Summary

Sanntidselektro: Bruk lukket sløyfe Protokoller å probe Nevronale Dynamics og Beyond

Published: June 24, 2015
doi:

Summary

Closed-loop protocols are becoming increasingly widespread in modern day electrophysiology. We present a simple, versatile and inexpensive way to perform complex electrophysiological protocols in cortical pyramidal neurons in vitro, using a desktop computer and a digital acquisition board.

Abstract

Eksperimentell nevrovitenskap er vitne til en økt interesse for utvikling og anvendelse av ny og ofte komplekse, lukket sløyfe protokoller, hvor stimulus brukes avhenger i sanntid på responsen til systemet. Nye søknader spenner fra gjennomføringen av virtuelle virkelighet systemer for å studere motoriske responser både hos mus 1 og i sebrafisk 2, for å kontrollere anfall følgende kortikale slag hjelp optogenetics tre. En viktig fordel med lukket sløyfeteknikker ligger i evnen til sentret høyere dimensjonale egenskaper som ikke er direkte tilgjengelige, eller som er avhengig av flere variable, slik som neuronal eksitabilitet 4 og påliteligheten, mens den på samme tid maksimerer den eksperimentelle gjennomstrømming. I dette bidraget og i sammenheng med mobilelektrofysiologi, beskriver vi hvordan du kan bruke en rekke av lukket-sløyfe-protokoller til studiet av respons egenskapene til pyramide kortikale nevroner, recorded intracellulært med lappen klemmeteknikken i akutte hjerneskiver fra somatosensoriske cortex av unge rotter. Som ingen kommersielt tilgjengelig eller åpen kildekode gir alle funksjonene som kreves for effektivt å utføre forsøkene beskrevet her, ble en ny programvareverktøykasse kalt LCG 5 utviklet, hvis modulær struktur maksimerer gjenbruk av programkode og tilrettelegger for implementering av nye eksperimentelle paradigmer. Stimulerings kurver er spesifisert med en compact meta-beskrivelse og fulle eksperimentelle protokoller er beskrevet i tekst-baserte konfigurasjonsfiler. I tillegg har LCG et kommandolinjegrensesnitt som er egnet for gjentakelse av forsøk og automatisering av eksperimentelle protokoller.

Introduction

I de siste årene har mobilelektro utviklet seg fra den tradisjonelle åpne sløyfe paradigmet ansatt i spenning og strøm klemme eksperimenter til moderne lukket-sløyfe-protokoller. Den mest kjente closed-loop teknikken er kanskje den dynamiske klemme 6,7, noe som gjorde at den syntetiske injeksjon av kunstige spenningsstyrte ionekanaler å bestemme nevronale membranspenning 8, i inngående studie av effekten av ikke-determinis flimring på ionekanaler på nerve dynamikk 9, samt rekreasjon in vitro av realistisk i vivo- som synaptisk bakgrunn aktivitet 10.

Andre lukket-sløyfe paradigmer som er foreslått inkluderer reaktiv klemme 11, for å studere in vitro generering av selv vedvarende vedvarende aktivitet, og responsen klemme 4,12, for å undersøke de cellulære mekanismene bak nevronale eksitabilitet.

ontent "> Her beskriver vi et kraftig rammeverk som gjør det mulig å bruke en rekke av lukket-sløyfe elektro protokoller i sammenheng med hel-celle patch clamp opptak utført i akutte hjerneskiver. Vi viser hvordan du tar opp somatisk membran spenning ved hjelp av patch clamp opptak i pyramidale nevroner fra somatosensoriske cortex av unge rotter og bruke tre forskjellige lukket sløyfe protokoller ved hjelp av LCG, et kommandolinjebasert programvare verktøykasse utviklet i laboratoriet for teoretisk nevrobiologi og Neuroengineering.

Kort fortalt, de beskrevne protokoller er først den automatiserte injeksjon av en rekke nåværende klemme stimulansebølgeformer, relevante for karakterisering av et stort sett med aktive og passive egenskaper membran. Disse har blitt foreslått å fange elektro fenotype av en celle i form av sine responsegenskaper til en stereotyp rekke stimulansebølgeformer. Kjent som e-kode i en celle (f.eks se & #160; 13,14), blir en slik samling av elektriske responser benyttes av flere laboratorier til objektiv klassifisere nerveceller på basis av deres elektriske egenskaper. Dette omfatter analyse av den stasjonære kryssløpsoverføringsforhold (Fi kurve), ved en innovativ teknikk som innebærer lukket sløyfe, sanntids styring av raten av avfyring ved hjelp av en proporsjonal-integral-derivat (PID) regulatoren , andre rekreasjon av realistisk in vivo-lignende bakgrunn synaptisk aktivitet i de vitro forberedelser 10 og, tredje kunstig tilkobling i sanntid av to samtidig registrert pyramidale nevroner ved hjelp av en virtuell GABAergic interneuron, som er simulert ved datamaskinen.

I tillegg implementerer LCG den teknikk som er kjent som aktiv elektrode Compensation (AEC) 15, som gjør det mulig å implementere dynamisk klem protokoller ved hjelp av en enkelt elektrode. Dette gjør at kompenserende uønskede effekter (enrtifacts) av opptakselektrode som oppstår når den brukes for å levere intracellulære stimuli. Metoden er basert på en ikke-parametrisk estimat av de ekvivalente elektriske egenskapene til opptakskretsen.

Teknikker og eksperimentelle protokollen beskrevet i denne artikkelen kan lett brukes i konvensjonell åpen sløyfe spenning og strøm klemme eksperimenter og kan utvides til andre preparater som ekstracellulære 4,16 eller intracellulære opptak in vivo 17,18. Den forsiktige montering av oppsettet for hele cellen patch clamp elektrofysiologi er et svært viktig skritt for stabile, høye kvalitet opptak. I det følgende antar vi at en slik eksperimentelle oppsettet er allerede tilgjengelig for eksperimentator, og fokusere på å beskrive bruken av LCG. Leseren blir pekt på 19-22 for flere tips om optimalisering og feilsøking.

Protocol

Protokollen er beskrevet her er i samsvar med anbefalinger og retningslinjer for etikkomiteen ved Institutt for biomedisin ved Universitetet i Antwerpen. Denne protokollen krever fremstillingen av ikke-sansende materiale fra det eksplanterte hjernen av juvenile Wistar-rotter, erholdt ved godkjente humane eutanasi teknikker. 1. Utstyr Forberedelser Installere og konfigurere datainnsamling og stimulering system. Bruk en personlig datamaskin (PC) er utstyrt med en datainnsam…

Representative Results

I de foregående avsnittene har vi beskrevet hvordan du bruker programvaren verktøykasse LCG å karakterisere de elektrofysiologiske egenskapene L5 pyramidale celler og å gjenskape in vivo -lignende synaptisk aktivitet i en skive forberedelse. Bruken av en kommandolinje-grensesnitt og semi-automatisert protokoll favoriserer reproduserbarheten og effektiviteten av forsøket, som kan ha en stor innvirkning på produksjonen og kvaliteten av data som produseres. I tillegg, siden dataene er lagret på en konsisten…

Discussion

I denne teksten en full protokoll for gjennomføring av real-time, ble lukket-sløyfe encellede elektrofysiologiske eksperimenter beskrevet, ved hjelp av patch clamp teknikken og en nylig utviklet programvare verktøykasse kalt LCG. For å optimalisere kvaliteten på opptakene er det avgjørende at innspillingen setup være jordet, skjermet og vibrasjonsfri: Dette sikrer stabil og varig hel-celle tilgang til cellen, som sammen med mulighet for å automatisere hele seksjoner av stimuleringsregimer tillater for maksimerin…

Divulgaciones

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Financial support from the Flanders Research Foundation FWO (contract n. 12C9112N to DL), the 7th Framework Programme of the European Commission (Marie Curie Network “C7”, contract n. 238214; ICT Future Emerging Technology “ENLIGHTENMENT” project, contract n. 306502), the Interuniversity Attraction Poles Program initiated by the Belgian Science Policy Office (contract n. IUAP-VII/20), and the University of Antwerp is kindly acknowledged.

Materials

Tissue slicer Leica VT-1000S
Pipette puller Sutter P-97
Pipettes WPI 1B150F-4 1.5/0.84 mm OD/ID, with filament
Vibration isolation table TMC 20 Series
Microscope Leica DMLFS 40X Immersion Objective
Manipulators Scientifica PatchStar
Amplifiers Axon Instruments MultiClamp 700B Computer controlled
Data acquisition card National Instruments PCI-6229 Supported by Comedi Linux Drivers
Desktop computer Dell Optiplex 7010 Tower OS: real-time Linux
Oscilloscopes Tektronix TDS-1002
Perfusion Pump Gibson MINIPULS3 Used with R4 Pump head (F117606)
Temperature controller Multichannel Systems TC02 PH01 Perfusion Cannula
Manometer Testo 510 Optional
Incubator Memmert WB14
NaCl Sigma 71376 ACSF
KCl Sigma P9541 ACSF, ICS
NaH2PO4 Sigma S3139 ACSF
NaHCO3 Sigma S6014 ACSF
CaCl2 Sigma C1016 ACSF
MgCl2 Sigma M8266 ACSF
Glucose Sigma G7528 ACSF
K-Gluconate Sigma G4500 ICS
HEPES Sigma H3375 ICS
Mg-ATP Sigma A9187 ICS
Na2-GTP Sigma 51120 ICS
Na2-Phosphocreatine Sigma P7936 ICS

Referencias

  1. Saleem, A. B., Ayaz, A., Jeffery, K. J., Harris, K. D., Carandini, M. Integration of visual motion and locomotion in mouse visual cortex. Nature neuroscience. 16, 1864-1869 (2013).
  2. Ahrens, M. B., Li, J. M., et al. Brain-wide neuronal dynamics during motor adaptation in zebrafish. Nature. 485 (7399), 471-477 (2012).
  3. Paz, J. T., Davidson, T. J., et al. Closed-loop optogenetic control of thalamus as a tool for interrupting seizures after cortical injury. Nature neuroscience. 16 (1), 64-70 (2013).
  4. Wallach, A., Eytan, D., Gal, A., Zrenner, C., Marom, S. Neuronal response clamp. Frontiers in neuroengineering. 3 (April), 3 (2011).
  5. Linaro, D., Couto, J., Giugliano, M. Command-line cellular electrophysiology for conventional and real-time closed-loop experiments. Journal of neuroscience. 230, 5-19 (2014).
  6. Sharp, A., O’Neil, M., Abbott, L. F., Marder, E. Dynamic clamp: computer-generated conductances in real neurons. Journal of neurophysiology. 69 (3), 992-995 (1993).
  7. Robinson, H. P., Kawai, N. Injection of digitally synthesized synaptic conductance transients to measure the integrative properties of neurons. Journal of neuroscience methods. 49 (3), 157-165 (1993).
  8. Vervaeke, K., Hu, H., Graham, L. J., Storm, J. F. Contrasting effects of the persistent Na+ current on neuronal excitability and spike timing. Neuron. 49 (2), 257-270 (2006).
  9. White, J. A., Klink, R., Alonso, A., Kay, A. R. Noise from voltage-gated ion channels may influence neuronal dynamics in the entorhinal cortex. Journal of neurophysiology. 80 (1), 262-269 (1998).
  10. Destexhe, a., Rudolph, M., Fellous, J. M., Sejnowski, T. J. Fluctuating synaptic conductances recreate in vivo-like activity in neocortical neurons. Neurociencias. 107 (1), 13-24 (2001).
  11. Fellous, J. -. M. Regulation of Persistent Activity by Background Inhibition in an In Vitro Model of a Cortical Microcircuit. Cerebral Cortex. 13 (11), 1232-1241 (2003).
  12. Gal, A., Eytan, D., Wallach, A., Sandler, M., Schiller, J., Marom, S. Dynamics of excitability over extended timescales in cultured cortical neurons. The Journal of neuroscience. the official journal of the Society for Neuroscience. 30 (48), 16332-16342 (2010).
  13. Wang, Y., Toledo-Rodriguez, M., et al. Anatomical, physiological and molecular properties of Martinotti cells in the somatosensory cortex of the juvenile rat. The Journal of physiology. 561 (Pt 1), 65-90 (2004).
  14. Wang, Y., Gupta, A., Toledo-Rodriguez, M., Wu, C. Z., Markram, H. Anatomical, physiological, molecular and circuit properties of nest basket cells in the developing somatosensory cortex). Cerebral cortex (New York, N.Y). 12 (4), 395-410 (1991).
  15. Brette, R., Piwkowska, Z., et al. High-resolution intracellular recordings using a real-time computational model of the electrode. Neuron. 59 (3), 379-391 (2008).
  16. Rutishauser, U., Kotowicz, A., Laurent, G. A method for closed-loop presentation of sensory stimuli conditional on the internal brain-state of awake animals. Journal of neuroscience. 215 (1), 139-155 (2013).
  17. Margrie, T., Brecht, M., Sakmann, B. In vivo, low-resistance, whole-cell recordings from neurons in the anaesthetized and awake mammalian brain. Pflugers Archiv European Journal of Physiology. 444 (4), 491-498 (2002).
  18. Graham, L., Schramm, A. In Vivo Dynamic-Clamp Manipulation of Extrinsic and Intrinsic Conductances: Functional Roles of Shunting Inhibition and I BK in Rat and Cat Cortex. Dynamic Clamp: From Principles to Applications. , (2008).
  19. Sakmann, B., Neher, E. . Single-channel recording. , (1995).
  20. Molleman, A. . Patch Clamping. , (2002).
  21. Davie, J. T., Kole, M. H. P., et al. Dendritic patch-clamp recording. Nature Protocols. 1 (3), 1235-1247 (2006).
  22. Gold, R. . The Axon Guide for Electrophysiolog., & Biophysics Laboratory Techniques... , (2007).
  23. Mainen, Z. F., Sejnowski, T. J. Reliability of spike timing in neocortical neurons. Science. 268 (5216), 1503-1506 (1995).
  24. Buzsáki, G. Action potential threshold of hippocampal pyramidal cells in vivo is increased by recent spiking activity. Neurociencias. 105 (1), 121-130 (2001).
  25. Koch, C., Segev, I. . Methods in Neuronal Modeling: From Synapses to Networks. , (1988).
  26. Silberberg, G., Markram, H. Disynaptic inhibition between neocortical pyramidal cells mediated by Martinotti cells. Neuron. 53 (5), 735-746 (2007).
  27. Berger, T. K., Silberberg, G., Perin, R., Markram, H. Brief bursts self-inhibit and correlate the pyramidal network. PLoS biology. 8 (9), (2010).
  28. Tsodyks, M., Pawelzik, K., Markram, H. Neural networks with dynamic synapses. Neural computation. 10 (4), 821-835 (1998).
  29. Kapfer, C., Glickfeld, L. L., Atallah, B. Supralinear increase of recurrent inhibition during sparse activity in the somatosensory cortex. Nature. 10 (6), 743-753 (2007).
check_url/es/52320?article_type=t

Play Video

Citar este artículo
Linaro, D., Couto, J., Giugliano, M. Real-time Electrophysiology: Using Closed-loop Protocols to Probe Neuronal Dynamics and Beyond. J. Vis. Exp. (100), e52320, doi:10.3791/52320 (2015).

View Video