防冻蛋白 (AFP) 与特定的冰平面结合,以防止或减缓冰的生长。基于荧光的冰平面亲和力 (FIPA) 分析是对确定 AFP 绑定冰平面的原始冰蚀刻方法的修改。AFP 采用荧光标记,并融入宏观单一冰晶中,并在紫外线下可视化。
防冻蛋白 (AFP) 表现在各种冷硬生物体中,以防止或减缓内部冰的生长。AFP 通过冰结合表面与特定的冰平面结合。基于荧光的冰平面亲和力 (FIPA) 分析是一种用于确定 AFP 与之结合的冰平面的修改技术。FIPA 基于确定法新社绑定冰平面的原始冰蚀方法。它在缩短的实验时间内产生更清晰的图像。在 FIPA 分析中,AFP 被荧光标记为有幻想标记或共价染料,然后慢慢融入宏观单一冰晶中,该晶体已预制成半球,并定向以确定 a 轴 和 c 轴。法新社的冰半球在紫外线下被成像,使用过滤器来阻挡非特异性光,以可视化法新社的平面。AFP 的荧光标签允许实时监控 AFP 吸附到冰中。已发现这些标签不会影响 AFP 绑定的平面。FIPA 分析还引入了将多个不同标签的 AFP 绑在同一个单一冰晶上的选项,以帮助区分其绑定平面。FIPA的这些应用有助于增进我们对AFP如何与冰结合以阻止其生长的理解,以及为什么许多产生AFF的生物会表达多种AFP等形。
抗冻蛋白(AFPs)的产生是生活在冰层中环境中的一些生物体的重要生存机制。直到最近,人们还认为AFP的唯一功能是防止或减缓内部冰晶的生长,这些冰晶会阻断循环,造成组织损伤和渗透应激。不能容忍任何程度的冰冻的生物,如鱼,表达AFP,以完全抑制冰晶生长1。其他,如草,是耐冻和表达AFP,以抑制冰的再封装,减少形成大冰晶在他们的组织2。在低温下稳定膜是另一个功能,建议为AFP3。最近,一个新的角色被建议为法新社的南极细菌, 马里诺莫纳斯原始,从冰覆盖的咸水湖4。这个AFP是一个更大的粘合蛋白5的一部分,被认为是附加细菌到冰上,以更好地获得氧气和营养物质6。其他微生物已知分泌AFP,这可能改变它们生活7的冰的结构。
在一些鱼类、昆虫、植物、藻类、细菌、硅藻和真菌中发现了AFP。它们具有显著不同的序列和结构,与不同祖先在不同场合的进化相一致:然而,它们都与冰结合,并通过吸附抑制机制8抑制其生长。AFP各有一个特定的表面,作为其冰结合点(IBS)。这些通常通过9-11表面残留物的现场定向突变来识别。IBS 假设将水分子排列在与特定冰平面相匹配的冰样图案中。因此,法新社形成其配体之前,绑定到它5,12。冰飞机可以通过米勒指数来定义,不同的AFP可以与不同的平面结合。因此,I型法新社从冬季比目鱼绑定到20-21金字塔平面13,III型法新社结合主棱镜和金字塔平面使用复合冰结合表面11,14,而云杉芽虫法新社,一个过度活跃的法新社,同时结合到主平面和基底平面15,16。其他过度活跃的AFP,如 MpAFP,与多个冰平面结合,如它们对单个冰晶半球5,17的完全覆盖所示。据推测,超活性AFP结合基底平面和其他飞机的能力,可能占其活性的10倍,比适度活跃的AFP18。虽然超活性AFP的效率是有据可查的,但它们与多个冰层结合的能力仍然不为人所知。
确定法新社飞往冰上飞机的最初方法是由查尔斯·奈特13,19开发的。在这种方法中,一个宏观的单一冰晶被安装在一个空心金属棒(冷手指)上,通过将其浸入装满脱气水的半球杯中形成半球。然后,半球被淹没在AFP的稀释溶液中,在几个小时内,由通过冷手指循环的乙二醇温度控制,从法新社溶液中长出一层冰到冰晶半球。冰晶从溶液中取出,从冷手指上分离出来,放置在-10至-15°C的冰柜室中。表面用锋利的刀片刮去防冻蛋白溶液的冷冻表面薄膜,冰晶允许升华至少3小时。升华后,由AFP绑定的冰平面可视为从残余蛋白质中提取的白色蚀刻图案。冰半球可以定向到其 c轴和 斧头,定位冰的基础平面和棱镜平面,并确定蚀刻补丁的米勒指数。
在这里,我们描述了对确定法新社绑定冰平面的原始方法的修改,我们称之为荧光基冰平面亲和力(FIPA)11。AFP 的荧光标记要么带有钟音标签,如绿色荧光蛋白 (GFP)11,16,17,20,要么与荧光染料共价绑定到 AFP5,21。荧光标记的AFP被吸收到一个冰晶中,并且使用与原始冰蚀实验相同的实验程序过度生长。在整个实验中,可以使用紫外线(UV)灯监测与生长的冰半球结合的AFP的程度。实验完成后,半球可以直接从冷手指上取下并成像,无需升华。然而,如果需要,半球可以留给升华,以可视化传统的冰蚀刻。对FIPA方法的修改将传统的冰蚀协议缩短了几个小时。此外,还有可能同时成像几个具有不同荧光标签的 AFP,以可视化 AFP 绑定冰平面的重叠模式。
查尔斯·奈特研制的冰蚀方法,用于确定法新社的冰平面,大大推进了对AFP冰结合机理的研究。虽然AFP的结构可以通过X射线晶体学26,27 来解决,但没有明显的方法来推断AFP绑定在冰上的互补表面。当I型法新社从冬季比目鱼的最初特征,它被假设绑定到冰28的主要棱镜平面。然而,奈特的破冰实验I型法新社显示,他们与冰13金字塔平面结合。这一结果促使法新社研究界重?…
The authors have nothing to disclose.
PLD担任加拿大蛋白质工程研究主席。这项工作由加拿大卫生研究所向民盟提供的赠款资助。这项工作还得到了日本科学促进协会(JSPS)和日本生物导向技术研究促进机构(BRAIN)的科学研究资助。我们感谢克里斯·马歇尔博士和迈克·奎珀博士开创性的工作,导致FIPA。我们还感谢萨凯·齐达博士为这项工作提供设施,并感谢劳里·格雷厄姆博士为荧光灯激发和排放过滤器的建立提供便利。
NESLAB RTE Refrigerating Bath/Circulators | Thermo Scientific | RTE7 | |
Ethylene glycol, Premixed Antifreeze/Coolant | Certified | 29-3037-0 | Common automotive antifreeze |
Cold finger | not available | not available | Custom made with brass (9 cm long, 1.5 cm outer diameter) |
Hemispherical cup | not available | not available | Custom made with resin (8 cm outer diameter, 6 cm inner diameter) |
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Emission Filters | Lightools Research | LT-9EFPVG, LT-9GFPVG, LT-9RFPVG | Filter ring adapter may be required to fit filter onto camera lens |