Summary

Real-time Elektrofysiologi: Brug lukkede kredsløb protokoller til Probe Neuronal Dynamics og Beyond

Published: June 24, 2015
doi:

Summary

Closed-loop protocols are becoming increasingly widespread in modern day electrophysiology. We present a simple, versatile and inexpensive way to perform complex electrophysiological protocols in cortical pyramidal neurons in vitro, using a desktop computer and a digital acquisition board.

Abstract

Eksperimentel neurovidenskab er vidne til en øget interesse for udvikling og anvendelse af nye og ofte komplekse, lukkede kredsløb protokoller, hvor stimulus anvendte afhænger i real-tid på respons af systemet. Seneste applikationer spænder fra gennemførelsen af virtual reality-systemer til at studere motoriske respons både mus 1 og i zebrafisk 2, til at kontrollere anfald efter kortikal slagtilfælde hjælp optogenetics 3. En væsentlig fordel ved lukkede kredsløb teknikker ligger i evnen til sondering højere dimensionelle egenskaber, som ikke er direkte tilgængelige eller som er afhængige af flere variabler, såsom neuronal excitabilitet 4 og pålidelighed, mens på samme tid at maksimere den eksperimentelle gennemløb. I dette bidrag og i forbindelse med cellulære elektrofysiologi, beskriver vi, hvordan man anvender en række lukkede kredsløb protokoller til studiet af respons egenskaber af pyramideformede kortikale neuroner, recbestilte intracellulært med patch clamp-teknik i akutte hjernen skiver fra somatosensoriske cortex af unge rotter. Da der ikke kommercielt tilgængelige eller open source-software indeholder alle de funktioner, der kræves for effektivt at udføre forsøgene beskrevet her blev en ny software værktøjskasse kaldet LCG 5 udviklet, hvis modulære opbygning maksimerer genbrug af computer-kode og letter gennemførelsen af nye eksperimentelle paradigmer. Stimulation kurveformer angives ved hjælp af et kompakt meta-beskrivelse og fuld forsøgsprotokoller er beskrevet i tekstbaserede konfigurationsfiler. Derudover LCG har en kommando-line interface, der er velegnet til gentagelse af forsøg, og automatisering af forsøgsprotokoller.

Introduction

I de senere år har cellulær elektrofysiologi udviklet sig fra den traditionelle åben sløjfe paradigme anvendes i spænding og strøm clamp-forsøg til moderne lukkede kredsløb protokoller. Den bedst kendte lukkede kredsløb teknik er måske den dynamiske klemme 6,7, hvilket gjorde det muligt for syntetiske injektion af kunstige spændingsafhængige ionkanaler at bestemme den neuronale membran spænding 8, den tilbundsgående undersøgelse af virkningerne af ikke-deterministisk flimmer på ionkanaler på neuronale respons dynamik 9, samt rekreation in vitro af realistiske i vivo- ligesom synaptisk baggrund aktivitet 10.

Andre lukkede kredsløb paradigmer, der er blevet foreslået omfatter den reaktive klemme 11, for at studere in vitro generering af selvbærende vedvarende aktivitet, og svaret klemme 4,12, til at undersøge de cellulære mekanismer underliggende neuronal uro.

Indholdsproduktion "> Her beskriver vi en kraftig ramme, der tillader anvendelse af en bred vifte af lukkede elektrofysiologiske protokoller i forbindelse med hel-celle patch clamp optagelser udført i akutte hjernen skiver. Vi viser hvordan man optager membran spænding somatisk ved hjælp af patch clamp optagelser i pyramideformede neuroner fra somatosensoriske cortex af unge rotter og anvende tre forskellige lukkede kredsløb protokoller bruger LCG, en kommando-linje-baseret software værktøjskasse udviklet i laboratoriet af Teoretisk neurobiologi og Neuroengineering.

Kort fortalt de beskrevne protokoller er først automatiseret injektion af en række aktuelle klemme stimulus kurveformer, der er relevante for karakterisering af et stort sæt egenskaber aktive og passive membran. Disse er blevet foreslået at fange den elektrofysiologiske fænotype af en celle med hensyn til dets respons egenskaber til en stereotyp serie af stimulus bølgeformer. Kendt som e-koden af en celle (f.eks, se & #160; 13,14), er en sådan samling af elektriske reaktioner, der anvendes af flere laboratorier for objektivt klassificere neuroner på grundlag af deres elektriske egenskaber. Dette omfatter en analyse af den stationære input-output transfer forhold (FI kurve), som en innovativ teknik, der involverer lukket kredsløb, real-time kontrol af satsen for fyring ved hjælp af en proportional-integral-derivat (PID) controller andet genskabelse af realistiske in vivo-lignende baggrund synaptisk aktivitet i de vitro præparater 10 og for det tredje den kunstige forbindelse i realtid af to samtidigt konstateret pyramideformede neuroner ved hjælp af en virtuel GABAerg interneuron, der simuleres ved computeren.

Derudover LCG gennemfører teknik kendt som aktive elektrode Compensation (AEC) 15, som tillader gennemførelsen af dynamiske clamp-protokoller under anvendelse af en enkelt elektrode. Dette gør det muligt at kompensere uønskede virkninger (artifacts) af optagelsen elektrode, der opstår, når det anvendes til at levere intracellulære stimuli. Fremgangsmåden er baseret på en ikke-parametrisk skøn over de tilsvarende elektriske egenskaber af optagelsen kredsløb.

De teknikker og eksperimentelle protokoller, der er beskrevet i dette papir kan let anvendes i konventionel åben sløjfe spænding og nuværende clamp-forsøg, og kan udvides til andre præparater, såsom ekstracellulær 4,16 eller intracellulære optagelser in vivo 17,18. Den omhyggelige samling af opsætningen for hele celle patch clamp elektrofysiologi er et meget vigtigt skridt for en stabil, høj kvalitet optagelser. I det følgende antager vi, at en sådan forsøgsopstilling er allerede tilgængelig for forsøgslederen, og fokusere vores opmærksomhed på at beskrive brugen af ​​LCG. Læseren bliver peget på 19-22 for yderligere tips om optimering og debugging.

Protocol

Den her beskrevne protokol følger anbefalingerne og retningslinjer for den etiske komité for Biomedicinsk Institut ved universitetet i Antwerpen. Denne protokol skal der udarbejdes ikke-sansende materiale fra eksplanterede hjerne af unge Wistar rotter opnås ved godkendte humane eutanasi teknikker. 1. Udstyr Forberedelse Installere og konfigurere erhvervelse data og stimulering system. Brug en personlig computer (PC) er udstyret med en dataopsamling (DAQ) kort understø…

Representative Results

I de foregående afsnit har vi beskrevet, hvordan at bruge softwaren værktøjskassen LCG at karakterisere de elektrofysiologiske egenskaber af L5 pyramideformede celler og til at genskabe in vivo-lignende synaptisk aktivitet i en skive forberedelse. Brugen af ​​en kommando-line interface og semi-automatiske protokol favoriserer reproducerbarhed og effektivitet af forsøget, som kan have en stor indflydelse på produktionen og kvaliteten af ​​de producerede data. Derudover, da dataene er gemt på en ens…

Discussion

I denne tekst en fuld protokol for gennemførelse af real-time, blev lukket kredsløb enkelt celle elektrofysiologiske eksperimenter beskrives ved hjælp af patch clamp-teknik og en nylig udviklet software værktøjskasse kaldet LCG. For at optimere kvaliteten af ​​optagelserne er det afgørende, at opsætningen optagelsen være korrekt jordforbindelse, skærmet og vibrationsfri: dette sikrer stabil og varig hel-celle adgang til cellen, der sammen med mulighed for at automatisere hele sektioner af stimulation protok…

Divulgaciones

The authors have nothing to disclose.

Acknowledgements

Financial support from the Flanders Research Foundation FWO (contract n. 12C9112N to DL), the 7th Framework Programme of the European Commission (Marie Curie Network “C7”, contract n. 238214; ICT Future Emerging Technology “ENLIGHTENMENT” project, contract n. 306502), the Interuniversity Attraction Poles Program initiated by the Belgian Science Policy Office (contract n. IUAP-VII/20), and the University of Antwerp is kindly acknowledged.

Materials

Tissue slicer Leica VT-1000S
Pipette puller Sutter P-97
Pipettes WPI 1B150F-4 1.5/0.84 mm OD/ID, with filament
Vibration isolation table TMC 20 Series
Microscope Leica DMLFS 40X Immersion Objective
Manipulators Scientifica PatchStar
Amplifiers Axon Instruments MultiClamp 700B Computer controlled
Data acquisition card National Instruments PCI-6229 Supported by Comedi Linux Drivers
Desktop computer Dell Optiplex 7010 Tower OS: real-time Linux
Oscilloscopes Tektronix TDS-1002
Perfusion Pump Gibson MINIPULS3 Used with R4 Pump head (F117606)
Temperature controller Multichannel Systems TC02 PH01 Perfusion Cannula
Manometer Testo 510 Optional
Incubator Memmert WB14
NaCl Sigma 71376 ACSF
KCl Sigma P9541 ACSF, ICS
NaH2PO4 Sigma S3139 ACSF
NaHCO3 Sigma S6014 ACSF
CaCl2 Sigma C1016 ACSF
MgCl2 Sigma M8266 ACSF
Glucose Sigma G7528 ACSF
K-Gluconate Sigma G4500 ICS
HEPES Sigma H3375 ICS
Mg-ATP Sigma A9187 ICS
Na2-GTP Sigma 51120 ICS
Na2-Phosphocreatine Sigma P7936 ICS

Referencias

  1. Saleem, A. B., Ayaz, A., Jeffery, K. J., Harris, K. D., Carandini, M. Integration of visual motion and locomotion in mouse visual cortex. Nature neuroscience. 16, 1864-1869 (2013).
  2. Ahrens, M. B., Li, J. M., et al. Brain-wide neuronal dynamics during motor adaptation in zebrafish. Nature. 485 (7399), 471-477 (2012).
  3. Paz, J. T., Davidson, T. J., et al. Closed-loop optogenetic control of thalamus as a tool for interrupting seizures after cortical injury. Nature neuroscience. 16 (1), 64-70 (2013).
  4. Wallach, A., Eytan, D., Gal, A., Zrenner, C., Marom, S. Neuronal response clamp. Frontiers in neuroengineering. 3 (April), 3 (2011).
  5. Linaro, D., Couto, J., Giugliano, M. Command-line cellular electrophysiology for conventional and real-time closed-loop experiments. Journal of neuroscience. 230, 5-19 (2014).
  6. Sharp, A., O’Neil, M., Abbott, L. F., Marder, E. Dynamic clamp: computer-generated conductances in real neurons. Journal of neurophysiology. 69 (3), 992-995 (1993).
  7. Robinson, H. P., Kawai, N. Injection of digitally synthesized synaptic conductance transients to measure the integrative properties of neurons. Journal of neuroscience methods. 49 (3), 157-165 (1993).
  8. Vervaeke, K., Hu, H., Graham, L. J., Storm, J. F. Contrasting effects of the persistent Na+ current on neuronal excitability and spike timing. Neuron. 49 (2), 257-270 (2006).
  9. White, J. A., Klink, R., Alonso, A., Kay, A. R. Noise from voltage-gated ion channels may influence neuronal dynamics in the entorhinal cortex. Journal of neurophysiology. 80 (1), 262-269 (1998).
  10. Destexhe, a., Rudolph, M., Fellous, J. M., Sejnowski, T. J. Fluctuating synaptic conductances recreate in vivo-like activity in neocortical neurons. Neurociencias. 107 (1), 13-24 (2001).
  11. Fellous, J. -. M. Regulation of Persistent Activity by Background Inhibition in an In Vitro Model of a Cortical Microcircuit. Cerebral Cortex. 13 (11), 1232-1241 (2003).
  12. Gal, A., Eytan, D., Wallach, A., Sandler, M., Schiller, J., Marom, S. Dynamics of excitability over extended timescales in cultured cortical neurons. The Journal of neuroscience. the official journal of the Society for Neuroscience. 30 (48), 16332-16342 (2010).
  13. Wang, Y., Toledo-Rodriguez, M., et al. Anatomical, physiological and molecular properties of Martinotti cells in the somatosensory cortex of the juvenile rat. The Journal of physiology. 561 (Pt 1), 65-90 (2004).
  14. Wang, Y., Gupta, A., Toledo-Rodriguez, M., Wu, C. Z., Markram, H. Anatomical, physiological, molecular and circuit properties of nest basket cells in the developing somatosensory cortex). Cerebral cortex (New York, N.Y). 12 (4), 395-410 (1991).
  15. Brette, R., Piwkowska, Z., et al. High-resolution intracellular recordings using a real-time computational model of the electrode. Neuron. 59 (3), 379-391 (2008).
  16. Rutishauser, U., Kotowicz, A., Laurent, G. A method for closed-loop presentation of sensory stimuli conditional on the internal brain-state of awake animals. Journal of neuroscience. 215 (1), 139-155 (2013).
  17. Margrie, T., Brecht, M., Sakmann, B. In vivo, low-resistance, whole-cell recordings from neurons in the anaesthetized and awake mammalian brain. Pflugers Archiv European Journal of Physiology. 444 (4), 491-498 (2002).
  18. Graham, L., Schramm, A. In Vivo Dynamic-Clamp Manipulation of Extrinsic and Intrinsic Conductances: Functional Roles of Shunting Inhibition and I BK in Rat and Cat Cortex. Dynamic Clamp: From Principles to Applications. , (2008).
  19. Sakmann, B., Neher, E. . Single-channel recording. , (1995).
  20. Molleman, A. . Patch Clamping. , (2002).
  21. Davie, J. T., Kole, M. H. P., et al. Dendritic patch-clamp recording. Nature Protocols. 1 (3), 1235-1247 (2006).
  22. Gold, R. . The Axon Guide for Electrophysiolog., & Biophysics Laboratory Techniques... , (2007).
  23. Mainen, Z. F., Sejnowski, T. J. Reliability of spike timing in neocortical neurons. Science. 268 (5216), 1503-1506 (1995).
  24. Buzsáki, G. Action potential threshold of hippocampal pyramidal cells in vivo is increased by recent spiking activity. Neurociencias. 105 (1), 121-130 (2001).
  25. Koch, C., Segev, I. . Methods in Neuronal Modeling: From Synapses to Networks. , (1988).
  26. Silberberg, G., Markram, H. Disynaptic inhibition between neocortical pyramidal cells mediated by Martinotti cells. Neuron. 53 (5), 735-746 (2007).
  27. Berger, T. K., Silberberg, G., Perin, R., Markram, H. Brief bursts self-inhibit and correlate the pyramidal network. PLoS biology. 8 (9), (2010).
  28. Tsodyks, M., Pawelzik, K., Markram, H. Neural networks with dynamic synapses. Neural computation. 10 (4), 821-835 (1998).
  29. Kapfer, C., Glickfeld, L. L., Atallah, B. Supralinear increase of recurrent inhibition during sparse activity in the somatosensory cortex. Nature. 10 (6), 743-753 (2007).

Play Video

Citar este artículo
Linaro, D., Couto, J., Giugliano, M. Real-time Electrophysiology: Using Closed-loop Protocols to Probe Neuronal Dynamics and Beyond. J. Vis. Exp. (100), e52320, doi:10.3791/52320 (2015).

View Video