Summary

Realtidselektro: Använda Closed-loop protokollen till Probe neurala Dynamics and Beyond

Published: June 24, 2015
doi:

Summary

Closed-loop protocols are becoming increasingly widespread in modern day electrophysiology. We present a simple, versatile and inexpensive way to perform complex electrophysiological protocols in cortical pyramidal neurons in vitro, using a desktop computer and a digital acquisition board.

Abstract

Experimentell neurovetenskap bevittnar ett ökat intresse för utveckling och tillämpning av nya och ofta komplexa, protokoll slutna kretslopp, där stimulans tillämpas beror i realtid på respons av systemet. Nya applikationer sträcker sig från genomförandet av virtual reality-system för att studera motoriska gensvar både hos möss 1 och i zebrafisk 2, för att kontrollera om krampanfall efter kortikal stroke använder optogenetik 3. En viktig fördel med slutna tekniker består i förmågan att sondera högre dimensionella egenskaper som inte är direkt tillgängliga eller som är beroende av flera variabler, såsom neuronala retbarhet 4 och tillförlitlighet, medan samtidigt maximera den experimentella genomströmning. I detta bidrag och i samband med cellelektro, beskriver vi hur du använder en mängd slutna protokoll till studiet av svarsegenskaperna hos pyramidal kortikala neuroner, recorded intracellulärt med patch clamp-tekniken i akut hjärnan skivor från somatosensoriska cortex av unga råttor. Eftersom ingen kommersiellt tillgängliga eller öppen källkod ger alla funktioner som krävs för att effektivt utföra de experiment som beskrivs här, en ny programvara verktygslåda kallad LCG 5 utvecklas, vars modulär struktur maximerar återanvändning av programkod och underlättar genomförandet av nya experimentella paradigm. Stimulering vågformer anges med en kompakt meta-beskrivning och fullständiga försöksprotokoll beskrivs i textbaserade konfigurationsfiler. Dessutom har LCG ett kommandoradsgränssnitt som lämpar sig för upprepning av försök och automatisering av experimentella protokoll.

Introduction

Under de senaste åren, har cellulära elektrofysiologi utvecklats från den traditionella öppen slinga paradigmet används i spänning och ström clamp-experiment till moderna med sluten slinga protokoll. Den mest kända slutna tekniken är kanske den dynamiska klämman 6,7, vilket gjorde det möjligt för syntetiska injektion av artificiella spänningskänsliga jonkanaler att bestämma nervmembranspänningen 8, den fördjupade studie av effekterna av icke-deterministiska flimmer på jonkanaler på neuronala svar dynamik 9, liksom rekreation in vitro av realistiska i vivo- som synaptiska bakgrundsaktiviteten 10.

Andra sluten slinga paradigm som har föreslagits innefattar den reaktiva klämman 11, för att studera in vitro generation av självunderhållande ihållande aktivitet, och svaret klämma 4,12, för att undersöka de cellulära mekanismerna bakom neuronala retbarhet.

INNEHÅLL "> Här beskriver vi ett kraftfullt ramverk som gör det möjligt att tillämpa en mängd slutna elektro protokoll i samband med hela celler patch clamp inspelningar utförs i akut hjärnan skivor. Vi visar hur du spelar in somatisk membranspänning med hjälp av patch clamp inspelningar i pyramidala nervceller från somatosensoriska cortex av juvenila råttor och tillämpa tre olika slutna protokoll med hjälp av LCG, ett kommando-line-baserad programvara verktygslåda utvecklats i laboratoriet för teoretisk neurobiologi och Neuroengineering.

I korthet, de beskrivna protokollen är först den automatiserade injektion av en serie strömtång stimulans vågformer, som är relevanta för karakterisering av ett stort antal aktiva och passiva membranegenskaper. Dessa har föreslagits att fånga elektro fenotypen av en cell i termer av dess svar egenskaper till en stereotyp rad stimulans vågformer. Känd som e-koden för en cell (t.ex. se & #160; 13,14), är en sådan samling av elektriska svaren används av flera laboratorier att objektivt klassificera neuroner på grundval av deras elektriska egenskaper. Detta innefattar analys av den stationära input-output överförande förhållande (FI kurva) genom en innovativ teknik som innebär sluten slinga, i realtid kontroll över graden av bränning med hjälp av en proportionell-integral-derivata (PID) regulator , andra återskapande av realistiska in vivo -liknande bakgrund synaptisk aktivitet i de vitro-preparat 10 och för det tredje den konstgjorda anslutning i realtid av två samtidigt registreras pyramidala nervceller med hjälp av en virtuell GABAergic interneuronen, som simuleras av datorn.

Dessutom LCG implementerar den teknik som kallas aktiva elektroden Kompensation (AEC) 15, som gör det möjligt att genomföra dynamiska klämprotokoll med användning av en enda elektrod. Detta gör det möjligt att kompensera oönskade effekter (enrtifacts) i inspelningen elektroden som uppstår när den används för att leverera intracellulära stimuli. Metoden är baserad på en icke-parametrisk beräkning av de ekvivalenta elektriska egenskaperna hos inspelningskretsen.

De tekniker och experimentella protokoll som beskrivs i detta dokument kan lätt tillämpas i konventionell öppen slinga spännings- och strömkläm experiment och kan utvidgas till andra preparat, såsom extracellulära 4,16 eller intracellulära inspelningar in vivo 17,18. Den noggranna monteringen av installationen för hela cell patch clamp elektrofysiologi är ett mycket viktigt steg för stabila, högkvalitativa inspelningar. I det följande antar vi att en sådan experimentuppställning är redan tillgänglig för försöks och fokusera vår uppmärksamhet på att beskriva användningen av LCG. Läsaren pekade på 19-22 för ytterligare tips om optimering och felsökning.

Protocol

Protokollet som beskrivs här uppfyller de rekommendationer och riktlinjer för den etiska kommittén vid institutionen för biomedicin vid universitetet i Antwerpen. Detta protokoll kräver framställningen av icke-kännande material från explanterade hjärnan hos unga Wistar-råttor, som erhållits av godkända humana dödshjälp tekniker. 1. Förberedelse av utrustning Installera och konfigurera datainsamling och stimuleringssystem. Använd en persondator (PC) utrusta…

Representative Results

I de tidigare avsnitten har vi beskrivit hur man använder programvaran verktygslåda LCG att karakterisera elektrofysiologiska egenskaperna hos L5 pyramidala celler och att återskapa in vivo -liknande synaptisk aktivitet i en skiva beredning. Användningen av ett kommandoradsgränssnitt och halvautomatiska protokoll gynnar reproducerbarhet och effektivitet av experimentet, som kan ha en stor inverkan på produktionen och kvaliteten på de uppgifter som tas fram. Dessutom, eftersom data sparas på ett konsekve…

Discussion

I denna text ett fullständigt protokoll för att genomföra realtid, var stängd slinga enda cell elektrofysiologiska experiment beskrivs med hjälp av patch clamp teknik och en nyligen utvecklad programvara verktygslåda kallas LCG. För att optimera kvaliteten på inspelningarna är det viktigt att inspelnings installationen vara jordat, avskärmad och vibrationsfri: Detta säkerställer stabil och varaktig hela-cell tillgång till cellen, som tillsammans med möjligheten att automatisera hela sektioner av stimulerin…

Divulgaciones

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Financial support from the Flanders Research Foundation FWO (contract n. 12C9112N to DL), the 7th Framework Programme of the European Commission (Marie Curie Network “C7”, contract n. 238214; ICT Future Emerging Technology “ENLIGHTENMENT” project, contract n. 306502), the Interuniversity Attraction Poles Program initiated by the Belgian Science Policy Office (contract n. IUAP-VII/20), and the University of Antwerp is kindly acknowledged.

Materials

Tissue slicer Leica VT-1000S
Pipette puller Sutter P-97
Pipettes WPI 1B150F-4 1.5/0.84 mm OD/ID, with filament
Vibration isolation table TMC 20 Series
Microscope Leica DMLFS 40X Immersion Objective
Manipulators Scientifica PatchStar
Amplifiers Axon Instruments MultiClamp 700B Computer controlled
Data acquisition card National Instruments PCI-6229 Supported by Comedi Linux Drivers
Desktop computer Dell Optiplex 7010 Tower OS: real-time Linux
Oscilloscopes Tektronix TDS-1002
Perfusion Pump Gibson MINIPULS3 Used with R4 Pump head (F117606)
Temperature controller Multichannel Systems TC02 PH01 Perfusion Cannula
Manometer Testo 510 Optional
Incubator Memmert WB14
NaCl Sigma 71376 ACSF
KCl Sigma P9541 ACSF, ICS
NaH2PO4 Sigma S3139 ACSF
NaHCO3 Sigma S6014 ACSF
CaCl2 Sigma C1016 ACSF
MgCl2 Sigma M8266 ACSF
Glucose Sigma G7528 ACSF
K-Gluconate Sigma G4500 ICS
HEPES Sigma H3375 ICS
Mg-ATP Sigma A9187 ICS
Na2-GTP Sigma 51120 ICS
Na2-Phosphocreatine Sigma P7936 ICS

Referencias

  1. Saleem, A. B., Ayaz, A., Jeffery, K. J., Harris, K. D., Carandini, M. Integration of visual motion and locomotion in mouse visual cortex. Nature neuroscience. 16, 1864-1869 (2013).
  2. Ahrens, M. B., Li, J. M., et al. Brain-wide neuronal dynamics during motor adaptation in zebrafish. Nature. 485 (7399), 471-477 (2012).
  3. Paz, J. T., Davidson, T. J., et al. Closed-loop optogenetic control of thalamus as a tool for interrupting seizures after cortical injury. Nature neuroscience. 16 (1), 64-70 (2013).
  4. Wallach, A., Eytan, D., Gal, A., Zrenner, C., Marom, S. Neuronal response clamp. Frontiers in neuroengineering. 3 (April), 3 (2011).
  5. Linaro, D., Couto, J., Giugliano, M. Command-line cellular electrophysiology for conventional and real-time closed-loop experiments. Journal of neuroscience. 230, 5-19 (2014).
  6. Sharp, A., O’Neil, M., Abbott, L. F., Marder, E. Dynamic clamp: computer-generated conductances in real neurons. Journal of neurophysiology. 69 (3), 992-995 (1993).
  7. Robinson, H. P., Kawai, N. Injection of digitally synthesized synaptic conductance transients to measure the integrative properties of neurons. Journal of neuroscience methods. 49 (3), 157-165 (1993).
  8. Vervaeke, K., Hu, H., Graham, L. J., Storm, J. F. Contrasting effects of the persistent Na+ current on neuronal excitability and spike timing. Neuron. 49 (2), 257-270 (2006).
  9. White, J. A., Klink, R., Alonso, A., Kay, A. R. Noise from voltage-gated ion channels may influence neuronal dynamics in the entorhinal cortex. Journal of neurophysiology. 80 (1), 262-269 (1998).
  10. Destexhe, a., Rudolph, M., Fellous, J. M., Sejnowski, T. J. Fluctuating synaptic conductances recreate in vivo-like activity in neocortical neurons. Neurociencias. 107 (1), 13-24 (2001).
  11. Fellous, J. -. M. Regulation of Persistent Activity by Background Inhibition in an In Vitro Model of a Cortical Microcircuit. Cerebral Cortex. 13 (11), 1232-1241 (2003).
  12. Gal, A., Eytan, D., Wallach, A., Sandler, M., Schiller, J., Marom, S. Dynamics of excitability over extended timescales in cultured cortical neurons. The Journal of neuroscience. the official journal of the Society for Neuroscience. 30 (48), 16332-16342 (2010).
  13. Wang, Y., Toledo-Rodriguez, M., et al. Anatomical, physiological and molecular properties of Martinotti cells in the somatosensory cortex of the juvenile rat. The Journal of physiology. 561 (Pt 1), 65-90 (2004).
  14. Wang, Y., Gupta, A., Toledo-Rodriguez, M., Wu, C. Z., Markram, H. Anatomical, physiological, molecular and circuit properties of nest basket cells in the developing somatosensory cortex). Cerebral cortex (New York, N.Y). 12 (4), 395-410 (1991).
  15. Brette, R., Piwkowska, Z., et al. High-resolution intracellular recordings using a real-time computational model of the electrode. Neuron. 59 (3), 379-391 (2008).
  16. Rutishauser, U., Kotowicz, A., Laurent, G. A method for closed-loop presentation of sensory stimuli conditional on the internal brain-state of awake animals. Journal of neuroscience. 215 (1), 139-155 (2013).
  17. Margrie, T., Brecht, M., Sakmann, B. In vivo, low-resistance, whole-cell recordings from neurons in the anaesthetized and awake mammalian brain. Pflugers Archiv European Journal of Physiology. 444 (4), 491-498 (2002).
  18. Graham, L., Schramm, A. In Vivo Dynamic-Clamp Manipulation of Extrinsic and Intrinsic Conductances: Functional Roles of Shunting Inhibition and I BK in Rat and Cat Cortex. Dynamic Clamp: From Principles to Applications. , (2008).
  19. Sakmann, B., Neher, E. . Single-channel recording. , (1995).
  20. Molleman, A. . Patch Clamping. , (2002).
  21. Davie, J. T., Kole, M. H. P., et al. Dendritic patch-clamp recording. Nature Protocols. 1 (3), 1235-1247 (2006).
  22. Gold, R. . The Axon Guide for Electrophysiolog., & Biophysics Laboratory Techniques... , (2007).
  23. Mainen, Z. F., Sejnowski, T. J. Reliability of spike timing in neocortical neurons. Science. 268 (5216), 1503-1506 (1995).
  24. Buzsáki, G. Action potential threshold of hippocampal pyramidal cells in vivo is increased by recent spiking activity. Neurociencias. 105 (1), 121-130 (2001).
  25. Koch, C., Segev, I. . Methods in Neuronal Modeling: From Synapses to Networks. , (1988).
  26. Silberberg, G., Markram, H. Disynaptic inhibition between neocortical pyramidal cells mediated by Martinotti cells. Neuron. 53 (5), 735-746 (2007).
  27. Berger, T. K., Silberberg, G., Perin, R., Markram, H. Brief bursts self-inhibit and correlate the pyramidal network. PLoS biology. 8 (9), (2010).
  28. Tsodyks, M., Pawelzik, K., Markram, H. Neural networks with dynamic synapses. Neural computation. 10 (4), 821-835 (1998).
  29. Kapfer, C., Glickfeld, L. L., Atallah, B. Supralinear increase of recurrent inhibition during sparse activity in the somatosensory cortex. Nature. 10 (6), 743-753 (2007).

Play Video

Citar este artículo
Linaro, D., Couto, J., Giugliano, M. Real-time Electrophysiology: Using Closed-loop Protocols to Probe Neuronal Dynamics and Beyond. J. Vis. Exp. (100), e52320, doi:10.3791/52320 (2015).

View Video