Closed-loop protocols are becoming increasingly widespread in modern day electrophysiology. We present a simple, versatile and inexpensive way to perform complex electrophysiological protocols in cortical pyramidal neurons in vitro, using a desktop computer and a digital acquisition board.
Experimentell neurovetenskap bevittnar ett ökat intresse för utveckling och tillämpning av nya och ofta komplexa, protokoll slutna kretslopp, där stimulans tillämpas beror i realtid på respons av systemet. Nya applikationer sträcker sig från genomförandet av virtual reality-system för att studera motoriska gensvar både hos möss 1 och i zebrafisk 2, för att kontrollera om krampanfall efter kortikal stroke använder optogenetik 3. En viktig fördel med slutna tekniker består i förmågan att sondera högre dimensionella egenskaper som inte är direkt tillgängliga eller som är beroende av flera variabler, såsom neuronala retbarhet 4 och tillförlitlighet, medan samtidigt maximera den experimentella genomströmning. I detta bidrag och i samband med cellelektro, beskriver vi hur du använder en mängd slutna protokoll till studiet av svarsegenskaperna hos pyramidal kortikala neuroner, recorded intracellulärt med patch clamp-tekniken i akut hjärnan skivor från somatosensoriska cortex av unga råttor. Eftersom ingen kommersiellt tillgängliga eller öppen källkod ger alla funktioner som krävs för att effektivt utföra de experiment som beskrivs här, en ny programvara verktygslåda kallad LCG 5 utvecklas, vars modulär struktur maximerar återanvändning av programkod och underlättar genomförandet av nya experimentella paradigm. Stimulering vågformer anges med en kompakt meta-beskrivning och fullständiga försöksprotokoll beskrivs i textbaserade konfigurationsfiler. Dessutom har LCG ett kommandoradsgränssnitt som lämpar sig för upprepning av försök och automatisering av experimentella protokoll.
Under de senaste åren, har cellulära elektrofysiologi utvecklats från den traditionella öppen slinga paradigmet används i spänning och ström clamp-experiment till moderna med sluten slinga protokoll. Den mest kända slutna tekniken är kanske den dynamiska klämman 6,7, vilket gjorde det möjligt för syntetiska injektion av artificiella spänningskänsliga jonkanaler att bestämma nervmembranspänningen 8, den fördjupade studie av effekterna av icke-deterministiska flimmer på jonkanaler på neuronala svar dynamik 9, liksom rekreation in vitro av realistiska i vivo- som synaptiska bakgrundsaktiviteten 10.
Andra sluten slinga paradigm som har föreslagits innefattar den reaktiva klämman 11, för att studera in vitro generation av självunderhållande ihållande aktivitet, och svaret klämma 4,12, för att undersöka de cellulära mekanismerna bakom neuronala retbarhet.
INNEHÅLL "> Här beskriver vi ett kraftfullt ramverk som gör det möjligt att tillämpa en mängd slutna elektro protokoll i samband med hela celler patch clamp inspelningar utförs i akut hjärnan skivor. Vi visar hur du spelar in somatisk membranspänning med hjälp av patch clamp inspelningar i pyramidala nervceller från somatosensoriska cortex av juvenila råttor och tillämpa tre olika slutna protokoll med hjälp av LCG, ett kommando-line-baserad programvara verktygslåda utvecklats i laboratoriet för teoretisk neurobiologi och Neuroengineering.I korthet, de beskrivna protokollen är först den automatiserade injektion av en serie strömtång stimulans vågformer, som är relevanta för karakterisering av ett stort antal aktiva och passiva membranegenskaper. Dessa har föreslagits att fånga elektro fenotypen av en cell i termer av dess svar egenskaper till en stereotyp rad stimulans vågformer. Känd som e-koden för en cell (t.ex. se & #160; 13,14), är en sådan samling av elektriska svaren används av flera laboratorier att objektivt klassificera neuroner på grundval av deras elektriska egenskaper. Detta innefattar analys av den stationära input-output överförande förhållande (FI kurva) genom en innovativ teknik som innebär sluten slinga, i realtid kontroll över graden av bränning med hjälp av en proportionell-integral-derivata (PID) regulator , andra återskapande av realistiska in vivo -liknande bakgrund synaptisk aktivitet i de vitro-preparat 10 och för det tredje den konstgjorda anslutning i realtid av två samtidigt registreras pyramidala nervceller med hjälp av en virtuell GABAergic interneuronen, som simuleras av datorn.
Dessutom LCG implementerar den teknik som kallas aktiva elektroden Kompensation (AEC) 15, som gör det möjligt att genomföra dynamiska klämprotokoll med användning av en enda elektrod. Detta gör det möjligt att kompensera oönskade effekter (enrtifacts) i inspelningen elektroden som uppstår när den används för att leverera intracellulära stimuli. Metoden är baserad på en icke-parametrisk beräkning av de ekvivalenta elektriska egenskaperna hos inspelningskretsen.
De tekniker och experimentella protokoll som beskrivs i detta dokument kan lätt tillämpas i konventionell öppen slinga spännings- och strömkläm experiment och kan utvidgas till andra preparat, såsom extracellulära 4,16 eller intracellulära inspelningar in vivo 17,18. Den noggranna monteringen av installationen för hela cell patch clamp elektrofysiologi är ett mycket viktigt steg för stabila, högkvalitativa inspelningar. I det följande antar vi att en sådan experimentuppställning är redan tillgänglig för försöks och fokusera vår uppmärksamhet på att beskriva användningen av LCG. Läsaren pekade på 19-22 för ytterligare tips om optimering och felsökning.
I denna text ett fullständigt protokoll för att genomföra realtid, var stängd slinga enda cell elektrofysiologiska experiment beskrivs med hjälp av patch clamp teknik och en nyligen utvecklad programvara verktygslåda kallas LCG. För att optimera kvaliteten på inspelningarna är det viktigt att inspelnings installationen vara jordat, avskärmad och vibrationsfri: Detta säkerställer stabil och varaktig hela-cell tillgång till cellen, som tillsammans med möjligheten att automatisera hela sektioner av stimulerin…
The authors have nothing to disclose.
Financial support from the Flanders Research Foundation FWO (contract n. 12C9112N to DL), the 7th Framework Programme of the European Commission (Marie Curie Network “C7”, contract n. 238214; ICT Future Emerging Technology “ENLIGHTENMENT” project, contract n. 306502), the Interuniversity Attraction Poles Program initiated by the Belgian Science Policy Office (contract n. IUAP-VII/20), and the University of Antwerp is kindly acknowledged.
Tissue slicer | Leica | VT-1000S | |
Pipette puller | Sutter | P-97 | |
Pipettes | WPI | 1B150F-4 | 1.5/0.84 mm OD/ID, with filament |
Vibration isolation table | TMC | 20 Series | |
Microscope | Leica | DMLFS | 40X Immersion Objective |
Manipulators | Scientifica | PatchStar | |
Amplifiers | Axon Instruments | MultiClamp 700B | Computer controlled |
Data acquisition card | National Instruments | PCI-6229 | Supported by Comedi Linux Drivers |
Desktop computer | Dell | Optiplex 7010 Tower | OS: real-time Linux |
Oscilloscopes | Tektronix | TDS-1002 | |
Perfusion Pump | Gibson | MINIPULS3 | Used with R4 Pump head (F117606) |
Temperature controller | Multichannel Systems | TC02 | PH01 Perfusion Cannula |
Manometer | Testo | 510 | Optional |
Incubator | Memmert | WB14 | |
NaCl | Sigma | 71376 | ACSF |
KCl | Sigma | P9541 | ACSF, ICS |
NaH2PO4 | Sigma | S3139 | ACSF |
NaHCO3 | Sigma | S6014 | ACSF |
CaCl2 | Sigma | C1016 | ACSF |
MgCl2 | Sigma | M8266 | ACSF |
Glucose | Sigma | G7528 | ACSF |
K-Gluconate | Sigma | G4500 | ICS |
HEPES | Sigma | H3375 | ICS |
Mg-ATP | Sigma | A9187 | ICS |
Na2-GTP | Sigma | 51120 | ICS |
Na2-Phosphocreatine | Sigma | P7936 | ICS |