Closed-loop protocols are becoming increasingly widespread in modern day electrophysiology. We present a simple, versatile and inexpensive way to perform complex electrophysiological protocols in cortical pyramidal neurons in vitro, using a desktop computer and a digital acquisition board.
Eksperimentell nevrovitenskap er vitne til en økt interesse for utvikling og anvendelse av ny og ofte komplekse, lukket sløyfe protokoller, hvor stimulus brukes avhenger i sanntid på responsen til systemet. Nye søknader spenner fra gjennomføringen av virtuelle virkelighet systemer for å studere motoriske responser både hos mus 1 og i sebrafisk 2, for å kontrollere anfall følgende kortikale slag hjelp optogenetics tre. En viktig fordel med lukket sløyfeteknikker ligger i evnen til sentret høyere dimensjonale egenskaper som ikke er direkte tilgjengelige, eller som er avhengig av flere variable, slik som neuronal eksitabilitet 4 og påliteligheten, mens den på samme tid maksimerer den eksperimentelle gjennomstrømming. I dette bidraget og i sammenheng med mobilelektrofysiologi, beskriver vi hvordan du kan bruke en rekke av lukket-sløyfe-protokoller til studiet av respons egenskapene til pyramide kortikale nevroner, recorded intracellulært med lappen klemmeteknikken i akutte hjerneskiver fra somatosensoriske cortex av unge rotter. Som ingen kommersielt tilgjengelig eller åpen kildekode gir alle funksjonene som kreves for effektivt å utføre forsøkene beskrevet her, ble en ny programvareverktøykasse kalt LCG 5 utviklet, hvis modulær struktur maksimerer gjenbruk av programkode og tilrettelegger for implementering av nye eksperimentelle paradigmer. Stimulerings kurver er spesifisert med en compact meta-beskrivelse og fulle eksperimentelle protokoller er beskrevet i tekst-baserte konfigurasjonsfiler. I tillegg har LCG et kommandolinjegrensesnitt som er egnet for gjentakelse av forsøk og automatisering av eksperimentelle protokoller.
I de siste årene har mobilelektro utviklet seg fra den tradisjonelle åpne sløyfe paradigmet ansatt i spenning og strøm klemme eksperimenter til moderne lukket-sløyfe-protokoller. Den mest kjente closed-loop teknikken er kanskje den dynamiske klemme 6,7, noe som gjorde at den syntetiske injeksjon av kunstige spenningsstyrte ionekanaler å bestemme nevronale membranspenning 8, i inngående studie av effekten av ikke-determinis flimring på ionekanaler på nerve dynamikk 9, samt rekreasjon in vitro av realistisk i vivo- som synaptisk bakgrunn aktivitet 10.
Andre lukket-sløyfe paradigmer som er foreslått inkluderer reaktiv klemme 11, for å studere in vitro generering av selv vedvarende vedvarende aktivitet, og responsen klemme 4,12, for å undersøke de cellulære mekanismene bak nevronale eksitabilitet.
ontent "> Her beskriver vi et kraftig rammeverk som gjør det mulig å bruke en rekke av lukket-sløyfe elektro protokoller i sammenheng med hel-celle patch clamp opptak utført i akutte hjerneskiver. Vi viser hvordan du tar opp somatisk membran spenning ved hjelp av patch clamp opptak i pyramidale nevroner fra somatosensoriske cortex av unge rotter og bruke tre forskjellige lukket sløyfe protokoller ved hjelp av LCG, et kommandolinjebasert programvare verktøykasse utviklet i laboratoriet for teoretisk nevrobiologi og Neuroengineering.Kort fortalt, de beskrevne protokoller er først den automatiserte injeksjon av en rekke nåværende klemme stimulansebølgeformer, relevante for karakterisering av et stort sett med aktive og passive egenskaper membran. Disse har blitt foreslått å fange elektro fenotype av en celle i form av sine responsegenskaper til en stereotyp rekke stimulansebølgeformer. Kjent som e-kode i en celle (f.eks se & #160; 13,14), blir en slik samling av elektriske responser benyttes av flere laboratorier til objektiv klassifisere nerveceller på basis av deres elektriske egenskaper. Dette omfatter analyse av den stasjonære kryssløpsoverføringsforhold (Fi kurve), ved en innovativ teknikk som innebærer lukket sløyfe, sanntids styring av raten av avfyring ved hjelp av en proporsjonal-integral-derivat (PID) regulatoren , andre rekreasjon av realistisk in vivo-lignende bakgrunn synaptisk aktivitet i de vitro forberedelser 10 og, tredje kunstig tilkobling i sanntid av to samtidig registrert pyramidale nevroner ved hjelp av en virtuell GABAergic interneuron, som er simulert ved datamaskinen.
I tillegg implementerer LCG den teknikk som er kjent som aktiv elektrode Compensation (AEC) 15, som gjør det mulig å implementere dynamisk klem protokoller ved hjelp av en enkelt elektrode. Dette gjør at kompenserende uønskede effekter (enrtifacts) av opptakselektrode som oppstår når den brukes for å levere intracellulære stimuli. Metoden er basert på en ikke-parametrisk estimat av de ekvivalente elektriske egenskapene til opptakskretsen.
Teknikker og eksperimentelle protokollen beskrevet i denne artikkelen kan lett brukes i konvensjonell åpen sløyfe spenning og strøm klemme eksperimenter og kan utvides til andre preparater som ekstracellulære 4,16 eller intracellulære opptak in vivo 17,18. Den forsiktige montering av oppsettet for hele cellen patch clamp elektrofysiologi er et svært viktig skritt for stabile, høye kvalitet opptak. I det følgende antar vi at en slik eksperimentelle oppsettet er allerede tilgjengelig for eksperimentator, og fokusere på å beskrive bruken av LCG. Leseren blir pekt på 19-22 for flere tips om optimalisering og feilsøking.
I denne teksten en full protokoll for gjennomføring av real-time, ble lukket-sløyfe encellede elektrofysiologiske eksperimenter beskrevet, ved hjelp av patch clamp teknikken og en nylig utviklet programvare verktøykasse kalt LCG. For å optimalisere kvaliteten på opptakene er det avgjørende at innspillingen setup være jordet, skjermet og vibrasjonsfri: Dette sikrer stabil og varig hel-celle tilgang til cellen, som sammen med mulighet for å automatisere hele seksjoner av stimuleringsregimer tillater for maksimerin…
The authors have nothing to disclose.
Financial support from the Flanders Research Foundation FWO (contract n. 12C9112N to DL), the 7th Framework Programme of the European Commission (Marie Curie Network “C7”, contract n. 238214; ICT Future Emerging Technology “ENLIGHTENMENT” project, contract n. 306502), the Interuniversity Attraction Poles Program initiated by the Belgian Science Policy Office (contract n. IUAP-VII/20), and the University of Antwerp is kindly acknowledged.
Tissue slicer | Leica | VT-1000S | |
Pipette puller | Sutter | P-97 | |
Pipettes | WPI | 1B150F-4 | 1.5/0.84 mm OD/ID, with filament |
Vibration isolation table | TMC | 20 Series | |
Microscope | Leica | DMLFS | 40X Immersion Objective |
Manipulators | Scientifica | PatchStar | |
Amplifiers | Axon Instruments | MultiClamp 700B | Computer controlled |
Data acquisition card | National Instruments | PCI-6229 | Supported by Comedi Linux Drivers |
Desktop computer | Dell | Optiplex 7010 Tower | OS: real-time Linux |
Oscilloscopes | Tektronix | TDS-1002 | |
Perfusion Pump | Gibson | MINIPULS3 | Used with R4 Pump head (F117606) |
Temperature controller | Multichannel Systems | TC02 | PH01 Perfusion Cannula |
Manometer | Testo | 510 | Optional |
Incubator | Memmert | WB14 | |
NaCl | Sigma | 71376 | ACSF |
KCl | Sigma | P9541 | ACSF, ICS |
NaH2PO4 | Sigma | S3139 | ACSF |
NaHCO3 | Sigma | S6014 | ACSF |
CaCl2 | Sigma | C1016 | ACSF |
MgCl2 | Sigma | M8266 | ACSF |
Glucose | Sigma | G7528 | ACSF |
K-Gluconate | Sigma | G4500 | ICS |
HEPES | Sigma | H3375 | ICS |
Mg-ATP | Sigma | A9187 | ICS |
Na2-GTP | Sigma | 51120 | ICS |
Na2-Phosphocreatine | Sigma | P7936 | ICS |