the utilization of specific culture media that allow their growth and maintenance over time. Here, we describe a method to establish a small intestinal and colon crypt-derived system from human whole tissue or biopsies. We emphasize the culture modalities that are essential for the successful growth and maintenance of human enteroids and colonoids.
消化管のライニング上皮は一定のリニューアルです。このプロセスは、連続的に裏返すように迅速に腸上皮を交換する子孫を産生腸管幹細胞(のISC)の増殖によって引き起こされる。のISCを含む増殖性コンパートメントは陰窩の下部に限定される。のISCは、最終的に吸収または分泌系統に分化子孫を生じさせる。彼らはルーメン1に剥離する前に上向きに移動するように地下室を出て、絨毛または表面上皮上に移動すると、細胞が徐々に分化する。のISCは、腸細胞、microfold細胞、腸細胞、杯細胞、房細胞およびパネート細胞を含むすべての腸管上皮細胞タイプを生じさせる。コロンは、散乱腸と房細胞2で、結腸および杯細胞から主に構成された細長い陰窩ことを特徴としている。
エクスビボ CULトゥーレ·システムは、ISCのメンテナンスと腸組織の恒常性を研究するための有望なツールを構成している。生理学的な条件を完全に再生し、上皮の微小環境は、多くの場合、3,4変更されないようにしかし、それは組織培養技術に頼ることは困難である。 ISCの分野における主要な進歩は、正常な腸のニッチ信号を置き換えるために定義された成長因子を使用して、個々のマウスのISCを維持し、拡大した組織培養技術を確立した。長期培養条件は佐藤らによって記載され、その単一陰窩または腸上皮から単離された幹細胞は、複数の陰様ドメイン5-7を含む3次元の上皮構造を形成するために成長する。これらの三次元構造は、連続的に拡大する分裂事象を受ける。興味深いことに、起源の組織に固有のすべての腸の細胞型が生成され、同様に内腔8内に押し出される。このシステムの改変を用いて、上皮オルガノイドは、胃、小腸および大腸から生成することができる。具体的には、小腸からの上皮オルガノイドはenteroids 9であり、コロンからのものがcolonoids 9,10です。これらの上皮オルガノイド培養系は、このように単離された細胞5,6,10-15の「幹細胞性」を試験するインビトロで幹細胞として機能する単離された単一細胞の能力を試験するために使用されてきた。他の研究者は、個々の上皮細胞16〜21の機能を研究するenteroidsとcolonoids両方を使用している。したがって、enteroidとcolonoid培養は、幹細胞および非幹細胞の両方の機能を評価し、腸内の基本的な細胞間相互作用に新たな洞察を与えるために使用することができる。
2011年には、佐藤らは、人間の小腸および結腸22,23から派生した上皮オルガノイドの長期培養を生成した。培地組成の違い、ヒト上皮enteroidsに加えとcolonoidsは彼らのネズミの対応と同じ特徴を示す。さらに、それらは、バレット食道、腺腫または腺癌、および嚢胞性線維22,24として病変組織から生成することができる。人間enteroidsは腸管幹細胞および上皮粘膜生物学を研究し、正常と異常の両方胃腸生理学3を研究するための新たな実験系として機能するように貴重なシステムを構成している。
ここでは、人間の小腸および結腸陰窩( 図1)からenteroidsとcolonoidsを確立するための方法を説明します。この方法論のレビューでは、全組織と生検から陰コレクションを強調する。私たちは、人間enteroidsとcolonoidsと、このモデルによって実施可能な実験的な戦略の成功成長および維持に不可欠な文化様式を再現。
この方法は、腸上皮生物学を研究するための便利なツールを構成している腸管上皮系統および上皮ダイナミクスを再現する完全なシステムを提供しています。ここに提示された方法を効率的に人間enteroidsとcolonoidsになり、佐藤とClevers 22によって元のマウス研究から適応されました。ここでは、手動で任意の細胞の汚染物質を避けるために、顕微解剖によって陰窩を拾いました。この方法は、陰窩の直接可視化を可能にし、「振る」ことにより、元の暗号コレクションに比べて一貫性の残業につながる。他のグループは、特にコラゲナーゼ25とEDTAによるキレート化を置き換えるわずかに異なるアプローチを使用して、同様のテクニクスを開発しました。暗号コレクションの違いのほかに、それらのテクニクスは文化22で人間enteroidsを成長するために必要な定義されたメディアを使用。陰窩播種で成長効率を高めるために、GSK3インヒビター(CHIR99021)を追加最初の2日間12。
組織または生検の取り扱いが重要であり、暗号の分離とすぐ組織が実験室に到着したように実行する必要があります。しかし、遅延陰窩の単離および培養は、組織採取後24時間まで実施することができる以前に、マウス組織26について記載した(データは示さず)。腸組織を完全に組織破壊を回避するためにDPBSで満たし、4℃で維持されるべきである円錐管に配置する必要があります。遅延準備は、組織出荷が可能になりますが、温度変化は、輸送中に避けるべきである。初期陰窩めっきに必要な全体的な時間は、陰窩を分離し、めっきする組織と、1〜2時間後に処理するために15〜30分間で約2時間である。組織の顕微解剖は、きれいな地下室の準備の重要な決定要因と述語です。しかし、ハンドシェイクによって陰窩リリース様々なプロトコルに記載されるようにすることが可能である22,23。
ネズミenteroid(enteroids)システムと類似しているにもかかわらず、人間enteroidsは時間をかけて彼らの成長を促進し、維持するために特定の分子を必要とする。成長因子は、EGF、ノギン、Rスポンジン、マウス上皮オルガノイドと同様に使用される。しかし、のWnt-3Aの使用が不可欠である。我々は、形成ならびに成長効率は、ヒト組換えタンパク質よりはWnt-3A条件培地を使用して大きいことを指摘した。同時に、我々は、グリコーゲンシンターゼキナーゼ3(CHIR99021)12の阻害剤を使用して改良された培養条件を示した。組み換え成長因子は、Wnt-3A、Rスポンジン、及びノギン馴化メディアで置き換えることができる。のWnt-3Aを発現するL細胞株は(ATCC)は、市販されている。他のグループはNoggin- 19、およびWnt-3A / R-spondin3 / Noggin- 28発現細胞株、Rスポンジン1- 23,27を開発した。二つの小分子阻害剤は、培養に使用されている私DIAとは、文化29の維持のために必要である。 – 83から01の成長因子βおよびアクチビン/ノーダル受容体を形質転換の選択的阻害剤である(アクチビン様キナーゼ4、5、7)及びSB202190は、p38マイトジェン活性化プロテインキナーゼ阻害剤(MAPK)である。両阻害剤は、ヒト人工多能性幹細胞の自己再生を維持し、30-32、ヒトナイーブな多能性幹細胞を確立するためにそれぞれ使用されてきた。また、ニコチンアミド、ニコチンアミドアデニンジヌクレオチドの前駆体は、長期的22,29にenteroidsとcolonoidsの拡張を維持するために必要とされる。
それは地下室の準備からの収量を決定としてEDTAのキレート化は重要なステップです。私たちは、2 mMのEDTA処理に成功している。しかし、EDTAの濃度は、組織の種類に関して15 mMまでの2mMから変更することができる。その場合には、インキュベーション時間は、実験的に決定されなければならない。初期めっき後、cryptはラウンドuとなりますpと、最終的にはenteroidsを形成する。しかし、enteroidsまたはcolonoidsは、多くの場合、無分化した細胞にはほとんどして球体を形成することにより、「ステム」表現型を示す。その場合には、分化は、Wnt-3A、ニコチンアミドおよびp38 MAPK阻害剤を回収することによって開始することができる。そのようなDAPTまたはDBZなどのNotch阻害剤の使用はenteroids 22内分化を強化するのに役立ちます。
このモデルは、吸収性および分泌分化系統の両方を含む幹細胞区画から生じる継続的な陰出芽イベントならびに絨毛様上皮ドメインを有する腸生理を再現する。興味深いことに、このシステムは、任意の間葉細胞を含有し、ニッチ信号要件を満たすために特定のメディア条件を使用していない。
マウスモデルと同様に、人間enteroidsは、幹細胞として機能するそれらの細胞の能力をテストするために、単離された腸上皮細胞から生成することができる。セベRALの研究は、幹のプロパティ12,23,33を用いて細胞を濃縮する分化マーカー(CD44、CD24またはCD166)とEPHB2陽性細胞のクラスターを使用してきた。一緒に、これらの研究は、幹細胞性を試験するため、ヒトenteroids培養物の有用性を実証する。他の研究者は、感染下痢性疾患、嚢胞性線維症、または結腸直腸癌22,34-37腸疾患を調査するためにこのモデルを使用している。これらの研究は、人間enteroidsパーソナライズスクリーニングに向かって移動する可能性と信頼性の高いヒト疾患モデルを構成していることを示している。人間enteroidsは、遺伝的にウイルス粒子38とDNAトランスフェクションまたは感染を使用して変更することができます。これはヒト上皮オルガノイドまたは正しい遺伝子突然変異内の遺伝子固有の機能を研究するための強力なツールを提供します。最近では、Schwankらは、CRISPR / Cas9システムとゲノムを編集して、交流を引き起こしCFTR遺伝子に突然変異を修正する可能性を実証したystic線維症24。人間enteroidsは腸管幹細胞および上皮粘膜生物学を研究し、正常と異常の両方胃腸生理学を研究するための新たな実験系として機能するように貴重なシステムを構成している。
The authors have nothing to disclose.
We gratefully acknowledge Dr. Hans Clevers (Hubrecht Institute for Developmental Biology and Stem Cell Research, Netherlands) for the kind gift of TOPflash cells.
This project was supported in part by NIH-R01DK083325 (MAH); NIH P30 DK078392 (Digestive Health Center); NIH UL1RR026314 (CTSA).
Name of Reagent | Company | Catalog Number |
Dulbecco’s Phosphate buffered saline Ca2+, Mg2+ free (DPBS) | Life technologies; Gibco | 14190-144 |
Ethylenediaminetetraacetic acid (EDTA) | Sigma-Aldrich | 431788 |
Sorbitol | Fischer Scientific | BP439-500 |
Sucrose | Fischer Scientific | BP220-1 |
Bovine serum albumin (BSA) Fraction V | Fischer Scientific | BP1600-100 |
Gzntamycin/Amphotericin B solution | Life technologies; Gibco | R-015-10 |
Wnt-3A conditionned medium | in house | – |
Advanced DMEM/F12 | Life technologies; Gibco | 12634-028 |
HEPES 1M | Life technologies; Gibco | 15630-080 |
GlutaMAX (glutamine) | Life technologies; Gibco | 35050-061 |
Penicillin-Streptomycin (10,000 U/mL) | Life technologies; Gibco | 15140-148 |
N2 Supplement | Life technologies; Gibco | 17502-048 |
B27 Supplement | Life technologies; Gibco | 17504-044 |
N-Acetylcysteine | Sigma-Aldrich | A9165-5G |
Nicotidamide | Sigma-Aldrich | N0636 |
Matrigel, GFR, Phenol free (basement membrane matrix) | Corning | 356231 |
human recombinant Noggin | R&D | 6057-NG/CF |
human recombinant R-Spondin | Preprotech | 120-38 |
human recombinant EGF | Sigma-Aldrich | E9644-.2MG |
Y-27632 | Sigma-Aldrich | Y0503-1MG |
A-83-01 | Tocris | 2939 |
SB202190 | Sigma-Aldrich | S7067-5MG |
human [Leu]15-Gastrin 1 | Sigma-Aldrich | G9145-.1MG |
CHIR99021 | Stemgent | 04-0004 |
Thiazovivin | Stemgent | 04-0017 |
TrypLE Express Enzyme (1X), phenol red (cell dissociation enzyme) | Life technologies; Gibco | 12605-010 |
Fetal Bovine Serum | Life technologies; Gibco | 10082-147 |
CTS Synth-a-Freeze Medium (freezing medium) | Life technologies; Gibco | A13713-01 |
L Wnt-3A cell line | ATCC | CRL-2647 |
Renilla luciferase assay | Promega | E2710 |
human recombinant Wnt-3A | R&D | 5036-WN/CF |
HEK293 TOPflash cell line | – | – |